Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26911	0.0057	NA	NA	NA	4.6832362517346e-13	72534975	72541443
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	0.6805	4.6832362517346e-13	72534975	72541443	9.54912288460336e-14	72568009	72596993
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6748	0.005	9.54912288460336e-14	72568009	72596993	6.07683221293084e-20	94060783	94060783
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-2.0517	6.07683221293084e-20	94060783	94060783	1.12705964907815e-19	94062928	94062928
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	109987341	4696	4526	0.0035	1.12705964907815e-19	94062928	94062928	2.09233268340552e-10	109987341	109987341
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-1.511	2.09233268340552e-10	109987341	109987341	5.59596244521704e-10	109989998	109989998
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	150839754	5870	5649	-0.0021	5.59596244521704e-10	109989998	109989998	5.22795624885187e-108	150839754	150841957
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-2.8036	5.22795624885187e-108	150839754	150841957	7.7388512219823e-110	150847304	150851439
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	167483267	6871	6643	0.0024	7.7388512219823e-110	150847304	150851439	1.20762782877967e-189	167483267	167483267
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-3.1791	1.20762782877967e-189	167483267	167483267	1.69368546852086e-195	167507898	167507898
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	247186514	28794	27825	0.0013	1.69368546852086e-195	167507898	167507898	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11159	8e-04	NA	NA	NA	1.76153101946358e-10	34524344	34561038
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34597294	21	20	-0.481	1.76153101946358e-10	34524344	34561038	4.63697271639736e-09	34575366	34610922
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34599239	37752538	1342	1299	-0.015	4.63697271639736e-09	34575366	34610922	7.55687459383396e-09	37737511	37760672
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37753711	37789939	19	19	0.456	7.55687459383396e-09	37737511	37760672	1.15803613048495e-14	37787637	37797909
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37854350	26	26	-0.4935	1.15803613048495e-14	37787637	37797909	3.28666966671381e-14	37839335	37863712
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37855837	50770002	5197	4999	-0.0035	3.28666966671381e-14	37839335	37863712	6.05431828397514e-113	50767803	50771952
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50771952	50900912	64	63	-0.8749	6.05431828397514e-113	50767803	50771952	1.38056505990530e-117	50895804	50903149
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50903149	106244482	15719	15158	0.0019	1.3805650599053e-117	50895804	50903149	1.65606820399337e-19	106244482	106244482
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-2.0326	1.65606820399337e-19	106244482	106244482	2.59249578559717e-19	106250718	106250718
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	242689978	43915	42355	0.0026	2.59249578559717e-19	106250718	106250718	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10396	0.0044	NA	NA	NA	1.97759815332873e-27	32074432	32074432
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-2.3753	1.97759815332873e-27	32074432	32074432	2.68934830390403e-28	32080848	32080848
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1815	6e-04	2.68934830390403e-28	32080848	32080848	5.99409845782277e-09	37949781	37953375
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.784	5.99409845782277e-09	37949781	37953375	5.5638614998392e-08	37961110	37963736
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	164005577	40804	39298	7e-04	5.5638614998392e-08	37961110	37963736	8.30165914811809e-14	164001657	164005577
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.1007	8.30165914811809e-14	164001657	164005577	3.79385299366284e-14	164027724	164036648
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11736	4e-04	3.79385299366284e-14	164027724	164036648	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3267	0.0116	NA	NA	NA	5.29728393750064e-182	9815760	9815760
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.3161	5.29728393750064e-182	9815760	9815760	2.20250956740996e-186	9842644	9842644
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14456	-0.0011	2.20250956740996e-186	9842644	9842644	3.73121785305069e-10	68897538	69085386
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	0.5784	3.73121785305069e-10	68897538	69085386	3.81594323776256e-10	69153675	69665979
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	87193253	5920	5710	0.0051	3.81594323776256e-10	69153675	69665979	3.05182511167292e-36	87193253	87193253
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87196350	87198840	2	2	-2.696	3.05182511167292e-36	87193253	87193253	2.24759241056580e-35	87198840	87198840
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87201443	186676034	29241	28249	0.0018	2.2475924105658e-35	87198840	87198840	9.25819288590674e-16	186676034	186676034
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-1.8285	9.25819288590674e-16	186676034	186676034	4.03672485494358e-15	186680176	186680176
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1503	-0.0035	4.03672485494358e-15	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	8750027	2603	2499	3e-04	NA	NA	NA	8.2566649604415e-11	8744438	8750027
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.9049	8.2566649604415e-11	8744438	8750027	3.61612785550051e-11	8800001	8809384
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	115836233	29691	28699	-0.0014	3.61612785550051e-11	8800001	8809384	1.18972742108843e-54	115829211	115844749
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	115838907	116108460	96	92	0.4931	1.18972742108843e-54	115829211	115844749	3.83291548677077e-51	116096290	116143161
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	116111045	140193383	7678	7436	0.0042	3.83291548677077e-51	116096290	116143161	1.00358913752480e-11	140190643	140193383
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140195260	140201609	5	5	-1.016	1.0035891375248e-11	140190643	140193383	1.00283628727509e-11	140201609	140203440
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	180342860	13567	13107	0.0044	1.00283628727509e-11	140201609	140203440	4.68415898377395e-14	180194323	180342860
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.8829	4.68415898377395e-14	180194323	180342860	9.42636317893056e-14	180358977	180364670
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180362342	1	0	NA	9.42636317893056e-14	180358977	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	103	-0.0673	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11275	0.0056	NA	NA	NA	2.13798451338448e-98	32558677	32563252
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	10	-2.0268	2.13798451338448e-98	32558677	32563252	0.00397416968706639	32590568	32628420
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32633691	7	7	-0.8725	0.00397416968706639	32590568	32628420	3.30918797253444e-12	32613538	32634977
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	67060622	11069	10657	0.0027	3.30918797253444e-12	32613538	32634977	6.95685460629213e-08	67043365	67060622
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67111812	8	8	-0.6638	6.95685460629213e-08	67043365	67060622	2.68095567967868e-08	67111812	67117470
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67113676	74647491	2509	2422	0.0072	2.68095567967868e-08	67111812	67117470	7.2281564264232e-73	74647491	74647491
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-3.8578	7.2281564264232e-73	74647491	74647491	1.71632742700010e-77	74653360	74653360
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	77490500	860	832	0.0101	1.7163274270001e-77	74653360	74653360	5.11828593715756e-85	77490500	77490500
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-3.2989	5.11828593715756e-85	77490500	77490500	9.15216429956812e-79	77509983	77509983
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	103841482	7054	6812	0.0036	9.15216429956812e-79	77509983	77509983	1.14353958941577e-47	103841482	103841482
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-2.2285	1.14353958941577e-47	103841482	103841482	2.02470441022529e-48	103868154	103868154
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10093	0.002	2.02470441022529e-48	103868154	103868154	1.19597258124258e-06	134627341	134629897
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	1.19597258124258e-06	134627341	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.9964	NA	NA	NA	2.42538568381138e-07	134635779	134639397
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	139643729	1896	1831	-0.0081	2.42538568381138e-07	134635779	134639397	1.52201389491301e-09	139641158	139643729
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-1.1274	1.52201389491301e-09	139641158	139643729	2.70871129708948e-08	139648318	139651247
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8419	-0.0091	2.70871129708948e-08	139648318	139651247	2.26261679016104e-40	165643653	165643653
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.06	2.26261679016104e-40	165643653	165643653	3.69922992238049e-37	165650610	165650610
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1736	-0.0163	3.69922992238049e-37	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	38269153	13603	13107	0.0032	NA	NA	NA	1.34428676330532e-29	38262701	38277728
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38270942	38318910	26	25	-0.7143	1.34428676330532e-29	38262701	38277728	6.06882442707822e-31	38310399	38325369
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38320617	38320617	1	0	NA	6.06882442707822e-31	38310399	38325369	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38323325	110802713	22043	21226	0.0048	NA	NA	NA	9.75012803399447e-36	110800031	110806988
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110805032	110844105	19	19	-0.8795	9.75012803399447e-36	110800031	110806988	3.40226245444911e-34	110841345	110845825
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110845825	118609124	3572	3446	-0.0074	3.40226245444911e-34	110841345	110845825	1.18294033986355e-19	118609124	118609124
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118611324	118620875	4	4	1.4378	1.18294033986355e-19	118609124	118609124	4.18229972964174e-19	118620875	118620875
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141410894	10535	10143	0.0029	4.18229972964174e-19	118620875	118620875	5.4864449811953e-10	141406414	141419692
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.6123	5.4864449811953e-10	141406414	141419692	9.39136947832777e-10	141432778	141443577
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	147702365	2639	2549	-0.009	9.39136947832777e-10	141432778	141443577	6.36201488539063e-07	147697712	147702365
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147708382	3	3	-1.0631	6.36201488539063e-07	147697712	147702365	5.11725856644361e-07	147708382	147710037
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	151728811	1629	1573	-0.012	5.11725856644361e-07	147708382	147710037	1.90469921391943e-06	151686560	151735783
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151747905	10	10	-0.5676	1.90469921391943e-06	151686560	151735783	9.0436911004073e-07	151739173	151756837
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151750057	158821263	2598	2521	-0.0128	9.0436911004073e-07	151739173	151756837	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	6926661	2391	2304	0.0056	NA	NA	NA	6.64055632152642e-15	6907624	7156900
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	8137794	11	11	-0.7647	6.64055632152642e-15	6907624	7156900	4.93734523749294e-15	7824059	8143301
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8139999	122398671	34593	33332	0.0015	4.93734523749294e-15	7824059	8143301	6.94433293396696e-10	122352766	122406769
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122406769	122486046	15	13	0.583	6.94433293396696e-10	122352766	122406769	9.6787670586934e-10	122481289	122507197
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122490361	146264846	7556	7266	0.0011	9.6787670586934e-10	122481289	122507197	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	1404267	517	496	-0.0037	NA	NA	NA	1.94816739567836e-40	1401750	1409154
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	1407195	1475813	22	22	-0.8896	1.94816739567836e-40	1401750	1409154	1.35742096819205e-46	1467660	1478393
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	1478393	4892878	1292	1236	0.0236	1.35742096819205e-46	1467660	1478393	1.89634934711062e-35	4885956	4894693
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4894693	4955465	18	18	-0.8535	1.89634934711062e-35	4885956	4894693	4.15130256177711e-30	4936528	4956891
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4956891	15802255	3608	3457	0.0014	4.15130256177711e-30	4936528	4956891	2.25824428902705e-09	15802255	15802255
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.4573	2.25824428902705e-09	15802255	15802255	2.33332323087497e-10	15807123	15807123
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2287	-0.0052	2.33332323087497e-10	15807123	15807123	1.37248256225020e-36	22477358	22477358
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-2.7051	1.3724825622502e-36	22477358	22477358	2.33256927610651e-35	22492603	22492603
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5036	-1e-04	2.33256927610651e-35	22492603	22492603	8.9464700816044e-69	70926188	70926188
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.7576	8.9464700816044e-69	70926188	70926188	7.53880855907506e-67	70930528	70930528
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	70935055	1	0	NA	7.53880855907506e-67	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70939069	138250679	24121	23269	-0.006	NA	NA	NA	6.22656160377097e-09	138246907	138250679
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138252639	138253816	2	2	-1.4373	6.22656160377097e-09	138246907	138250679	1.64597898681243e-06	138253816	138255962
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138255962	140145683	746	705	-0.0312	1.64597898681243e-06	138253816	138255962	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23735	-0.0019	NA	NA	NA	6.10121531522843e-40	77917893	77917893
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.9074	6.10121531522843e-40	77917893	77917893	1.08597852950778e-37	77928669	77928669
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	82866553	1495	1443	0.005	1.08597852950778e-37	77928669	77928669	9.21108413557544e-221	82866553	82866553
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82869426	82881204	6	6	-4.086	9.21108413557544e-221	82866553	82866553	9.90957347881842e-239	82881204	82881204
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	135285645	18713	18042	-0.002	9.90957347881842e-239	82881204	82881204	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	134450318	45304	43718	5e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	889	0.0014	NA	NA	NA	1.93964010048994e-06	2103711	2118376
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.6254	1.93964010048994e-06	2103711	2118376	3.4590404489207e-06	2120968	2131554
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	9523923	2815	2709	0.0015	3.4590404489207e-06	2120968	2131554	1.24997783544081e-13	9456107	9531133
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	0.671	1.24997783544081e-13	9456107	9531133	5.76611665734205e-13	9589725	9607363
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	132289090	41406	39958	0.0021	5.76611665734205e-13	9589725	9607363	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	34578806	6015	5805	-0.0092	NA	NA	NA	1.75676052239964e-09	34566316	34587106
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34580008	34613316	17	17	0.4793	1.75676052239964e-09	34566316	34587106	9.68849181945235e-09	34601014	34624187
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34614409	56646284	7992	7697	-1e-04	9.68849181945235e-09	34601014	34624187	1.34725498459185e-08	56596626	56660235
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56650373	56708261	23	23	0.4085	1.34725498459185e-08	56596626	56660235	3.89390364006676e-08	56691355	56755838
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56711774	71375082	3616	3498	0.0165	3.89390364006676e-08	56691355	56755838	3.05012435251593e-88	71375082	71375082
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.2226	3.05012435251593e-88	71375082	71375082	2.16721989405375e-85	71377671	71377671
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114118270	13978	13465	-0.0019	2.16721989405375e-85	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114123340	114123340	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	21501507	1038	994	-0.0034	NA	NA	NA	3.25625065793877e-80	21485351	21511829
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21503195	22032374	263	251	-0.433	3.25625065793877e-80	21485351	21511829	2.86130628542295e-110	22017734	22041571
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22034704	105632168	30353	29279	-0.001	2.86130628542295e-110	22017734	22041571	1.40393381587231e-23	105622008	105736025
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105848335	47	45	0.4762	1.40393381587231e-23	105622008	105736025	2.78215250530084e-09	105846004	105856972
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105850033	105875924	6	6	-0.5123	2.78215250530084e-09	105846004	105856972	0.0363639811986186	105856591	105917286
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	171	-0.0186	0.0363639811986186	105856591	105917286	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.0188	NA	NA	NA	7.414937009514e-10	18692865	18741716
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20088256	150	147	0.9397	7.414937009514e-10	18692865	18741716	2.12452877067090e-314	20079935	20308014
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	100298352	31166	30093	-0.005	2.12452877067090e-314	20079935	20308014	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34333833	10710	10337	0.0079	NA	NA	NA	5.58537565921099e-15	34302966	34347190
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34339543	34552260	39	37	0.4338	5.58537565921099e-15	34302966	34347190	1.17938028063302e-15	34539890	34574587
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34556917	75093957	9774	9407	0.0045	1.17938028063302e-15	34539890	34574587	8.73327527998507e-08	75092501	75097331
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.0902	8.73327527998507e-08	75092501	75097331	1.77486753234623e-07	75099083	75102639
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4940	-0.0129	1.77486753234623e-07	75099083	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11628	0.0061	NA	NA	NA	1.83921777691762e-08	31436580	31468896
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.455	1.83921777691762e-08	31436580	31468896	2.68708952870965e-08	31492553	31898606
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1744	-8e-04	2.68708952870965e-08	31492553	31898606	1.32452259530568e-19	36673853	36675987
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	4	-1.4614	1.32452259530568e-19	36673853	36675987	6.43441796823079e-20	36682031	36683509
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1926	0.0203	6.43441796823079e-20	36682031	36683509	4.04701283501565e-26	41506317	41533641
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41704093	64	62	0.4558	4.04701283501565e-26	41506317	41533641	4.26397550093181e-29	41644979	42142363
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41706870	78653545	13682	13218	0.0024	4.26397550093181e-29	41644979	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22135	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	208	0.0177	NA	NA	NA	3.60945788874363e-07	790492	790526
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	-1.3835	3.60945788874363e-07	790492	790526	7.12823854195152e-08	794978	798817
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	259	8e-04	7.12823854195152e-08	794978	798817	4.28832901150979e-10	1398325	1398325
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.5628	4.28832901150979e-10	1398325	1398325	2.70848966789927e-10	1400840	1400840
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	20841320	8828	8527	0.0204	2.70848966789927e-10	1400840	1400840	3.37581813103580e-09	20809612	20865349
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20900139	16	16	-0.4976	3.3758181310358e-09	20809612	20865349	5.62074933134162e-09	20883588	20913550
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20901410	55769042	10017	9684	0.0174	5.62074933134162e-09	20883588	20913550	7.20095281341181e-47	55769042	55769042
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-3.2044	7.20095281341181e-47	55769042	55769042	8.98086096017744e-44	55772729	55772729
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	63682646	3652	3518	0.0149	8.98086096017744e-44	55772729	55772729	8.86487710520627e-08	63680032	63682646
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63684364	63691596	4	4	-0.9732	8.86487710520627e-08	63680032	63682646	7.8368359109393e-08	63691069	63694462
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63694462	63788698	46	45	-0.0257	7.8368359109393e-08	63691069	63694462	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499034	584	562	-0.0062	NA	NA	NA	4.67266533396951e-11	1493655	1515948
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1499421	1499421	1	0	NA	4.67266533396951e-11	1493655	1515948	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1532433	11	10	0.7128	NA	NA	NA	2.00088129703033e-11	1521410	1546858
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20253	-0.0035	2.00088129703033e-11	1521410	1546858	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12987	-0.0013	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2879	-0.0069	NA	NA	NA	7.26115444974436e-90	22667608	22667608
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22679305	2	2	-4.5359	7.26115444974436e-90	22667608	22667608	9.0094449048329e-06	22679305	22682428
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22682428	22715919	16	16	-1.6455	9.0094449048329e-06	22679305	22682428	0.00123255529726210	22712211	22715919
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22718614	22720195	2	2	-3.6782	0.0012325552972621	22712211	22715919	1.01215102765478e-62	22720195	22720195
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6305	0.0073	1.01215102765478e-62	22720195	22720195	2.55953657732412e-60	35472378	35472378
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.6085	2.55953657732412e-60	35472378	35472378	2.09070733967889e-59	35476942	35476942
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6766	0.0017	2.09070733967889e-59	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2708291	1793	1736	0.03	NA	NA	NA	0	2708113	2712641
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22112	0.8852	0	2708113	2712641	1.28588222005889e-35	76998610	76998610
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.0862	1.28588222005889e-35	76998610	76998610	2.61672831523792e-35	77010018	77010018
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154578922	22192	21424	0.8843	2.61672831523792e-35	77010018	77010018	8.04182317819706e-309	154570196	154582414
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154888224	202	194	-0.0015	8.04182317819706e-309	154570196	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-2.9693	NA	NA	NA	2.22502715366219e-16	3034907	3733715
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5531459	15	15	-0.8729	2.22502715366219e-16	3034907	3733715	4.7724808882045e-09	5422507	6692482
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5593746	6992372	136	131	-2.7103	4.7724808882045e-09	5422507	6692482	0.00231728914457759	6912779	7193174
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6993680	7653082	199	190	-2.1734	0.00231728914457759	6912779	7193174	0.000481910063077996	7296153	7788596
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	10501368	485	472	-2.5946	0.000481910063077996	7296153	7788596	1.73500288442286e-10	10472399	10513747
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10503821	12452734	26	26	-1.1593	1.73500288442286e-10	10472399	10513747	1.06963047909830e-10	11660512	12452734
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.648	1.0696304790983e-10	11660512	12452734	8.61826823899277e-10	12541506	12550566
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-1.6617	8.61826823899277e-10	12541506	12550566	5.6611431573827e-07	12638022	12721434
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.0249	5.6611431573827e-07	12638022	12721434	0.000203071919574506	12792780	12888523
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13129843	113	110	-1.8044	0.000203071919574506	12792780	12888523	0.0350250758789112	13019119	13165652
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13230706	32	30	-2.5572	0.0350250758789112	13019119	13165652	0.122901374591269	13150942	13445263
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13232295	13816133	212	203	-2.9846	0.122901374591269	13150942	13445263	0.00021848382995068	13777254	13828384
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13820955	13863657	10	9	-1.3432	0.00021848382995068	13777254	13828384	3.75756144237042e-08	13854528	13869106
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	120	-3.2033	3.75756144237042e-08	13854528	13869106	1.96918853352744e-09	14095118	14331599
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14705886	181	176	-2.4082	1.96918853352744e-09	14095118	14331599	0.0143048056199542	14473497	15143138
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14707011	15915466	389	370	-2.7765	0.0143048056199542	14473497	15143138	0.00360342495629267	15719904	15958396
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16007396	34	31	-1.9474	0.00360342495629267	15719904	15958396	0.000744075169300616	15974702	16042966
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16015301	16102267	44	42	-2.8538	0.000744075169300616	15974702	16042966	0.00135239172945887	16067790	16163786
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16103913	16214032	47	45	-2.0515	0.00135239172945887	16067790	16163786	1.32351734865859e-05	16191571	16343057
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16215750	22139807	975	949	-2.8911	1.32351734865859e-05	16191571	16343057	7.76606617998059e-07	22052726	22157319
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-0.8577	7.76606617998059e-07	22052726	22157319	8.33341219380715e-17	22177335	22178964
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22268552	29	28	-3.2353	8.33341219380715e-17	22177335	22178964	0.00313829295958679	22243796	22791720
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22876519	45	43	-2.4466	0.00313829295958679	22243796	22791720	0.0119282022316374	22821878	22908342
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22877495	22877495	1	0	NA	0.0119282022316374	22821878	22908342	NA	NA	NA
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22924754	16	15	-3.3469	NA	NA	NA	6.97787937396808e-10	22923722	25737663
MSK_252152920020_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22926726	57440809	88	83	-1.3624	6.97787937396808e-10	22923722	25737663	NA	NA	NA
