Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26816	-0.0015	NA	NA	NA	3.70288315031170e-28	72536231	72539143
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.7097	3.7028831503117e-28	72536231	72539143	2.43950714649939e-29	72574479	72589682
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	146297175	16261	15647	0.0073	2.43950714649939e-29	72574479	72589682	1.95315374792335e-07	146273215	147308557
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147352661	11	11	-0.8367	1.95315374792335e-07	146273215	147308557	0.00150608503630712	147315217	147414355
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147357754	147510532	26	23	-0.2113	0.00150608503630712	147315217	147414355	0.000127187128243218	147497268	147644831
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	148081741	3	3	-1.4003	0.000127187128243218	147497268	147644831	0.000527778827699578	148081741	148088285
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	151026228	1344	1303	0.0094	0.000527778827699578	148081741	148088285	4.68390073604519e-23	151026228	151026228
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-2.818	4.68390073604519e-23	151026228	151026228	1.01337715550222e-23	151036435	151036435
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2572	-5e-04	1.01337715550222e-23	151036435	151036435	4.08467285302863e-14	157133150	157133150
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	3.0902	4.08467285302863e-14	157133150	157133150	3.2089322635211e-13	157136342	157136342
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	247186514	32910	31620	0.0018	3.2089322635211e-13	157136342	157136342	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	146571330	45074	43360	0.0024	NA	NA	NA	6.7027423151097e-37	146571330	146571330
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146582195	1	0	NA	6.7027423151097e-37	146571330	146571330	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146585707	146592775	3	3	-4.1149	NA	NA	NA	3.17595535475349e-37	146592775	146592775
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31531	0.0073	3.17595535475349e-37	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15596	0.0093	NA	NA	NA	1.03311528936202e-19	47460892	47460892
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-3.6552	1.03311528936202e-19	47460892	47460892	6.69607957392649e-19	47466921	47466921
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	47469018	1	0	NA	6.69607957392649e-19	47466921	47466921	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47470384	199329592	49411	47513	0.0034	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9233	0.0145	NA	NA	NA	2.95585239389933e-49	34445002	34445002
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-3.2841	2.95585239389933e-49	34445002	34445002	4.50172012484682e-49	34491115	34491115
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	69085386	8866	8536	0.0029	4.50172012484682e-49	34491115	34491115	6.79565363379799e-64	69085386	69088563
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69088563	69165814	11	11	-2.7638	6.79565363379799e-64	69085386	69088563	5.56628087958868e-65	69163312	69165814
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	186676034	35163	33786	0.0181	5.56628087958868e-65	69163312	69165814	3.05023914601444e-14	186676034	186676034
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.1539	3.05023914601444e-14	186676034	186676034	3.03646232262808e-14	186680176	186680176
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191041481	1542	1474	0.0079	3.03646232262808e-14	186680176	186680176	2.65525421852628e-05	190996185	191116001
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	7	-0.7223	2.65525421852628e-05	190996185	191116001	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	51648	0.0053	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11234	0.0116	NA	NA	NA	1.11815694369244e-16	32548736	32563252
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32590568	5	5	-2.1613	1.11815694369244e-16	32548736	32563252	4.83941194536891e-17	32588005	32593151
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	54035000	8307	7993	2e-04	4.83941194536891e-17	32588005	32593151	1.03932245311892e-27	54035000	54035000
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.5288	1.03932245311892e-27	54035000	54035000	9.90105122776244e-28	54042734	54042734
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	165643653	34317	33009	0.0037	9.90105122776244e-28	54042734	54042734	2.20302758369899e-09	165642393	165643653
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.8461	2.20302758369899e-09	165642393	165643653	3.06372884925141e-09	165650610	165653315
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1742	-0.0243	3.06372884925141e-09	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	125831554	42438	40819	0.003	NA	NA	NA	8.42474723530392e-08	125829681	125831554
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125836353	2	2	-2.4376	8.42474723530392e-08	125829681	125831554	4.77252566761603e-08	125836353	125836353
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125837524	125837524	1	0	NA	4.77252566761603e-08	125836353	125836353	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7068	0.0091	NA	NA	NA	2.70036676414628e-65	141410894	141414719
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-2.5434	2.70036676414628e-65	141410894	141414719	2.02615780053188e-60	141435643	141440184
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141442231	1	0	NA	2.02615780053188e-60	141435643	141440184	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141443577	158821263	6877	6608	-0.0158	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25017905	8128	7813	0.0098	NA	NA	NA	8.19804923128641e-19	25017905	25017905
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25022606	25022606	1	0	NA	8.1980492312864e-19	25017905	25017905	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-2.9645	NA	NA	NA	2.00762642340979e-19	25039370	25039370
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	87255865	17688	17001	0.0131	2.00762642340979e-19	25039370	25039370	5.30003221855317e-27	87255865	87255865
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-3.478	5.30003221855317e-27	87255865	87255865	2.03621833718946e-27	87262662	87262662
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	142329141	17358	16695	0.0151	2.03621833718946e-27	87262662	87262662	9.9150647450898e-07	142325349	142329141
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142331353	142334063	3	3	-1.7947	9.9150647450898e-07	142325349	142329141	8.54336735811153e-06	142334063	142338381
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142336041	146264846	1382	1329	-0.0446	8.54336735811153e-06	142334063	142338381	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12569	0.0059	NA	NA	NA	8.07387156254413e-10	70926188	70926188
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.6024	8.07387156254413e-10	70926188	70926188	8.5393879501594e-09	70930528	70930528
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	23865	-0.017	8.5393879501594e-09	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	43139	-0.0035	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	134450318	45304	43570	-0.0026	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	34292801	12171	11737	0.0068	NA	NA	NA	3.69954243393263e-09	34282100	34292801
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	34302633	36734934	6	6	-1.4969	3.69954243393263e-09	34282100	34292801	1.35839626004583e-09	36734934	36739877
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	36739877	46992235	3306	3197	-0.0106	1.35839626004583e-09	36734934	36739877	1.13127911078155e-08	46992235	46992235
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-2.462	1.13127911078155e-08	46992235	46992235	7.86330036214536e-08	46996769	46996769
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	132289090	29676	28580	-7e-04	7.86330036214536e-08	46996769	46996769	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7074	-1e-04	NA	NA	NA	1.94777577133383e-28	37953582	37953582
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.4767	1.94777577133383e-28	37953582	37953582	3.24376509441325e-29	37957844	37957844
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	100690991	19740	18994	0.0109	3.24376509441325e-29	37957844	37957844	1.04757479181995e-23	100690991	100690991
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.045	1.04757479181995e-23	100690991	100690991	2.1676189796619e-22	100693892	100693892
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4399	-0.0083	2.1676189796619e-22	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	106358491	31885	30617	-0.0037	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2757	NA	NA	NA	0.00134650698637184	18452491	18831600
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	144	-0.8215	0.00134650698637184	18452491	18831600	2.50480003674374e-67	20029653	20330200
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	20752	-0.0103	2.50480003674374e-67	20029653	20330200	8.44692994576087e-18	74669752	74669752
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	3	-2.9371	8.44692994576087e-18	74669752	74669752	9.36468165504769e-18	74680439	74680439
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9226	-0.0118	9.36468165504769e-18	74680439	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	76923844	21135	20331	-0.0065	NA	NA	NA	7.74198514659087e-20	76922411	76934755
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	7.74198514659087e-20	76922411	76934755	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-1.8879	NA	NA	NA	1.38799290455749e-18	76934755	76942679
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4352	-0.0245	1.38799290455749e-18	76934755	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13335	-0.0134	NA	NA	NA	2.83052521287239e-07	36668730	36678537
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-1.5122	2.83052521287239e-07	36668730	36678537	3.45526266075482e-07	36680557	36686013
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	78637954	15757	15160	-0.0102	3.45526266075482e-07	36680557	36686013	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78653545	78653545	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22066	9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	475	-0.0524	NA	NA	NA	2.98110094708621e-08	1395246	1398325
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.351	2.98110094708621e-08	1395246	1398325	3.40638838949234e-07	1400840	1405308
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	20883588	8839	8487	-0.0122	3.40638838949234e-07	1400840	1405308	6.97735203346077e-07	20878378	20883588
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20886133	20897098	4	4	-1.6223	6.97735203346077e-07	20878378	20883588	1.72694089448685e-06	20897098	20905020
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20900139	20900139	1	0	NA	1.72694089448685e-06	20897098	20905020	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20901410	63788698	13721	13186	-0.0094	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	560	-0.0403	NA	NA	NA	1.47014475873762e-19	1499421	1516966
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.8171	1.47014475873762e-19	1499421	1516966	1.02724306936162e-20	1523000	1532433
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20180	-0.0071	1.02724306936162e-20	1523000	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12917	-0.0095	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49571068	16557	15892	-0.0164	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1091	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529	94062	5	5	0.1933	NA	NA	NA	9.98561828439715e-13	94062	94062
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.5198	9.98561828439715e-13	94062	94062	2.02094993197735e-10	104732	108902
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2751284	1798	1721	0.0041	2.02094993197735e-10	104732	108902	0	2745317	2765746
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2754701	76998610	22921	22037	1.0257	0	2745317	2765746	3.13958431967936e-09	76992219	76998610
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.7711	3.13958431967936e-09	76992219	76998610	7.178874211267e-10	77010018	77014050
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154578922	22192	21355	1.0193	7.178874211267e-10	77010018	77014050	7.71150579883202e-137	154570075	154601146
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154888224	202	193	-0.0316	7.71150579883202e-137	154570075	154601146	NA	NA	NA
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-2.4963	NA	NA	NA	2.82329580740011e-09	2969891	3777766
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5531459	15	15	-0.7056	2.82329580740011e-09	2969891	3777766	6.15553204507613e-10	4948824	6688691
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5593746	6922654	98	91	-2.6184	6.15553204507613e-10	4948824	6688691	0.0186365119284101	6825108	7070931
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6924280	10511255	726	705	-2.1695	0.0186365119284101	6825108	7070931	2.79773599190075e-06	10475426	10537808
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10512616	11673476	20	18	-0.7033	2.79773599190075e-06	10475426	10537808	0.00116658147509347	10645500	12559410
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12973899	139	134	-1.9723	0.00116658147509347	10645500	12559410	0.00157615718155657	12861657	13022741
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12975651	13129843	64	63	-1.2401	0.00157615718155657	12861657	13022741	5.85201423757418e-19	13109337	13148290
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14508894	505	484	-2.4994	5.85201423757418e-19	13109337	13148290	5.62743916300859e-07	14502379	14530328
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	12	-0.8002	5.62743916300859e-07	14502379	14530328	4.38034872297624e-05	14538156	14563486
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	25737663	1634	1566	-2.4451	4.38034872297624e-05	14538156	14563486	6.80530465500368e-09	22911915	26872527
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	31	-1.115	6.80530465500368e-09	22911915	26872527	0.00130567035378162	26933862	27000085
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27064654	24	23	-2.1793	0.00130567035378162	26933862	27000085	0.00150183938668646	27006628	27113201
MSK_252152919160_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27067889	57440809	29	29	-0.9725	0.00150183938668646	27006628	27113201	NA	NA	NA
