Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26104	0.0067	NA	NA	NA	7.78657615458273e-31	72536231	72545984
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72539143	1	0	NA	7.78657615458273e-31	72536231	72545984	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72540240	72579311	13	11	-1.8657	NA	NA	NA	1.89130417843678e-30	72559751	72589682
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150839754	17560	16377	0.0016	1.89130417843678e-30	72559751	72589682	1.838182006711e-12	150836484	150839754
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	5	-1.8017	1.838182006711e-12	150836484	150839754	1.68549571289304e-13	150848509	150852858
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151028700	79	74	-0.0872	1.68549571289304e-13	150848509	150852858	1.06221087588786e-35	151028700	151028700
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151032967	151036435	3	3	-3.6023	1.06221087588786e-35	151028700	151028700	1.66895478635795e-31	151036435	151036435
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2504	0.0108	1.66895478635795e-31	151036435	151036435	3.24441187631126e-09	157133150	157133150
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.4508	3.24441187631126e-09	157133150	157133150	7.30853946543016e-09	157136342	157136342
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	247186514	32910	30843	-6e-04	7.30853946543016e-09	157136342	157136342	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33617141	11132	10436	0.0057	NA	NA	NA	1.59526005561019e-16	33617141	33617141
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33619260	33621111	2	2	-3.162	1.59526005561019e-16	33617141	33617141	1.02580113634306e-14	33621111	33621111
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33622478	43932674	4332	4032	-0.0142	1.02580113634306e-14	33621111	33621111	2.8418470326814e-10	43930985	43937215
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43934924	43934924	1	0	NA	2.8418470326814e-10	43930985	43937215	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43937215	43949625	6	6	-1.5453	NA	NA	NA	6.18735630864895e-11	43944524	43953461
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43953461	146571330	29601	27715	0.0068	6.18735630864895e-11	43944524	43953461	4.88075284737327e-48	146571330	146571330
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-3.8487	4.88075284737327e-48	146571330	146571330	1.17837827781775e-47	146592775	146592775
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	30628	4e-04	1.17837827781775e-47	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	164001657	53489	50054	-4e-04	NA	NA	NA	1.97309099859629e-16	163987457	164019640
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164009321	2	0	NA	1.97309099859629e-16	163987457	164019640	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164012645	164112873	25	24	0.9316	NA	NA	NA	4.20065017111709e-16	164105613	164126256
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	164115417	1	0	NA	4.20065017111709e-16	164105613	164126256	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164121847	194354505	10128	9457	9e-04	NA	NA	NA	7.10243903486142e-30	194354505	194358882
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-2.5089	7.10243903486142e-30	194354505	194358882	1.33250442760499e-29	194365648	194366950
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1842	-0.0298	1.33250442760499e-29	194365648	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	191153613	55161	51679	0.0088	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	50251	0.0011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32543054	11675	10960	0.0103	NA	NA	NA	4.52937224730129e-09	32521417	32605300
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32548736	32654861	23	21	-0.7444	4.52937224730129e-09	32521417	32605300	0.00442061380882606	32600962	32667180
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32657601	32713363	24	22	0.0788	0.00442061380882606	32600962	32667180	9.76718334312432e-10	32713363	32713363
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-1.8734	9.76718334312432e-10	32713363	32713363	3.85078535428246e-20	32728487	32731072
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	33687559	419	391	0.0231	3.85078535428246e-20	32728487	32731072	7.54049349591355e-12	33685356	33687559
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33690281	33694763	3	3	-2.2949	7.54049349591355e-12	33685356	33687559	1.43774517039977e-12	33694763	33694763
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33696513	33696513	1	0	NA	1.43774517039977e-12	33694763	33694763	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33699370	74647491	13127	12278	-7e-04	NA	NA	NA	2.75218116966812e-27	74647491	74647491
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	-3.3275	2.75218116966812e-27	74647491	74647491	8.66372406604606e-29	74655219	74655219
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	79015901	1140	1060	0.0287	8.66372406604606e-29	74655219	74655219	3.03813115899706e-148	79015901	79015901
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79018959	79018959	1	0	NA	3.03813115899706e-148	79015901	79015901	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79085247	12	12	-3.8362	NA	NA	NA	2.70532088457751e-143	79085247	79085247
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79091850	170753106	29681	27734	-0.0024	2.70532088457751e-143	79085247	79085247	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	158821263	56695	53067	0.0041	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7226901	2393	2258	0.0384	NA	NA	NA	1.61572059647113e-07	6905670	7260442
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	8139999	10	10	-0.9376	1.61572059647113e-07	6905670	7260442	6.92539961757514e-07	8137794	8150258
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8143301	25022606	5726	5362	0.0053	6.92539961757514e-07	8137794	8150258	1.42590951226817e-07	25017905	25022606
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.8024	1.42590951226817e-07	25017905	25022606	1.16196404186517e-07	25039370	25047250
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39341524	4940	4636	-0.005	1.16196404186517e-07	25039370	25047250	2.01702167211294e-19	39323411	39358419
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39345557	39530374	68	63	0.6129	2.01702167211294e-19	39323411	39358419	2.17708326519121e-18	39504332	39552040
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39533030	146264846	31426	29505	0.0069	2.17708326519121e-18	39504332	39552040	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12223	-0.001	NA	NA	NA	1.65182743870428e-16	70926188	70926188
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.1797	1.65182743870428e-16	70926188	70926188	5.36177359389437e-16	70930528	70930528
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	85753966	4934	4646	-0.0037	5.36177359389437e-16	70930528	70930528	5.89103863879957e-07	85752126	85753966
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85755185	85756629	3	3	1.7451	5.89103863879957e-07	85752126	85753966	8.95884472632444e-07	85756629	85758929
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85758929	140145683	19933	18693	-0.0141	8.95884472632444e-07	85756629	85758929	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	41937	-0.0025	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	15789	-0.0068	NA	NA	NA	2.64456041493412e-08	55059157	55142193
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55219985	41	39	-0.5384	2.64456041493412e-08	55059157	55142193	2.28499177952132e-08	55196550	55252451
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55221692	134450318	28358	26585	-0.0026	2.28499177952132e-08	55196550	55252451	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	132289090	45161	42265	8e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6904	-0.0068	NA	NA	NA	1.41303944669714e-23	37953582	37953582
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-3.8725	1.41303944669714e-23	37953582	37953582	5.79510858579145e-24	37957844	37957844
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	51296396	5468	5105	-0.0027	5.79510858579145e-24	37957844	37957844	3.22289280446692e-07	51294959	51296396
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-1.7857	3.22289280446692e-07	51294959	51296396	4.83535151817834e-07	51300398	51301682
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	114123340	18833	17664	0.0025	4.83535151817834e-07	51300398	51301682	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	105595302	31641	29631	-0.0034	NA	NA	NA	4.21843541720894e-31	105594189	105602602
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105597555	1	0	NA	4.21843541720894e-31	105594189	105602602	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-1.8829	NA	NA	NA	5.85279914190423e-26	105630089	105673157
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	217	0.0341	5.85279914190423e-26	105630089	105673157	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	20088256	156	147	-0.6362	NA	NA	NA	3.13721877322548e-45	20009685	20339495
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	100298352	31166	29145	-0.0133	3.13721877322548e-45	20009685	20339495	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54352394	13696	12870	0.0058	NA	NA	NA	1.38300800814799e-20	54352394	54352394
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54356704	2	2	-3.5835	1.38300800814799e-20	54352394	54352394	0.00177273994689389	54356704	54363713
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54362111	54379839	8	7	-0.9963	0.00177273994689389	54356704	54363713	2.78578050892376e-05	54363713	54400475
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	69974672	5106	4795	0.0075	2.78578050892376e-05	54363713	54400475	1.65958912088949e-26	69961280	69981763
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69976196	70124136	67	65	-0.7026	1.65958912088949e-26	69961280	69981763	1.25636609412075e-24	70112209	70139125
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70126361	75093957	1644	1562	0.0044	1.25636609412075e-24	70112209	70139125	7.73411211533998e-10	75092501	75093957
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.0802	7.73411211533998e-10	75092501	75093957	3.12824886358815e-10	75100865	75102639
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4802	-0.0065	3.12824886358815e-10	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	78653545	29634	27695	0.0038	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15103	4e-04	NA	NA	NA	9.37184347584125e-15	53092949	53092949
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-3.0612	9.37184347584125e-15	53092949	53092949	1.48497348345285e-14	53099601	53099601
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6306	-0.0094	1.48497348345285e-14	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	450	0.0081	NA	NA	NA	2.63337399119197e-11	1398325	1398325
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.4043	2.63337399119197e-11	1398325	1398325	3.50368477911471e-09	1400840	1400840
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	19694025	8533	7989	0.0267	3.50368477911471e-09	1400840	1400840	2.64863876812259e-07	19692626	19694025
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-1.72	2.64863876812259e-07	19692626	19694025	1.03023780285195e-06	19700620	19702214
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	20841320	292	272	-0.0382	1.03023780285195e-06	19700620	19702214	1.03069983858984e-07	20795869	20870473
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20905020	18	18	-0.8036	1.03069983858984e-07	20795869	20870473	6.60294811429117e-09	20886133	20919563
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20906926	63787171	13718	12865	0.0087	6.60294811429117e-09	20886133	20919563	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	542	-0.0086	NA	NA	NA	8.38204389424496e-24	1499034	1511632
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1531162	10	8	-1.918	8.38204389424496e-24	1499034	1511632	3.79438404729988e-24	1521410	1532433
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	8037439	2258	2113	0.0022	3.79438404729988e-24	1521410	1532433	9.83537632374876e-45	8004112	8060184
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8043565	8529793	234	224	0.5153	9.83537632374876e-45	8004112	8060184	2.61178348987929e-48	8504414	8552372
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8531586	62419534	18492	17324	-0.0049	2.61178348987929e-48	8504414	8552372	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12571	-0.008	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	35472378	9552	8954	-0.0031	NA	NA	NA	1.74248366330612e-13	35472378	35472378
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.9367	1.74248366330612e-13	35472378	35472378	1.32756796368987e-13	35476942	35476942
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49565816	7001	6533	-0.0051	1.32756796368987e-13	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49567768	49571068	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1097	NA	NA	NA	1.3580983572875e-12	4926	94062
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.4616	1.3580983572875e-12	4926	94062	1.26594537937684e-12	104732	108902
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2712641	1782	1674	0.0166	1.26594537937684e-12	104732	108902	0	2708113	2721311
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2713845	154578922	45131	42183	0.9664	0	2708113	2721311	4.51357767403108e-124	154561691	154599547
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154888224	202	184	-0.0239	4.51357767403108e-124	154561691	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	10515697	966	897	-2.0724	NA	NA	NA	9.24603667157246e-13	10399102	12554612
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	13128515	219	207	-1.4091	9.24603667157246e-13	10399102	12554612	2.47482878999625e-23	13080405	13167862
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13129843	1	0	NA	2.47482878999625e-23	13080405	13167862	NA	NA	NA
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	25737663	2151	2005	-2.2436	NA	NA	NA	4.08480678295927e-22	22916746	26887743
MSK_252152920181_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	78	-0.9692	4.08480678295927e-22	22916746	26887743	NA	NA	NA
