Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	150823073	45465	44007	-0.034	NA	NA	NA	0	150818222	150836484
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150836481	1	0	NA	0	150818222	150836484	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836484	150851439	9	9	1.321	NA	NA	NA	2.02557334841448e-08	150847304	150858516
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	154671137	1766	1711	0.0674	2.02557334841448e-08	150847304	150858516	8.4720265397532e-07	154669968	154674900
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154672405	154677804	5	5	1.588	8.4720265397532e-07	154669968	154674900	2.57247570367504e-07	154673614	154680715
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154678945	157133150	990	962	0.0805	2.57247570367504e-07	154673614	154680715	4.18918841436573e-12	157133150	157133150
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	3.0981	4.18918841436573e-12	157133150	157133150	1.05996816871113e-285	157136342	157136342
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	247186514	32910	31858	0.115	1.05996816871113e-285	157136342	157136342	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	43934924	15467	14987	0.0717	NA	NA	NA	6.24378334842742e-12	43930985	43937215
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43937215	43949625	6	6	-1.7651	6.24378334842742e-12	43930985	43937215	1.43784535590139e-11	43944524	43953461
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43953461	242689978	62354	60348	0.0659	1.43784535590139e-11	43944524	43953461	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	164001657	53490	51732	-0.0673	NA	NA	NA	0	163992903	164009321
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164112873	27	27	1.1838	0	163992903	164009321	6.76885482490356e-20	164101776	164123806
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	199329592	12115	11694	0.0798	6.76885482490356e-20	164101776	164123806	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3300	0.0844	NA	NA	NA	4.55933564541505e-25	9815760	9821327
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.0362	4.55933564541505e-25	9815760	9821327	1.27273238781828e-23	9832823	9842644
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	186676034	50213	48575	0.0631	1.27273238781828e-23	9832823	9842644	3.39134620713586e-17	186676034	186676034
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.8348	3.39134620713586e-17	186676034	186676034	8.33870999236261e-18	186680176	186680176
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	190772330	1451	1396	0.0808	8.3387099923626e-18	186680176	186680176	2.19672904701715e-22	190749363	190789240
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190921041	53	51	-0.7643	2.19672904701715e-22	190749363	190789240	1.51444336481407e-05	190899523	190975721
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	41	-0.0503	1.51444336481407e-05	190899523	190975721	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	52102	-0.0066	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	18573084	6631	6424	0.0784	NA	NA	NA	1.82842257195989e-08	18571731	18573084
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18574467	18576632	2	2	-2.6125	1.82842257195989e-08	18571731	18573084	3.32645340491647e-08	18576632	18579024
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18579024	79018959	19791	19149	0.0609	3.32645340491647e-08	18576632	18579024	7.67332101151396e-74	79018959	79024557
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-2.9474	7.67332101151396e-74	79018959	79024557	0	79085247	79091850
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	26914	-0.221	0	79085247	79091850	0	165642393	165643653
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.9991	0	165642393	165643653	1.13492625987006e-12	165650610	165653315
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1751	-0.3577	1.13492625987006e-12	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	118605955	39262	38027	0.0472	NA	NA	NA	1.17086850975352e-27	118604024	118605955
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118607355	118620875	6	6	1.8358	1.17086850975352e-27	118604024	118605955	5.84417956410967e-11	118620875	118622742
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141409512	10534	10199	0.0661	5.84417956410967e-11	118620875	118622742	1.94243939397584e-19	141406414	141414719
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141440184	15	15	-1.4056	1.94243939397584e-19	141406414	141414719	3.23313185689432e-18	141434131	141443577
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	158821263	6878	6665	0.0657	3.23313185689432e-18	141434131	141443577	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	105914378	32233	31213	0.2375	NA	NA	NA	0	105838505	105983816
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	105919748	146264846	12333	11930	0.8436	0	105838505	105983816	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	100348045	22993	22271	0.15	NA	NA	NA	6.61873600374862e-293	100348045	100348045
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.7027	6.61873600374862e-293	100348045	100348045	1.52234878275386e-08	100350814	100350814
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	140145683	14949	14461	0.0412	1.52234878275386e-08	100350814	100350814	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9424	0.0724	NA	NA	NA	5.63797240930819e-08	27036630	27038538
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.554	5.63797240930819e-08	27036630	27038538	0	27041812	27043861
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	135285645	35077	33939	-0.1098	0	27041812	27043861	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4920907	1771	1718	0.0044	NA	NA	NA	1.78969596592888e-21	4920907	4928045
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4923300	4923300	1	0	NA	1.78969596592888e-21	4920907	4928045	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-2.647	NA	NA	NA	7.12674990724655e-22	4929502	4932214
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	134450318	43527	42191	0.0681	7.12674990724655e-22	4929502	4932214	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	132289090	45161	43743	-0.3236	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33885026	5832	5641	-0.3751	NA	NA	NA	6.88044738389006e-09	33837999	33900814
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33891096	33891096	1	0	NA	6.88044738389006e-09	33837999	33900814	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33896774	33984182	20	19	-1.2637	NA	NA	NA	4.59524068709965e-08	33963271	34023347
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33992097	37953582	1485	1437	-0.3873	4.59524068709965e-08	33963271	34023347	3.05800864878124e-11	37953582	37953582
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-3.5421	3.05800864878124e-11	37953582	37953582	4.82896215896885e-12	37957844	37957844
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	47724088	3886	3768	-0.3587	4.82896215896885e-12	37957844	37957844	1.89441318743244e-57	47710041	47735477
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47725901	48022586	171	168	-1.1181	1.89441318743244e-57	47710041	47735477	2.00407951854898e-59	48008388	48048167
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	48025182	71373779	6265	6078	-0.3507	2.00407951854898e-59	48008388	48048167	6.54894476621832e-11	71372480	71373779
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71375082	71377671	3	3	-2.8391	6.54894476621832e-11	71372480	71373779	5.63741538878873e-11	71377671	71379555
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	95690264	7174	6937	-0.3206	5.63741538878873e-11	71377671	71379555	6.72073977468791e-07	95688641	95690264
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	95693603	95695263	2	2	-2.8059	6.72073977468791e-07	95688641	95690264	5.52555954834668e-07	95695263	95698075
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	95698075	114123340	6803	6590	-0.332	5.52555954834668e-07	95695263	95698075	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	105948347	31726	30695	-0.3545	NA	NA	NA	2.13620560664617e-44	105946993	105948347
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105977946	10	9	-2.6503	2.13620560664617e-44	105946993	105948347	1.81606441752143e-20	105977946	105985422
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105985422	106358491	149	146	-0.3451	1.81606441752143e-20	105977946	105985422	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	100298352	31322	30340	-0.0451	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54348362	13695	13236	0.0081	NA	NA	NA	1.35327833249892e-154	54339225	54353978
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	10	-1.4187	1.35327833249892e-154	54339225	54353978	3.61413146438663e-134	54368717	54402057
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	88690571	11951	11596	-0.2004	3.61413146438663e-134	54368717	54402057	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13407	-0.3326	NA	NA	NA	2.91274884560554e-122	36672710	36673853
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	1.3924	2.91274884560554e-122	36672710	36673853	1.75271325609849e-08	36684619	36686013
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15224	-0.3592	1.75271325609849e-08	36684619	36686013	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	35009893	10646	10297	-0.3743	NA	NA	NA	1.27808684319442e-34	34902190	35063895
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	35017617	35486935	158	152	-0.985	1.27808684319442e-34	34902190	35063895	1.43362238839259e-34	35468060	35513241
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	35489504	76116026	12160	11780	-0.376	1.43362238839259e-34	35468060	35513241	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	20841320	9322	9022	-0.265	NA	NA	NA	6.0205233367455e-16	20809612	20870473
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20900139	16	16	-1.2068	6.0205233367455e-16	20809612	20870473	1.29318284185933e-243	20880539	20909791
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20901410	63788698	13721	13260	-0.1506	1.29318284185933e-243	20880539	20909791	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	563	0.025	NA	NA	NA	2.4895685711982e-10	1495671	1511632
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1531162	10	8	-1.4648	2.4895685711982e-10	1495671	1511632	1.28623960099075e-10	1525300	1544485
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	59451672	19674	19041	0.053	1.28623960099075e-10	1525300	1544485	1.65833954060309e-13	59442261	59458129
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	59454114	59510476	25	25	-0.9075	1.65833954060309e-13	59442261	59458129	7.44948404034873e-12	59502759	59520348
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	59512111	62419534	1285	1248	0.0145	7.44948404034873e-12	59502759	59520348	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13044	-0.382	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1102	0.0517	NA	NA	NA	2.28781716501337e-06	18123761	18125356
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	2.441	2.28781716501337e-06	18123761	18125356	1.16818866258128e-06	18129194	18131561
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	22667608	1849	1794	0.0188	1.16818866258128e-06	18129194	18131561	1.15469768024147e-22	22643742	22686731
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	18	-1.4537	1.15469768024147e-22	22643742	22686731	1.04696942301846e-23	22714979	22725305
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	49571068	13553	13105	0.0444	1.04696942301846e-23	22714979	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2426938	1540	1489	0.0157	NA	NA	NA	9.4686494420737e-08	2426938	2426938
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	2.6122	9.4686494420737e-08	2426938	2426938	2.21556668044035e-08	2428307	2430156
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2711273	252	245	5e-04	2.21556668044035e-08	2428307	2430156	2.01129688601158e-134	2706218	2721311
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2712641	102700695	28275	27307	1.0201	2.01129688601158e-134	2706218	2721311	1.43897373367834e-06	102695017	102700695
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	102702964	102711501	4	4	-0.8592	1.43897373367834e-06	102695017	102700695	2.50702818725586e-05	102711501	102716046
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	102712118	103146444	168	162	0.8613	2.50702818725586e-05	102711501	102716046	4.51530842825783e-09	103107068	103154028
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103148232	103239703	26	25	1.792	4.51530842825783e-09	103107068	103154028	1.47572751767448e-08	103228308	103264934
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103241730	154442377	16628	16066	1.0146	1.47572751767448e-08	103228308	103264934	4.20140949753271e-09	154441943	154442377
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-0.9556	4.20140949753271e-09	154441943	154442377	9.68640726532283e-07	154450309	154456891
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154578922	27	26	1.0297	9.68640726532283e-07	154450309	154456891	1.57310802888416e-11	154561691	154601295
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154888224	202	198	3e-04	1.57310802888416e-11	154561691	154601295	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-1.9019	NA	NA	NA	1.47214397874818e-08	2969891	3223585
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	4597974	12	12	0.0099	1.47214397874818e-08	2969891	3223585	2.2941832152391e-10	4431527	6692482
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4846477	4846477	1	0	NA	2.2941832152391e-10	4431527	6692482	NA	NA	NA
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4948824	25737663	3201	3086	-1.5951	NA	NA	NA	8.5202411054625e-08	22852177	26904563
MSK_252152920191_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	79	-0.8439	8.5202411054625e-08	22852177	26904563	NA	NA	NA
