Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1640562	211	200	-0.254	NA	NA	NA	2.91153926728815e-27	1640562	1640562
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1652866	1654026	2	2	-2.816	2.91153926728815e-27	1640562	1640562	2.86903128367355e-35	1654026	1654026
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1669998	1669998	1	0	NA	2.86903128367355e-35	1654026	1654026	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1673810	9768023	2993	2861	-0.3821	NA	NA	NA	1.63735741006742e-91	9768023	9768023
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9769722	9776903	4	4	-3.1516	1.63735741006742e-91	9768023	9768023	4.34167292155623e-93	9776903	9776903
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9779758	12762774	1303	1260	-0.3909	4.34167292155623e-93	9776903	9776903	9.8930950243448e-183	12762774	12762774
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12835156	6	6	-3.5452	9.8930950243448e-183	12762774	12762774	5.10143890971726e-201	12835156	12835156
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12839991	26683506	5260	5025	-0.4257	5.10143890971726e-201	12835156	12835156	4.04234078078095e-115	26683506	26690698
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26685367	26723750	14	12	-2.1112	4.04234078078095e-115	26683506	26690698	4.93487875885955e-116	26719727	26723750
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26727974	38896756	4582	4380	-0.442	4.93487875885955e-116	26719727	26723750	4.00548568407902e-237	38891881	38901799
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	38901799	39304436	144	137	0.2649	4.00548568407902e-237	38891881	38901799	8.7298242496431e-186	39303738	39309189
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	39309189	40783207	679	629	-0.4408	8.7298242496431e-186	39303738	39309189	4.71981052903903e-11	40775542	40783207
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	40786324	40808230	10	10	0.1511	4.71981052903903e-11	40775542	40783207	2.63961777954246e-11	40808230	40818737
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	40818723	42653290	784	744	-0.4552	2.63961777954246e-11	40808230	40818737	1.54523005460219e-70	42653290	42653290
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	42655074	42656394	2	0	NA	1.54523005460219e-70	42653290	42653290	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	42658754	42667305	5	5	-2.579	NA	NA	NA	7.21940307685922e-75	42667305	42667305
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	42669967	46661658	1672	1618	-0.4367	7.21940307685922e-75	42667305	42667305	1.03929052912957e-45	46661658	46661658
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	46664384	46672970	4	4	-2.3142	1.03929052912957e-45	46661658	46661658	1.60773530003826e-50	46672970	46672970
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	46675012	58020324	4526	4342	-0.4594	1.60773530003826e-50	46672970	46672970	0	58018213	58025093
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	58021682	58021682	1	0	NA	0	58018213	58025093	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	58025093	61712482	1398	1346	0.2245	NA	NA	NA	2.77427346346041e-67	61703313	61717040
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61713975	61985849	78	76	0.7098	2.77427346346041e-67	61703313	61717040	4.42723527407477e-65	61979203	61989699
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61988332	72541443	4218	4037	0.2181	4.42723527407477e-65	61979203	61989699	1.18703701979420e-32	72540240	72543019
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72543019	72579311	11	10	1.1776	1.1870370197942e-32	72540240	72543019	1.83869500150561e-36	72574479	72589682
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	117433454	14458	13809	0.2068	1.83869500150561e-36	72574479	72589682	3.31019540500042e-11	117428852	117435135
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	117434042	117445687	16	16	0.6424	3.31019540500042e-11	117428852	117435135	2.27632857703967e-09	117443261	117451810
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	117446559	150818222	3081	2942	0.2246	2.27632857703967e-09	117443261	117451810	1.47625198228489e-13	150811736	150836481
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150851439	12	11	0.8261	1.47625198228489e-13	150811736	150836481	4.58978087756666e-15	150846148	150857070
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	71	0.2266	4.58978087756666e-15	150846148	150857070	5.79660379937871e-19	151024118	151026228
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	1.2391	5.79660379937871e-19	151024118	151026228	3.28951383649518e-13	151036435	151038091
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2557	0.2351	3.28951383649518e-13	151036435	151038091	1.13333426282061e-20	157133150	157133150
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.5276	1.13333426282061e-20	157133150	157133150	1.72602212144603e-19	157136342	157136342
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	158168671	386	356	0.1868	1.72602212144603e-19	157136342	157136342	2.26692240583974e-54	158155876	158179018
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	158169823	158385058	99	95	0.671	2.26692240583974e-54	158155876	158179018	3.01204786490260e-77	158374845	158391270
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	158386767	171107278	5082	4856	0.1984	3.0120478649026e-77	158374845	158391270	2.34409416726773e-152	171095164	171119130
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	171111491	171765572	212	206	0.6524	2.34409416726773e-152	171095164	171119130	4.46177516903784e-38	171746003	171774904
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	171766789	172227821	191	182	0.9936	4.46177516903784e-38	171746003	171774904	5.2725707891173e-11	172212586	172231489
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	172228960	172313090	25	24	0.6308	5.2725707891173e-11	172212586	172231489	9.74609354067017e-17	172310430	172334031
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	172326170	181225712	3532	3406	0.1955	9.74609354067017e-17	172310430	172334031	0	181219039	181231671
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181226960	181226960	1	0	NA	0	181219039	181231671	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181229291	191355849	2992	2864	0.6507	NA	NA	NA	2.75183670688024e-48	191348756	191357987
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	191356431	191492555	83	80	0.2654	2.75183670688024e-48	191348756	191357987	2.93311034787498e-48	191486865	191503848
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	191494216	199057637	2112	2020	0.6605	2.93311034787498e-48	191486865	191503848	2.00819383092905e-269	199049483	199069651
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	199062196	200037518	469	446	0.2268	2.00819383092905e-269	199049483	199069651	3.93291589953829e-154	200034387	200040832
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200038821	201412390	605	580	0.6495	3.93291589953829e-154	200034387	200040832	0	201405606	201421331
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	201414719	213492299	4562	4370	0.1976	0	201405606	201421331	0	213481060	213504577
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	213494783	220070440	2224	2139	0.6247	0	213481060	213504577	0	220063585	220080173
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	220073461	223887030	1327	1273	0.2012	0	220063585	220080173	1.73245951398042e-16	223882299	223889841
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	223888506	223920557	20	19	0.7049	1.73245951398042e-16	223882299	223889841	3.02821942132693e-16	223918934	223931592
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	223923074	231045429	2730	2625	0.1969	3.02821942132693e-16	223918934	223931592	1.00308654258982e-25	231033805	231056473
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231048154	231048154	1	0	NA	1.00308654258982e-25	231033805	231056473	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231048827	231157926	41	39	0.6415	NA	NA	NA	1.44965916582132e-30	231151887	231165176
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231161274	238414722	2726	2624	0.1852	1.44965916582132e-30	231151887	231165176	0	238412619	238417840
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	238417840	246669591	3347	3232	-0.5632	0	238412619	238417840	1.53575451165496e-07	246643175	246691241
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246674083	246713340	11	11	-0.0996	1.53575451165496e-07	246643175	246691241	0.000114947479990511	246696388	246738832
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246738832	246794552	8	8	-0.7539	0.000114947479990511	246696388	246738832	8.40452589220825e-12	246794552	246806669
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246862029	26	25	-2.7009	8.40452589220825e-12	246794552	246806669	5.34292200840662e-09	246857496	246863179
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	246911251	10	10	-1.1315	5.34292200840662e-09	246857496	246863179	1.32151040010510e-09	246902470	246914572
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246912838	247186514	88	88	-0.5419	1.3215104001051e-09	246902470	246914572	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	19240422	5636	5387	0.185	NA	NA	NA	2.23605741534538e-45	19216255	19254686
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	19251560	19496243	56	54	0.6684	2.23605741534538e-45	19216255	19254686	1.86990253864475e-38	19483308	19521785
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	19503455	34543992	5830	5565	0.2253	1.86990253864475e-38	19483308	19521785	2.95767817898386e-17	34539740	34554208
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34582272	16	16	0.7754	2.95767817898386e-17	34539740	34554208	2.83361958783865e-17	34575366	34589997
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34583814	42761761	3452	3288	0.2375	2.83361958783865e-17	34575366	34589997	6.14067397787414e-114	42755139	42766859
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42763199	43235967	146	142	0.7056	6.14067397787414e-114	42755139	42766859	2.61378995217255e-72	43214789	43256076
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43245090	44031041	376	347	0.2426	2.61378995217255e-72	43214789	43256076	1.15274296130471e-32	44028474	44031041
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	44034744	44082323	21	21	-0.4202	1.15274296130471e-32	44028474	44031041	9.09129213346673e-33	44082323	44085698
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	44085698	49973955	2181	2096	0.2242	9.09129213346673e-33	44082323	44085698	9.6219452412902e-135	49952790	49980046
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	49976631	50364306	206	200	0.6634	9.6219452412902e-135	49952790	49980046	3.10057560621435e-153	50360363	50370054
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50366515	52600588	812	781	0.1799	3.10057560621435e-153	50360363	50370054	4.18040616050639e-08	52583578	52600588
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8185	4.18040616050639e-08	52583578	52600588	5.72709330941891e-07	52635695	52645468
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	56970005	1522	1463	0.2038	5.72709330941891e-07	52635695	52645468	1.3351100720636e-31	56946291	56988187
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	56979470	57300299	37	37	0.6776	1.3351100720636e-31	56946291	56988187	7.70223570231829e-30	57281206	57329327
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57307517	57307517	1	0	NA	7.70223570231829e-30	57281206	57329327	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57317385	62628706	1661	1588	0.2019	NA	NA	NA	4.45829377917517e-259	62619654	62634235
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	62631817	63670473	377	365	0.6918	4.45829377917517e-259	62619654	62634235	1.2700230393762e-204	63659775	63678194
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	63671974	66357387	959	914	0.2301	1.2700230393762e-204	63659775	63678194	4.22119715278388e-107	66357387	66357387
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-3.5275	4.22119715278388e-107	66357387	66357387	1.16770665051519e-109	66360747	66360747
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	66568301	62	62	0.2259	1.16770665051519e-109	66360747	66360747	5.16690274909111e-22	66562290	66573467
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66571316	66677491	54	53	0.6534	5.16690274909111e-22	66562290	66573467	7.92186218933121e-31	66666553	66689709
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66682432	67044364	62	62	0.1837	7.92186218933121e-31	66666553	66689709	2.62763532860654e-12	67032946	67044364
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	67051038	67108089	8	8	0.7493	2.62763532860654e-12	67032946	67044364	1.63488974676644e-08	67095881	67135080
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	67113968	87149187	6411	6125	0.2078	1.63488974676644e-08	67095881	67135080	4.20562108784524e-07	86984833	87245647
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87245647	87335913	5	5	0.8377	4.20562108784524e-07	86984833	87245647	6.73519743923067e-07	87274739	87410858
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87363443	89890854	457	439	0.1858	6.73519743923067e-07	87274739	87410858	1.82096765655130e-11	89876334	89890854
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89902365	91270311	15	15	-0.2959	1.8209676565513e-11	89876334	89890854	8.73703998071602e-14	91270311	94892766
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94784165	108633073	4058	3885	0.1963	8.73703998071602e-14	91270311	94892766	2.03764506511267e-94	108624823	108669309
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	108664794	109067137	129	124	0.6425	2.03764506511267e-94	108624823	108669309	2.62181110692871e-91	109026065	109094396
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	109073745	109073745	1	0	NA	2.62181110692871e-91	109026065	109094396	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	109080713	120767259	3089	2960	0.1925	NA	NA	NA	0	120765632	120771587
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	120769542	135512139	3777	3614	-0.4802	0	120765632	120771587	8.10870212310536e-13	135510435	135516103
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	135514326	135528575	9	9	0.1733	8.10870212310536e-13	135510435	135516103	2.97184697360089e-15	135526366	135533237
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	135531130	146571330	3641	3480	-0.5041	2.97184697360089e-15	135526366	135533237	2.07961004103244e-12	146562545	146571330
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	0.4147	2.07961004103244e-12	146562545	146571330	1.3331600189247e-11	146592775	146597405
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	175500774	9566	9096	-0.4847	1.3331600189247e-11	146592775	146597405	0	175498985	175502778
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	175502778	180359346	1853	1778	0.2135	0	175498985	175502778	0	180348912	180365212
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180362575	192493876	3654	3512	0.663	0	180348912	180365212	4.16294789201939e-30	192476061	192514824
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	192497179	192621214	65	62	1.0073	4.16294789201939e-30	192476061	192514824	2.92879062592217e-13	192604910	192632919
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	192623164	193205785	132	129	1.3262	2.92879062592217e-13	192604910	192632919	2.25549551541827e-202	193197139	193215026
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	193215026	197586327	1042	1009	0.6513	2.25549551541827e-202	193197139	193215026	1.43921775036192e-06	197575811	197593664
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197588397	197609680	11	11	1.0539	1.43921775036192e-06	197575811	197593664	0.018354184638096	197591972	197622397
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197612724	197612724	1	0	NA	0.018354184638096	197591972	197622397	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197614569	197647812	15	15	1.3207	NA	NA	NA	2.83286262525735e-07	197635395	197657051
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197649276	198054570	193	188	0.9957	2.83286262525735e-07	197635395	197657051	1.10759801654225e-57	198047097	198070440
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198058785	199788712	518	489	0.6672	1.10759801654225e-57	198047097	198070440	8.80997008354404e-241	199780404	199820088
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	199793018	201162071	478	462	0.1619	8.80997008354404e-241	199780404	199820088	4.29418763561065e-09	201159862	201162071
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	201164494	201170663	5	5	-0.498	4.29418763561065e-09	201159862	201162071	4.33393622229644e-09	201170663	201171756
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	201171756	214945599	5342	5125	0.1943	4.33393622229644e-09	201170663	201171756	1.87461187796780e-71	214944029	214948561
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	214947253	215018879	41	38	-0.4933	1.8746118779678e-71	214944029	214948561	4.50066211750641e-65	215013890	215022360
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	215022360	230838864	5314	5087	0.178	4.50066211750641e-65	215013890	215022360	8.44500539364342e-13	230819267	230838864
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	230840788	230841949	2	2	0.7649	8.44500539364342e-13	230819267	230838864	0.0838939712683846	230841949	230867473
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	230843131	234062959	1437	1386	0.2061	0.0838939712683846	230841949	230867473	5.55974837963713e-10	234058898	234065182
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	234065182	234096241	14	13	0.6895	5.55974837963713e-10	234058898	234065182	5.82713983169194e-61	234096241	234096241
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	234097440	241021970	2487	2373	-0.5004	5.82713983169194e-61	234096241	234096241	8.48639349620887e-63	241020862	241028585
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241027169	241109130	42	40	0.195	8.48639349620887e-63	241020862	241028585	1.64000656943781e-42	241101947	241115974
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241112425	242686945	536	513	-0.4571	1.64000656943781e-42	241101947	241115974	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242689978	242689978	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	3097932	1178	1123	-0.5256	NA	NA	NA	0	3096774	3099269
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	3099269	3946749	293	277	0.1928	0	3096774	3099269	0	3944008	3971474
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	3971474	9209938	1686	1625	-0.5309	0	3944008	3971474	2.19064721335536e-14	9207130	9220825
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9213868	9213868	1	0	NA	2.19064721335536e-14	9207130	9220825	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9216703	9225641	6	6	0.2811	NA	NA	NA	4.76338296920099e-11	9220825	9227886
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9227886	11383299	923	885	-0.4586	4.76338296920099e-11	9220825	9227886	3.03886865066975e-93	11383299	11383299
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-3.4208	3.03886865066975e-93	11383299	11383299	5.57787227785393e-96	11389624	11389624
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	16094900	1829	1754	-0.4671	5.57787227785393e-96	11389624	11389624	2.21062961228120e-07	16085832	16100120
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	16100120	16115650	7	7	0.0862	2.2106296122812e-07	16085832	16100120	1.35649501580673e-08	16111233	16125687
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	16119003	16119003	1	0	NA	1.35649501580673e-08	16111233	16125687	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	16122608	47460892	10291	9857	-0.5192	NA	NA	NA	7.54336463914163e-24	47460892	47460892
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.3578	7.54336463914163e-24	47460892	47460892	2.32662166089991e-60	47466921	47466921
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	76722236	10916	10465	-0.5203	2.32662166089991e-60	47466921	47466921	8.3809596347211e-62	76720829	76722236
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76725184	76730752	3	3	0.3989	8.3809596347211e-62	76720829	76722236	1.00696021891537e-09	76730752	76734828
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76734828	78874427	763	727	-0.5422	1.00696021891537e-09	76730752	76734828	0	78871745	78878560
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	78878560	83631268	1187	1127	0.1696	0	78871745	78878560	0	83616713	83636764
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	83636764	88828538	1370	1307	-0.549	0	83616713	83636764	0	88809522	88837554
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	88837554	98876637	1334	1282	0.174	0	88809522	88837554	1.17412148821478e-168	98875738	98880674
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	98880674	99062596	79	77	-0.5472	1.17412148821478e-168	98875738	98880674	2.01077184424774e-165	99060933	99064613
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99064613	108872506	2800	2693	0.1906	2.01077184424774e-165	99060933	99064613	5.40234135039697e-14	108870783	108873657
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	108873657	108886993	8	8	-0.4786	5.40234135039697e-14	108870783	108873657	1.60801652331399e-14	108885450	108889642
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	108889642	113467244	1441	1395	0.2069	1.60801652331399e-14	108885450	108889642	0	113462807	113474137
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	113469318	113469318	1	0	NA	0	113462807	113474137	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	113471486	117020160	1397	1347	0.6528	NA	NA	NA	9.5349078179988e-21	117006418	117028249
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117021288	117149747	63	61	0.9503	9.5349078179988e-21	117006418	117028249	1.38809183105989e-16	117144405	117162039
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117154306	117272802	64	62	0.5928	1.38809183105989e-16	117144405	117162039	4.81468936029394e-14	117264939	117283411
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117275620	117393949	57	54	0.9409	4.81468936029394e-14	117264939	117283411	9.20642121763923e-25	117387102	117410980
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117396298	119862821	558	533	0.5825	9.20642121763923e-25	117387102	117410980	2.80359139071552e-256	119849859	119876985
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	119865010	127441969	3015	2872	0.1892	2.80359139071552e-256	119849859	119876985	6.77845194257083e-12	127441969	127441969
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127444734	127450506	2	2	1.4986	6.77845194257083e-12	127441969	127441969	6.60282846970735e-12	127450506	127450506
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127453439	127457577	2	0	NA	6.60282846970735e-12	127450506	127450506	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127459161	133189686	2429	2313	0.1933	NA	NA	NA	1.04445242111209e-130	133189686	133189686
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-4.0369	1.04445242111209e-130	133189686	133189686	4.3702210151723e-144	133194685	133194685
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	137557504	1541	1481	0.182	4.3702210151723e-144	133194685	133194685	0	137553364	137559218
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	137559218	144009226	2239	2154	-0.5281	0	137553364	137559218	0	144007719	144012017
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	144012017	154668155	2946	2810	0.1527	0	144007719	144012017	2.6448016128735e-07	154665945	154668155
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	154669676	154679462	2	2	1.0596	2.6448016128735e-07	154665945	154668155	2.55999349440047e-06	154679462	154682084
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	154682084	156820484	587	557	0.1589	2.55999349440047e-06	154679462	154682084	2.25762568727829e-09	156819832	156826698
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	156821028	156831183	4	4	-0.621	2.25762568727829e-09	156819832	156826698	3.20783393850503e-10	156826698	156832789
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	156832789	157770290	408	391	0.1829	3.20783393850503e-10	156826698	156832789	3.01215328109375e-200	157759559	157775581
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	157772112	158953569	422	402	0.6709	3.01215328109375e-200	157759559	157775581	1.24011207859822e-294	158932782	158977843
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	158963072	163992903	1628	1545	0.1911	1.24011207859822e-294	158932782	158977843	2.95156470586833e-124	163992903	163992903
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	26	1.3214	2.95156470586833e-124	163992903	163992903	2.16708913476319e-126	164107951	164107951
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	176625798	4137	3961	0.2022	2.16708913476319e-126	164107951	164107951	3.72769043326112e-294	176622103	176627111
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176627111	176920648	138	133	-0.5546	3.72769043326112e-294	176622103	176627111	1.33450925903199e-291	176917542	176923330
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176923330	185828014	2701	2581	0.1967	1.33450925903199e-291	176917542	176923330	0	185825899	185831747
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	185831747	187131532	534	511	1.0079	0	185825899	185831747	0	187130320	187135041
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187135041	188403055	559	534	0.2137	0	187130320	187135041	1.52667519368024e-42	188397577	188406436
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	188404620	188512057	50	50	0.7274	1.52667519368024e-42	188397577	188406436	5.4008747367682e-51	188505696	188521245
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	188516141	191219222	1003	969	0.1958	5.4008747367682e-51	188505696	188521245	8.20037171416854e-09	191217656	191219222
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	1.2972	8.20037171416854e-09	191217656	191219222	9.70874895162032e-09	191222891	191224191
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	194354505	1006	955	0.1865	9.70874895162032e-09	191222891	191224191	4.95833404363951e-16	194353315	194360242
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	1.0513	4.95833404363951e-16	194353315	194360242	2.61620116127265e-18	194364470	194368145
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	943	0.2082	2.61620116127265e-18	194364470	194368145	2.41706713750433e-19	196807153	196905767
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196952514	28	27	-0.2018	2.41706713750433e-19	196807153	196905767	4.22547447784431e-15	196945209	196966631
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196957322	199329592	956	915	0.1998	4.22547447784431e-15	196945209	196966631	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	1726422	566	540	-0.4436	NA	NA	NA	2.92405570834922e-08	1721406	1726422
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1732474	1732706	2	2	0.8185	2.92405570834922e-08	1721406	1726422	1.57231081834727e-46	1732706	1732706
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1734030	24828998	7063	6749	-0.5242	1.57231081834727e-46	1732706	1732706	1.67743782222573e-44	24824690	24828998
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	24833221	24847651	6	5	0.3299	1.67743782222573e-44	24824690	24828998	1.61570055182282e-13	24847651	24849090
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	24849090	47217676	5969	5704	-0.5476	1.61570055182282e-13	24847651	24849090	1.70022558867022e-07	47213528	47217676
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	47219157	47228328	4	4	0.1955	1.70022558867022e-07	47213528	47217676	2.18884984620314e-08	47228328	47229331
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	47229331	63346612	3613	3463	-0.5587	2.18884984620314e-08	47228328	47229331	1.52033468470552e-84	63346612	63346612
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-3.8444	1.52033468470552e-84	63346612	63346612	9.54823005066624e-78	63358506	63358506
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	69075140	1210	1158	-0.5677	9.54823005066624e-78	63358506	63358506	1.18102024892789e-246	69075140	69075140
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69085386	69165814	12	10	-3.2488	1.18102024892789e-246	69075140	69075140	2.56481976425081e-263	69165814	69165814
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	83723634	4669	4478	-0.535	2.56481976425081e-263	69165814	69165814	4.97580193424774e-32	83719609	83731844
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	83726287	83763529	20	20	0.1383	4.97580193424774e-32	83719609	83731844	3.1708711916244e-35	83758879	83766335
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	83766335	119334954	11609	11139	-0.5413	3.1708711916244e-35	83758879	83766335	6.77172677834878e-28	119334954	119334954
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-2.1048	6.77172677834878e-28	119334954	119334954	3.72139114474100e-23	119348829	119348829
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	119908267	163	152	-0.5307	3.721391144741e-23	119348829	119348829	3.55009877944806e-46	119908267	119908267
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119909612	119911175	2	2	-3.2244	3.55009877944806e-46	119908267	119908267	6.59644304809124e-55	119911175	119911175
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119913100	124060766	1313	1259	-0.5653	6.59644304809124e-55	119911175	119911175	1.21204271471391e-09	124058067	124060766
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	124063394	124068249	4	4	0.2382	1.21204271471391e-09	124058067	124060766	2.24323768084241e-08	124068249	124071351
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	124069509	173224400	13410	12838	-0.5369	2.24323768084241e-08	124068249	124071351	3.49329055567912e-26	173224400	173224400
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.4174	3.49329055567912e-26	173224400	173224400	2.0209690526507e-30	173228860	173228860
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173453572	102	97	-0.5446	2.0209690526507e-30	173228860	173228860	2.7643690706911e-102	173452095	173460492
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173460492	173660684	91	87	0.2572	2.7643690706911e-102	173452095	173460492	5.19465032724684e-27	173660684	173660684
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.9953	5.19465032724684e-27	173660684	173660684	5.27083128986905e-34	173666072	173666072
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	174350425	288	280	0.2188	5.27083128986905e-34	173666072	173666072	0	174347558	174354597
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	174353295	174353295	1	0	NA	0	174347558	174354597	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	174354597	175860235	454	440	-0.5455	NA	NA	NA	4.21885869235761e-88	175860235	175860235
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	-4.0158	4.21885869235761e-88	175860235	175860235	6.73839185295204e-92	175863396	175863396
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	186676034	3028	2900	-0.5527	6.73839185295204e-92	175863396	175863396	7.78253036740922e-139	186676034	186676034
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.6992	7.78253036740922e-139	186676034	186676034	3.65020954606918e-134	186680176	186680176
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	298	-0.5305	3.65020954606918e-134	186680176	186680176	5.58577717967581e-12	187330240	187330240
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.8029	5.58577717967581e-12	187330240	187330240	4.39012984662356e-10	187333619	187333619
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190772330	1143	1088	-0.5861	4.39012984662356e-10	187333619	187333619	6.73534760662498e-33	190756763	190784435
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190924564	54	54	-1.0101	6.73534760662498e-33	190756763	190784435	1.21589470990524e-20	190915643	190930709
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190927969	191153613	44	42	-0.5786	1.21589470990524e-20	190915643	190930709	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	5650639	1769	1681	0.2069	NA	NA	NA	0	5611037	5673514
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	5657199	32028323	6903	6609	0.6165	0	5611037	5673514	8.07691386989064e-60	32019048	32041114
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32030288	32247171	109	104	0.9983	8.07691386989064e-60	32019048	32041114	5.15513371080256e-09	32247171	32247171
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32249514	32253273	3	3	0.0182	5.15513371080256e-09	32247171	32247171	3.29113363744553e-10	32253273	32255254
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32255254	32778646	225	218	0.9984	3.29113363744553e-10	32253273	32255254	1.56116826803944e-90	32767556	32789744
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32780491	37088740	1451	1391	0.6403	1.56116826803944e-90	32767556	32789744	0	37080649	37096717
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	37090719	41523233	1423	1366	0.1724	0	37080649	37096717	9.25315638849032e-08	41518325	41541451
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	41538820	41565304	12	12	0.5904	9.25315638849032e-08	41518325	41541451	1.01744924143831e-07	41554784	41596520
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	41568850	44728483	892	857	0.1789	1.01744924143831e-07	41554784	41596520	1.06189146574220e-79	44728483	44741586
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	44741586	44841243	22	22	-0.7766	1.0618914657422e-79	44728483	44741586	1.29331499940362e-79	44839788	44841243
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	44844220	56793709	2439	2353	0.1728	1.29331499940362e-79	44839788	44841243	9.16553986107818e-267	56777714	56798669
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56796254	58353361	410	394	0.6104	9.16553986107818e-267	56777714	56798669	5.97766061482158e-245	58350104	58364739
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58354838	64895527	2091	2014	0.1914	5.97766061482158e-245	58350104	58364739	0	64886393	64900369
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	64897666	66313883	622	592	0.6643	0	64886393	64900369	2.95486444838643e-38	66306087	66321252
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	66315308	66420616	60	59	0.2386	2.95486444838643e-38	66306087	66321252	4.20509340998603e-131	66419414	66423267
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	66423267	77971860	3193	3050	-0.5336	4.20509340998603e-131	66419414	66423267	8.87537013067119e-26	77967758	77973343
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	77973343	78031526	20	18	0.0877	8.87537013067119e-26	77967758	77973343	2.16291081570922e-27	78027418	78040038
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78036651	79812689	722	679	-0.5382	2.16291081570922e-27	78027418	78040038	9.6370518640036e-07	79810827	79817154
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79817154	79820228	3	3	0.2336	9.6370518640036e-07	79810827	79817154	4.07724756966835e-06	79818802	79829048
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79821533	81455586	673	645	-0.5338	4.07724756966835e-06	79818802	79829048	2.35960684177441e-191	81455586	81455586
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	81470252	81494463	12	12	-2.649	2.35960684177441e-191	81455586	81455586	4.32110699712518e-196	81494463	81494463
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	81495991	87005072	1375	1309	-0.5667	4.32110699712518e-196	81494463	81494463	1.17498989717877e-35	87000295	87005072
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	87012030	87105647	16	16	0.2073	1.17498989717877e-35	87000295	87005072	3.55179503460022e-10	87086298	87127428
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	87111248	87111248	1	0	NA	3.55179503460022e-10	87086298	87127428	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	87114901	91535143	1147	1100	0.602	NA	NA	NA	0	91523089	91562611
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	91538096	159144480	21166	20207	0.1006	0	91523089	91562611	4.8367107786878e-47	159140875	159144480
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	159147265	159199222	17	17	0.9581	4.8367107786878e-47	159140875	159144480	1.22219494458500e-56	159199222	159202977
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	159202977	167240089	1997	1917	0.0453	1.222194944585e-56	159199222	159202977	1.89049055185726e-16	167237164	167240089
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167242653	167266074	11	8	0.7677	1.89049055185726e-16	167237164	167240089	1.24383961978077e-13	167266074	167267730
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167267730	167948134	359	339	0.0895	1.24383961978077e-13	167266074	167267730	7.56622400785007e-15	167946827	167948134
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167949964	167972406	7	7	0.8461	7.56622400785007e-15	167946827	167948134	2.86578611183404e-13	167972406	167989144
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167978872	174741129	2465	2349	0.0765	2.86578611183404e-13	167972406	167989144	2.31225496313714e-194	174718830	174754146
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174754146	175060832	114	110	0.8161	2.31225496313714e-194	174718830	174754146	4.70230527178119e-197	175058845	175064620
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	175064620	179429409	1613	1539	0.0824	4.70230527178119e-197	175058845	175064620	8.63359889720976e-10	179429409	179429409
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	1.294	8.63359889720976e-10	179429409	179429409	1.90408607169904e-09	179431937	179433578
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	180344964	303	295	0.0739	1.90408607169904e-09	179431937	179433578	1.84230786542983e-15	180342860	180344964
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180346557	180358977	7	7	0.9156	1.84230786542983e-15	180342860	180344964	8.28112571872348e-17	180358977	180362342
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	103	0.0366	8.28112571872348e-17	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	241674	57	56	0.4834	NA	NA	NA	1.48490412701904e-23	234115	246974
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	326323	44	40	-0.0429	1.48490412701904e-23	234115	246974	1.24734554761225e-52	323898	327962
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	1555146	472	449	0.6409	1.24734554761225e-52	323898	327962	1.3719567571111e-10	1546510	1563210
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	1557709	1603284	22	21	0.213	1.3719567571111e-10	1546510	1563210	2.96009402855804e-14	1593934	1610095
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	1605602	3209039	665	640	0.6484	2.96009402855804e-14	1593934	1610095	1.55425196672269e-08	3207654	3209039
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3210332	3213242	3	3	1.5304	1.55425196672269e-08	3207654	3209039	3.07818921606889e-08	3213242	3215254
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3215254	8178279	1929	1844	0.6222	3.07818921606889e-08	3213242	3215254	0	8158049	8200786
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	8183990	19055368	3572	3413	0.1834	0	8158049	8200786	6.48281278271294e-40	19027052	19070878
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	19065029	19301599	56	52	0.6384	6.48281278271294e-40	19027052	19070878	2.40738820505085e-44	19298139	19336079
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	19316417	29966336	3769	3607	0.1586	2.40738820505085e-44	19298139	19336079	1.07058271290492e-15	29950805	29966336
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	30005338	12	10	0.8163	1.07058271290492e-15	29950805	29966336	1.27105215372625e-11	30005338	30026699
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	31383925	580	544	0.1792	1.27105215372625e-11	30005338	30026699	4.24057022361878e-103	31383925	31383925
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31385778	31385778	1	0	NA	4.24057022361878e-103	31383925	31383925	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31395330	5	5	-2.5416	NA	NA	NA	8.83938136174454e-100	31395330	31395330
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31418006	31418006	1	0	NA	8.83938136174454e-100	31395330	31395330	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	470	0.1976	NA	NA	NA	1.11652813300333e-61	32548736	32563252
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32588005	5	5	-2.0888	1.11652813300333e-61	32548736	32563252	2.71208726838013e-05	32563252	32593151
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32713363	41	40	-0.0528	2.71208726838013e-05	32563252	32593151	1.03830144300168e-08	32709263	32718991
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	6	-2.3431	1.03830144300168e-08	32709263	32718991	1.87994804824254e-07	32723722	32731072
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32767722	15	15	-0.4114	1.87994804824254e-07	32723722	32731072	2.01283485334395e-16	32745036	32771725
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32771725	37458771	2067	1984	0.1937	2.01283485334395e-16	32745036	32771725	5.48581469785607e-07	37457472	37458771
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	37460550	37463506	3	3	1.0783	5.48581469785607e-07	37457472	37458771	5.09822342804054e-08	37463506	37465654
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	37465654	39992419	1112	1070	0.2011	5.09822342804054e-08	37463506	37465654	0	39990463	39997135
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	39994692	49027493	3302	3148	-0.506	0	39990463	39997135	1.89307821180077e-14	49027493	49027493
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49039318	49045025	2	2	-1.9853	1.89307821180077e-14	49027493	49027493	2.29801997474374e-15	49045025	49045025
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49049568	51409071	641	618	-0.5656	2.29801997474374e-15	49045025	49045025	1.08461049797074e-38	51404946	51411293
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	51411293	51473729	22	20	0.1394	1.08461049797074e-38	51404946	51411293	2.99712596923433e-25	51470535	51481049
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	51478104	52270879	388	364	-0.5161	2.99712596923433e-25	51470535	51481049	7.30182964345575e-14	52265719	52270879
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	52275515	52308943	9	9	0.206	7.30182964345575e-14	52265719	52270879	5.00175969242975e-17	52308943	52319683
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	52314510	52314510	1	0	NA	5.00175969242975e-17	52308943	52319683	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	52319683	54035000	697	668	-0.5261	NA	NA	NA	6.2212814569422e-11	54033505	54035000
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	0.4888	6.2212814569422e-11	54033505	54035000	1.56360594922513e-11	54042734	54045472
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	57208870	1226	1182	-0.5493	1.56360594922513e-11	54042734	54045472	0	57206224	57211596
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57211596	69940615	2177	2076	0.1588	0	57206224	57211596	0	69938363	69947990
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	69947990	76084574	2291	2193	-0.5307	0	69938363	69947990	0	76083173	76087214
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	76087214	76524350	195	190	0.231	0	76083173	76087214	0	76522079	76526464
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	76526464	81334248	1284	1234	-0.5397	0	76522079	76526464	2.89530381874839e-170	81334248	81334248
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-4.5482	2.89530381874839e-170	81334248	81334248	1.90083282681683e-179	81348170	81348170
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	81427982	13	12	-0.637	1.90083282681683e-179	81348170	81348170	1.18721359925668e-30	81423509	81434200
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81434200	85761542	1060	1027	0.1734	1.18721359925668e-30	81423509	81434200	7.03833223356407e-139	85753391	85765929
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	85765929	86102908	74	72	-0.5512	7.03833223356407e-139	85753391	85765929	1.90615367790595e-157	86096112	86109798
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	86109798	134629897	15368	14678	0.1819	1.90615367790595e-157	86096112	86109798	1.08486513625334e-08	134627341	134629897
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-0.5785	1.08486513625334e-08	134627341	134629897	8.33066093807317e-09	134635779	134639397
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	143762461	2940	2825	0.1896	8.33066093807317e-09	134635779	134639397	0	143758176	143769929
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	143767832	151836461	2990	2870	-0.5321	0	143758176	143769929	0	151836461	151836461
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151837089	154128877	836	800	0.685	0	151836461	151836461	0	154128877	154128877
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	154138819	160718638	2151	2064	-0.5233	0	154128877	154128877	5.85894024709973e-15	160711422	160718638
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	160720422	160740647	10	10	0.1242	5.85894024709973e-15	160711422	160718638	8.63573007567955e-17	160740647	160749224
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	160747204	163254036	1097	1056	-0.5667	8.63573007567955e-17	160740647	160749224	0	163251866	163257781
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	163257781	165643653	598	574	0.1341	0	163251866	163257781	1.01668868598390e-57	165643653	165643653
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.046	1.0166886859839e-57	165643653	165643653	1.60528912041514e-49	165650610	165650610
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1717	0.1484	1.60528912041514e-49	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	634336	83	81	0.2795	NA	NA	NA	7.38695097311416e-118	524935	643650
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	638739	5424390	1863	1778	-0.4459	7.38695097311416e-118	524935	643650	0	5415031	5426090
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5426090	34104659	10184	9711	0.1908	0	5415031	5426090	0	34101828	34107626
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	34107626	34934610	314	297	-0.561	0	34101828	34107626	9.8283918469484e-09	34923027	34945548
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	34936476	34997897	30	29	-0.2532	9.8283918469484e-09	34923027	34945548	9.23592029093698e-07	34959777	35041677
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	35001463	35001463	1	0	NA	9.23592029093698e-07	34959777	35041677	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	35014433	38274436	1130	1094	-0.5208	NA	NA	NA	4.9910153541424e-07	38252620	38280664
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38277728	38312900	21	19	-0.1878	4.9910153541424e-07	38252620	38280664	1.97262438012695e-10	38302124	38332055
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38315044	38315044	1	0	NA	1.97262438012695e-10	38302124	38332055	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38317119	46380230	2741	2595	-0.5117	NA	NA	NA	0	46358562	46385043
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	46385043	64523575	3194	3061	0.1833	0	46358562	46385043	1.26053133453671e-07	64523575	64523575
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-0.9016	1.26053133453671e-07	64523575	64523575	1.12380610930814e-07	64532949	64532949
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	68064629	700	665	0.1814	1.12380610930814e-07	64532949	64532949	0	68059492	68070319
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	68070319	84523431	5341	5107	-0.5263	0	68059492	68070319	1.01229661215430e-53	84521641	84526347
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	84526347	84575212	28	25	0.2452	1.0122966121543e-53	84521641	84526347	2.23611469184754e-73	84572697	84577145
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	84577145	86118737	238	224	-0.5657	2.23611469184754e-73	84572697	84577145	1.27960934985728e-07	86107742	86123888
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86120619	86158166	20	19	-0.8638	1.27960934985728e-07	86107742	86123888	2.13300181026449e-10	86153422	86172836
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86160294	109216032	9069	8704	-0.5172	2.13300181026449e-10	86153422	86172836	7.4654354659926e-10	109212149	109216032
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109240210	6	5	0.2114	7.4654354659926e-10	109212149	109216032	2.25437892586643e-09	109240210	109247295
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	118611324	4299	4112	-0.522	2.25437892586643e-09	109240210	109247295	4.63354769470624e-48	118611324	118611324
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.5691	4.63354769470624e-48	118611324	118611324	2.33432489476759e-45	118620875	118620875
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	129188522	4725	4546	-0.527	2.33432489476759e-45	118620875	118620875	4.19853180940293e-36	129182289	129193801
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	129189253	129231869	36	36	-0.1724	4.19853180940293e-36	129182289	129193801	3.77119217916856e-10	129218491	129258693
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	129232782	132970189	1839	1762	-0.4599	3.77119217916856e-10	129218491	129258693	0	132965397	132971987
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	132971987	133574222	302	288	0.2469	0	132965397	132971987	0	133571933	133582910
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133580513	141393068	3623	3465	-0.4603	0	133571933	133582910	2.52093906985362e-17	141381496	141400646
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141394308	141440184	24	23	0.0143	2.52093906985362e-17	141381496	141400646	5.40345098856419e-15	141432778	141446728
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	112	-0.4693	5.40345098856419e-15	141432778	141446728	9.92354962266525e-25	141689547	141690753
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.3962	9.92354962266525e-25	141689547	141690753	1.05532251593525e-24	141714168	141720303
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	145233741	1316	1254	-0.4696	1.05532251593525e-24	141714168	141720303	0	145223890	145236124
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145236124	158821263	5436	5208	0.198	0	145223890	145236124	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.5666	NA	NA	NA	2.70553680913344e-45	581533	581533
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.4784	2.70553680913344e-45	581533	581533	3.87181582563285e-57	588865	588865
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7156900	2271	2184	-0.5788	3.87181582563285e-57	588865	588865	1.93579519679616e-22	7156900	7322035
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7226901	1	0	NA	1.93579519679616e-22	7156900	7322035	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-1.5464	NA	NA	NA	5.3546420786669e-29	7729311	7824059
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	16874181	2987	2872	-0.526	5.3546420786669e-29	7729311	7824059	4.00652733386642e-09	16869117	16874181
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16875574	16882152	2	2	0.6384	4.00652733386642e-09	16869117	16874181	6.06017701644907e-09	16882152	16885246
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16885246	25022606	2739	2623	-0.5301	6.06017701644907e-09	16882152	16885246	1.33990060937888e-62	25022606	25022606
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-2.9972	1.33990060937888e-62	25022606	25022606	4.94842611538329e-58	25039370	25039370
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25364544	148	141	-0.5616	4.94842611538329e-58	25039370	25039370	1.46492600827729e-10	25360879	25364544
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25367387	25373883	4	4	0.307	1.46492600827729e-10	25360879	25364544	1.41332126810897e-09	25373883	25375469
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25375469	28774717	1442	1387	-0.5262	1.41332126810897e-09	25373883	25375469	0	28773046	28776191
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	28776191	32797545	1467	1400	0.1736	0	28773046	28776191	3.13208764917836e-40	32797545	32797545
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-1.7036	3.13208764917836e-40	32797545	32797545	3.59894252208412e-40	32808049	32808049
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	47993944	3336	3194	0.1966	3.59894252208412e-40	32808049	32808049	4.15017174316632e-232	47980991	48000265
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	47995352	49570121	430	417	0.606	4.15017174316632e-232	47980991	48000265	4.82722134787158e-249	49552462	49596903
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	49577773	55208020	1591	1536	0.1734	4.82722134787158e-249	49552462	49596903	0	55204696	55215225
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	55210074	61873546	1887	1790	0.6508	0	55204696	55215225	1.64536593255259e-15	61866707	61884271
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	61876247	61930587	31	29	0.2623	1.64536593255259e-15	61866707	61884271	2.26601348663573e-15	61921745	61941179
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	61932547	68284454	1956	1883	0.6372	2.26601348663573e-15	61921745	61941179	1.278028677686e-46	68279693	68287813
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68286619	68437410	61	56	0.172	1.278028677686e-46	68279693	68287813	8.25108852048629e-47	68421777	68448519
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68442466	74659838	2111	2025	0.6253	8.25108852048629e-47	68421777	68448519	1.21853814989140e-124	74653984	74665294
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	74662843	75070364	167	155	0.1748	1.2185381498914e-124	74653984	74665294	1.04490845910281e-06	75067336	75079455
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75070496	75082273	5	5	0.6866	1.04490845910281e-06	75067336	75079455	2.47380727179264e-05	75079617	75099525
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75085865	75651294	163	160	0.1685	2.47380727179264e-05	75079617	75099525	4.50074606710236e-77	75628165	75662084
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75656158	76290009	177	170	0.6428	4.50074606710236e-77	75628165	75662084	5.21993168411387e-137	76265693	76304145
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	76294675	85547707	2182	2092	0.1825	5.21993168411387e-137	76265693	76304145	1.63631848747474e-09	85536142	85549060
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85549060	85580815	14	13	0.6159	1.63631848747474e-09	85536142	85549060	3.73706397551194e-10	85576714	85588328
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85582342	90577323	1428	1366	0.1606	3.73706397551194e-10	85576714	85588328	4.21328253877921e-08	90557131	90590265
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	90590265	90644971	9	8	-0.3602	4.21328253877921e-08	90557131	90590265	2.24104193887655e-07	90640212	90665161
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	90651975	90729968	13	12	0.2146	2.24104193887655e-07	90640212	90665161	1.49749429048559e-15	90729968	90746124
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	90740858	90877274	32	31	-0.5383	1.49749429048559e-15	90729968	90746124	4.00119727140453e-60	90871710	90879504
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	90879504	97804398	2193	2095	0.1668	4.00119727140453e-60	90871710	90879504	1.25777114988176e-132	97790126	97810039
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	97808758	98115571	138	134	0.68	1.25777114988176e-132	97790126	97810039	3.22960757541786e-101	98109960	98120735
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	98117815	100176685	798	763	0.1999	3.22960757541786e-101	98109960	98120735	7.61212407761943e-08	100160883	100180714
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	100179204	100192618	8	8	0.7214	7.61212407761943e-08	100160883	100180714	2.23361478103269e-07	100186324	100198425
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	100194189	101228126	502	486	0.2423	2.23361478103269e-07	100186324	100198425	4.02319452261632e-08	101221373	101230574
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	101230574	101245220	8	8	0.7408	4.02319452261632e-08	101221373	101230574	2.49754142411628e-06	101245220	101255162
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	101247218	101573681	101	97	0.2158	2.49754142411628e-06	101245220	101255162	1.44473447570992e-08	101563412	101578246
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	101576746	101598260	10	9	0.8046	1.44473447570992e-08	101563412	101578246	6.48540783133214e-11	101594242	101602690
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	101600698	102698779	392	372	0.2067	6.48540783133214e-11	101594242	101602690	9.85204758413642e-25	102692722	102704040
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102700984	102810285	50	50	0.5962	9.85204758413642e-25	102692722	102704040	4.35590673664487e-30	102804266	102819283
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102813783	110964296	2818	2697	0.2014	4.35590673664487e-30	102804266	102819283	0	110932360	110976330
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	110971261	116139362	1135	1083	0.6338	0	110932360	110976330	5.41432501594032e-161	116107183	116168002
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	116147874	117567934	369	352	0.9991	5.41432501594032e-161	116107183	116168002	6.17231528907842e-166	117528885	117595462
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	117574001	121124797	1240	1189	1.3997	6.17231528907842e-166	117528885	117595462	8.7579341745521e-239	121120080	121130452
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	121126112	121126112	1	0	NA	8.7579341745521e-239	121120080	121130452	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	121130452	121622635	218	208	2.0115	NA	NA	NA	1.58401844625900e-225	121620449	121626342
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	121624655	127920590	1998	1912	1.4598	1.584018446259e-225	121620449	121626342	2.01770356904001e-258	127844865	127962866
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	127923915	137460707	2903	2785	1.2144	2.01770356904001e-258	127844865	127962866	2.61967559926398e-17	137407706	137490375
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137470815	137748793	43	43	0.8781	2.61967559926398e-17	137407706	137490375	4.74587106557794e-211	137748793	137748793
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137751905	137922591	32	31	-0.6597	4.74587106557794e-211	137748793	137748793	9.18843442864568e-277	137922591	137922591
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	141857404	1235	1168	0.9411	9.18843442864568e-277	137922591	137922591	1.59935029816033e-97	141836884	141886723
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	141859078	143888195	782	752	0.684	1.59935029816033e-97	141836884	141886723	6.76789565579962e-10	143869553	143914353
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143889160	144005097	31	30	0.3262	6.76789565579962e-10	143869553	143914353	5.17653855554072e-07	143954402	144172829
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144106507	146264846	772	745	0.6768	5.17653855554072e-07	143954402	144172829	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7627	-0.5362	NA	NA	NA	5.76239138956445e-125	23343915	23343915
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.9099	5.76239138956445e-125	23343915	23343915	5.74661228183344e-120	23365926	23365926
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39048058	4723	4541	-0.53	5.74661228183344e-120	23365926	23365926	4.37732596429775e-28	38758232	39048058
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39062211	39130211	4	3	-1.3372	4.37732596429775e-28	38758232	39048058	8.73582388887364e-07	39130211	39146895
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	70926188	342	332	-0.5627	8.73582388887364e-07	39130211	39146895	4.15641323476721e-113	70926188	70926188
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.3457	4.15641323476721e-113	70926188	70926188	5.56439348009952e-109	70930528	70930528
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	87138428	5393	5188	-0.5511	5.56439348009952e-109	70930528	70930528	6.55828668947877e-98	87138428	87138428
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	87139814	87149173	5	5	-2.8333	6.55828668947877e-98	87138428	87138428	8.33945723262505e-97	87149173	87149173
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	87153415	112062107	8374	8016	-0.5317	8.33945723262505e-97	87149173	87149173	1.13819991895794e-09	112062107	112062107
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-1.618	1.13819991895794e-09	112062107	112062107	3.26412840342458e-74	112069192	112069192
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	140145683	11096	10640	-0.48	3.26412840342458e-74	112069192	112069192	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	3115497	1137	1095	0.1044	NA	NA	NA	5.97965474796889e-15	3110027	3119817
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3118513	3154316	16	15	0.6447	5.97965474796889e-15	3110027	3119817	6.3279906211242e-15	3149623	3159741
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3157456	35084592	11415	10920	0.1234	6.3279906211242e-15	3149623	3159741	0	35078593	35088891
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	35085999	35810696	302	287	0.6712	0	35078593	35088891	1.68511891010142e-238	35800324	35815882
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	35812318	59757178	4893	4705	0.1813	1.68511891010142e-238	35800324	35815882	1.58128123460302e-09	59755454	59757178
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	59759443	59759443	1	0	NA	1.58128123460302e-09	59755454	59757178	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	59762013	59763385	2	2	-0.7376	NA	NA	NA	2.57440185112606e-07	59763385	59766415
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	59766415	63313067	1199	1142	0.2232	2.57440185112606e-07	59763385	59766415	2.90166723534151e-11	63310749	63318334
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	63315067	63328843	6	6	0.9091	2.90166723534151e-11	63310749	63318334	2.03685921090809e-10	63326535	63332373
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	63331205	69920448	2210	2115	0.2034	2.03685921090809e-10	63326535	63332373	5.19741498197498e-72	69909833	69926784
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69922909	69922909	1	0	NA	5.19741498197498e-72	69909833	69926784	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69925203	70129706	96	93	0.6708	NA	NA	NA	4.02111656515221e-69	70125686	70137443
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70133541	84491707	5304	5080	0.2105	4.02111656515221e-69	70125686	70137443	5.45685278779886e-22	84482688	84505119
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	84493899	84567234	35	34	0.6436	5.45685278779886e-22	84482688	84505119	1.00493298104089e-23	84556277	84575382
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	84568645	127563278	15473	14810	0.2068	1.00493298104089e-23	84556277	84575382	3.28184144169664e-13	127560827	127563278
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127578239	7	7	-0.5198	3.28184144169664e-13	127560827	127563278	4.34223595359885e-12	127578239	127581493
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127581493	135285645	2711	2597	0.1859	4.34223595359885e-12	127578239	127581493	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	562233	141	138	-0.3958	NA	NA	NA	2.87034769341736e-53	562233	562233
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	567312	569718	3	3	-2.79	2.87034769341736e-53	562233	562233	1.67350193335307e-45	569718	569718
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	571761	571761	1	0	NA	1.67350193335307e-45	569718	569718	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	574017	4229388	1380	1318	-0.4054	NA	NA	NA	0	4183268	4343816
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4309183	6134095	784	754	0.1229	0	4183268	4343816	5.32705668329276e-28	6129015	6148585
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6144917	6234905	42	40	0.6055	5.32705668329276e-28	6129015	6148585	1.82962077641106e-26	6227269	6243475
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6235928	9975184	1628	1550	0.1618	1.82962077641106e-26	6227269	6243475	2.01150356978093e-14	9969799	9978924
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9976937	10012710	16	16	0.6815	2.01150356978093e-14	9969799	9978924	1.60253740499557e-16	10009711	10017412
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	10016215	22345257	4672	4486	0.1401	1.60253740499557e-16	10009711	10017412	2.07839438802394e-76	22338802	22351870
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	22346695	22696804	90	81	0.6543	2.07839438802394e-76	22338802	22351870	2.27626168229392e-77	22685478	22701429
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	22697024	47446041	7400	7089	0.1451	2.27626168229392e-77	22685478	22701429	7.93543506703359e-32	47436303	47447526
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47447526	47529291	39	39	0.6162	7.93543506703359e-32	47436303	47447526	1.69649504735701e-20	47522647	47537788
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47532199	55118214	709	681	0.2119	1.69649504735701e-20	47522647	47537788	2.08025279932598e-43	55112618	55124730
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	38	-0.3837	2.08025279932598e-43	55112618	55124730	8.0881978132936e-46	55207305	55221692
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	62051392	2711	2587	0.2077	8.0881978132936e-46	55207305	55221692	1.53726668319603e-15	62044850	62056470
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62054081	62090200	19	18	0.7127	1.53726668319603e-15	62044850	62056470	2.53936199348984e-13	62084013	62098678
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62092641	64858484	1186	1132	0.2293	2.53936199348984e-13	62084013	62098678	1.01680957549196e-07	64841972	64869674
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64859557	64908525	19	19	0.592	1.01680957549196e-07	64841972	64869674	5.32651157603281e-07	64890461	64925811
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64909785	66463477	702	664	0.2362	5.32651157603281e-07	64890461	64925811	8.49283214879398e-09	66460753	66463477
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.4468	8.49283214879398e-09	66460753	66463477	1.02035589722009e-10	66469412	66469412
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	105786885	13143	12582	0.2021	1.02035589722009e-10	66469412	66469412	3.13990254346454e-55	105759908	105805880
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	105791800	106178990	92	87	0.6203	3.13990254346454e-55	105759908	105805880	1.63337912792335e-61	106170815	106186356
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106180192	116079231	3302	3158	0.1905	1.63337912792335e-61	106170815	106186356	2.89672593290310e-34	116040446	116089606
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	116085864	116185148	42	42	0.6514	2.8967259329031e-34	116040446	116089606	4.05598656424513e-27	116174789	116236345
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	116227321	120678087	1973	1885	0.2201	4.05598656424513e-27	116174789	116236345	1.10596664733190e-08	120646288	120681756
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	120680370	120717892	18	18	0.5971	1.1059666473319e-08	120646288	120681756	8.17296232114563e-20	120715854	120732418
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	120720259	134450318	5150	4929	0.1772	8.17296232114563e-20	120715854	120732418	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	286	0.6256	NA	NA	NA	1.42820229517409e-06	734832	736988
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.175	1.42820229517409e-06	734832	736988	3.88851036115734e-08	743223	747365
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3295	0.6446	3.88851036115734e-08	743223	747365	1.75060833924007e-208	9523923	9523923
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9550789	4	4	-3.3881	1.75060833924007e-208	9523923	9523923	1.62106918886932e-28	9550789	9550789
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9554149	9610054	12	12	-0.1688	1.62106918886932e-28	9550789	9550789	1.66983864849922e-26	9607363	9626623
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	548	0.6583	1.66983864849922e-26	9607363	9626623	6.82061405762735e-42	11116883	11116883
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	2.1076	6.82061405762735e-42	11116883	11116883	1.27257065727533e-29	11140421	11140421
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11471117	81	81	0.6653	1.27257065727533e-29	11140421	11140421	2.98886315967217e-09	11395862	11499421
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11474527	11706924	58	54	0.9791	2.98886315967217e-09	11395862	11499421	3.48018931621718e-19	11698655	11720186
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11709059	15022610	1445	1390	0.6564	3.48018931621718e-19	11698655	11720186	5.14196491786069e-60	15018685	15026060
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	15024788	15201748	51	46	1.2666	5.14196491786069e-60	15018685	15026060	1.06087286605315e-07	15186046	15215949
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	15204586	15287808	43	41	1.5587	1.06087286605315e-07	15186046	15215949	0.000821148166232553	15273929	15309663
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	15290052	15348236	10	10	1.2152	0.000821148166232553	15273929	15309663	8.70754637237279e-12	15334021	15359299
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	15353253	31084265	5128	4921	0.6398	8.70754637237279e-12	15334021	15359299	7.51265919015904e-20	31066869	31171313
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31098259	31296973	45	44	0.286	7.51265919015904e-20	31066869	31171313	8.24920819360924e-22	31289039	31308483
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31298659	33854421	914	874	0.6682	8.24920819360924e-22	31289039	31308483	0	33839947	33860652
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33858537	39161748	754	724	0.1708	0	33839947	33860652	0	39158958	39163304
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	39163304	46452343	2378	2278	-0.5471	0	39158958	39163304	0	46450716	46454604
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46454604	46890904	218	209	0.2244	0	46450716	46454604	0	46885559	46892427
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46892427	104508782	19411	18574	-0.5171	0	46885559	46892427	0	104502285	104518372
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	104518372	117879234	4904	4703	0.1948	0	104502285	104518372	0	117863511	117891421
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	117881875	122264615	1895	1800	0.6517	0	117863511	117891421	1.62616249285569e-10	122256074	122268871
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	122266124	122285276	11	11	1.2238	1.62616249285569e-10	122256074	122268871	9.55768143326571e-12	122280977	122288023
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	122286700	132289090	3479	3307	0.6362	9.55768143326571e-12	122280977	122288023	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18463142	34	31	0.0983	NA	NA	NA	5.76149486327167e-05	18453728	18463142
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18464409	18468031	4	4	-0.5994	5.76149486327167e-05	18453728	18463142	4.84751010156926e-06	18468031	18471165
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18469503	19334518	276	269	0.1674	4.84751010156926e-06	18468031	18471165	9.15386490872625e-07	19327742	19334518
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19337560	19355808	6	6	0.8282	9.15386490872625e-07	19327742	19334518	1.20699522289331e-08	19355808	19362016
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19357527	37953582	7018	6712	0.1856	1.20699522289331e-08	19355808	19362016	2.16326816426569e-172	37953582	37953582
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.6086	2.16326816426569e-172	37953582	37953582	2.15490268635338e-166	37957844	37957844
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	41495193	1449	1387	0.1846	2.15490268635338e-166	37957844	37957844	2.36216553622532e-07	41492209	41495193
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	41500109	41509231	5	5	-0.4729	2.36216553622532e-07	41492209	41495193	1.14492960322523e-08	41509231	41512062
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	41512062	49964838	3425	3296	0.2014	1.14492960322523e-08	41509231	41512062	7.03404100303827e-19	49964838	49964838
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.7499	7.03404100303827e-19	49964838	49964838	2.28996520571151e-19	49971732	49971732
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1738	0.1761	2.28996520571151e-19	49971732	49971732	3.75574362752362e-10	56600720	56658479
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	0.6125	3.75574362752362e-10	56600720	56658479	8.44706765220877e-08	56679017	56688605
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	56774546	20	20	0.1082	8.44706765220877e-08	56679017	56688605	2.4258613339098e-28	56770498	56777182
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56777182	56946038	36	36	-0.719	2.4258613339098e-28	56770498	56777182	1.61074509263616e-111	56937354	56946038
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56952687	64605525	1644	1575	0.1447	1.61074509263616e-111	56937354	56946038	9.29080522639961e-79	64572517	64615816
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	64615816	65152450	86	80	0.6358	9.29080522639961e-79	64572517	64615816	2.75520094604183e-71	65132282	65185964
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	65169548	102017512	11892	11375	0.1661	2.75520094604183e-71	65132282	65185964	2.99893168666495e-144	101986241	102028297
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	102021102	102456426	194	182	0.6098	2.99893168666495e-144	101986241	102028297	1.00109389721237e-87	102440648	102468805
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	102461684	103760260	222	212	0.1624	1.00109389721237e-87	102440648	102468805	4.49168336885883e-315	103754183	103767575
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	103767575	114123340	3511	3358	-0.528	4.49168336885883e-315	103754183	103767575	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	20396799	511	486	0.2057	NA	NA	NA	6.45486071073846e-09	20387667	20406205
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20404754	20445600	14	13	0.6473	6.45486071073846e-09	20387667	20406205	1.86778799143208e-09	20435941	20467991
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20447721	22547992	1012	961	0.2777	1.86778799143208e-09	20435941	20467991	2.02655696477763e-12	22545671	22549517
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22549517	22552528	3	3	1.0454	2.02655696477763e-12	22545671	22549517	7.03692527253745e-08	22550588	22554737
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22554737	38725862	5727	5490	0.189	7.03692527253745e-08	22550588	22554737	3.08659061170838e-08	38724727	38725862
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	38727102	38735127	5	5	-0.4877	3.08659061170838e-08	38724727	38725862	2.27164077374829e-10	38735127	38738224
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	38736426	38736426	1	0	NA	2.27164077374829e-10	38735127	38738224	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	38738224	40676611	375	366	0.2122	NA	NA	NA	1.37110271658981e-05	40651178	40687108
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.6243	1.37110271658981e-05	40651178	40687108	8.61511339105619e-06	40704122	40760176
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	41301235	136	129	0.1933	8.61511339105619e-06	40704122	40760176	1.27455463377713e-31	41287721	41308146
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	41302239	41432695	62	59	0.6182	1.27455463377713e-31	41287721	41308146	1.17212906467850e-43	41428347	41439665
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	41434634	46775775	1161	1118	0.1892	1.1721290646785e-43	41428347	41439665	5.62935821657156e-11	46774115	46775775
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46778735	46787389	5	5	-0.5445	5.62935821657156e-11	46774115	46775775	1.00524392090415e-09	46787389	46789074
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46789074	73061942	10399	9958	0.1964	1.00524392090415e-09	46787389	46789074	2.59849572900695e-19	73060301	73075500
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	8	-0.6154	2.59849572900695e-19	73060301	73075500	1.74907579944839e-19	73091980	73101327
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	80814220	3584	3433	0.1931	1.74907579944839e-19	73091980	73101327	3.41316507749612e-40	80811994	80815242
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	80815242	80851344	19	18	-0.575	3.41316507749612e-40	80811994	80815242	3.57145595742582e-30	80846467	80851344
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	80853583	81003411	67	63	0.1804	3.57145595742582e-30	80846467	80851344	5.66020236808083e-07	80997484	81003411
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	81005077	81014114	6	6	0.7292	5.66020236808083e-07	80997484	81003411	1.48312023529583e-07	81014114	81021806
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	81015817	85266849	860	829	0.1601	1.48312023529583e-07	81014114	81021806	8.05276013947248e-20	85239078	85279387
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85275361	85483230	36	36	0.5346	8.05276013947248e-20	85239078	85279387	5.30476766466462e-16	85458333	85518928
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85490546	95181454	3704	3548	0.1856	5.30476766466462e-16	85458333	85518928	2.02996970375965e-12	95173187	95185876
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	95183054	95214967	19	18	0.6217	2.02996970375965e-12	95173187	95185876	2.52816231146994e-11	95211996	95221504
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	95216161	101415050	2223	2133	0.189	2.52816231146994e-11	95211996	95221504	3.06462268491073e-13	101410294	101416537
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101416537	101442622	14	14	0.7178	3.06462268491073e-13	101410294	101416537	8.5483166128967e-10	101435918	101454235
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101444399	105788623	1717	1643	0.2307	8.5483166128967e-10	101435918	101454235	1.28098260490646e-15	105787390	105788623
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105789767	105798116	5	5	-0.789	1.28098260490646e-15	105787390	105788623	4.02263416057389e-14	105798116	105798116
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105850033	21	21	0.1944	4.02263416057389e-14	105798116	105798116	3.54426303881363e-11	105850033	105850033
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-0.6402	3.54426303881363e-11	105850033	105850033	7.45793266610386e-06	105875924	105881893
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105948347	19	19	0.1403	7.45793266610386e-06	105875924	105881893	0.00159189486031482	105919618	105962305
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105985458	12	11	0.5847	0.00159189486031482	105919618	105962305	3.47194242389507e-05	105973615	106019719
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105989160	105989160	1	0	NA	3.47194242389507e-05	105973615	106019719	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106358491	146	143	0.1654	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.4953	NA	NA	NA	5.02935464769245e-12	18692865	18741716
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19465359	92	91	0.3594	5.02935464769245e-12	18692865	18741716	3.51582360218686e-13	19424067	19800789
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	19874677	13	13	1.0047	3.51582360218686e-13	19424067	19800789	5.19642704992829e-07	19819961	19882711
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19879448	20088256	45	41	0.5958	5.19642704992829e-07	19819961	19882711	1.47709393998320e-185	20088256	20088256
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32536263	3678	3496	-0.5672	1.4770939399832e-185	20088256	20088256	7.32207117644631e-10	32523241	32546617
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32539377	32572315	12	12	-0.0577	7.32207117644631e-10	32523241	32546617	1.79806977272547e-16	32560268	32583146
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32576881	41580562	3634	3471	-0.5244	1.79806977272547e-16	32560268	32583146	4.54666909439857e-22	41577471	41585642
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41584581	41607374	16	15	0.1293	4.54666909439857e-22	41577471	41585642	2.29245857841629e-24	41603798	41610260
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41608964	42814374	550	534	-0.5288	2.29245857841629e-24	41603798	41610260	0	42809137	42815957
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	42815957	61254837	7591	7262	0.159	0	42809137	42815957	0	61248995	61258354
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	61255880	64297575	1600	1532	0.6407	0	61248995	61258354	0	64291078	64304864
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	64301099	69746189	2301	2186	0.1966	0	64291078	64304864	0	69741527	69753479
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69748140	69748140	1	0	NA	0	69741527	69753479	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69749320	74669752	2172	2082	-0.4278	NA	NA	NA	5.54435326664066e-16	74665386	74669752
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.6431	5.54435326664066e-16	74665386	74669752	2.80914314211189e-15	74680439	74696127
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	160	-0.4448	2.80914314211189e-15	74680439	74696127	3.94381912995806e-08	75114211	75115806
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	0.6667	3.94381912995806e-08	75114211	75115806	2.88950779611380e-08	75119713	75121466
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	80360337	2045	1951	-0.4533	2.8895077961138e-08	75119713	75121466	4.97650544175072e-233	80357507	80362078
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	80362078	81352336	154	150	0.2348	4.97650544175072e-233	80357507	80362078	6.9078702546984e-88	81347511	81360742
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	81353945	87482804	2337	2243	0.662	6.9078702546984e-88	81347511	81360742	0	87470565	87497071
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87484520	99632987	4625	4400	0.9833	0	87470565	87497071	3.95902771137912e-11	99632987	99632987
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.315	3.95902771137912e-11	99632987	99632987	1.12434514704906e-10	99635701	99635701
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217181	267	255	0.963	1.12434514704906e-10	99635701	99635701	2.16659090226692e-08	100212174	100278665
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	0.2397	2.16659090226692e-08	100212174	100278665	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	3275631	1274	1205	-0.3619	NA	NA	NA	2.22205000932023e-07	3268475	3275631
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3277821	3288953	7	7	0.3259	2.22205000932023e-07	3268475	3275631	6.82693983653089e-22	3288953	3291394
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3291394	14876356	4187	4017	-0.5143	6.82693983653089e-22	3288953	3291394	9.24835317718227e-25	14687636	14956177
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-1.2614	9.24835317718227e-25	14687636	14956177	5.04425544693208e-26	15028108	15034210
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	33278944	5109	4906	-0.5107	5.04425544693208e-26	15028108	15034210	1.39704372864336e-26	32558526	33278944
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33293241	33396966	7	7	0.1439	1.39704372864336e-26	32558526	33278944	7.75674591223337e-20	33396966	33469289
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33445329	67456060	7148	6849	-0.5216	7.75674591223337e-20	33396966	33469289	3.31105511708114e-21	67454628	67456060
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	67458787	67461846	2	2	0.5283	3.31105511708114e-21	67454628	67456060	2.40338184204105e-06	67461846	67466009
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	67466009	68534408	538	516	-0.4607	2.40338184204105e-06	67461846	67466009	2.04541557778964e-09	68529419	68649801
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68606309	68838384	24	22	-0.8295	2.04541557778964e-09	68529419	68649801	8.55544424565392e-10	68744086	68850394
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68842364	69373238	239	227	-0.4452	8.55544424565392e-10	68744086	68850394	4.45973659867686e-06	69370753	69373238
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69374507	69375802	2	2	-1.4056	4.45973659867686e-06	69370753	69373238	4.36814295527812e-20	69375802	69379489
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69378025	69378025	1	0	NA	4.36814295527812e-20	69375802	69379489	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69379489	72941901	1212	1173	-0.5069	NA	NA	NA	2.80262393708121e-23	72929786	72941901
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72963578	4	4	-1.382	2.80262393708121e-23	72929786	72941901	2.46059911959065e-11	72963578	72963578
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72964783	75093957	755	728	-0.4918	2.46059911959065e-11	72963578	72963578	1.28742223053877e-35	75093957	75093957
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.3156	1.28742223053877e-35	75093957	75093957	2.59415151527269e-36	75100865	75100865
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	587	-0.5778	2.59415151527269e-36	75100865	75100865	3.78069281144232e-18	76923844	76925748
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.2447	3.78069281144232e-18	76923844	76925748	2.23310846518457e-33	76940218	76944661
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4313	-0.498	2.23310846518457e-33	76940218	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1903358	853	812	-0.4508	NA	NA	NA	1.75940216121537e-16	1902148	1903358
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1906391	4	4	0.7472	1.75940216121537e-16	1902148	1903358	4.85063244766055e-18	1906391	1906391
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	4051644	951	914	-0.47	4.85063244766055e-18	1906391	1906391	7.26579898477189e-08	4047239	4051644
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4052847	4059947	6	6	0.1906	7.26579898477189e-08	4047239	4051644	1.20900466350183e-12	4059947	4065405
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4061551	4061551	1	0	NA	1.20900466350183e-12	4059947	4065405	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4063438	17525096	5153	4936	-0.5128	NA	NA	NA	1.10572229264066e-20	17521021	17530886
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	17527121	17552356	15	15	0.142	1.10572229264066e-20	17521021	17530886	1.27109902085519e-19	17547606	17556809
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	17555662	31457889	5054	4832	-0.4924	1.27109902085519e-19	17547606	17556809	1.12734536360842e-20	31447686	31467971
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	17	-1.1037	1.12734536360842e-20	31447686	31467971	2.03783473341256e-20	31490899	31503774
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32447831	173	169	-0.4734	2.03783473341256e-20	31490899	31503774	2.40367404533224e-143	32446622	32449417
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32449417	32828797	193	185	0.1951	2.40367404533224e-143	32446622	32449417	2.36988761167344e-10	32826928	32828797
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.4036	2.36988761167344e-10	32826928	32828797	3.99618903815574e-09	32832642	32833765
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1394	0.2294	3.99618903815574e-09	32832642	32833765	4.53533910806636e-34	36673853	36673853
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-1.0586	4.53533910806636e-34	36673853	36673853	2.86687631171207e-32	36684619	36684619
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41550918	2024	1941	0.2313	2.86687631171207e-32	36684619	36684619	3.80452348064367e-65	41546807	41553226
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41552048	41710400	54	54	-0.3845	3.80452348064367e-65	41546807	41553226	3.10527450150381e-66	41706870	42143048
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	51770888	3243	3096	0.212	3.10527450150381e-66	41706870	42143048	2.49724021622681e-08	51770828	51770888
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	51771564	51779169	2	2	1.3321	2.49724021622681e-08	51770828	51770888	1.54236353495856e-08	51779169	51780508
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	51780508	53394451	667	641	0.2163	1.54236353495856e-08	51779169	51780508	2.88838509166091e-36	53391552	53394451
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	53397199	53427443	16	16	1.0237	2.88838509166091e-36	53391552	53394451	2.58215707136758e-34	53427443	53430088
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	53430088	57750549	1756	1663	0.2277	2.58215707136758e-34	53427443	53430088	0	57736486	57769554
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	57762852	77009423	7366	7067	-0.4671	0	57736486	57769554	0	77009423	77011137
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	77011137	78653545	629	591	0.69	0	77009423	77011137	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	115020	4	4	0.2477	NA	NA	NA	2.25357171357181e-08	112131	121665
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	121665	3485718	1207	1151	-0.5351	2.25357171357181e-08	112131	121665	0	3485718	3488055
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	3488055	3650711	73	69	-2.6142	0	3485718	3488055	0	3649463	3650711
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	3654609	14112462	3639	3466	-0.5418	0	3649463	3650711	2.00358448131936e-102	14096231	14142555
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	14114512	16780963	70	70	0.099	2.00358448131936e-102	14096231	14142555	1.40230971987406e-28	14968075	16787891
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	16783849	16940655	69	66	0.6799	1.40230971987406e-28	14968075	16787891	0	16940655	16940655
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	16943794	16943794	1	0	NA	0	16940655	16940655	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	16945712	46956124	9280	8914	-0.5268	NA	NA	NA	0	46956124	46958184
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	46958184	47325941	108	103	-2.6064	0	46956124	46958184	0	47324168	47325941
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	47338019	68541706	6044	5783	-0.5369	0	47324168	47325941	1.46188210146266e-26	68539085	68541706
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	68546217	68569178	12	12	0.2333	1.46188210146266e-26	68539085	68541706	1.00969517570647e-24	68569178	68573275
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	68573275	76116026	2457	2347	-0.5434	1.00969517570647e-24	68569178	68573275	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	5889755	2612	2509	-0.3745	NA	NA	NA	3.45134995559302e-14	5885250	5891680
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	5891680	5911999	14	14	0.2549	3.45134995559302e-14	5885250	5891680	2.82735575120923e-24	5910650	5913150
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	5913150	7163243	588	567	-0.4895	2.82735575120923e-24	5910650	5913150	0	7163243	7164473
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7164473	8994090	790	748	0.614	0	7163243	7164473	3.00939911971795e-81	8963005	9049489
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8999471	10698881	782	748	0.9022	3.00939911971795e-81	8963005	9049489	0	10696730	10699821
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10699821	12399730	757	736	0.2023	0	10696730	10699821	2.85063010456906e-121	12386815	12428463
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12400986	13028289	295	281	0.6478	2.85063010456906e-121	12386815	12428463	1.50341381815108e-07	13025169	13028289
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13029419	13030925	2	2	-0.6223	1.50341381815108e-07	13025169	13028289	6.27251104518501e-08	13030925	13033606
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13033606	20386500	3375	3206	0.6239	6.27251104518501e-08	13030925	13033606	0	20369347	20422223
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	52981940	8858	8461	0.1857	0	20369347	20422223	2.44956417878739e-11	52979731	52981940
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52983820	52994318	6	6	-0.6147	2.44956417878739e-11	52979731	52981940	3.02281514899028e-11	52994318	52996264
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52996264	58206232	2387	2291	0.1745	3.02281514899028e-11	52994318	52996264	4.14686744423934e-07	58197961	58212113
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58208527	58244012	16	14	-0.2414	4.14686744423934e-07	58197961	58212113	3.06812473358341e-07	58239871	58261341
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	63788698	2577	2467	0.1713	3.06812473358341e-07	58239871	58261341	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	11849327	4246	4055	0.9688	NA	NA	NA	2.38433880201006e-14	11836899	11858156
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	11851130	12062410	36	34	0.6076	2.38433880201006e-14	11836899	11858156	2.91626995447536e-16	12027735	12127349
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12074039	18018524	2242	2148	0.9696	2.91626995447536e-16	12027735	12127349	7.13893003447627e-205	18006130	18035912
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	18020194	19777847	631	597	0.6311	7.13893003447627e-205	18006130	18035912	0	19773066	19787402
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	19781468	25446357	1763	1682	0.1564	0	19773066	19787402	6.21622482079724e-17	25438339	25453685
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	25448894	25496853	21	19	0.6678	6.21622482079724e-17	25438339	25453685	1.57482771113302e-16	25488947	25500782
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	25499631	26106478	71	68	0.118	1.57482771113302e-16	25488947	25500782	8.21109944037301e-05	26076860	26115657
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26108173	26126306	7	7	0.5841	8.21109944037301e-05	26076860	26115657	0.000953212547248692	26125721	26130512
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26127264	26142400	14	13	0.0495	0.000953212547248692	26125721	26130512	0.0356262746322588	26130512	26156026
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26144661	28266113	21	20	-0.2195	0.0356262746322588	26130512	26156026	4.57574032684916e-12	28247413	29311018
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	36439385	3136	2992	0.2064	4.57574032684916e-12	28247413	29311018	1.81541656767584e-08	36437144	36439385
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	36443254	36446265	3	3	-0.72	1.81541656767584e-08	36437144	36439385	2.34663690802493e-08	36446265	36450253
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	36450253	41718865	1722	1625	0.1308	2.34663690802493e-08	36446265	36450253	1.48134490729316e-06	41716093	41718865
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	41720184	41723558	2	2	1.0596	1.48134490729316e-06	41716093	41718865	4.36532564677921e-05	41723558	41725446
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	41725446	48663634	2732	2616	0.176	4.36532564677921e-05	41723558	41725446	9.53830455311704e-25	48657343	48672693
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48664432	48768416	54	52	0.5501	9.53830455311704e-25	48657343	48672693	2.14194739849994e-29	48750872	48774704
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48769946	60317278	3983	3798	0.1545	2.14194739849994e-29	48750872	48774704	0	60312572	60333300
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60317520	62419534	895	858	0.6288	0	60312572	60333300	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	13562263	25	22	-0.7064	NA	NA	NA	1.52962678562910e-08	10165953	13687936
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13600227	13600227	1	0	NA	1.5296267856291e-08	10165953	13687936	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13612839	14329497	49	45	-0.1736	NA	NA	NA	2.98547577922909e-05	13889359	14368782
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14330769	14489502	47	44	-0.4824	2.98547577922909e-05	13889359	14368782	4.96865266831309e-07	14486161	14489502
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14491488	14501081	3	3	0.3645	4.96865266831309e-07	14486161	14489502	1.37489346442333e-09	14501081	14503669
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14503669	16012221	570	543	-0.5464	1.37489346442333e-09	14501081	14503669	1.76484786336411e-260	16010166	16013668
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16013668	16334316	150	145	0.2118	1.76484786336411e-260	16010166	16013668	1.65195973746565e-275	16333003	16335957
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16335957	21688347	1915	1821	-0.5383	1.65195973746565e-275	16333003	16335957	0	21685616	21692684
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	21692684	26035656	1178	1115	0.1573	0	21685616	21692684	5.39062485491828e-109	26030188	26040005
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	26038694	26321886	138	133	0.6354	5.39062485491828e-109	26030188	26040005	3.04912924926028e-96	26314084	26328442
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	26324044	30517973	1436	1384	0.1833	3.04912924926028e-96	26314084	26328442	0	30514198	30519336
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	30519336	38292262	3778	3596	-0.524	0	30514198	30519336	0	38290307	38293938
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	38293938	39189156	462	441	0.1774	0	38290307	38293938	1.89700070450509e-40	39187067	39190634
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	39190634	39222160	21	21	0.9325	1.89700070450509e-40	39187067	39190634	1.24644225272649e-35	39218462	39226868
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	39225216	45344507	2925	2801	0.2046	1.24644225272649e-35	39218462	39226868	7.29208641324826e-23	45341526	45344507
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	45345821	45345821	1	0	NA	7.29208641324826e-23	45341526	45344507	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	45348895	45367164	13	13	-0.5377	NA	NA	NA	6.63237927392509e-22	45367164	45370017
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	45368574	45368574	1	0	NA	6.63237927392509e-22	45367164	45370017	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	45370017	46922972	728	690	0.1898	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	24222194	3688	3527	0.2071	NA	NA	NA	9.71141524656403e-177	24219554	24223585
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24223585	24470106	123	116	-0.5337	9.71141524656403e-177	24219554	24223585	4.33633479992094e-204	24468607	24471605
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24471605	26954738	1531	1462	0.1906	4.33633479992094e-204	24468607	24471605	6.34515267000222e-135	26948662	26957720
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	26956144	27321356	197	188	0.6582	6.34515267000222e-135	26948662	26957720	0	27321356	27323022
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27323022	29564367	1207	1146	-0.4505	0	27321356	27323022	2.16160919533972e-08	29563483	29564367
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	29574316	29582674	4	3	-1.4066	2.16160919533972e-08	29563483	29564367	6.61047492944631e-08	29581368	29584524
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	29584524	35472378	2801	2675	-0.5075	6.61047492944631e-08	29581368	29584524	5.31771503381483e-08	35472378	35472378
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.6215	5.31771503381483e-08	35472378	35472378	5.74421362403184e-08	35476942	35476942
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	40025517	2430	2340	-0.4507	5.74421362403184e-08	35476942	35476942	2.88969489908791e-08	40017002	40025517
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40027630	40028911	2	2	0.7399	2.88969489908791e-08	40017002	40025517	6.21910082825233e-10	40028911	40028911
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40030431	41220567	619	592	-0.4554	6.21910082825233e-10	40028911	40028911	4.0368375615769e-35	41216678	41237593
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41226643	41323557	24	21	0.2468	4.0368375615769e-35	41216678	41237593	1.42328901979804e-31	41319774	41325707
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41324672	49571068	3928	3752	-0.4648	1.42328901979804e-31	41319774	41325707	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	-0.1959	NA	NA	NA	1.22213500349428e-19	94062	94062
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.6049	1.22213500349428e-19	94062	94062	2.28732217479405e-20	104732	106242
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	203986	49	48	-0.4676	2.28732217479405e-20	104732	106242	9.3816323674259e-05	163455	211285
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	205706	222034	20	20	-0.0695	9.3816323674259e-05	163455	211285	8.8621164604817e-08	213885	231553
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	223009	1521019	766	741	-0.4517	8.8621164604817e-08	213885	231553	4.00322357818457e-11	1518376	1526617
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1522369	1530474	10	9	-1.1206	4.00322357818457e-11	1518376	1526617	9.51344377195092e-08	1529356	1534998
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2708291	935	899	-0.4866	9.51344377195092e-08	1529356	1534998	0	2708113	2711273
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	35973720	12440	11886	0.4704	0	2708113	2711273	4.99277573610268e-09	35969493	35973720
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	35975613	35977427	2	2	-0.8245	4.99277573610268e-09	35969493	35973720	2.64928935908743e-08	35977427	35977427
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	35981008	70339259	9042	8648	0.4611	2.64928935908743e-08	35977427	35977427	1.19990478452679e-10	70339259	70339259
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	70343617	70345180	2	2	-0.9825	1.19990478452679e-10	70339259	70339259	4.77359559570061e-11	70345180	70345180
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	70347182	76998610	1453	1391	0.4618	4.77359559570061e-11	70345180	70345180	1.62080701384365e-30	76998610	76998610
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.9019	1.62080701384365e-30	76998610	76998610	2.90299737555062e-31	77010018	77010018
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	104142227	5860	5593	0.4529	2.90299737555062e-31	77010018	77010018	1.66869636123811e-09	104139248	104142227
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104143351	104153314	6	6	1.2194	1.66869636123811e-09	104139248	104142227	1.63433593371731e-09	104153314	104156131
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104154319	135367341	10508	10029	0.4697	1.63433593371731e-09	104153314	104156131	0	135364321	135376485
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	135374659	136562596	436	420	1.1705	0	135364321	135376485	3.74436239822131e-08	136562596	136562596
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	136564056	136565300	2	2	2.4629	3.74436239822131e-08	136562596	136562596	2.14513414300332e-05	136565300	136567197
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	136567197	136690989	33	32	1.2458	2.14513414300332e-05	136565300	136567197	6.84126818939406e-58	136681146	136696891
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	136696891	139994718	1028	996	0.448	6.84126818939406e-58	136681146	136696891	1.45899412090080e-44	139904307	140050297
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140046761	140117922	31	31	1.1565	1.4589941209008e-44	139904307	140050297	7.31347215335069e-42	140106530	140129330
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140129330	154582414	4289	4106	0.4469	7.31347215335069e-42	140106530	140129330	0	154578922	154586690
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.498	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2973379	120	114	-3.3767	NA	NA	NA	1.51585421542233e-21	2969891	3223585
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3034907	3034907	1	0	NA	1.51585421542233e-21	2969891	3223585	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	5593746	19	18	-1.3322	NA	NA	NA	8.29603233980443e-09	4597974	6715636
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7070931	177	168	-2.928	8.29603233980443e-09	4597974	6715636	5.32845773032344e-06	7016002	7224954
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7073916	7073916	1	0	NA	5.32845773032344e-06	7016002	7224954	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7078300	7485594	123	119	-2.2609	NA	NA	NA	0.429131914370677	7242656	7652302
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7660965	38	36	-2.7288	0.429131914370677	7242656	7652302	0.000745651563757539	7614417	7666216
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7663037	7709619	30	29	-3.7086	0.000745651563757539	7614417	7666216	3.71822010434833e-18	7708716	7712882
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	24	-1.8713	3.71822010434833e-18	7708716	7712882	6.3063552792998e-05	7749796	7832896
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10473791	417	394	-2.794	6.3063552792998e-05	7749796	7832896	0.0160333504533216	9094974	10503821
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10475426	10515697	13	12	-2.1934	0.0160333504533216	9094974	10503821	5.20194887121003e-14	10512616	10515697
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.5665	5.20194887121003e-14	10512616	10515697	4.75500866873229e-05	10645500	11673476
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	6	-2.33	4.75500866873229e-05	10645500	11673476	0.0133498520494488	10655750	12502304
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.7721	0.0133498520494488	10655750	12502304	0.000206782192055904	12537944	12573266
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12926941	110	106	-2.3233	0.000206782192055904	12537944	12573266	0.00162640003283399	12804329	13001517
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13128515	79	79	-1.7123	0.00162640003283399	12804329	13001517	5.65193496813019e-31	13112411	13137597
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13597813	204	198	-3.1327	5.65193496813019e-31	13112411	13137597	9.79848654011684e-09	13587025	13606316
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13603478	13716000	16	13	-1.5479	9.79848654011684e-09	13587025	13606316	1.46171042202259e-17	13716000	13717328
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	13716331	1	0	NA	1.46171042202259e-17	13716000	13717328	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13717328	13828384	27	25	-3.4445	NA	NA	NA	2.4651098050421e-07	13816133	13828384
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13836933	13866668	8	7	-2.2587	2.4651098050421e-07	13816133	13828384	2.06342802304924e-05	13866668	13872200
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13868296	14045293	85	81	-3.4339	2.06342802304924e-05	13866668	13872200	1.45101256215653e-06	14043659	14045293
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14046104	14056906	3	3	-1.4573	1.45101256215653e-06	14043659	14045293	0.000158580398752558	14056906	14070165
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14063795	14063795	1	0	NA	0.000158580398752558	14056906	14070165	NA	NA	NA
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14064204	14122129	33	31	-3.4096	NA	NA	NA	1.24107623972420e-05	14116822	14122129
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.1837	1.2410762397242e-05	14116822	14122129	5.53523311718953e-06	14143748	14203911
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14353244	32	30	-3.4874	5.53523311718953e-06	14143748	14203911	1.51220781248827e-14	14349668	14353244
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14354682	14375855	11	9	-1.3491	1.51220781248827e-14	14349668	14353244	0.000152804752021827	14374313	14384653
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14376942	14416385	23	21	-2.7274	0.000152804752021827	14374313	14384653	0.00397791257063971	14409145	14422395
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14418116	14434038	8	8	-1.4445	0.00397791257063971	14409145	14422395	7.38991195812041e-06	14426934	14438363
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14434065	14524829	52	46	-2.9689	7.38991195812041e-06	14426934	14438363	0.000116160765613634	14494397	14553021
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14694578	42	40	-2.0304	0.000116160765613634	14494397	14553021	1.45946647833422e-08	14603508	14712496
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	15920478	400	382	-3.0755	1.45946647833422e-08	14603508	14712496	3.99150396608604e-10	15750379	15958396
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16182565	107	103	-2.3517	3.99150396608604e-10	15750379	15958396	5.3319330595247e-13	16167700	16220531
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	22139807	992	937	-3.1174	5.3319330595247e-13	16167700	16220531	5.95685610513681e-08	22052726	22139807
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.1471	5.95685610513681e-08	22052726	22139807	3.09518300848397e-10	22177335	22182080
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	91	-3.1982	3.09518300848397e-10	22177335	22182080	9.27797648587124e-57	23283689	26870361
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	29	-0.3419	9.27797648587124e-57	23283689	26870361	1.78165707121017e-06	26938967	26952278
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27003308	12	12	-1.4776	1.78165707121017e-06	26938967	26952278	1.22994106307104e-05	26998633	27006628
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.072	1.22994106307104e-05	26998633	27006628	1.79780628872713e-22	27019256	27019256
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27032300	3	3	-3.4876	1.79780628872713e-22	27019256	27019256	6.34264791774488e-10	27032300	27039222
MSK_252152920167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27039222	57440809	33	30	-0.947	6.34264791774488e-10	27032300	27039222	NA	NA	NA
