Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12790795	4517	4204	0.0119	NA	NA	NA	1.18550519850936e-12	12790795	12790795
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12793354	12835156	3	3	-0.9905	1.18550519850936e-12	12790795	12790795	4.50314480884906e-12	12835156	12835156
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12839991	72537426	23374	21906	2e-04	4.50314480884906e-12	12835156	12835156	6.46468902216792e-117	72537426	72537426
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	1.4939	6.46468902216792e-117	72537426	72537426	1.47918171593366e-115	72579311	72579311
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	1.47918171593366e-115	72579311	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	78420864	1943	1800	-0.0054	NA	NA	NA	4.04135214011478e-09	78415331	78420864
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	78422595	78424172	2	2	-1.0534	4.04135214011478e-09	78415331	78420864	1.5861713134356e-09	78424172	78431623
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	78431623	84484082	1542	1451	-0.0022	1.5861713134356e-09	78424172	78431623	4.55392289221513e-17	84484082	84484082
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-1.396	4.55392289221513e-17	84484082	84484082	3.12510974284961e-17	84487429	84487429
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	150819879	14066	13124	0.002	3.12510974284961e-17	84487429	84487429	3.63679160709241e-14	150816180	150819879
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	0.5716	3.63679160709241e-14	150816180	150819879	5.57848949020837e-16	150851439	150852858
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151024118	77	71	0.0358	5.57848949020837e-16	150851439	150852858	1.03120383357713e-14	151024118	151024118
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151026228	1	0	NA	1.03120383357713e-14	151024118	151024118	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8527	NA	NA	NA	3.02052313317844e-12	151036435	151038091
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	194976022	15975	14958	-0.0062	3.02052313317844e-12	151036435	151038091	9.0049203527084e-25	194972886	194978218
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	194977713	195065867	11	11	-0.7313	9.0049203527084e-25	194972886	194978218	8.45148194035352e-26	195048208	195095156
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	195091758	1	0	NA	8.45148194035352e-26	195048208	195095156	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195095156	200602881	2159	2016	0.0014	NA	NA	NA	2.10097979290019e-09	200584100	200634858
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200797743	37	36	-0.2497	2.10097979290019e-09	200584100	200634858	4.56736692537288e-09	200672373	200816497
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200801004	246794552	17284	16179	-0.0032	4.56736692537288e-09	200672373	200816497	7.72026398745181e-12	246750352	246812425
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246864725	28	28	0.3126	7.72026398745181e-12	246750352	246812425	5.87339130158208e-15	246858820	246882156
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246875016	247186514	96	92	-0.0297	5.87339130158208e-15	246858820	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34558824	11527	10751	-0.0054	NA	NA	NA	4.01066598600365e-12	34554208	34558824
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34561038	34579933	9	9	0.5586	4.01066598600365e-12	34554208	34558824	7.82375761505035e-12	34579933	34582272
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	242689978	66291	61934	-0.0037	7.82375761505035e-12	34579933	34582272	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	65160634	23509	21999	-0.0078	NA	NA	NA	3.89051020952466e-10	65155469	65160634
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-1.1245	3.89051020952466e-10	65155469	65160634	2.06960984331106e-10	65184180	65195223
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	163992903	29976	28023	-0.0041	2.06960984331106e-10	65184180	65195223	7.82912726847076e-94	163992903	163997228
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164036648	9	8	1.6006	7.82912726847076e-94	163992903	163997228	0.00195947724621658	164001657	164042397
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164038917	164107951	19	17	0.9504	0.00195947724621658	164001657	164042397	3.22573157211004e-66	164105613	164107951
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196822133	11132	10437	0.0016	3.22573157211004e-66	164105613	164107951	2.55882770025103e-11	196807153	196835413
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929805	20	19	0.3823	2.55882770025103e-11	196807153	196835413	1.49390110805387e-10	196928503	196946355
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196929826	199329592	964	894	0.0059	1.49390110805387e-10	196928503	196946355	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	63346612	17223	16093	-0.0019	NA	NA	NA	1.48763003252708e-279	63346612	63346612
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-5.6291	1.48763003252708e-279	63346612	63346612	1.30853421264611e-260	63358506	63358506
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	68905670	1208	1127	0.0013	1.30853421264611e-260	63358506	63358506	3.11574005867188e-13	68897538	69075140
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69665979	17	16	0.4605	3.11574005867188e-13	68897538	69075140	1.13232670164208e-14	69643272	69687545
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69677857	186676034	35160	32893	-0.0049	1.13232670164208e-14	69643272	69687545	1.20426710928928e-64	186676034	186676034
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.6882	1.20426710928928e-64	186676034	186676034	3.01192797896398e-64	186680176	186680176
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	190710812	1439	1334	-0.0013	3.01192797896398e-64	186680176	186680176	3.08221205638532e-17	190674430	190754887
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190907760	59	57	-0.2709	3.08221205638532e-17	190674430	190754887	2.68466681696879e-06	190871220	190924564
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190907865	191153613	51	48	-0.0457	2.68466681696879e-06	190871220	190924564	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	201	-0.0255	NA	NA	NA	6.83777387719562e-10	727098	812169
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-0.6722	6.83777387719562e-10	727098	812169	6.33923499398221e-12	816789	870657
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	12857302	3747	3522	-0.0116	6.33923499398221e-12	816789	870657	5.44019553021356e-254	12857302	12857302
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-5.1584	5.44019553021356e-254	12857302	12857302	6.75616458800644e-240	12873052	12873052
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180644810	49789	46572	-0.0031	6.75616458800644e-240	12873052	12873052	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29941766	10586	9888	-0.0022	NA	NA	NA	1.9943512952609e-15	29939288	29962849
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	29950805	1	0	NA	1.9943512952609e-15	29939288	29962849	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30000990	12	10	0.6001	NA	NA	NA	2.35288629182405e-15	29995247	30004636
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30004636	32558677	1078	1009	0.0057	2.35288629182405e-15	29995247	30004636	6.1012572921833e-61	32548736	32654861
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32762061	66	65	-0.6675	6.1012572921833e-61	32548736	32654861	3.72352749335188e-123	32707427	32771725
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	32767722	2	0	NA	3.72352749335188e-123	32707427	32771725	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32771725	170748606	44371	41527	-0.0048	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	170753106	170753106	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	118611324	39265	36783	-0.0026	NA	NA	NA	1.37149965218655e-126	118611324	118611324
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-3.1027	1.37149965218655e-126	118611324	118611324	2.79910137610049e-134	118620875	118620875
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2966	-0.0058	2.79910137610049e-134	118620875	118620875	1.79937524523979e-111	125831554	125831554
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-2.8249	1.79937524523979e-111	125831554	125831554	7.09739243468252e-106	125837524	125837524
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	126483571	292	276	0.0058	7.09739243468252e-106	125837524	125837524	5.79637298966052e-08	126481091	126485885
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126484099	126488400	9	8	-0.4894	5.79637298966052e-08	126481091	126485885	2.95308772529671e-08	126486474	126492843
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126488971	133433384	3353	3137	-0.0014	2.95308772529671e-08	126486474	126492843	1.47596768311403e-10	133426996	133437464
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-0.5491	1.47596768311403e-10	133426996	133437464	3.44274810255656e-10	133444486	133455682
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141409512	3699	3452	0.0015	3.44274810255656e-10	133444486	133455682	1.20263428190514e-14	141406414	141413352
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141410894	1	0	NA	1.20263428190514e-14	141406414	141413352	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	0.5153	NA	NA	NA	5.27040628245655e-12	141438504	141446728
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	142149857	292	278	0.0066	5.27040628245655e-12	141438504	141446728	5.63206909674763e-08	142140540	142149857
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142152205	142152205	1	0	NA	5.63206909674763e-08	142140540	142149857	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-0.7377	NA	NA	NA	3.95907980104941e-28	142166710	142166710
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-3.7075	3.95907980104941e-28	142166710	142166710	3.96531210304312e-119	142167908	142167908
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	147702365	2339	2200	-0.01	3.96531210304312e-119	142167908	142167908	5.39037779561639e-16	147702365	147702365
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	1.3658	5.39037779561639e-16	147702365	147702365	3.81724360963486e-16	147707161	147707161
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	156483966	3181	2960	-0.0019	3.81724360963486e-16	147707161	147707161	2.12761643623120e-14	156483966	156485711
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	3	1.059	2.1276164362312e-14	156483966	156485711	3.54711606671779e-13	156488598	156490484
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158804557	1051	971	-9e-04	3.54711606671779e-13	156488598	156490484	2.28472270504079e-10	158792914	158811268
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158811268	158821263	3	3	-0.9385	2.28472270504079e-10	158792914	158811268	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	110	-0.0094	NA	NA	NA	1.26622031442235e-70	581533	581533
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	3.0601	1.26622031442235e-70	581533	581533	2.14993005574922e-81	588865	588865
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25022606	8008	7489	-0.0011	2.14993005574922e-81	588865	588865	9.49124235100637e-24	25022606	25022606
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.3639	9.49124235100637e-24	25022606	25022606	1.15328402600426e-11	25039370	25039370
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	25	0.0212	1.15328402600426e-11	25039370	25039370	3.05539567053580e-13	25120552	25120552
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25124428	2	2	1.6344	3.0553956705358e-13	25120552	25120552	6.56053760858907e-24	25124428	25124428
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25125700	25125700	1	0	NA	6.56053760858907e-24	25124428	25124428	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	26932396	766	713	0.0051	NA	NA	NA	2.65346555229457e-09	26929508	26932396
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26932895	26936405	4	4	-0.7261	2.65346555229457e-09	26929508	26932396	1.51573322303637e-08	26936405	26937497
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26937497	32797545	2261	2118	-0.0076	1.51573322303637e-08	26936405	26937497	9.10597483822123e-48	32797545	32797545
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-1.9203	9.10597483822123e-48	32797545	32797545	3.01828215685804e-50	32808049	32808049
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1773	-0.0012	3.01828215685804e-50	32808049	32808049	1.76750993795498e-18	39333915	39358419
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39464577	42	40	-0.3263	1.76750993795498e-18	39333915	39358419	1.32187665531152e-17	39451583	39479971
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39465285	64522535	6213	5812	-0.0043	1.32187665531152e-17	39451583	39479971	1.29427957382171e-14	64522535	64522535
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	64527039	64538632	3	3	-1.0764	1.29427957382171e-14	64522535	64522535	9.28465491528956e-15	64538632	64538632
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	64543239	146264846	25234	23657	-0.0075	9.28465491528956e-15	64538632	64538632	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7467	-0.0043	NA	NA	NA	0	23343915	23343915
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.8862	0	23343915	23343915	5.84331439336442e-320	23365926	23365926
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	73133242	6019	5634	0.0025	5.84331439336442e-320	23365926	23365926	3.42125529047708e-18	73133242	73133242
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73135012	73139210	3	3	-1.1848	3.42125529047708e-18	73133242	73133242	5.19529605965489e-18	73139210	73139210
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73140836	140145683	23919	22336	3e-04	5.19529605965489e-18	73139210	73139210	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	41898	-0.003	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2005	-0.0038	NA	NA	NA	6.3683610834358e-45	5738494	5742476
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.8713	6.3683610834358e-45	5738494	5742476	2.29403072465484e-49	5763749	5766615
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55114405	14751	13782	-0.0044	2.29403072465484e-49	5763749	5766615	1.00334364105126e-09	55076294	55131703
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55118214	55207305	39	38	0.2451	1.00334364105126e-09	55076294	55131703	1.76707526681664e-09	55194990	55231935
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	134450318	28361	26528	-0.0027	1.76707526681664e-09	55194990	55231935	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	31098259	11152	10455	-0.0015	NA	NA	NA	9.050195318416e-12	31058854	31188761
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31132716	31292507	42	40	-0.2676	9.050195318416e-12	31058854	31188761	1.77025445265898e-12	31268595	31313528
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31295667	46992235	4288	4022	0.0037	1.77025445265898e-12	31268595	31313528	1.00543477566202e-19	46992235	46992235
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.505	1.00543477566202e-19	46992235	46992235	2.51743064387914e-19	46996769	46996769
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	132289090	29676	27760	-9e-04	2.51743064387914e-19	46996769	46996769	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6866	-0.0114	NA	NA	NA	6.52042587226851e-220	37953582	37953582
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-5.2551	6.52042587226851e-220	37953582	37953582	6.48362319061185e-258	37957844	37957844
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4575	-0.0048	6.48362319061185e-258	37957844	37957844	8.55759314150871e-09	49964838	49964838
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	0.9979	8.55759314150871e-09	49964838	49964838	5.4916663503952e-08	49971732	49971732
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1689	5e-04	5.4916663503952e-08	49971732	49971732	7.16433062650979e-15	56610886	56658479
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56680346	13	12	0.5515	7.16433062650979e-15	56610886	56658479	6.44364375544049e-16	56677538	56685341
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56681665	114123340	17606	16511	-0.0047	6.44364375544049e-16	56677538	56685341	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	52	0.4581	NA	NA	NA	9.57005423899337e-45	19483933	19535787
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5274	0.0106	9.57005423899337e-45	19483933	19535787	3.08907763933382e-12	34666996	34674458
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-0.9754	3.08907763933382e-12	34666996	34674458	1.19547158255438e-12	34683810	34685308
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1787	0.0016	1.19547158255438e-12	34683810	34685308	1.71740508342903e-09	40663660	40676611
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.5233	1.71740508342903e-09	40663660	40676611	6.57567633847294e-09	40726930	40746865
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	73061942	11763	10980	-5e-04	6.57567633847294e-09	40726930	40746865	5.63300550098449e-31	73061942	73061942
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	1.0146	5.63300550098449e-31	73061942	73061942	1.35345049915256e-31	73092112	73092112
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73101327	1	0	NA	1.35345049915256e-31	73092112	73092112	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	79172702	2912	2738	-0.0023	NA	NA	NA	7.36986048923363e-10	79171460	79172702
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79174722	79174722	1	0	NA	7.36986048923363e-10	79171460	79172702	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-0.7665	NA	NA	NA	9.63484289437348e-10	79183154	79185548
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	106358491	9540	8934	-7e-04	9.63484289437348e-10	79183154	79185548	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.0362	NA	NA	NA	2.30058516825532e-07	18450562	18810004
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20308014	151	141	0.6028	2.30058516825532e-07	18450562	18810004	9.3869241774336e-226	20079935	20310916
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	32454294	3669	3430	-0.0133	9.3869241774336e-226	20079935	20310916	1.81274364402539e-40	32452971	32520164
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32456500	32456500	1	0	NA	1.81274364402539e-40	32452971	32520164	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	24	-0.638	NA	NA	NA	6.97580514763454e-43	32578483	32664506
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	6.97580514763454e-43	32578483	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	59468560	11128	10367	2e-04	NA	NA	NA	3.39009406738433e-08	59465473	59468560
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59475528	59483715	3	3	-0.8147	3.39009406738433e-08	59465473	59468560	1.61462846080275e-08	59483715	59488251
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59488251	74669752	6727	6232	7e-04	1.61462846080275e-08	59483715	59488251	3.61249760089293e-117	74669752	74669752
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	3	-2.9205	3.61249760089293e-117	74669752	74669752	4.22212680952353e-109	74680439	74680439
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	8976	-0.0087	4.22212680952353e-109	74680439	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	88676988	25656	24028	0.0046	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88690571	88690571	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	12957	0.0095	NA	NA	NA	9.19194631930109e-69	36673853	36673853
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.6079	9.19194631930109e-69	36673853	36673853	3.47970248456861e-64	36684619	36684619
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1888	0.0231	3.47970248456861e-64	36684619	36684619	4.83800315756288e-11	41506317	41526558
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	-0.3359	4.83800315756288e-11	41506317	41526558	1.13721951853625e-43	41566540	41570512
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41568539	1	0	NA	1.13721951853625e-43	41566540	41570512	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41644148	34	33	0.3918	NA	NA	NA	8.81131433917923e-09	41636402	41644148
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41644979	41648545	3	3	-0.2348	8.81131433917923e-09	41636402	41644148	7.92256200099474e-06	41648545	41652861
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	41710400	8	7	0.6536	7.92256200099474e-06	41648545	41652861	1.96416362884039e-12	41708551	42143048
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	42142363	1	0	NA	1.96416362884039e-12	41708551	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42143048	78653545	13678	12799	0.009	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	469065	161	149	-3e-04	NA	NA	NA	3.25121733086155e-06	457708	505456
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	470350	524605	24	22	0.2924	3.25121733086155e-06	457708	505456	4.62260301810783e-08	489057	554710
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	531845	40226609	11609	10921	-0.0062	4.62260301810783e-08	489057	554710	5.64866010110142e-17	40226609	40226609
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40230827	40235901	3	3	-1.1498	5.64866010110142e-17	40226609	40226609	6.33888355864051e-17	40235901	40235901
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40244566	76116026	11167	10431	-0.0052	6.33888355864051e-17	40235901	40235901	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	456	0.0278	NA	NA	NA	2.01560267944224e-13	1398325	1398325
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3956	2.01560267944224e-13	1398325	1398325	1.54236319225379e-16	1400840	1400840
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	22984756	9381	8781	0.0197	1.54236319225379e-16	1400840	1400840	1.45226426053017e-11	22984756	22984756
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23010575	23012951	2	2	-1.1408	1.45226426053017e-11	22984756	22984756	6.60690932071975e-11	23012951	23012951
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23015440	40540618	2816	2618	0.0038	6.60690932071975e-11	23012951	23012951	1.89652029779385e-155	40540618	40540618
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-3.4416	1.89652029779385e-155	40540618	40540618	1.61646107150844e-165	40553315	40553315
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	63787171	10362	9713	0.0106	1.61646107150844e-165	40553315	40553315	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	548	-0.008	NA	NA	NA	0	1506379	1506379
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	-3.2137	0	1506379	1506379	0	1532433	1532433
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	19603	-0.0052	0	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	20628393	2312	2152	0.0025	NA	NA	NA	1.54494299286622e-08	20626064	20628393
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	20631816	20633489	2	2	-0.998	1.54494299286622e-08	20626064	20628393	5.19106407597475e-08	20633489	20636113
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	20636113	46922972	11127	10406	-0.0052	5.19106407597475e-08	20633489	20636113	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2793	0.0041	NA	NA	NA	1.00269032880132e-183	22667608	22667608
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22682428	3	3	-3.6877	1.00269032880132e-183	22667608	22667608	3.39250833970505e-06	22682428	22682428
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22686690	22702398	7	7	-1.5779	3.39250833970505e-06	22682428	22682428	1.88529543852371e-05	22701205	22706166
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22704683	22725305	12	9	-3.3524	1.88529543852371e-05	22701205	22706166	0	22725305	22725305
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6134	0.0053	0	22725305	22725305	2.17562384583964e-176	35472378	35472378
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-4.4197	2.17562384583964e-176	35472378	35472378	4.03032861342544e-171	35476942	35476942
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6532	0.0057	4.03032861342544e-171	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.0216	NA	NA	NA	8.95441611811875e-06	4926	94062
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	1.0218	8.95441611811875e-06	4926	94062	5.4522629398598e-32	104732	104732
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	828162	539	503	0.0139	5.4522629398598e-32	104732	104732	1.54892977484435e-97	822702	832952
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	829169	1274736	139	131	0.4793	1.54892977484435e-97	822702	832952	6.32630087972067e-121	1179171	1295803
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1282772	2672401	1075	999	0.0124	6.32630087972067e-121	1179171	1295803	5.54635863890709e-14	2669410	2692498
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.3263	5.54635863890709e-14	2669410	2692498	1.97943917366034e-102	2708291	2711273
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1672	0.9019	1.97943917366034e-102	2708291	2711273	5.1335940663853e-11	8449254	8452395
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8459880	3	3	-0.0185	5.1335940663853e-11	8449254	8452395	6.98807058147155e-08	8459880	8461739
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8461739	19294903	4640	4314	0.9352	6.98807058147155e-08	8459880	8461739	0.063442503719358	19254309	19294903
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19296599	19306937	6	6	0.5721	0.063442503719358	19254309	19294903	0.012179399159094	19306937	19340710
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19309933	23885871	1690	1588	0.9624	0.012179399159094	19306937	19340710	5.03247488922019e-10	23885871	23892198
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	23892198	23893450	3	3	1.9921	5.03247488922019e-10	23885871	23892198	2.18800859772974e-13	23892255	23897652
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	23897652	76998610	14806	13855	0.9408	2.18800859772974e-13	23892255	23897652	1.77259151035768e-88	76998610	76998610
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.8737	1.77259151035768e-88	76998610	76998610	8.68451787391698e-91	77010018	77010018
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154442377	22161	20794	0.9404	8.68451787391698e-91	77010018	77010018	3.40162679495466e-104	154442377	154442377
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-1.9481	3.40162679495466e-104	154442377	154442377	8.00167566393758e-53	154450309	154450309
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	0.8522	8.00167566393758e-53	154450309	154450309	5.7710517567961e-80	154570196	154586690
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	184	0.0068	5.7710517567961e-80	154570196	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	112	-3.9734	NA	NA	NA	1.64544894942167e-20	3034907	3773948
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.64544894942167e-20	3034907	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	14	-1.1968	NA	NA	NA	2.17146107468555e-10	4948824	6696721
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6999891	141	130	-3.4271	2.17146107468555e-10	4948824	6696721	6.3351486155794e-06	6984704	6999891
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7001716	7020318	13	11	-1.6159	6.3351486155794e-06	6984704	6999891	1.79379376251488e-09	7020318	7024303
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7021965	7051884	19	18	-3.7148	1.79379376251488e-09	7020318	7024303	0.000447118068237101	7043431	7124918
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7249762	50	46	-2.3261	0.000447118068237101	7043431	7124918	3.00264495618896e-05	7244216	7249762
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7250951	7256919	4	4	-5.2953	3.00264495618896e-05	7244216	7249762	5.64604536603261e-06	7256919	7259689
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7258171	7495687	76	70	-2.4033	5.64604536603261e-06	7256919	7259689	6.08323344801158e-09	7456245	7606496
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7709619	66	60	-3.6618	6.08323344801158e-09	7456245	7606496	0.00055604547317897	7677056	7774773
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	84	-2.822	0.00055604547317897	7677056	7774773	9.13707300531146e-06	7930528	8069958
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8259766	60	54	-3.8219	9.13707300531146e-06	7930528	8069958	3.16349575742108e-06	8229100	8280065
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8277707	8316416	14	14	-2.2866	3.16349575742108e-06	8229100	8280065	5.70021021427843e-05	8300654	8347344
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324291	10513747	293	276	-3.5237	5.70021021427843e-05	8300654	8347344	2.51745550373451e-28	10512616	10515697
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.5754	2.51745550373451e-28	10512616	10515697	1.06229308338562e-13	10631941	10655750
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12541506	18	15	-3.7975	1.06229308338562e-13	10631941	10655750	0.000204336118231999	12502304	12559410
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	48	-2.2213	0.000204336118231999	12502304	12559410	1.38247890303972e-05	12651786	12696242
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	9	-4.2226	1.38247890303972e-05	12651786	12696242	4.15425834834263e-05	12725675	12786515
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	13104920	117	109	-2.288	4.15425834834263e-05	12725675	12786515	0.0629756140118634	12926941	13104920
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	9	-1.1221	0.0629756140118634	12926941	13104920	9.82278165168088e-17	13129843	13133803
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	381	-3.8627	9.82278165168088e-17	13129843	13133803	4.34180224869875e-08	14326935	14356069
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14380301	19	19	-2.5254	4.34180224869875e-08	14326935	14356069	8.4305398039787e-06	14374313	14381372
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14404284	10	10	-4.2818	8.4305398039787e-06	14374313	14381372	0.000214390219887381	14391767	14415559
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14404979	14707011	122	116	-2.6356	0.000214390219887381	14391767	14415559	9.58994802546763e-06	14587291	14819097
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14708015	14708015	1	0	NA	9.58994802546763e-06	14587291	14819097	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14709446	15284717	164	154	-3.3666	NA	NA	NA	4.74947477895126e-06	15245772	15296498
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15388044	66	61	-4.2067	4.74947477895126e-06	15245772	15296498	1.27920372172801e-06	15379192	15418992
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15389388	15915466	157	152	-3.361	1.27920372172801e-06	15379192	15418992	4.15331900034575e-05	15761232	15980898
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16083793	67	61	-2.5377	4.15331900034575e-05	15761232	15980898	9.2141278920023e-05	16027648	16110790
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16085263	16354465	89	86	-3.3573	9.2141278920023e-05	16027648	16110790	0.0125629319288769	16219596	16371504
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16357759	16387273	6	6	-2.1473	0.0125629319288769	16219596	16371504	0.00896727929866223	16377188	16544310
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	21036411	670	630	-3.7229	0.00896727929866223	16377188	16544310	2.08623378129161e-06	21026715	21041164
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.553	2.08623378129161e-06	21026715	21041164	1.23066712521632e-07	21047798	21059229
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	245	-3.6963	1.23066712521632e-07	21047798	21059229	1.03818833970663e-07	22052726	22165808
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22157319	1	0	NA	1.03818833970663e-07	22052726	22165808	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-1.6738	NA	NA	NA	4.58279439146778e-12	22175425	22179794
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	86	-3.8592	4.58279439146778e-12	22175425	22179794	2.33145500934169e-55	23283689	26870361
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	27019256	48	43	-1.3845	2.33145500934169e-55	23283689	26870361	3.05092514971626e-05	27007874	27019256
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27032300	3	3	-4.0548	3.05092514971626e-05	27007874	27019256	8.61152627499056e-09	27032300	27063070
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27039222	27039222	1	0	NA	8.61152627499056e-09	27032300	27063070	NA	NA	NA
MSK_252152920170_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.7202	NA	NA	NA	NA	NA	NA
