Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	94060783	34898	33908	0.0038	NA	NA	NA	1.92449778887418e-08	94060783	94060783
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-2.1456	1.92449778887418e-08	94060783	94060783	5.51212819083784e-09	94062928	94064124
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	116029725	6936	6733	0.0038	5.51212819083784e-09	94062928	94064124	8.78319570937345e-24	116029725	116029725
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-3.4201	8.78319570937345e-24	116029725	116029725	1.56280428646991e-23	116033402	116033402
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	247186514	39310	38229	-0.0021	1.56280428646991e-23	116033402	116033402	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11207	0.0092	NA	NA	NA	2.12445098322345e-240	34543992	34551222
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-3.5809	2.12445098322345e-240	34543992	34551222	3.26734399615669e-191	34583814	34589997
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	468	-0.0258	3.26734399615669e-191	34583814	34589997	7.77693855704256e-10	35818921	35821494
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-2.2789	7.77693855704256e-10	35818921	35821494	7.36299973687801e-10	35844884	35844884
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	89231629	18268	17783	-0.0012	7.36299973687801e-10	35844884	35844884	2.66723323821615e-28	89057273	89263354
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89231739	91155301	71	70	-0.6375	2.66723323821615e-28	89057273	89263354	5.57695617145277e-30	91129939	94784165
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91158269	146571330	14709	14321	0.009	5.57695617145277e-30	91129939	94784165	1.18970557286123e-76	146571330	146571330
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.2687	1.18970557286123e-76	146571330	146571330	3.71213747442635e-75	146592775	146592775
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	184501938	12648	12281	8e-04	3.71213747442635e-75	146592775	146592775	7.87218801490102e-65	184501938	184501938
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184505519	184510172	3	3	-4.581	7.87218801490102e-65	184501938	184501938	9.55977339126627e-65	184510172	184510172
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184517600	242689978	20098	19509	0.0125	9.55977339126627e-65	184510172	184510172	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	99891210	32183	31243	0.0086	NA	NA	NA	2.43071430045159e-15	99891210	99891210
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.7783	2.43071430045159e-15	99891210	99891210	4.57406536755896e-15	99897201	99897201
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11190	0.0054	4.57406536755896e-15	99897201	99897201	7.96593520761277e-17	133189686	133189686
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-2.9297	7.96593520761277e-17	133189686	133189686	8.4551255643399e-17	133194685	133194685
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	192546280	19353	18830	4e-04	8.4551255643399e-17	133194685	133194685	3.95692986868293e-57	192546280	192546280
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-4.3351	3.95692986868293e-57	192546280	192546280	7.42394595179724e-57	192550989	192550989
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	199329592	2565	2488	-0.028	7.42394595179724e-57	192550989	192550989	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3302	0.0155	NA	NA	NA	6.43578564127939e-73	9815760	9815760
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.2014	6.43578564127939e-73	9815760	9815760	4.61867476458171e-74	9842644	9842644
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	186676034	50213	48762	0.0038	4.61867476458171e-74	9842644	9842644	4.80103528690196e-16	186676034	186676034
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.8451	4.80103528690196e-16	186676034	186676034	5.04232349247686e-17	186680176	186680176
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1504	6e-04	5.04232349247686e-17	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	32139800	8729	8471	-0.0034	NA	NA	NA	1.92629068676928e-09	32119841	32152945
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32141434	32209048	35	33	0.5414	1.92629068676928e-09	32119841	32152945	5.06316323700836e-09	32194127	32228793
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32210714	137833920	30325	29447	0.004	5.06316323700836e-09	32194127	32228793	1.32368611575500e-44	137833920	137836466
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137836466	137843309	4	4	-3.2872	1.323686115755e-44	137833920	137836466	1.11795755960773e-45	137842107	137843309
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137844931	180644810	14673	14263	0.0084	1.11795755960773e-45	137842107	137843309	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11312	0.0083	NA	NA	NA	4.60642334705406e-08	32539864	32588005
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32626619	13	13	0.8182	4.60642334705406e-08	32539864	32588005	4.14973403165834e-08	32600962	32633691
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32628420	170753106	44427	43143	7e-04	4.14973403165834e-08	32600962	32633691	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	158815157	56694	55096	-0.0021	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158821263	158821263	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	32797545	11193	10854	4e-04	NA	NA	NA	4.22655435234508e-23	32797545	32797545
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32805686	2	2	-3.403	4.22655435234508e-23	32797545	32797545	8.93038603850517e-24	32805686	32805686
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32808049	146264846	33371	32447	0.0082	8.93038603850517e-24	32805686	32805686	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	94830548	20918	20357	-0.0017	NA	NA	NA	5.45735481584753e-08	94827655	94833621
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	94831719	94842494	6	6	-1.1778	5.45735481584753e-08	94827655	94833621	6.53981164264339e-08	94838268	94845369
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	94843753	128192171	12124	11780	-0.0075	6.53981164264339e-08	94838268	94845369	2.66469122102925e-08	128190987	128192171
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128194109	128200634	4	4	-1.4722	2.66469122102925e-08	128190987	128192171	7.15234773489813e-08	128200634	128202559
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128202559	140145683	4892	4729	-0.0139	7.15234773489813e-08	128200634	128202559	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	4696485	1647	1595	0.0335	NA	NA	NA	2.1504295058406e-13	4696485	4696485
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	4696626	4704399	2	2	-2.6054	2.1504295058406e-13	4696485	4696485	4.25309440890626e-13	4704399	4704399
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	4705584	132797428	42223	41064	7e-04	4.25309440890626e-13	4704399	4704399	6.65226783269673e-39	132797428	132797428
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	-4.3744	6.65226783269673e-39	132797428	132797428	1.62083964735611e-33	132801463	132801463
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	917	-0.005	1.62083964735611e-33	132801463	132801463	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5744034	2140	2076	-0.0075	NA	NA	NA	3.44904752438179e-08	5727997	5749258
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5745329	5775970	17	17	-0.7022	3.44904752438179e-08	5727997	5749258	6.13704988812972e-08	5766615	5794170
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5777496	134450318	43147	41940	0.0083	6.13704988812972e-08	5766615	5794170	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	80662066	27341	26535	0.0025	NA	NA	NA	4.56818418832076e-10	80662066	80662066
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-2.3013	4.56818418832076e-10	80662066	80662066	4.52380839739943e-10	80666751	80666751
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	132289090	17818	17311	-0.0027	4.52380839739943e-10	80666751	80666751	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7148	0.0061	NA	NA	NA	4.04237601948188e-42	37953582	37953582
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.5683	4.04237601948188e-42	37953582	37953582	1.19900419787843e-43	37957844	37957844
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	113788788	24152	23476	0.0068	1.19900419787843e-43	37957844	37957844	8.342283740649e-08	113787620	113788788
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	2.0341	8.342283740649e-08	113787620	113788788	5.48326990684989e-08	113792974	113792974
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	146	0.064	5.48326990684989e-08	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	106358491	31885	30974	-3e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	100298352	31322	30454	0.0015	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	25014015	8513	8279	-0.021	NA	NA	NA	2.88737394202327e-09	25014015	25014015
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	25015891	25018098	2	2	-2.1857	2.88737394202327e-09	25014015	25014015	2.60584306536795e-09	25018098	25019582
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	25019582	76345774	12339	12022	-0.0029	2.60584306536795e-09	25018098	25019582	3.16496727782262e-135	76328213	76359883
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76347246	77373888	502	493	0.519	3.16496727782262e-135	76328213	76359883	1.04061375050569e-122	77352114	77388697
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77375743	88690571	4301	4199	-0.0042	1.04061375050569e-122	77352114	77388697	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13500	-0.009	NA	NA	NA	6.30193616608698e-16	36672710	36673853
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.5986	6.30193616608698e-16	36672710	36673853	9.51429921459403e-17	36684619	36686013
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41521544	2012	1951	0.0046	9.51429921459403e-17	36684619	36686013	1.62224627375887e-21	41506317	41535779
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	42151941	71	69	-0.533	1.62224627375887e-21	41506317	41535779	2.31801564023857e-18	41708551	42170272
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13268	-0.0127	2.31801564023857e-18	41708551	42170272	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22313	-0.0029	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	40540618	12693	12326	-0.0321	NA	NA	NA	4.46971875011311e-22	40540618	40540618
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-2.7312	4.46971875011311e-22	40540618	40540618	1.28374987244321e-22	40553315	40553315
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	63788698	10363	10091	-0.006	1.28374987244321e-22	40553315	40553315	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	62419534	21579	20991	0.002	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13056	-0.0032	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	35472378	9551	9288	-6e-04	NA	NA	NA	6.79176002868616e-10	35469770	35472378
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.2704	6.79176002868616e-10	35469770	35472378	1.43936216544694e-10	35476942	35476942
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37689058	1212	1191	0.0166	1.43936216544694e-10	35476942	35476942	4.53597565604603e-12	37683516	37691481
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37690142	37715385	15	14	-0.9091	4.53597565604603e-12	37683516	37691481	1.68642866374843e-10	37709300	37725321
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5610	-0.0123	1.68642866374843e-10	37709300	37725321	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.1141	NA	NA	NA	6.63365100258567e-05	3237	94062
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.3432	6.63365100258567e-05	3237	94062	1.81539450671816e-38	104732	104732
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	16	0.1089	1.81539450671816e-38	104732	104732	2.86024842599847e-14	124528	124528
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	1.25	2.86024842599847e-14	124528	124528	4.10540939850265e-09	130528	132689
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2708291	1759	1715	-0.0112	4.10540939850265e-09	130528	132689	7.98263940720775e-09	2706218	2712641
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	2734440	10	10	0.8681	7.98263940720775e-09	2706218	2712641	1.01720089331664e-05	2726260	2742851
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2736584	2751284	8	8	-0.1567	1.01720089331664e-05	2726260	2742851	7.13073317647982e-05	2747802	2769568
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2754701	154578922	45115	43841	0.8691	7.13073317647982e-05	2747802	2769568	1.43502485972654e-108	154561606	154599547
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154888224	202	195	-0.0223	1.43502485972654e-108	154561606	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-2.9156	NA	NA	NA	7.15215171659232e-09	2969891	3773948
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.0385	7.15215171659232e-09	2969891	3773948	4.27958673951619e-06	5422507	6730882
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	114	-2.817	4.27958673951619e-06	5422507	6730882	5.52799376951995e-05	6902863	7034323
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7653082	216	211	-2.1118	5.52799376951995e-05	6902863	7034323	5.24475441019484e-06	7386947	7782532
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	10511255	489	473	-2.6526	5.24475441019484e-06	7386947	7782532	5.56157443093666e-10	10492142	10513747
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10512616	12452734	22	22	-0.8741	5.56157443093666e-10	10492142	10513747	1.07900415173925e-19	11698871	12502304
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.6453	1.07900415173925e-19	11698871	12502304	1.95737033997840e-05	12537944	12557151
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	13129843	190	185	-1.7417	1.9573703399784e-05	12537944	12557151	4.80771366539569e-28	13090512	13153117
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14508021	504	490	-2.8894	4.80771366539569e-28	13090512	13153117	7.21581439417004e-08	14502379	14528771
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	7.21581439417004e-08	14502379	14528771	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	12	-0.8392	NA	NA	NA	1.85251156149036e-05	14539230	14561228
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	15911389	429	416	-2.7181	1.85251156149036e-05	14539230	14561228	0.00256799315465307	15557173	16039703
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15915466	15915466	1	0	NA	0.00256799315465307	15557173	16039703	NA	NA	NA
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16175250	102	102	-2.1557	NA	NA	NA	4.76020891106539e-06	16082040	16290147
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16176562	22139807	998	963	-2.8269	4.76020891106539e-06	16082040	16290147	9.29133714703664e-06	22051284	22157319
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-0.7423	9.29133714703664e-06	22051284	22157319	1.39806091963185e-07	22177335	22182080
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	93	-3.0431	1.39806091963185e-07	22177335	22182080	2.91889887170344e-15	22924754	26872527
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	31	-1.1587	2.91889887170344e-15	22924754	26872527	4.33711328420587e-06	26938967	26945893
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.3231	4.33711328420587e-06	26938967	26945893	0.00066530681348728	26965406	26995399
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	12	-1.4768	0.00066530681348728	26965406	26995399	5.24212254556485e-05	27009433	27019256
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.6511	5.24212254556485e-05	27009433	27019256	1.54119361410281e-09	27039222	27053237
MSK_252152919161_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	32	-0.9088	1.54119361410281e-09	27039222	27053237	NA	NA	NA
