Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	38346924	14288	13347	-0.1649	NA	NA	NA	0	38316936	38405329
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	38350880	42540998	1649	1542	0.0959	0	38316936	38405329	8.70709325362212e-313	42521918	42556342
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	42541094	51701685	3663	3458	-0.1656	8.70709325362212e-313	42521918	42556342	1.65034586101838e-85	51685217	51718560
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51703570	52378388	306	292	0.1092	1.65034586101838e-85	51685217	51718560	1.92054390627641e-16	52378388	52378388
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52379645	52385001	3	2	1.5203	1.92054390627641e-16	52378388	52378388	3.76097499600092e-16	52385001	52385001
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52387461	72536231	7984	7495	0.1169	3.76097499600092e-16	52385001	52385001	4.03401671042833e-24	72534975	72536231
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72539143	2	0	NA	4.03401671042833e-24	72534975	72536231	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72540240	72568009	10	10	0.8795	NA	NA	NA	1.98815377497232e-45	72559751	72571158
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72571158	81864083	2835	2672	0.1649	1.98815377497232e-45	72559751	72571158	3.9627178975293e-46	81860266	81864083
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	81865401	81866611	2	2	-0.8082	3.9627178975293e-46	81860266	81864083	6.01592561297717e-10	81866611	81866611
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	81868788	81868788	1	0	NA	6.01592561297717e-10	81866611	81866611	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	81869978	84515313	668	624	0.2862	NA	NA	NA	2.19934421335021e-111	84507798	84523377
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84518014	85092379	236	222	0.6893	2.19934421335021e-111	84507798	84523377	2.03592409169244e-60	85077589	85105721
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85095885	85742732	304	290	0.3563	2.03592409169244e-60	85077589	85105721	4.50178156724282e-10	85735211	85745222
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85745222	85781420	16	16	-0.0144	4.50178156724282e-10	85735211	85745222	6.79146661293498e-08	85778723	85791022
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85782624	102429242	5778	5440	0.3383	6.79146661293498e-08	85778723	85791022	3.22561173685652e-56	102352528	102487135
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	102435665	103904723	268	255	0.1052	3.22561173685652e-56	102352528	102487135	2.57940879409202e-15	103899771	103907903
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	12	0.6562	2.57940879409202e-15	103899771	103907903	5.75692159125659e-16	103932025	104109172
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	108203143	896	838	0.0862	5.75692159125659e-16	103932025	104109172	1.91607129676261e-11	108203143	108203143
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108205691	108206802	2	2	-1.0932	1.91607129676261e-11	108203143	108203143	2.04301246005106e-11	108206802	108206802
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108207899	110023268	685	640	0.1136	2.04301246005106e-11	108206802	108206802	2.12322889287207e-12	110015739	110023268
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-0.7818	2.12322889287207e-12	110015739	110023268	6.80486368910593e-12	110041712	110058441
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	111159663	477	450	0.126	6.80486368910593e-12	110041712	110058441	4.52099340912606e-115	111113754	111196921
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111161029	111161029	1	0	NA	4.52099340912606e-115	111113754	111196921	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111169548	144530059	3689	3449	-0.1429	NA	NA	NA	0	144458571	144970789
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144542687	146294654	386	357	0.469	0	144458571	144970789	3.93542033076697e-20	146283719	147308557
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147847659	40	37	0.0675	3.93542033076697e-20	146283719	147308557	5.31829640737925e-24	147508217	148084402
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	151024118	1344	1251	0.5057	5.31829640737925e-24	147508217	148084402	1.10996498812028e-09	151020826	151024118
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151038091	6	6	1.1958	1.10996498812028e-09	151020826	151024118	1.46819573322565e-29	151038091	151045965
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151040463	160418252	3973	3725	0.5537	1.46819573322565e-29	151038091	151045965	4.68159623634565e-26	160413428	160418252
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	160421823	160445165	12	11	1.2746	4.68159623634565e-26	160413428	160418252	1.96631474793167e-23	160445165	160448699
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	160446461	160446461	1	0	NA	1.96631474793167e-23	160445165	160448699	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	160448699	167479184	2800	2632	0.5516	NA	NA	NA	1.30380522594128e-11	167477428	167493768
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167483267	2	0	NA	1.30380522594128e-11	167477428	167493768	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	7	-0.0938	NA	NA	NA	7.11172055079287e-10	167506259	167520743
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	180677484	5188	4864	0.505	7.11172055079287e-10	167506259	167520743	0	180670945	180679940
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	180678633	181844654	514	471	1.0526	0	180670945	180679940	0	181839082	181848876
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181846740	192715640	3000	2824	0.5101	0	181839082	181848876	1.19233357044043e-09	192715640	192715640
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-0.5992	1.19233357044043e-09	192715640	192715640	1.14091071885236e-08	192719540	192719540
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	193852919	147	138	0.4665	1.14091071885236e-08	192719540	192719540	6.14375494808398e-88	193827196	193870407
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	193860954	200600795	2497	2359	0.8925	6.14375494808398e-88	193827196	193870407	3.48810204468041e-09	200589108	200623556
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200602881	200665389	22	22	0.5444	3.48810204468041e-09	200589108	200623556	1.96923531164493e-06	200642828	200678532
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	201241651	220	207	0.8732	1.96923531164493e-06	200642828	200678532	6.12009158585971e-139	201234038	201249136
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	201242852	205303352	1721	1615	0.4213	6.12009158585971e-139	201234038	201249136	0	205303352	205308141
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	205305196	205305196	1	0	NA	0	205303352	205308141	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	205308141	218248407	4535	4279	-0.4575	NA	NA	NA	0	218235462	218261861
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	218250865	247186514	10947	10282	-0.1377	0	218235462	218261861	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34551222	11523	10783	0.103	NA	NA	NA	8.90517900188562e-12	34539740	34556434
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34582272	15	15	-0.3404	8.90517900188562e-12	34539740	34556434	4.42070960368323e-12	34575366	34591681
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34583814	37810001	1371	1292	0.115	4.42070960368323e-12	34575366	34591681	3.96860008389501e-20	37800512	37815049
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.3693	3.96860008389501e-20	37800512	37815049	4.76769519214023e-18	37847519	37859985
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5441	0.0811	4.76769519214023e-18	37847519	37859985	1.66433544663633e-235	52600588	52600588
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-3.2776	1.66433544663633e-235	52600588	52600588	4.09306372922532e-230	52635695	52635695
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	85469592	10566	9957	0.0856	4.09306372922532e-230	52635695	52635695	5.5494230716286e-13	85467648	85469592
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85471088	85475968	4	3	-0.6474	5.5494230716286e-13	85467648	85469592	1.43421763349247e-07	85475968	85479003
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85477748	85477748	1	0	NA	1.43421763349247e-07	85475968	85479003	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85479003	88361334	726	683	0.1476	NA	NA	NA	1.98014411111414e-10	88343235	88361334
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88366110	88383597	7	7	0.7553	1.98014411111414e-10	88343235	88361334	5.06805229556285e-08	88383597	88390196
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88386446	89890854	314	298	0.1655	5.06805229556285e-08	88383597	88390196	2.45829543623051e-11	89874859	91057122
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89902365	89902365	1	0	NA	2.45829543623051e-11	89874859	91057122	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91057122	91270311	14	14	-0.3254	NA	NA	NA	5.51604909104033e-11	91179406	94920265
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94784165	100294384	1729	1631	0.1074	5.51604909104033e-11	91179406	94920265	7.89752466000678e-18	100292351	100306139
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	100297406	100314980	7	7	0.8853	7.89752466000678e-18	100292351	100306139	3.34037882450473e-16	100303701	100317225
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	100317225	132389588	8244	7709	0.1416	3.34037882450473e-16	100303701	100317225	6.00725505778326e-12	132384767	132389588
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132397397	132739926	8	7	-0.5008	6.00725505778326e-12	132384767	132389588	1.60798413128398e-10	132739926	132750789
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132747227	177662551	14999	14032	0.104	1.60798413128398e-10	132739926	132750789	0	177654354	177667041
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	177667041	199430339	6706	6285	0.6642	0	177654354	177667041	0	199424321	199438476
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	199438476	218844854	7295	6821	-0.162	0	199424321	199438476	1.32271153236381e-09	218842100	218844854
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218847224	218850436	3	3	0.7418	1.32271153236381e-09	218842100	218844854	4.58492006611677e-09	218850436	218852974
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218852974	242689978	8466	7949	-0.1581	4.58492006611677e-09	218850436	218852974	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	15699494	5750	5386	-0.1227	NA	NA	NA	6.68542408225825e-125	15674279	15721750
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	15701504	17171305	581	548	0.1213	6.68542408225825e-125	15674279	15721750	5.2249902059664e-131	17143757	17191933
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17174664	24095340	2034	1906	-0.1469	5.2249902059664e-131	17143757	17191933	2.25985158353691e-65	24034577	24122685
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	24103000	24832444	254	235	0.1198	2.25985158353691e-65	24034577	24122685	9.87875081410672e-57	24790665	24873135
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	24838281	32074432	2176	2047	-0.128	9.87875081410672e-57	24790665	24873135	1.68144331965161e-05	32064724	32080848
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32098215	4	4	-0.715	1.68144331965161e-05	32064724	32080848	2.02707910386968e-21	32080848	32105610
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32100511	67078973	13292	12498	-0.1356	2.02707910386968e-21	32080848	32105610	1.76658714578130e-43	67025572	67104916
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	67082130	67592035	171	160	0.1247	1.7665871457813e-43	67025572	67104916	4.16879904055152e-37	67570901	67606662
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	67594365	68940290	493	462	-0.1481	4.16879904055152e-37	67570901	67606662	1.47407424155810e-07	68934644	68940290
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	68941243	68957676	5	5	0.4519	1.4740742415581e-07	68934644	68940290	2.08378466188185e-07	68957676	68967369
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	68958660	75479859	2115	1991	-0.1329	2.08378466188185e-07	68957676	68967369	2.13107961430646e-25	75474341	75787094
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	17	-0.7122	2.13107961430646e-25	75474341	75787094	6.12567504389134e-25	75870144	76000715
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	77429577	588	560	-0.1496	6.12567504389134e-25	75870144	76000715	2.09829381774685e-21	77429577	77429577
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	77431114	77434901	4	4	-1.1916	2.09829381774685e-21	77429577	77429577	2.89478745780794e-18	77434901	77434901
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	77437063	89273156	3044	2866	-0.1452	2.89478745780794e-18	77434901	77434901	0	89263528	89282837
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89274616	112882989	5298	4965	0.2018	0	89263528	89282837	0	112871949	112895127
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	112884580	129476424	6360	5969	-0.1275	0	112871949	112895127	0	129458147	129490357
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129478806	164027724	11308	10630	0.1359	0	129458147	129490357	6.32375925313037e-24	164023502	164038917
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164105613	19	16	-0.4668	6.32375925313037e-24	164023502	164038917	1.24079181405952e-126	164077288	164121847
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164107951	174730888	3355	3157	5e-04	1.24079181405952e-126	164077288	164121847	2.92444069847611e-123	174714523	174730888
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174732977	174772331	20	19	0.4527	2.92444069847611e-123	174714523	174730888	2.85649482356658e-28	174772331	174778063
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174775059	181772709	2230	2100	-0.1382	2.85649482356658e-28	174772331	174778063	0	181754470	181789014
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	181774823	181774823	1	0	NA	0	181754470	181789014	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	181776489	190132768	3098	2902	0.1384	NA	NA	NA	2.11520644439713e-216	190102621	190155603
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190135846	192652101	884	825	-0.1372	2.11520644439713e-216	190102621	190155603	0	192652101	192653890
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192653890	194354505	543	512	-0.9492	0	192652101	192653890	2.47733038774232e-170	194354505	194354505
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194365648	5	5	-4.1824	2.47733038774232e-170	194354505	194354505	6.5534914256488e-190	194365648	194365648
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194366950	195827915	583	553	-0.8883	6.5534914256488e-190	194365648	194365648	4.6881429093335e-07	195820767	195827915
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	195829254	195834929	4	4	-0.1691	4.6881429093335e-07	195820767	195827915	2.45152292271948e-05	195834929	195844091
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	195836081	199329592	1394	1317	-0.8784	2.45152292271948e-05	195834929	195844091	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	-0.662	NA	NA	NA	7.93347971232608e-10	58159	65688
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	9350141	3222	3011	-0.1147	7.93347971232608e-10	58159	65688	1.47450702319075e-23	9167182	9423819
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9375784	9575410	76	72	0.1833	1.47450702319075e-23	9167182	9423819	2.64901089945882e-27	9567377	9587202
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9578984	9678933	47	41	0.7552	2.64901089945882e-27	9567377	9587202	2.40325645167069e-19	9671404	9682921
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9681569	9815760	39	34	0.1512	2.40325645167069e-19	9671404	9682921	3.31130955371629e-238	9815760	9815760
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.7608	3.31130955371629e-238	9815760	9815760	4.69020566078621e-306	9842644	9842644
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	10560448	205	194	0.2027	4.69020566078621e-306	9842644	9842644	6.75986929606698e-78	10528630	10620352
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	10567796	34445002	5962	5606	-0.1048	6.75986929606698e-78	10528630	10620352	5.58639933159242e-19	34433787	34445002
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	0.4871	5.58639933159242e-19	34433787	34445002	1.42855330132850e-92	34491115	34525462
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	64376590	7781	7299	-0.0414	1.4285533013285e-92	34491115	34525462	2.54128264753831e-95	64376590	64376590
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-1.7608	2.54128264753831e-95	64376590	64376590	2.00094126273683e-20	64390333	64390333
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1011	-0.187	2.00094126273683e-20	64390333	64390333	3.00590484813472e-15	68899247	69085386
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.7001	3.00590484813472e-15	68899247	69085386	1.95125493036234e-61	69144974	69656183
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	158285753	26972	25399	-0.2265	1.95125493036234e-61	69144974	69656183	0	158273183	158304569
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	158288684	158288684	1	0	NA	0	158273183	158304569	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	158289881	171485420	3872	3667	0.0814	NA	NA	NA	2.35920958485552e-85	171433991	171553519
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	171501525	173224400	348	318	-0.1804	2.35920958485552e-85	171433991	171553519	3.21549257343074e-17	173224400	173224400
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.159	3.21549257343074e-17	173224400	173224400	2.68131251623150e-14	173228860	173228860
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	186676034	3968	3743	-0.156	2.6813125162315e-14	173228860	173228860	2.56083731949499e-56	186676034	186676034
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.4136	2.56083731949499e-56	186676034	186676034	5.38000044844644e-53	186680176	186680176
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	287	-0.1413	5.38000044844644e-53	186680176	186680176	1.90604513795907e-30	187330240	187330240
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.8095	1.90604513795907e-30	187330240	187330240	3.23972999227154e-31	187333619	187333619
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190772330	1143	1071	-0.1617	3.23972999227154e-31	187333619	187333619	2.45864165501364e-30	190754887	190784435
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190924564	54	54	-0.5419	2.45864165501364e-30	190754887	190784435	1.05135950289164e-25	190917729	190927969
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190927969	191041481	37	34	-0.0895	1.05135950289164e-25	190917729	190927969	0.00110739957566903	191037553	191133609
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	6	-0.5206	0.00110739957566903	191037553	191133609	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	203	0.0445	NA	NA	NA	6.6976095731425e-07	729262	737829
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	816789	4	4	-0.7916	6.6976095731425e-07	729262	737829	2.16975641628374e-07	816789	870657
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	819038	819038	1	0	NA	2.16975641628374e-07	816789	870657	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	829954	1194940	117	104	-0.0812	NA	NA	NA	3.04069444202984e-14	1169776	1237479
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1197990	1617819	169	155	0.1751	3.04069444202984e-14	1169776	1237479	7.45747332523632e-33	1590150	1709326
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1645595	12857302	3462	3264	-0.056	7.45747332523632e-33	1590150	1709326	5.41718482951834e-33	12857302	12857302
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-2.059	5.41718482951834e-33	12857302	12857302	1.97239276186158e-36	12873052	12873052
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	17559190	1530	1434	-0.0381	1.97239276186158e-36	12873052	12873052	2.20781012032552e-07	17555576	17559190
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17647063	17653599	2	2	-0.9447	2.20781012032552e-07	17555576	17559190	8.89385522445014e-29	17653599	17671944
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17671944	53650767	8669	8120	-0.0687	8.89385522445014e-29	17653599	17671944	0	53643012	53659034
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	53653488	85910575	9959	9343	-0.4753	0	53643012	53659034	1.50131285859552e-173	85859772	85927865
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	85916526	87912256	486	450	-0.1572	1.50131285859552e-173	85859772	85927865	7.28631748435422e-192	87887192	87945887
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	87915628	112879972	6853	6459	-0.4911	7.28631748435422e-192	87887192	87945887	2.40421705979091e-13	112867834	112890226
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112881210	112882999	2	0	NA	2.40421705979091e-13	112867834	112890226	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112884924	112958921	33	30	-0.1512	NA	NA	NA	1.07334849190389e-10	112945689	112997938
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112961195	137913264	7613	7155	-0.4566	1.07334849190389e-10	112945689	112997938	1.25067493198576e-30	137900142	137921613
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137916146	138096543	63	60	-0.0973	1.25067493198576e-30	137900142	137921613	5.12403970615683e-21	138070593	138124461
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	138102436	140201609	892	832	-0.4292	5.12403970615683e-21	138070593	138124461	1.00557459978867e-83	140201609	140201609
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140203440	1	0	NA	1.00557459978867e-83	140201609	140201609	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140216524	7	7	-2.2973	NA	NA	NA	1.27619481535283e-95	140216524	140216524
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	153682607	4876	4564	-0.4335	1.27619481535283e-95	140216524	140216524	2.18320306894621e-05	153677404	153682607
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	153683387	153688142	4	4	0.1726	2.18320306894621e-05	153677404	153682607	5.4672438146122e-05	153688142	153690707
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	153689073	154138799	195	182	-0.4005	5.4672438146122e-05	153688142	153690707	8.0856485136754e-22	154122061	154152456
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	154140094	154354920	102	100	-0.1009	8.0856485136754e-22	154122061	154152456	1.67922432612804e-46	154340862	154371370
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	154357635	180346557	8384	7855	-0.4503	1.67922432612804e-46	154340862	154371370	1.21619391859083e-165	180346557	180346557
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-3.1115	1.21619391859083e-165	180346557	180346557	2.71700419969249e-90	180358977	180358977
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	100	-0.4518	2.71700419969249e-90	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	14853655	5278	4929	0.076	NA	NA	NA	0	14810157	14896205
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	14857310	31299556	5875	5519	-0.1746	0	14810157	14896205	2.66686955586214e-114	31269042	31344382
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31304224	32558677	524	490	0.0745	2.66686955586214e-114	31269042	31344382	1.11619953665929e-101	32558677	32564884
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	-2.1833	1.11619953665929e-101	32558677	32564884	3.3997012835078e-09	32588005	32600962
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	37	-0.2559	3.3997012835078e-09	32588005	32600962	1.61801368443415e-07	32707427	32713363
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728285	7	7	-1.7352	1.61801368443415e-07	32707427	32713363	0.00246655311417766	32721872	32732764
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32728487	32728487	1	0	NA	0.00246655311417766	32721872	32732764	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32739800	6	6	-0.5672	NA	NA	NA	5.3651195224146e-05	32732764	32758904
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	41467943	3676	3450	-0.1725	5.3651195224146e-05	32732764	32758904	3.28825086330337e-09	41431403	41498736
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	41474945	41601947	20	20	0.1709	3.28825086330337e-09	41431403	41498736	1.74815678726693e-08	41593200	41619268
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	41605715	43779098	967	915	-0.1557	1.74815678726693e-08	41593200	41619268	0	43774146	43783796
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	43780583	66395604	6201	5813	0.29	0	43774146	43783796	0	66388418	66403348
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66396868	77558013	3551	3321	-0.1243	0	66388418	66403348	5.42166172504012e-304	77542081	77560692
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77560692	79018959	273	258	0.4234	5.42166172504012e-304	77542081	77560692	5.74299955447623e-23	79015901	79018959
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.1884	5.74299955447623e-23	79015901	79018959	2.05620477096046e-14	79091850	79101978
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	79254859	27	25	0.4295	2.05620477096046e-14	79091850	79101978	9.85784879390002e-25	79233155	79263307
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79258795	80767636	478	446	-0.0624	9.85784879390002e-25	79233155	79263307	3.85638083470267e-61	80748013	80794105
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	80769998	80769998	1	0	NA	3.85638083470267e-61	80748013	80794105	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	80772303	83066401	538	510	0.191	NA	NA	NA	1.05706271978813e-164	83040234	83110082
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83070114	95499813	3392	3198	-0.106	1.05706271978813e-164	83040234	83110082	0	95465179	95535504
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95513554	103841482	2326	2196	-0.4807	0	95465179	95535504	2.74802158642170e-19	103841482	103841482
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.606	2.7480215864217e-19	103841482	103841482	1.24759105860066e-17	103868154	103868154
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	112578345	3145	2955	-0.4676	1.24759105860066e-17	103868154	103868154	1.65971139648737e-22	112557899	112593030
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	112580345	112580345	1	0	NA	1.65971139648737e-22	112557899	112593030	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	112581952	112774861	90	79	-0.1929	NA	NA	NA	4.08655672170558e-27	112763701	112789077
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	112776084	138436025	8646	8121	-0.481	4.08655672170558e-27	112763701	112789077	1.36030525914459e-294	138427440	138447205
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	138444664	139414628	418	391	-0.9133	1.36030525914459e-294	138427440	138447205	6.10936940140493e-49	139407993	139420180
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139418006	139643729	80	71	-0.4268	6.10936940140493e-49	139407993	139420180	7.04639156357355e-31	139643729	139643729
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-2.0406	7.04639156357355e-31	139643729	139643729	2.69942190712909e-27	139648318	139648318
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	142603284	621	587	-0.5278	2.69942190712909e-27	139648318	139648318	2.69506758619949e-09	142599363	142606022
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	142606022	142644021	10	9	-0.0097	2.69506758619949e-09	142599363	142606022	1.34220758503004e-10	142633133	142654280
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	142648452	156924354	5120	4807	-0.4665	1.34220758503004e-10	142633133	142654280	0	156913639	156941573
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	156926995	160260228	1087	1023	-0.8753	0	156913639	156941573	4.82557881001244e-252	160250783	160276072
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	160265869	162056126	697	653	-0.4448	4.82557881001244e-252	160250783	160276072	0	162050723	162064324
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162058613	162058613	1	0	NA	0	162050723	162064324	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162059980	165643653	1187	1105	-0.9512	NA	NA	NA	8.66752252311345e-36	165643653	165643653
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.6857	8.66752252311345e-36	165643653	165643653	1.63382538528553e-32	165650610	165650610
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	165653315	1	0	NA	1.63382538528553e-32	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165655123	170753106	1803	1699	-0.9238	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	21470927	7141	6725	-0.0865	NA	NA	NA	3.93208786552347e-174	21467946	21471397
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	21471397	21479051	8	8	0.5419	3.93208786552347e-174	21467946	21471397	4.94425791002808e-07	21477049	21482735
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	21480399	38269153	6454	6061	0.0666	4.94425791002808e-07	21477049	21482735	2.55355718258040e-10	38244071	38287976
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38270942	38332055	33	28	0.3715	2.5535571825804e-10	38244071	38287976	2.45252948230917e-107	38323325	38340009
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38333171	52892719	4468	4210	-0.1183	2.45252948230917e-107	38323325	38340009	2.54566344029353e-203	52792083	52981305
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52897995	63663280	1248	1175	0.128	2.54566344029353e-203	52792083	52981305	4.70548550797567e-21	63663280	63663280
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	63664758	63664758	1	0	NA	4.70548550797567e-21	63663280	63663280	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	63668435	63671043	2	2	1.7941	NA	NA	NA	5.16934307444822e-15	63671043	63671043
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	63676148	64204393	129	122	0.1778	5.16934307444822e-15	63671043	63671043	3.38673344264033e-09	64077702	64343339
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64317152	64454188	51	50	0.4771	3.38673344264033e-09	64077702	64343339	1.51148685465264e-20	64446612	64459529
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64456587	64582281	50	48	-0.0858	1.51148685465264e-20	64446612	64459529	1.50956729969016e-06	64562196	64582281
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64701021	64833838	13	11	0.4222	1.50956729969016e-06	64562196	64582281	0	64833838	64843136
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64836809	109216032	15362	14396	-0.0754	0	64833838	64843136	0	109214735	109216032
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109217320	1	0	NA	0	109214735	109216032	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109240210	5	5	0.6816	NA	NA	NA	6.41227647074743e-14	109240210	109245944
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109244233	1	0	NA	6.41227647074743e-14	109240210	109245944	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	110666822	641	600	-0.1516	NA	NA	NA	1.12775112164126e-09	110664627	110666822
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110668823	110668823	1	0	NA	1.12775112164126e-09	110664627	110666822	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110670746	110676852	2	2	0.9507	NA	NA	NA	1.31684370321405e-09	110676852	110676852
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110679651	113231408	1147	1070	-0.1164	1.31684370321405e-09	110676852	110676852	2.28007133956281e-197	113210628	113255269
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	113233292	118611324	2507	2361	0.1294	2.28007133956281e-197	113210628	113255269	4.89529193123204e-25	118611324	118611324
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.516	4.89529193123204e-25	118611324	118611324	5.8510581408812e-21	118620875	118620875
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2990	0.165	5.8510581408812e-21	118620875	118620875	4.97819724919628e-62	125831554	125831554
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-2.1378	4.97819724919628e-62	125831554	125831554	3.84478726541966e-80	125837524	125837524
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	125859264	11	11	0.0607	3.84478726541966e-80	125837524	125837524	3.55270512212869e-42	125859264	125862329
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125862329	125960167	47	45	-1.256	3.55270512212869e-42	125859264	125862329	0	125958349	125960167
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125961926	131238013	2515	2357	0.1896	0	125958349	125960167	1.19568660092226e-57	131238013	131238013
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131239610	131240815	2	2	-0.9059	1.19568660092226e-57	131238013	131238013	2.03095448447525e-58	131240815	131240815
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131242687	141409512	4786	4479	0.3552	2.03095448447525e-58	131240815	131240815	1.31377864697449e-65	141408013	141409512
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141410894	1	0	NA	1.31377864697449e-65	141408013	141409512	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	1.0892	NA	NA	NA	1.93586988939707e-21	141438504	141443577
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	142141101	291	276	0.432	1.93586988939707e-21	141438504	141443577	3.26203540014168e-17	142141101	142161005
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142149857	142167908	8	6	-0.4528	3.26203540014168e-17	142141101	142161005	3.59978605925944e-14	142156165	142167908
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143503317	486	458	0.3901	3.59978605925944e-14	142156165	142167908	9.42230276257283e-17	143503317	143503317
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-0.845	9.42230276257283e-17	143503317	143503317	2.67445954795461e-15	143584350	143584350
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	150580943	3005	2835	0.3527	2.67445954795461e-15	143584350	143584350	1.00289993463457e-06	150579037	150580943
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	150581652	150582286	2	2	-0.6395	1.00289993463457e-06	150579037	150580943	1.82327641860644e-07	150582286	150582924
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	150582924	155446066	1655	1527	0.377	1.82327641860644e-07	150582286	150582924	8.9412720804074e-162	155426628	155464221
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	155447846	158191657	1214	1124	0.1137	8.9412720804074e-162	155426628	155464221	1.81674636274139e-38	158191657	158191657
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158193795	158195947	2	2	-2.2161	1.81674636274139e-38	158191657	158191657	7.22936185177989e-38	158195947	158195947
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158197662	158821263	212	198	0.1377	7.22936185177989e-38	158195947	158195947	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	4976503	1920	1805	-0.9292	NA	NA	NA	7.84473534592624e-15	4976503	4976503
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4979450	4980958	2	2	-2.2276	7.84473534592624e-15	4976503	4976503	3.23632578803744e-10	4980958	4980958
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4984460	7156900	470	446	-0.8986	3.23632578803744e-10	4980958	4980958	5.64854336260056e-17	6926661	7260442
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-1.7089	5.64854336260056e-17	6926661	7260442	2.96140023269891e-17	7729311	8137794
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	15444819	2662	2515	-0.9013	2.96140023269891e-17	7729311	8137794	4.57942960030661e-23	15444819	15446571
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15446571	15457778	6	5	-2.1484	4.57942960030661e-23	15444819	15446571	2.17748762739574e-22	15453544	15457778
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15464010	24200321	2824	2640	-0.8867	2.17748762739574e-22	15453544	15457778	9.25434889873245e-12	24200321	24200321
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	24202837	24205866	2	2	-2.1099	9.25434889873245e-12	24200321	24200321	1.8051754975545e-08	24205866	24208869
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	24208869	25022606	234	221	-0.9311	1.8051754975545e-08	24205866	24208869	2.50427458328617e-24	25022606	25022606
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	0.6785	2.50427458328617e-24	25022606	25022606	7.61493023110144e-23	25039370	25039370
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	35570396	3790	3560	-0.8831	7.61493023110144e-23	25039370	25039370	0	35556087	35574259
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	35572607	38284448	735	695	-0.4321	0	35556087	35574259	1.47293226906038e-120	38274912	38298394
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38286573	39350798	417	393	-0.0968	1.47293226906038e-120	38274912	38298394	0	39350798	39356595
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39508035	60	54	-3.5395	0	39350798	39356595	0	39504332	39508035
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39509423	41138976	483	461	-0.1332	0	39504332	39508035	1.34621855390254e-107	41096124	41222349
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	41149420	43515874	863	811	-0.4207	1.34621855390254e-107	41096124	41222349	3.99520572102613e-134	43434689	47066831
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	43647063	51191560	832	795	-0.1387	3.99520572102613e-134	43434689	47066831	2.77309249078270e-10	51191560	51191560
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	2.7730924907827e-10	51191560	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-1.0594	NA	NA	NA	5.44500052306561e-10	51200291	51200291
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51689469	183	172	-0.1543	5.44500052306561e-10	51200291	51200291	1.24588161892768e-67	51669223	51701070
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51690648	74074585	6884	6462	0.163	1.24588161892768e-67	51669223	51701070	4.80929275224107e-59	74037181	74087795
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	74077691	74599207	187	172	-0.1037	4.80929275224107e-59	74037181	74087795	7.84794486708183e-35	74580307	74623093
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	74601191	75307146	264	247	0.1676	7.84794486708183e-35	74580307	74623093	2.47367584004139e-101	75289131	75320397
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75309812	95721121	5442	5087	-0.1398	2.47367584004139e-101	75289131	75320397	0	95715121	95727643
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	95722838	99986709	1579	1493	0.2725	0	95715121	95727643	0	99983348	99990666
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	99990666	100850923	387	361	1.0532	0	99983348	99990666	7.72304269076785e-07	100850923	100850923
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	100852782	100854125	2	2	0.102	7.72304269076785e-07	100850923	100850923	4.12308917403979e-21	100854125	100854125
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	100856661	102313775	553	518	1.2027	4.12308917403979e-21	100854125	100854125	0	102313775	102313775
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102317363	102317363	1	0	NA	0	102313775	102313775	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102321033	110545802	2866	2695	0.1613	NA	NA	NA	2.67613697271645e-108	110541040	110554208
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	110546967	111116264	175	163	0.5683	2.67613697271645e-108	110541040	110554208	5.4704454814733e-141	111076760	111138295
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	111122285	128356223	5024	4693	0.1166	5.4704454814733e-141	111076760	111138295	6.35813968839252e-32	128308989	128408523
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	128364778	128973776	167	148	0.3425	6.35813968839252e-32	128308989	128408523	2.54730602375416e-30	128946398	129000785
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	128976373	130768860	575	535	0.104	2.54730602375416e-30	128946398	129000785	5.3845760087196e-97	130736994	130823853
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	130770349	143101155	3861	3621	0.328	5.3845760087196e-97	130736994	130823853	2.90108911492245e-08	143069773	143123050
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143104062	143194840	28	27	0.6113	2.90108911492245e-08	143069773	143123050	6.14699920608931e-13	143187955	143213898
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143196704	146264846	1072	996	0.2031	6.14699920608931e-13	143187955	143213898	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	2958584	1038	976	-0.1294	NA	NA	NA	6.24133998311482e-34	2930577	2987819
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2960469	3371527	144	139	0.1262	6.24133998311482e-34	2930577	2987819	3.76841486326459e-41	3355815	3390433
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	3372755	3372755	1	0	NA	3.76841486326459e-41	3355815	3390433	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	3374284	38494864	11492	10763	-0.1387	NA	NA	NA	4.12867185368444e-19	38449475	38618729
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	38519628	39062211	52	52	0.1581	4.12867185368444e-19	38449475	38618729	0.00262054388767559	38698775	43599449
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39088753	66245109	14	14	-0.1153	0.00262054388767559	38698775	43599449	7.7581008975557e-08	44199401	66245109
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67859114	67942846	12	12	-0.6376	7.7581008975557e-08	44199401	66245109	2.35054325679823e-14	67927172	70174301
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	68483889	70926188	319	302	-0.1399	2.35054325679823e-14	67927172	70174301	3.27815286500424e-92	70926188	70926188
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.2233	3.27815286500424e-92	70926188	70926188	1.85059737509924e-79	70930528	70930528
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9316	-0.1429	1.85059737509924e-79	70930528	70930528	3.9141522686565e-20	100348045	100348045
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.7169	3.9141522686565e-20	100348045	100348045	1.39144825944433e-34	100350814	100350814
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	140145683	14949	14061	-0.1543	1.39144825944433e-34	100350814	100350814	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13298703	4590	4315	0.4505	NA	NA	NA	0	13286667	13310365
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13301416	27038538	5139	4826	0.1204	0	13286667	13310365	1.43594134064294e-12	27038538	27038538
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.356	1.43594134064294e-12	27038538	27038538	8.08497332091994e-13	27041812	27041812
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	35123338	2855	2688	0.1019	8.08497332091994e-13	27041812	27041812	2.23552998504223e-24	35101773	35136152
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	35125382	35349408	80	78	0.3799	2.23552998504223e-24	35101773	35136152	1.4690616121341e-45	35341166	35366374
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	35352564	51976747	2881	2686	0.0642	1.4690616121341e-45	35341166	35366374	0	51973194	51982009
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	51979738	57776243	1873	1739	-0.4936	0	51973194	51982009	5.78207893035686e-50	57772265	57776243
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	57778065	57857760	20	20	0.3097	5.78207893035686e-50	57772265	57776243	1.15012495525246e-63	57857760	57863535
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	57863535	58206592	42	37	-0.509	1.15012495525246e-63	57857760	57863535	4.39318528535443e-19	58180251	58242998
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	58216248	59759443	282	271	-0.1336	4.39318528535443e-19	58180251	58242998	1.65890963303452e-07	59759443	59759443
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	59762013	59763385	2	2	-1.1242	1.65890963303452e-07	59759443	59759443	8.65886406374326e-10	59763385	59763385
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	59766415	61559848	647	609	-0.1349	8.65886406374326e-10	59763385	59763385	4.11892398926447e-250	61558603	61561323
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	61561323	61921253	156	149	0.5154	4.11892398926447e-250	61558603	61561323	5.90659244757442e-264	61912192	61924634
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	61924634	71177029	3178	2976	-0.1414	5.90659244757442e-264	61912192	61924634	5.09962600695470e-109	71103722	71203419
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	71181405	72290242	482	453	0.1128	5.0996260069547e-109	71103722	71203419	0	72286150	72296210
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	72293867	75812637	1414	1330	0.7142	0	72286150	72296210	2.54467346575154e-190	75800265	75828276
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	75814570	77917893	949	895	1.0461	2.54467346575154e-190	75800265	75828276	3.48159388068867e-70	77917893	77917893
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.5994	3.48159388068867e-70	77917893	77917893	4.32556134964853e-56	77928738	77928738
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	78123731	48	46	1.0497	4.32556134964853e-56	77928738	77928738	2.41292163559607e-28	78104643	78157542
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	78127505	80769536	993	927	0.5969	2.41292163559607e-28	78104643	78157542	0	80758889	80776143
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	80771740	102826882	7590	7111	0.1513	0	80758889	80776143	0	102809715	102845735
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	102829847	105771406	1379	1293	-0.1197	0	102809715	102845735	1.82006426723668e-16	105761993	105780527
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	105772829	105826909	51	48	0.1745	1.82006426723668e-16	105761993	105780527	1.59462928433068e-16	105813028	105838279
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	105828428	108355672	773	726	-0.119	1.59462928433068e-16	105813028	105838279	4.83463827190493e-19	108341709	108370476
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	108357901	108478041	63	57	0.1688	4.83463827190493e-19	108341709	108370476	1.30186477997046e-18	108467352	108494756
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	108479688	110993046	596	560	-0.1324	1.30186477997046e-18	108467352	108494756	8.11887103164568e-32	110982416	110999873
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	110995138	111545211	81	76	-0.4709	8.11887103164568e-32	110982416	110999873	2.26390306602654e-16	111532212	111575383
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	111551295	111690929	57	53	-0.1028	2.26390306602654e-16	111532212	111575383	2.04969723907657e-11	111674952	111694164
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	111692347	111762784	36	31	-0.5181	2.04969723907657e-11	111674952	111694164	5.35654936090512e-21	111760916	111769767
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	111764178	112234200	180	167	-0.0572	5.35654936090512e-21	111760916	111769767	5.3074584266317e-07	112223742	112235573
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	112235573	112264726	15	13	-0.4571	5.3074584266317e-07	112223742	112235573	8.02108837693352e-06	112263440	112278003
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	112266836	114716053	820	779	-0.126	8.02108837693352e-06	112263440	112278003	5.66020455523827e-62	114696373	114727225
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114717195	115758723	360	332	0.1182	5.66020455523827e-62	114696373	114727225	0	115748455	115766874
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	115764547	127563278	4453	4177	-0.4526	0	115748455	115766874	2.58116783517923e-10	127551446	127563278
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127592138	13	13	0.0148	2.58116783517923e-10	127551446	127563278	1.47415122056731e-09	127592138	127608087
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127598425	135285645	2705	2550	-0.4456	1.47415122056731e-09	127592138	127608087	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	34643505	12387	11573	0.4865	NA	NA	NA	3.06471907735836e-59	34638935	34647444
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34645505	34854821	42	39	1.0501	3.06471907735836e-59	34638935	34647444	3.501713351035e-55	34846704	34857668
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34856415	59036925	5976	5631	0.4909	3.501713351035e-55	34846704	34857668	1.06540573581842e-92	59010980	59064454
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	59038936	59996225	392	370	0.2446	1.06540573581842e-92	59010980	59064454	1.75829663137912e-61	59986338	60009776
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	60000783	60002282	2	0	NA	1.75829663137912e-61	59986338	60009776	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	60005422	60323280	119	110	0.7128	NA	NA	NA	4.12237226790323e-56	60313192	60331077
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	60325549	62135385	779	723	0.2947	4.12237226790323e-56	60313192	60331077	4.16657535323646e-13	62121549	62149977
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62138755	62176447	22	19	-0.054	4.16657535323646e-13	62121549	62149977	7.05140455987934e-10	62167093	62191077
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62180848	68603835	2625	2450	-0.4423	7.05140455987934e-10	62167093	62191077	0	68601689	68606492
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	68606492	71817478	1074	1012	0.4521	0	68601689	68606492	2.01545568601967e-13	71810200	71819377
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	71819377	71861247	15	14	0.9993	2.01545568601967e-13	71810200	71819377	5.79301508757464e-22	71851786	71903673
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	71869385	77792000	2518	2356	0.472	5.79301508757464e-22	71851786	71903673	0	77790574	77794231
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	77794231	88207267	3433	3210	-0.4429	0	77790574	77794231	7.59594960388022e-37	88192279	88239446
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88208624	88520213	98	93	-0.1221	7.59594960388022e-37	88192279	88239446	8.06796637289702e-08	88456323	88548197
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88522625	88522625	1	0	NA	8.06796637289702e-08	88456323	88548197	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88530693	88615878	36	36	-0.4805	NA	NA	NA	1.00554548729069e-05	88590789	88662427
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88617951	88793207	69	64	-0.129	1.00554548729069e-05	88590789	88662427	3.38333858750087e-09	88767010	88806893
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88794713	88922094	60	55	-0.4837	3.38333858750087e-09	88767010	88806893	7.32919848907017e-11	88907287	88967637
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88925632	89496302	67	63	-0.1441	7.32919848907017e-11	88907287	88967637	2.55452472283335e-114	89491741	89498409
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	89498409	112846513	7454	7019	-0.9168	2.55452472283335e-114	89491741	89498409	0	112839033	112851703
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	112847858	127947558	5561	5239	-0.4419	0	112839033	112851703	2.20311026043723e-125	127935991	127955651
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	127949076	128668427	290	272	-0.0932	2.20311026043723e-125	127935991	127955651	1.34349159941097e-120	128659600	128677771
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	128671975	133802159	2090	1970	-0.4359	1.34349159941097e-120	128659600	128677771	6.57783843328462e-16	133780522	133817001
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	133804207	134017362	67	65	-0.191	6.57783843328462e-16	133780522	133817001	2.75185320423555e-13	133995857	134039846
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134020468	134333885	98	94	-0.4541	2.75185320423555e-13	133995857	134039846	5.20078023241142e-07	134318095	134339490
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134336346	134372904	9	8	-0.0167	5.20078023241142e-07	134318095	134339490	0.00249396508930305	134358978	134400713
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134373558	134439347	18	15	-0.4662	0.00249396508930305	134358978	134400713	0.0277546256182221	134400713	134439347
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134443483	134450318	2	2	0.1289	0.0277546256182221	134400713	134439347	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	2109441	919	856	0.0821	NA	NA	NA	1.43249669376148e-15	2106791	2109441
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.6935	1.43249669376148e-15	2106791	2109441	2.44616044945018e-17	2127537	2128807
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	3513257	609	575	0.0969	2.44616044945018e-17	2127537	2128807	1.30319973965459e-08	3492601	3521474
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	3515449	3551058	15	13	0.5138	1.30319973965459e-08	3492601	3521474	2.21505154030503e-10	3544010	3556749
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	3553676	4189676	224	212	0.0737	2.21505154030503e-10	3544010	3556749	3.88251099175076e-56	4172479	4207013
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4191679	4191679	1	0	NA	3.88251099175076e-56	4172479	4207013	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4198460	4508193	127	119	0.4881	NA	NA	NA	6.3244656143543e-36	4495716	4517081
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4510538	4756703	114	109	0.0929	6.3244656143543e-36	4495716	4517081	5.83700807873148e-14	4744290	4768389
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4758531	4758531	1	0	NA	5.83700807873148e-14	4744290	4768389	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4760603	4816111	30	30	0.4758	NA	NA	NA	4.782252870736e-20	4809210	4822525
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4819069	6078241	472	438	0.0822	4.782252870736e-20	4809210	4822525	2.96293756084754e-11	6076174	6078241
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	6084994	6096562	6	6	0.719	2.96293756084754e-11	6076174	6078241	1.11086545872053e-08	6096562	6100934
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	6098201	7884886	720	684	0.0995	1.11086545872053e-08	6096562	6100934	1.60913872712066e-22	7870282	7900758
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7890143	8039421	60	57	0.4382	1.60913872712066e-22	7870282	7900758	5.45766333602875e-15	8023055	8068318
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8055254	8694285	149	137	0.1076	5.45766333602875e-15	8023055	8068318	5.45276421921602e-08	8689944	8699271
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8698042	8713375	9	8	0.6259	5.45276421921602e-08	8689944	8699271	6.8339353526281e-09	8708794	8723533
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8717144	9523923	278	260	0.1022	6.8339353526281e-09	8708794	8723533	3.42352293438481e-56	9523923	9531133
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	4	-2.3217	3.42352293438481e-56	9523923	9531133	7.63686609341983e-77	9531133	9554149
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	11140421	589	562	0.0693	7.63686609341983e-77	9531133	9554149	2.70533716142813e-119	11116883	11182224
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	24227456	4448	4191	-0.1699	2.70533716142813e-119	11116883	11182224	2.24396709596716e-82	24221619	24229412
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	24228249	24394168	114	106	0.265	2.24396709596716e-82	24221619	24229412	1.12869907772838e-35	24385318	24410273
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	24396030	30321905	2037	1892	0.544	1.12869907772838e-35	24385318	24410273	9.14979163568077e-62	30267639	30353737
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	30326850	31132762	220	210	0.8179	9.14979163568077e-62	30267639	30353737	7.69009268085254e-18	31079618	31173065
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31292507	40	37	0.4157	7.69009268085254e-18	31079618	31173065	3.73726847202976e-24	31287684	31299898
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31295667	34302633	977	916	0.8516	3.73726847202976e-24	31287684	31299898	7.3749875431222e-24	34282100	36244407
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	34308659	36969273	35	35	0.3974	7.3749875431222e-24	34282100	36244407	2.53785400430153e-27	36953161	36992225
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	36973165	40224624	1087	1014	0.8588	2.53785400430153e-27	36953161	36992225	0	40223312	40230684
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	40227108	40228646	2	0	NA	0	40223312	40230684	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	40230684	42168943	547	514	0.1843	NA	NA	NA	1.22395368416829e-10	42149057	42168943
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	42170585	42176147	4	4	0.734	1.22395368416829e-10	42149057	42168943	3.62126032603537e-08	42176147	42179322
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	42177732	44486583	851	796	0.0868	3.62126032603537e-08	42176147	42179322	4.18051600602004e-16	44468996	44498341
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	44487823	44611608	56	52	0.3446	4.18051600602004e-16	44468996	44498341	1.48323646075502e-12	44593353	44623170
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	44613808	44923991	84	76	0.0756	1.48323646075502e-12	44593353	44623170	2.90179145899878e-97	44921312	44926023
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	44926023	45110303	53	53	0.8792	2.90179145899878e-97	44921312	44926023	2.43891944719399e-68	45096382	45120818
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	45113669	45113669	1	0	NA	2.43891944719399e-68	45096382	45120818	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	45117838	50663444	2211	2062	0.3304	NA	NA	NA	4.45801020267188e-36	50645873	50666092
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	50666092	50693553	16	15	0.6844	4.45801020267188e-36	50645873	50666092	2.67928796783186e-07	50690748	50712778
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	50695886	50695886	1	0	NA	2.67928796783186e-07	50690748	50712778	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	50698852	52410537	773	719	0.2964	NA	NA	NA	2.11084637614842e-64	52400588	52427009
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52415120	52667969	78	75	0.8336	2.11084637614842e-64	52400588	52427009	7.24015194805977e-74	52663264	52668951
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52668449	58069682	2073	1943	0.3305	7.24015194805977e-74	52663264	52668951	0	58062927	58077819
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	58076554	62941930	1385	1292	0.8546	0	58062927	58077819	0	62936569	62949520
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	62942855	70548934	2842	2665	0.3336	0	62936569	62949520	0	70524835	70568108
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	70550168	93001784	6224	5810	0.0914	0	70524835	70568108	0	92947820	93057672
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	93006261	102989108	3793	3555	-0.1544	0	92947820	93057672	2.8802249686057e-16	102973554	103003355
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	102994324	103095604	45	41	0.157	2.8802249686057e-16	102973554	103003355	1.27970431797990e-15	103069579	103130877
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	103100896	113667486	3997	3738	-0.1494	1.2797043179799e-15	103069579	103130877	0	113648595	113685105
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	113669720	130943064	6279	5879	0.1236	0	113648595	113685105	3.6209481178467e-43	130943064	130943064
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.4476	3.6209481178467e-43	130943064	130943064	3.07947029344863e-40	130946248	130946248
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	131088182	65	62	0.0702	3.07947029344863e-40	130946248	130946248	0.000890549150260022	131074213	131090090
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131090090	131099401	6	6	0.476	0.000890549150260022	131074213	131090090	4.7336050735283e-05	131097737	131104837
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131100943	131126508	14	13	0.0974	4.7336050735283e-05	131097737	131104837	1.16273912259423e-05	131119447	131130884
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131127700	131146139	10	10	0.4386	1.16273912259423e-05	131119447	131130884	6.31937975522948e-05	131140792	131161447
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131150252	132046422	364	346	0.0463	6.31937975522948e-05	131140792	131161447	1.16649608360245e-09	131991857	132096879
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132050358	132050358	1	0	NA	1.16649608360245e-09	131991857	132096879	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132052963	132289090	90	86	-0.1562	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11506	-0.1427	NA	NA	NA	2.97068992362992e-23	49964838	49964838
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.4271	2.97068992362992e-23	49964838	49964838	4.97439715592626e-32	49971732	49971732
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56646284	1803	1684	-0.1153	4.97439715592626e-32	49971732	49971732	1.5657486404125e-48	56610886	56650373
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56650373	56685341	16	16	0.5623	1.5657486404125e-48	56610886	56650373	6.56636942817275e-15	56679017	56691355
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	59636614	777	733	0.082	6.56636942817275e-15	56679017	56691355	9.34849858743735e-198	59622915	59649435
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	59638794	71271925	2792	2621	-0.1992	9.34849858743735e-198	59622915	59649435	4.79804991497308e-40	71261198	71278466
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71273571	71592045	110	101	0.1085	4.79804991497308e-40	71261198	71278466	1.20384995346756e-31	71527334	71637582
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71599745	75579103	1360	1278	-0.1629	1.20384995346756e-31	71527334	71637582	0	75538766	75605859
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	75598123	95834592	5833	5498	-0.515	0	75538766	75605859	0	95828237	95844303
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	95836272	114123340	6732	6325	-0.8946	0	95828237	95844303	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19490630	58	54	0.2374	NA	NA	NA	8.70325695326234e-19	19478367	19494416
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19492531	19640604	47	44	-0.1578	8.70325695326234e-19	19478367	19494416	9.27091695622716e-47	19635755	19641574
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19641182	19980955	189	169	0.3864	9.27091695622716e-47	19635755	19641574	7.52306854961493e-134	19978534	19987526
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19984368	22034704	1008	948	-0.1089	7.52306854961493e-134	19978534	19987526	0	22028350	22041571
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22035729	27695505	1794	1694	-0.5319	0	22028350	22041571	0	27682219	27706049
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	27706049	34498340	2565	2412	0.261	0	27682219	27706049	4.06999368881346e-31	34498340	34498340
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34499884	34501839	2	2	-1.0517	4.06999368881346e-31	34498340	34498340	9.13403541219966e-83	34501839	34501839
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34505234	34505234	1	0	NA	9.13403541219966e-83	34501839	34501839	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34506658	50122361	4349	4086	0.3384	NA	NA	NA	0	50122361	50122361
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	50124379	54622836	1687	1569	-0.9366	0	50122361	50122361	5.90016570991261e-28	54617934	54624876
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54624876	54678097	23	22	-0.2965	5.90016570991261e-28	54617934	54624876	3.04121720364846e-25	54676654	54683508
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54680450	54680450	1	0	NA	3.04121720364846e-25	54676654	54683508	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54682322	62153058	2826	2652	-0.9115	NA	NA	NA	0	62118314	62186857
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	62157297	69086125	3078	2882	-0.4478	0	62118314	62186857	2.55861157077063e-41	69086125	69086125
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-2.2925	2.55861157077063e-41	69086125	69086125	5.10592633698455e-37	69092211	69092211
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	77045563	3651	3438	-0.4582	5.10592633698455e-37	69092211	69092211	0	77044359	77045563
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	77048477	77048477	1	0	NA	0	77044359	77045563	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	77050461	99452628	7751	7318	0.5067	NA	NA	NA	9.44818194456854e-104	99436954	99476398
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	99453703	100370004	454	435	0.7597	9.44818194456854e-104	99436954	99476398	2.26126877908189e-58	100357061	100385026
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	100370637	106358491	2397	2230	0.5158	2.26126877908189e-58	100357061	100385026	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18450562	4	4	-0.4192	NA	NA	NA	1.06656812264104e-05	18450562	18452491
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18452491	20088256	152	142	0.3444	1.06656812264104e-05	18450562	18452491	0	20079935	20308014
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	36634163	5009	4700	-0.4681	0	20079935	20308014	2.30204083059162e-08	36623602	36643465
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	36635895	36657730	10	9	-0.0764	2.30204083059162e-08	36623602	36643465	0.000106281029452325	36645592	36688276
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	36660112	47518044	4710	4442	-0.4587	0.000106281029452325	36645592	36688276	2.20860338149924e-214	47507890	47525906
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47519257	48880150	590	547	-0.1303	2.20860338149924e-214	47507890	47525906	1.1972555937064e-133	48856530	48928182
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	48889637	51521197	1119	1046	-0.4314	1.1972555937064e-133	48856530	48928182	2.30884493811797e-52	51428375	51558061
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	51525545	52096833	198	185	-0.1388	2.30884493811797e-52	51428375	51558061	1.99515904456534e-74	52088766	52111046
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52098816	76125817	10452	9760	-0.4705	1.99515904456534e-74	52088766	52111046	7.22214936521393e-151	76117113	76135063
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	76127298	77055261	411	391	-0.144	7.22214936521393e-151	76117113	76135063	4.35671474540701e-133	77046039	77070418
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	77057149	88870935	4477	4199	-0.461	4.35671474540701e-133	77046039	77070418	1.18381768869607e-143	88856763	88877722
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	88872573	89637330	372	352	-0.1128	1.18381768869607e-143	88856763	88877722	7.70591309398937e-144	89628531	89648052
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	89638564	99440133	3455	3251	-0.4498	7.70591309398937e-144	89628531	89648052	9.23101137906808e-70	99422413	99452714
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99442306	99857292	214	203	-0.1448	9.23101137906808e-70	99422413	99452714	1.10608918806406e-31	99845964	99880237
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99858503	99858503	1	0	NA	1.10608918806406e-31	99845964	99880237	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99860280	100298352	148	140	-0.493	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	440	-0.4506	NA	NA	NA	1.26771975226352e-17	1296767	1296767
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.295	1.26771975226352e-17	1296767	1296767	4.3641158830811e-18	1300341	1300341
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	3154492	745	700	-0.4378	4.3641158830811e-18	1300341	1300341	1.45657635288089e-10	3143106	3154492
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3157092	3186299	16	14	0.069	1.45657635288089e-10	3143106	3154492	5.86116666879666e-14	3186299	3195231
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3188652	11859400	3256	3069	-0.439	5.86116666879666e-14	3186299	3195231	1.40763637041741e-22	11854083	11869256
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	11862662	11951324	34	31	-0.8727	1.40763637041741e-22	11854083	11869256	5.88846965772949e-14	11918330	11960569
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	11953825	12117419	65	65	-0.4064	5.88846965772949e-14	11918330	11960569	9.08028098990117e-21	12097572	12135286
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	12119975	34333833	6119	5783	-0.1248	9.08028098990117e-21	12097572	12135286	6.60628350262448e-15	34292521	34402206
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34339543	34621068	52	50	-0.3981	6.60628350262448e-15	34292521	34402206	9.35587447688778e-14	34556917	34661255
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34623136	57203733	4147	3915	-0.1362	9.35587447688778e-14	34556917	34661255	1.41578969556301e-08	57201427	57203733
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	0.9014	1.41578969556301e-08	57201427	57203733	1.23651678260408e-08	57206772	57206772
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5273	-0.1506	1.23651678260408e-08	57206772	57206772	4.96647514460659e-34	75093957	75093957
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-1.8149	4.96647514460659e-34	75093957	75093957	1.75621792997460e-33	75100865	75100865
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	82550577	2737	2560	-0.1661	1.7562179299746e-33	75100865	75100865	4.75842682593581e-121	82518620	82570031
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	82553120	83947204	607	570	0.083	4.75842682593581e-121	82518620	82570031	1.09510714252601e-131	83919690	83973447
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83949034	88690571	1787	1660	-0.2044	1.09510714252601e-131	83919690	83973447	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1902148	852	803	-0.4977	NA	NA	NA	2.05488607959293e-08	1899977	1902148
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1903358	1906391	5	5	0.2141	2.05488607959293e-08	1899977	1902148	9.66064096985526e-10	1906391	1909874
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	25453730	8697	8153	-0.4494	9.66064096985526e-10	1906391	1909874	7.15888463140815e-30	25446907	25458238
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25454674	25487750	33	29	-0.9687	7.15888463140815e-30	25446907	25458238	4.21919012269996e-25	25481070	25490741
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25488400	31119555	2298	2165	-0.4678	4.21919012269996e-25	25481070	25490741	5.57072343598703e-26	31109866	31123416
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31121537	31207423	45	45	-0.0617	5.57072343598703e-26	31109866	31123416	8.78111860443278e-26	31204133	31216805
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31209309	36673853	1941	1813	-0.4582	8.78111860443278e-26	31204133	31216805	3.16997902659763e-83	36673853	36673853
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.4648	3.16997902659763e-83	36673853	36673853	3.27439753229781e-81	36684619	36684619
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41526558	2014	1877	-0.4521	3.27439753229781e-81	36684619	36684619	1.38346054282044e-77	41521544	41529227
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41527705	41710400	64	62	-1.0444	1.38346054282044e-77	41521544	41529227	6.96226401805755e-61	41706870	42143048
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	42647491	199	182	-0.4663	6.96226401805755e-61	41706870	42143048	1.90158338359677e-11	42627067	42667436
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42648686	42762494	58	53	-0.1904	1.90158338359677e-11	42627067	42667436	2.20460113861515e-13	42739726	42782885
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42766906	54055890	3962	3717	-0.4537	2.20460113861515e-13	42739726	42782885	1.47234955644345e-11	54052219	54057841
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54057841	54084220	14	12	-0.9651	1.47234955644345e-11	54052219	54057841	1.29977992943370e-10	54079142	54091355
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54088191	59292244	2064	1928	-0.4799	1.2997799294337e-10	54079142	54091355	0	59289060	59294634
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	59294634	72294735	4830	4537	0.2666	0	59289060	59294634	1.55044932048969e-53	72294735	72294735
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72297674	72299153	2	2	-2.4095	1.55044932048969e-53	72294735	72294735	1.40621590713334e-46	72299153	72299153
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72303321	78653545	2550	2387	0.236	1.40621590713334e-46	72299153	72299153	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	112131	3	3	0.4105	NA	NA	NA	0.00537266927731171	112131	126758
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	115020	12862432	4446	4184	-0.1199	0.00537266927731171	112131	126758	0	12845324	12886094
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	12865608	20290502	1929	1797	0.1444	0	12845324	12886094	0	20287059	20297705
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	20294679	24478370	1153	1071	0.673	0	20287059	20297705	0	24478370	24480320
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	24480320	29272834	1376	1298	-0.1432	0	24478370	24480320	2.10672160957830e-24	29272834	29274146
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	29274146	29280823	4	3	1.2314	2.1067216095783e-24	29272834	29274146	6.1579449768849e-25	29276082	29280823
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	29287860	40226609	2883	2712	-0.1462	6.1579449768849e-25	29276082	29280823	5.1412766210395e-26	40226609	40226609
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40230827	40235901	3	3	-1.5443	5.1412766210395e-26	40226609	40226609	6.73761609205451e-25	40235901	40235901
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40244566	65357415	7969	7497	-0.1368	6.73761609205451e-25	40235901	40235901	2.67610225397842e-19	65357415	65357415
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65359770	65367911	4	3	-1.3805	2.67610225397842e-19	65357415	65357415	3.93611838517447e-19	65367911	65367911
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65369843	76116026	3194	2988	-0.132	3.93611838517447e-19	65367911	65367911	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	463	-0.7466	NA	NA	NA	7.40142342266045e-12	1398325	1398325
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	0.9106	7.40142342266045e-12	1398325	1398325	1.02665556734113e-10	1400840	1400840
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	2672802	611	568	-0.7747	1.02665556734113e-10	1400840	1400840	6.82843353033595e-143	2648232	2681667
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	2675368	6838563	1962	1824	-0.4443	6.82843353033595e-143	2648232	2681667	1.22516866749829e-97	6838383	6841333
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	6841333	6923173	46	44	0.3452	1.22516866749829e-97	6838383	6841333	1.00925219928278e-11	6917468	6936271
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	6925614	7056541	41	41	0.7036	1.00925219928278e-11	6917468	6936271	2.42456082074688e-67	7052825	7060832
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7060832	12865535	2600	2453	0.0546	2.42456082074688e-67	7052825	7060832	0	12859834	12872472
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12866996	14072425	572	539	0.5463	0	12859834	12872472	0.000169273957961232	14026212	14082413
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14074680	14103664	16	14	0.8346	0.000169273957961232	14026212	14082413	1.07729398722278e-60	14097310	14119865
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14104968	20420327	2875	2690	0.4709	1.07729398722278e-60	14097310	14119865	7.71682876120614e-63	20399700	20425020
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20422223	20493401	14	14	-0.3659	7.71682876120614e-63	20399700	20425020	9.03317307797862e-42	20463727	20517399
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	41532062	3917	3689	0.1527	9.03317307797862e-42	20463727	20517399	9.17267449184976e-66	41532062	41532062
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-3.0071	9.17267449184976e-66	41532062	41532062	1.52328988608294e-71	41538649	41538649
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	56199876	6412	5961	0.0541	1.52328988608294e-71	41538649	41538649	1.08192350590888e-164	56184103	56216358
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56202681	57844254	810	762	0.307	1.08192350590888e-164	56184103	56216358	1.91798344274949e-73	57811211	57878951
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57847011	59155887	538	508	0.5764	1.91798344274949e-73	57811211	57878951	4.44758147405698e-07	59143775	59171559
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59157002	59188967	24	22	0.2311	4.44758147405698e-07	59143775	59171559	0.000307174070728766	59174756	59191169
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59189632	59246409	32	25	0.5788	0.000307174070728766	59174756	59191169	1.23757961715974e-20	59246409	59246409
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.6023	1.23757961715974e-20	59246409	59246409	9.7176635198991e-14	59251831	59251831
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59284908	18	18	0.5924	9.7176635198991e-14	59251831	59251831	1.26413357871298e-07	59276092	59302266
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59285957	63788698	2072	1953	0.2499	1.26413357871298e-07	59276092	59302266	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	1511632	586	546	-0.1866	NA	NA	NA	1.00881485325945e-11	1499421	1515948
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1532433	9	9	0.3996	1.00881485325945e-11	1499421	1515948	1.03047886855972e-10	1528899	1548251
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	28266113	8456	7926	-0.1533	1.03047886855972e-10	1528899	1548251	0	26162094	29339510
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	34382637	2259	2129	0.1256	0	26162094	29339510	1.21438575755110e-242	34353604	34393453
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	34384442	35741437	556	526	0.5149	1.2143857575511e-242	34353604	34393453	0	35738653	35741437
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	35743960	42322563	2281	2131	-0.4772	0	35738653	35741437	0	42321373	42325149
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	42325149	50024307	3009	2831	0.3974	0	42321373	42325149	0	49971821	50086500
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	50034008	62374886	4419	4150	0.7082	0	49971821	50086500	5.26979136789098e-43	62326754	62374886
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62379059	62379059	1	0	NA	5.26979136789098e-43	62326754	62374886	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62382266	62419534	2	2	0.1258	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9882922	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9886732	10022306	9	9	-0.8033	NA	NA	NA	7.15709718835272e-16	10022306	10057408
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10057408	14404443	80	72	-0.0353	7.15709718835272e-16	10022306	10057408	2.83230227588124e-43	14403388	14406879
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14406879	14498344	34	33	0.7313	2.83230227588124e-43	14403388	14406879	3.78617838064608e-05	14467465	14505055
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14501081	14566287	35	34	0.4476	3.78617838064608e-05	14467465	14505055	1.81140068478901e-05	14561565	14567668
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14567668	14572439	3	3	-0.1412	1.81140068478901e-05	14561565	14567668	0.113683903056241	14569349	14631308
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14573659	14997075	212	202	-0.4928	0.113683903056241	14569349	14631308	1.70436807102327e-10	14989693	15003194
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	15001453	15033614	13	12	-0.0564	1.70436807102327e-10	14989693	15003194	2.38441794625e-11	15028838	15041012
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	15036163	16038164	323	307	-0.4997	2.38441794625e-11	15028838	15041012	7.30448589223943e-11	16036178	16038164
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16039094	16041496	2	2	0.543	7.30448589223943e-11	16036178	16038164	1.00245197038678e-07	16041496	16043143
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16043143	18319120	927	869	-0.4756	1.00245197038678e-07	16041496	16043143	2.75556472035296e-90	18313040	18326965
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18321702	18847197	252	240	-0.1302	2.75556472035296e-90	18313040	18326965	1.14303396510215e-133	18832783	18877866
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18854294	33390614	4951	4652	-0.5033	1.14303396510215e-133	18832783	18877866	0	33378919	33401548
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	33392838	43645627	5056	4745	-0.1551	0	33378919	33401548	1.93486505102853e-12	43641648	43645627
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43648176	43661998	9	8	0.4676	1.93486505102853e-12	43641648	43645627	9.8233458597142e-12	43661998	43666311
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43663166	43663166	1	0	NA	9.8233458597142e-12	43661998	43666311	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43664367	46922972	1533	1457	-0.1799	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2828	-0.4431	NA	NA	NA	3.74948711979615e-29	22643742	22677959
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.1791	3.74948711979615e-29	22643742	22677959	6.29367960172962e-35	22721042	22735036
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	31595980	4812	4531	-0.4713	6.29367960172962e-35	22721042	22735036	4.5609755086559e-46	31592332	31608401
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	31596856	31598483	2	0	NA	4.5609755086559e-46	31592332	31608401	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	31599616	31716675	67	66	-0.9044	NA	NA	NA	7.06007297919877e-46	31708105	31722716
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	31718146	37621766	2856	2678	-0.4593	7.06007297919877e-46	31708105	31722716	2.73407826655518e-23	37621766	37621766
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.2683	2.73407826655518e-23	37621766	37621766	1.68108688097875e-23	37626069	37626069
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	43949115	3159	2970	-0.4724	1.68108688097875e-23	37626069	37626069	2.39001884920719e-21	43923467	43958073
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43950256	44083721	99	93	-0.2174	2.39001884920719e-21	43923467	43958073	3.85939931698943e-18	44064696	44106930
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44085417	49571068	2555	2372	-0.4762	3.85939931698943e-18	44064696	44106930	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2302065	1400	1305	-0.3969	NA	NA	NA	2.29612008176890e-14	2301365	2302065
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	-1.4802	2.2961200817689e-14	2301365	2302065	1.09942426030921e-14	2304398	2306110
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2342739	43	40	-0.4029	1.09942426030921e-14	2304398	2306110	3.35556491627549e-06	2340193	2342739
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2343018	2345969	4	4	-0.999	3.35556491627549e-06	2340193	2342739	1.44120573303541e-05	2345969	2348093
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2346149	2375499	30	30	-0.4001	1.44120573303541e-05	2345969	2348093	0.000110040888604838	2369198	2385228
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2376763	2426938	59	59	-0.6471	0.000110040888604838	2369198	2385228	7.38020818278109e-22	2426938	2426938
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.0721	7.38020818278109e-22	2426938	2426938	1.05001363840819e-14	2428307	2428307
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2672401	224	213	-0.4125	1.05001363840819e-14	2428307	2428307	1.57104552042055e-05	2664508	2695630
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.6909	1.57104552042055e-05	2664508	2695630	6.51689349793641e-97	2708113	2711273
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	30194556	10339	9674	0.4546	6.51689349793641e-97	2708113	2711273	7.66836933079916e-221	30182131	30203683
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	30197118	31676535	658	613	0.8209	7.66836933079916e-221	30182131	30203683	8.65139098373238e-15	31667337	31687846
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	31679632	31739258	33	33	1.2468	8.65139098373238e-15	31667337	31687846	6.72676979630734e-23	31725728	31749931
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	31742833	110381808	20180	18974	0.8106	6.72676979630734e-23	31725728	31749931	0	110360955	110406635
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110385271	110385271	1	0	NA	0	110360955	110406635	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110386541	131787441	6583	6170	0.504	NA	NA	NA	0	131771254	131808016
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	131788452	154442377	7308	6921	0.8183	0	131771254	131808016	8.05211478894656e-32	154442377	154442377
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-1.0092	8.05211478894656e-32	154442377	154442377	5.18331325309389e-34	154450309	154450309
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154456891	1	0	NA	5.18331325309389e-34	154450309	154450309	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456908	154582414	27	23	0.8369	NA	NA	NA	5.80448388157755e-72	154578922	154586690
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	187	-0.1673	5.80448388157755e-72	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	116	-3.36	NA	NA	NA	3.02827135086734e-09	2936453	6741838
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	8005148	474	449	-2.5126	3.02827135086734e-09	2936453	6741838	7.76916764065944e-06	7895945	8069958
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8245608	58	52	-3.4793	7.76916764065944e-06	7895945	8069958	2.78767911405602e-10	8218072	8294345
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	8690572	119	110	-2.2948	2.78767911405602e-10	8218072	8294345	1.63964704621760e-05	8678888	8696392
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	8706644	9	9	-4.1267	1.6396470462176e-05	8678888	8696392	0.000301152637354696	8697715	8719458
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8710546	8824539	39	36	-2.6126	0.000301152637354696	8697715	8719458	0.0116787761284287	8770463	9063686
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8826900	10512616	142	134	-3.3063	0.0116787761284287	8770463	9063686	3.14766603185315e-30	10494395	10596655
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10513747	13129843	222	201	-1.8427	3.14766603185315e-30	10494395	10596655	2.35493180080583e-54	13109337	13146483
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	388	-3.3638	2.35493180080583e-54	13109337	13146483	4.30497265036216e-20	14321882	14376942
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14700040	145	130	-2.2604	4.30497265036216e-20	14321882	14376942	2.45235318606355e-07	14540351	14758901
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15521958	304	284	-2.9662	2.45235318606355e-07	14540351	14758901	5.12673558740560e-05	15469100	15538983
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15523178	15558235	24	24	-1.8256	5.1267355874056e-05	15469100	15538983	1.30103768472243e-05	15549637	15582236
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15559959	15915466	66	64	-3.1924	1.30103768472243e-05	15549637	15582236	0.000313595560014053	15780423	15996118
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15920478	1	0	NA	0.000313595560014053	15780423	15996118	NA	NA	NA
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16387273	161	155	-2.4299	NA	NA	NA	8.95968572409471e-12	16253090	16571246
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	21036411	670	626	-3.1636	8.95968572409471e-12	16253090	16571246	4.51110861516616e-06	21026715	21036503
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-0.8677	4.51110861516616e-06	21026715	21036503	2.50632319143532e-06	21048365	21059229
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22165808	264	250	-3.1857	2.50632319143532e-06	21048365	21059229	0.000223270512741066	22049641	22166564
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22166564	22181855	9	9	-1.4689	0.000223270512741066	22049641	22166564	2.14750681637965e-08	22181855	22200078
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22930737	90	83	-3.5517	2.14750681637965e-08	22181855	22200078	2.89475816815645e-72	22926726	23283689
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	30	-0.0885	2.89475816815645e-72	22926726	23283689	3.00916123463661e-13	26945084	26945893
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	3	-2.9464	3.00916123463661e-13	26945084	26945893	6.42015932813407e-20	26980386	26980386
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	10	-0.4154	6.42015932813407e-20	26980386	26980386	6.51640622511444e-19	27019256	27019256
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.7812	6.51640622511444e-19	27019256	27019256	3.15350944415731e-14	27032300	27039222
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27176933	21	20	-1.1135	3.15350944415731e-14	27032300	27039222	7.03075698912066e-07	27137064	27188740
MSK_252152920205_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.1728	7.03075698912066e-07	27137064	27188740	NA	NA	NA
