Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	63658749	24350	23772	-0.0119	NA	NA	NA	0	63648251	63677487
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	63665115	72537426	3544	3472	-0.6394	0	63648251	63677487	2.09623374383686e-26	72536231	72543019
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-1.9559	2.09623374383686e-26	72536231	72543019	1.27796049186283e-26	72567555	72589682
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	81953752	2879	2805	-0.6322	1.27796049186283e-26	72567555	72589682	8.263177974103e-07	81950446	81953752
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	81955492	81966459	4	4	-1.9091	8.263177974103e-07	81950446	81953752	9.91134065413608e-07	81966459	81970335
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	81968098	86385680	1433	1389	-0.6486	9.91134065413608e-07	81966459	81970335	0	86377680	86392294
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86387739	108533257	6812	6662	0.0954	0	86377680	86392294	1.05235147823778e-26	108533257	108535814
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-2.7767	1.05235147823778e-26	108533257	108535814	6.90538907949469e-26	108537259	108538662
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	150823073	6426	6272	0.0707	6.90538907949469e-26	108537259	108538662	4.13136024619945e-19	150819879	150836484
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	1.4155	4.13136024619945e-19	150819879	150836484	1.58465000533137e-184	150847304	150857070
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	195009358	16060	15741	0.1569	1.58465000533137e-184	150847304	150857070	2.45953655734989e-182	194977713	195011344
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-1.0021	2.45953655734989e-182	194977713	195011344	1.22952230354097e-09	195048208	195095156
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	231874748	13669	13348	0.0671	1.22952230354097e-09	195048208	195095156	0	231858439	231902310
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231876686	247186514	5936	5805	0.5254	0	231858439	231902310	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	43934924	15467	15095	0.1957	NA	NA	NA	7.3471132620824e-254	43934924	43934924
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43937215	43949625	6	6	-1.5692	7.3471132620824e-254	43934924	43934924	1.54834093822344e-11	43944524	43955033
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43953461	55851078	4438	4322	-0.2314	1.54834093822344e-11	43944524	43955033	1.08846474318411e-15	55778264	55941266
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55859549	55859549	1	0	NA	1.08846474318411e-15	55778264	55941266	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55866999	56053257	73	72	-0.6829	NA	NA	NA	1.87220196183445e-52	56043718	56066121
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	56056655	99613263	11827	11578	-0.1923	1.87220196183445e-52	56043718	56066121	0	99591870	99627358
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99615677	146571330	13262	12963	0.3099	0	99591870	99627358	5.15553157632105e-39	146571330	146571330
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-2.6576	5.15553157632105e-39	146571330	146571330	5.26461856240764e-184	146592775	146592775
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	227102465	26849	26226	0.2623	5.26461856240764e-184	146592775	146592775	4.19547516913911e-182	227006212	227117188
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227104457	227175009	20	20	0.7591	4.19547516913911e-182	227006212	227117188	1.38167675875148e-10	227152192	227204501
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227180643	242689978	5880	5748	0.0366	1.38167675875148e-10	227152192	227204501	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	11383299	4087	3972	0.1167	NA	NA	NA	3.22190427592284e-61	11381714	11383299
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-1.7578	3.22190427592284e-61	11381714	11383299	1.63433423355133e-12	11389624	11389624
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	17464363	2376	2324	0.1945	1.63433423355133e-12	11389624	11389624	6.18507889610418e-07	17462705	17464363
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17474742	17477587	3	3	-1.2796	6.18507889610418e-07	17462705	17464363	5.91556161018532e-07	17477587	17479703
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17479703	25913087	2576	2501	0.2404	5.91556161018532e-07	17477587	17479703	5.66689897242729e-49	25901612	25913087
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	25918611	26035686	15	15	-1.5109	5.66689897242729e-49	25901612	25913087	0	26035686	26045918
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	26045918	85844787	20653	20244	-0.0075	0	26035686	26045918	0	85839850	85846763
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85846763	85864354	11	11	-0.9584	0	85839850	85846763	0	85862343	85872096
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85865803	164005577	23767	23224	-0.0929	0	85862343	85872096	0	164001657	164012645
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	-1.4852	0	164001657	164012645	1.28602485495646e-10	164019640	164027724
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164189606	41	38	0.1441	1.28602485495646e-10	164019640	164027724	8.68332978266165e-05	164174637	164189606
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164193105	164208172	4	4	1.2176	8.68332978266165e-05	164174637	164189606	2.17792547962752e-83	164208172	164225424
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164211689	192546280	9523	9300	0.2777	2.17792547962752e-83	164208172	164225424	4.17936995160782e-84	192546280	192546280
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-2.8622	4.17936995160782e-84	192546280	192546280	3.28473401772983e-41	192552734	192552734
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	199329592	2564	2499	0.2748	3.28473401772983e-41	192552734	192552734	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	-0.9312	NA	NA	NA	3.09803514720901e-07	53781	84450
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	64376590	17342	16968	-0.2374	3.09803514720901e-07	53781	84450	3.37863721968715e-22	64376590	64376590
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-3.3748	3.37863721968715e-22	64376590	64376590	0	64390333	64390333
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	176558200	33388	32677	-0.3089	0	64390333	64390333	0	176531153	176570719
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	176561846	187330240	3177	3110	-1.2681	0	176531153	176570719	2.90239755185864e-07	187329037	187330240
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187335827	3	3	0.349	2.90239755185864e-07	187329037	187330240	6.11499455390398e-07	187335827	187346058
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187338465	191153613	1240	1205	-1.2679	6.11499455390398e-07	187335827	187346058	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	56310412	15133	14796	0.1077	NA	NA	NA	0	56303993	56318118
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56312254	76116640	5765	5652	-0.653	0	56303993	56318118	6.16306489547777e-18	76108175	76122105
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76120297	76170329	23	23	0.1945	6.16306489547777e-18	76108175	76122105	0	76161167	76204764
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76172220	180348365	32728	32000	-0.3189	0	76161167	76204764	0	180346557	180348365
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180351118	180358977	5	5	1.1295	0	180346557	180348365	8.36533953890373e-16	180358977	180358977
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	106	-0.3525	8.36533953890373e-16	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	318496	97	94	0.3708	NA	NA	NA	1.63476349349974e-100	299520	334423
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	320854	24415871	8177	7996	0.8958	1.63476349349974e-100	299520	334423	9.77426240731285e-89	24386454	24440173
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	24419425	24482416	29	29	0.3979	9.77426240731285e-89	24386454	24440173	1.93905053182826e-05	24460495	24517596
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	24484400	29361684	2035	1996	0.8483	1.93905053182826e-05	24460495	24517596	0	29360222	29363229
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29363229	32711957	1383	1357	-0.5866	0	29360222	29363229	1.43790922460449e-17	32707427	32728285
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32739800	15	15	-1.6721	1.43790922460449e-17	32707427	32728285	2.80243354920644e-18	32723722	32745036
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	43668490	4610	4508	-0.6256	2.80243354920644e-18	32723722	32745036	0	43650827	43680292
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	43669796	54495275	3823	3741	-0.0911	0	43650827	43680292	0	54449893	54547779
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54499608	74442268	5022	4890	0.3631	0	54449893	54547779	0	74425705	74462201
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74445844	110216570	10200	9971	0.9796	0	74425705	74462201	0	110214152	110218835
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110218835	134714741	8327	8145	-0.5449	0	110214152	110218835	2.36191472780217e-162	134704480	134714741
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134721598	134735126	4	4	-1.8512	2.36191472780217e-162	134704480	134714741	7.84764160383732e-07	134735126	134736933
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134736933	139643729	1861	1817	-0.6118	7.84764160383732e-07	134735126	134736933	2.36711417929001e-19	139643729	139643729
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-2.9704	2.36711417929001e-19	139643729	139643729	4.6735949120769e-18	139648318	139648318
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8547	-0.6133	4.6735949120769e-18	139648318	139648318	1.43383203264674e-16	165642393	165643653
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.3455	1.43383203264674e-16	165642393	165643653	1.20172376555151e-16	165650610	165653315
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1748	-0.6268	1.20172376555151e-16	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	100170227	31063	30373	-0.4693	NA	NA	NA	7.97885077099822e-309	100164752	100170227
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100171204	100174991	2	2	-2.4274	7.97885077099822e-309	100164752	100170227	0	100174991	100174991
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	130644514	13674	13333	-0.3234	0	100174991	100174991	0	130641114	130660277
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	130658355	130717089	27	27	-1.3766	0	130641114	130660277	8.65895604959569e-212	130716602	130722928
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	130721709	158821263	11928	11644	-0.1225	8.65895604959569e-212	130716602	130722928	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	724	-0.6422	NA	NA	NA	4.88238601203278e-79	2234351	2234351
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-5.3263	4.88238601203278e-79	2234351	2234351	0	2251011	2251011
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	40892587	12833	12575	-0.3942	0	2251011	2251011	0	40888127	40892587
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-2.354	0	40888127	40892587	8.19263639421311e-181	40897469	40897469
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	87895349	12489	12217	0.0069	8.19263639421311e-181	40897469	40897469	1.89786501132269e-192	87873080	87908694
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87901664	87986451	34	34	-0.8041	1.89786501132269e-192	87873080	87908694	2.90171523124161e-106	87984054	87991848
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87988224	104846548	5699	5569	0.0146	2.90171523124161e-106	87984054	87991848	0	104843799	104853131
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	104848310	146264846	12768	12487	1.0078	0	104843799	104853131	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	11611097	4119	4016	-0.6484	NA	NA	NA	6.25890040260509e-48	11611097	11611097
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11622688	11667942	7	7	-3.1341	6.25890040260509e-48	11611097	11611097	2.90800631392715e-74	11667942	11667942
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11674649	112062107	22720	22227	-0.6554	2.90800631392715e-74	11667942	11667942	2.33370442561846e-70	112062107	112062107
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-3.3243	2.33370442561846e-70	112062107	112062107	1.14598073193116e-29	112069192	112069192
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	140145683	11096	10858	-0.2562	1.14598073193116e-29	112069192	112069192	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9526	0.0659	NA	NA	NA	1.67782822342496e-38	27038538	27038538
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.0367	1.67782822342496e-38	27038538	27038538	9.65633245461042e-28	27041812	27041812
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14542	0.0686	9.65633245461042e-28	27041812	27041812	2.77936321692044e-23	77917893	77917893
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.6673	2.77936321692044e-23	77917893	77917893	5.72121989302378e-16	77928669	77928669
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19762	0.0615	5.72121989302378e-16	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1728	-0.6275	NA	NA	NA	6.1655942875759e-13	4920907	4929502
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-2.351	6.1655942875759e-13	4920907	4929502	4.47978055733479e-137	4931000	4934594
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	15515417	4268	4165	-0.538	4.47978055733479e-137	4931000	4934594	1.34755740071176e-161	15488704	15535392
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	15523459	15877982	58	58	0.369	1.34755740071176e-161	15488704	15535392	5.08975034999501e-26	15852675	15912594
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	15888591	19533104	1515	1488	-0.242	5.08975034999501e-26	15852675	15912594	3.96688110019121e-58	19521121	19549905
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	19535489	19535489	1	0	NA	3.96688110019121e-58	19521121	19549905	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	19537776	19909790	187	180	0.3	NA	NA	NA	7.32959793477435e-48	19898860	19924636
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	19913382	21222495	556	544	-0.2574	7.32959793477435e-48	19898860	19924636	1.57427228461465e-97	21212892	21234622
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	21224430	22851927	463	453	0.3368	1.57427228461465e-97	21212892	21234622	5.34445912144744e-60	22835864	22869778
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	22854579	24189227	205	198	-0.2882	5.34445912144744e-60	22835864	22869778	1.13308694753418e-53	24153052	24241551
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	24204748	25847570	445	436	0.3062	1.13308694753418e-53	24153052	24241551	3.80494332897356e-68	25788766	25896241
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25853331	27770690	604	595	-0.1939	3.80494332897356e-68	25788766	25896241	1.80666049544948e-91	27736231	27795252
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	27774097	30790610	801	787	0.2939	1.80666049544948e-91	27736231	27795252	3.35813764385942e-06	30716876	30828217
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	30794147	30865592	28	27	0.7603	3.35813764385942e-06	30716876	30828217	2.02022292969402e-88	30861423	30871925
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	30866961	55118214	5997	5867	-0.1009	2.02022292969402e-88	30861423	30871925	2.54381076028924e-78	55112618	55124730
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	40	-1.1334	2.54381076028924e-78	55112618	55124730	7.39533479657111e-36	55205278	55223056
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	61645974	2550	2490	-0.2349	7.39533479657111e-36	55205278	55223056	1.28200644888008e-218	61625343	61661388
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	61647245	63905707	918	904	0.2954	1.28200644888008e-218	61625343	61661388	2.87610502017356e-293	63899790	63914712
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	63907979	74283544	4090	4013	-0.2711	2.87610502017356e-293	63899790	63914712	0	74249207	74301178
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	74292663	134450318	20801	20305	0.3652	0	74249207	74301178	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3658	0.3701	NA	NA	NA	9.14385288244524e-44	9523923	9523923
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	4	-2.1944	9.14385288244524e-44	9523923	9523923	0	9554149	9554149
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	87763903	25367	24765	0.0539	0	9554149	9554149	0	87732328	87779779
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	87764824	122652094	12722	12419	-0.6305	0	87732328	87779779	4.64977048520917e-22	122639992	122658057
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	122654885	122746944	44	43	-1.3064	4.64977048520917e-22	122639992	122658057	6.54569382951285e-20	122738622	122758793
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	122749231	130943064	2729	2663	-0.6443	6.54569382951285e-20	122738622	122758793	2.53466336603535e-07	130936199	130943064
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.2446	2.53466336603535e-07	130936199	130943064	6.18260731626152e-09	130946248	130946248
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	535	-0.6195	6.18260731626152e-09	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	26663861	3086	2988	-0.2233	NA	NA	NA	2.85134838448386e-08	26647079	26706853
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	26666332	26732823	20	20	-0.8531	2.85134838448386e-08	26647079	26706853	2.39929998496368e-08	26715397	26746421
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	26734379	37953582	4232	4119	-0.2256	2.39929998496368e-08	26715397	26746421	4.18591329913545e-33	37953582	37953582
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.0636	4.18591329913545e-33	37953582	37953582	8.01538917689519e-55	37957844	37957844
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56650373	6685	6514	0.0401	8.01538917689519e-55	37957844	37957844	3.93902990336767e-51	56596626	56662112
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56708261	22	22	0.6048	3.93902990336767e-51	56596626	56662112	6.07442867480321e-07	56688605	56766462
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56711774	71375082	3616	3545	0.0532	6.07442867480321e-07	56688605	56766462	2.79992174226091e-35	71375082	71375082
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-3.9383	2.79992174226091e-35	71375082	71375082	1.22031870606698e-36	71377671	71377671
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4534	0.0692	1.22031870606698e-36	71377671	71377671	2.44028676867043e-12	89659397	89659397
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-2.2945	2.44028676867043e-12	89659397	89659397	1.06767570146517e-11	89662326	89662326
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9114	0.0676	1.06767570146517e-11	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	22083270	1331	1302	-0.5586	NA	NA	NA	1.10212808828076e-66	22073028	22095067
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22086379	22472801	163	157	-1.2346	1.10212808828076e-66	22073028	22095067	1.64195533953427e-71	22463236	22485140
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22475950	26008220	1222	1199	-0.5774	1.64195533953427e-71	22463236	22485140	0	25998805	26015691
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26009366	70858647	15656	15290	0.0499	0	25998805	26015691	0	70837032	70871139
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	70864022	73071404	1048	1023	-0.6448	0	70837032	70871139	4.27396518570838e-15	73061942	73072457
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	0.7578	4.27396518570838e-15	73061942	73072457	1.02222430143084e-14	73092018	73101327
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	90258100	6118	6007	-0.6314	1.02222430143084e-14	73092018	73101327	9.44571243307996e-10	90251000	90261135
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90259409	90286068	15	14	-1.4394	9.44571243307996e-10	90251000	90261135	7.7699691351042e-10	90277775	90292963
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90287219	99651813	3593	3531	-0.6445	7.7699691351042e-10	90277775	90292963	1.76552900682123e-17	99643224	99665296
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	99652790	99822455	84	82	-1.0824	1.76552900682123e-17	99643224	99665296	4.05328337601974e-21	99804945	99831792
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	99823267	105609466	2409	2367	-0.6044	4.05328337601974e-21	99804945	99831792	3.4389437754367e-06	105602602	105609466
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105611671	105673157	9	8	0.2291	3.4389437754367e-06	105602602	105609466	0.000305358448603049	105673157	105739770
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105681007	106358491	230	222	-0.6022	0.000305358448603049	105673157	105739770	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	29687889	2738	2679	-0.2567	NA	NA	NA	1.38123956521522e-26	29659545	29803939
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	29696462	30302213	148	146	-0.6868	1.38123956521522e-26	29659545	29803939	7.78393510815785e-39	30219359	30722915
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	30326899	47331325	6908	6746	-0.1796	7.78393510815785e-39	30219359	30722915	2.22340612454547e-26	47331325	47331325
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47333933	47335145	2	2	-2.4553	2.22340612454547e-26	47331325	47331325	3.49755423481123e-245	47335145	47336225
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47336225	100298352	21526	21040	-0.3842	3.49755423481123e-245	47335145	47336225	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54348362	13695	13403	-0.2381	NA	NA	NA	2.25577082118615e-19	54348362	54348362
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54356704	3	3	-2.6453	2.25577082118615e-19	54348362	54348362	0.00730321168689055	54353978	54365385
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54362111	54379839	8	8	-0.9899	0.00730321168689055	54353978	54365385	0.000158158404739124	54363713	54400475
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	88690571	11951	11678	-0.2493	0.000158158404739124	54363713	54400475	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	78653545	29634	28927	-0.3739	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	45643694	13830	13526	-0.0317	NA	NA	NA	0	45633174	45654819
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45645706	76116026	9134	8956	-0.6515	0	45633174	45654819	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	20841320	9322	9106	-0.2538	NA	NA	NA	1.11943257961183e-08	20810051	20878378
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20900139	16	16	-0.9389	1.11943257961183e-08	20810051	20878378	4.26101177404297e-08	20872378	20914739
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20901410	41532062	3810	3719	-0.2372	4.26101177404297e-08	20872378	20914739	3.67949043593239e-11	41532062	41532062
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-2.5352	3.67949043593239e-11	41532062	41532062	6.79171647628814e-262	41538649	41542955
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	63788698	9909	9661	-0.5114	6.79171647628814e-262	41538649	41542955	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	524236	194	191	0.6566	NA	NA	NA	7.93378981779708e-24	471433	548506
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	526141	1506379	392	384	0.2431	7.93378981779708e-24	471433	548506	1.42928723604766e-22	1499421	1506379
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-1.3054	1.42928723604766e-22	1499421	1506379	1.70177843185191e-22	1531162	1532433
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	30272679	8877	8671	0.313	1.70177843185191e-22	1531162	1532433	0.18361814805585	30145021	30277463
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	30274523	30279452	5	5	0.8334	0.18361814805585	30145021	30277463	3.18049080341962e-63	30274880	30386289
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	30280491	62419534	12102	11814	0.3206	3.18049080341962e-63	30274880	30386289	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	31792753	6158	6035	-0.632	NA	NA	NA	5.8462590940733e-11	31774413	31810727
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	31795589	31874216	44	44	-0.1362	5.8462590940733e-11	31774413	31810727	1.13565591978673e-10	31850950	31916845
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	31877444	46922972	7239	7075	-0.6198	1.13565591978673e-10	31850950	31916845	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15461843	6	6	-0.4584	NA	NA	NA	1.31966715040276e-53	14866086	15532174
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15464955	35472378	9546	9341	0.2292	1.31966715040276e-53	14866086	15532174	6.14636626366186e-56	35472378	35472378
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.4737	6.14636626366186e-56	35472378	35472378	3.66346955635322e-72	35476942	35476942
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	43353445	4090	3993	-0.0611	3.66346955635322e-72	35476942	35476942	0	43349514	43356402
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43355239	49571068	2913	2846	-1.1619	0	43349514	43356402	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	110583	18	17	-1.2552	NA	NA	NA	2.83028882417896e-06	4893	225722
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111851	2426938	1522	1485	-0.9018	2.83028882417896e-06	4893	225722	5.16125099773055e-06	2423726	2428167
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2431852	5	5	0.4863	5.16125099773055e-06	2423726	2428167	6.59804905648186e-07	2431852	2432847
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2431918	2717626	252	246	-1.0703	6.59804905648186e-07	2431852	2432847	3.2615330592029e-135	2705374	2724874
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2719027	154582414	45130	44118	-0.3137	3.2615330592029e-135	2705374	2724874	6.68854390528796e-102	154570075	154627446
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154860851	181	174	-1.095	6.68854390528796e-102	154570075	154627446	7.98729551968849e-05	154843218	154879183
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154862251	154888033	19	19	-0.4274	7.98729551968849e-05	154843218	154879183	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154888224	154888224	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3772482	125	120	-2.4339	NA	NA	NA	5.80802190471608e-07	2963612	3777766
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3773948	5531459	14	14	-0.7873	5.80802190471608e-07	2963612	3777766	0.000119967238025709	4846477	6728131
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5593746	10513747	826	806	-2.1367	0.000119967238025709	4846477	6728131	1.26687397872356e-05	10480759	10513747
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.5487	1.26687397872356e-05	10480759	10513747	5.9386341399893e-05	10645500	12502304
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12852769	100	100	-2.0717	5.9386341399893e-05	10645500	12502304	0.00293253322368953	12605673	12925401
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12855363	13129843	108	106	-1.5293	0.00293253322368953	12605673	12925401	8.31279214224283e-13	13101234	13166582
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	25737663	2151	2101	-2.3269	8.31279214224283e-13	13101234	13166582	1.01959832600777e-27	22921089	26873861
MSK_252152920110_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	80	-0.9994	1.01959832600777e-27	22921089	26873861	NA	NA	NA
