Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16613521	5754	5315	0.7679	NA	NA	NA	3.38071797766814e-141	16604893	16617289
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16614050	16963812	41	37	-0.0748	3.38071797766814e-141	16604893	16617289	1.04154577433282e-09	16926444	16963812
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	17080364	1	0	NA	1.04154577433282e-09	16926444	16963812	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17086698	17127039	11	10	0.8892	NA	NA	NA	0	17127039	17154037
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	62423503	18084	16706	-0.0766	0	17127039	17154037	0	62423503	62423503
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62427698	62429423	2	2	-2.3828	0	62423503	62423503	2.10095071559932e-15	62429423	62429423
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62431628	72537426	4001	3688	-0.3167	2.10095071559932e-15	62429423	62429423	3.98176357832327e-154	72537426	72539143
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-2.9731	3.98176357832327e-154	72537426	72539143	2.42399740872571e-154	72574479	72579311
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	85745222	4044	3725	-0.3115	2.42399740872571e-154	72574479	72579311	3.33410986430644e-282	85730573	85765171
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85753561	89658245	1287	1175	0.0968	3.33410986430644e-282	85730573	85765171	1.12086086197507e-184	89623344	89710115
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	89661433	96646365	2514	2307	0.4599	1.12086086197507e-184	89623344	89710115	0	96623170	96663651
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	96647708	109011259	3396	3116	0.0746	0	96623170	96663651	1.39987585924822e-10	109011259	109011259
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109023155	109023981	2	2	-1.5913	1.39987585924822e-10	109011259	109011259	1.18743108383870e-56	109023981	109023981
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109026805	150819879	6313	5808	0.3536	1.1874310838387e-56	109023981	109023981	6.6311585283689e-53	150818222	150819879
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-0.8405	6.6311585283689e-53	150818222	150819879	2.29264070607352e-05	150839754	150844444
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	7	-2.9785	2.29264070607352e-05	150839754	150844444	3.76305596538499e-76	150851439	150851439
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151024118	77	70	0.2523	3.76305596538499e-76	150851439	150851439	4.8339768266806e-08	151020826	151024118
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151036435	5	5	1.3126	4.8339768266806e-08	151020826	151024118	1.11972667642766e-07	151036435	151040463
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	164808311	5610	5167	0.3605	1.11972667642766e-07	151036435	151040463	2.96011782743532e-35	164804571	164812346
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	164809828	164873379	33	31	-0.4363	2.96011782743532e-35	164804571	164812346	0	164866653	164889369
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	164881736	205996274	14712	13595	0.0995	0	164866653	164889369	0	205980367	206008700
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	205998132	211829994	2111	1951	-0.4222	0	205980367	206008700	5.86645293314384e-89	211773665	211844900
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211832102	213032993	381	349	-0.0239	5.86645293314384e-89	211773665	211844900	1.32405698041414e-170	212997010	213068357
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	213042541	213042541	1	0	NA	1.32405698041414e-170	212997010	213068357	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	213048147	217645472	1626	1484	0.53	NA	NA	NA	6.64988210745403e-08	217629634	217645472
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	217652900	217658129	2	2	2.0192	6.64988210745403e-08	217629634	217645472	1.75143204134103e-147	217658129	217663470
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	217663470	246769018	10990	10206	0.8217	1.75143204134103e-147	217658129	217663470	6.75257520475592e-154	246738832	246805521
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	27	1.3672	6.75257520475592e-154	246738832	246805521	6.97428049920657e-08	246855902	246906110
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	88	0.9067	6.97428049920657e-08	246855902	246906110	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	42196496	14735	13617	-0.3104	NA	NA	NA	0	42163917	42228259
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42198186	66357387	8559	7875	0.0913	0	42163917	42228259	3.0440033913593e-53	66357387	66357387
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-3.6158	3.0440033913593e-53	66357387	66357387	5.62316330806818e-51	66360747	66360747
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	79182762	4298	3978	0.0631	5.62316330806818e-51	66360747	66360747	7.95030666436649e-07	79172532	79185314
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79184112	79196200	5	5	0.9457	7.95030666436649e-07	79172532	79185314	0	79185314	79206455
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79198028	204094939	36301	33540	0.218	0	79185314	79206455	0	204076190	204110414
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	204099319	242689978	13927	12896	-0.2534	0	204076190	204110414	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	67456712	24205	22336	0.3538	NA	NA	NA	0	67445748	67465073
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	67460427	68988439	567	534	-0.3269	0	67445748	67465073	3.14473719091072e-163	68965167	69006155
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	68990169	107250384	9493	8799	0.0833	3.14473719091072e-163	68965167	69006155	0	107164709	107336047
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	107258517	126132599	6574	6087	-0.3087	0	107164709	107336047	1.31294753823678e-309	126129148	126139233
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	126134484	127335817	396	354	0.3985	1.31294753823678e-309	126129148	126139233	9.3700200108066e-06	127329402	127335817
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127337742	127355988	8	7	-0.3094	9.3700200108066e-06	127329402	127335817	4.65253123086693e-06	127352985	127380381
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127357265	133189686	2466	2270	0.3547	4.65253123086693e-06	127352985	127380381	1.77901682472287e-47	133189686	133189686
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-3.3751	1.77901682472287e-47	133189686	133189686	2.3506675018148e-53	133194685	133194685
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	2.3506675018148e-53	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	163992903	9776	9011	0.3874	NA	NA	NA	0	163992903	163997228
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	27	-3.0913	0	163992903	163997228	0	164105613	164107951
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	170122885	1478	1370	0.3911	0	164105613	164107951	0	170074549	170188570
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	170127810	194354505	8652	7966	0.775	0	170074549	170188570	2.45220591456430e-198	194354505	194354505
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-3.867	2.4522059145643e-198	194354505	194354505	6.69750335456783e-206	194366950	194366950
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	912	0.7927	6.69750335456783e-206	194366950	194366950	5.50411425397094e-16	196806091	196905767
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196964180	32	30	0.2597	5.50411425397094e-16	196806091	196905767	2.59877439962018e-16	196952514	196972067
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196966631	199329592	952	875	0.8497	2.59877439962018e-16	196952514	196972067	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	65688	11	11	-0.3025	NA	NA	NA	1.08273060102104e-10	61552	78043
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	71148	545241	155	149	-0.9875	1.08273060102104e-10	61552	78043	7.98654719893681e-115	538278	554534
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	549820	9815760	3227	2978	-0.3059	7.9865471989368e-115	538278	554534	8.60603758086467e-126	9815760	9815760
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.5813	8.60603758086467e-126	9815760	9815760	6.48680351969654e-131	9842644	9842644
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	22946795	3742	3462	-0.3269	6.48680351969654e-131	9842644	9842644	1.00203590862234e-314	22884744	23036529
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	22956008	30253712	1678	1561	0.0681	1.00203590862234e-314	22884744	23036529	0	30179136	30323049
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	30265636	46949609	4671	4306	-0.3136	0	30179136	30323049	0	46927145	46965349
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	46951712	68905670	4945	4562	0.0875	0	46927145	46965349	1.70090364718145e-240	68905670	69069651
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	-3.0012	1.70090364718145e-240	68905670	69069651	4.25274124640428e-235	69163312	69165814
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	80843955	3746	3488	0.1114	4.25274124640428e-235	69163312	69165814	2.77428130844347e-289	80794436	80926692
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	80854648	84722875	1364	1252	-0.2927	2.77428130844347e-289	80794436	80926692	0	84715487	84734835
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	84724479	84724479	1	0	NA	0	84715487	84734835	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	84726941	111080314	8867	8163	-0.8913	NA	NA	NA	0	111063891	111086893
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	111081571	119514714	2405	2212	-0.3053	0	111063891	111086893	9.90314346694857e-12	119499240	119550771
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119520357	119720703	29	28	0.1813	9.90314346694857e-12	119499240	119550771	1.20960638403993e-11	119682909	119820393
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119722485	129191623	2544	2324	-0.2912	1.20960638403993e-11	119682909	119820393	0	129167181	129218818
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	129193067	186676034	16207	14963	0.0512	0	129167181	129218818	2.13370173932526e-57	186676034	186676034
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.9191	2.13370173932526e-57	186676034	186676034	1.90677218362665e-57	186680176	186680176
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187329037	305	280	0.0271	1.90677218362665e-57	186680176	186680176	5.93578447547562e-06	187321709	187329037
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187330240	187338465	5	5	0.8387	5.93578447547562e-06	187321709	187329037	1.02535936472454e-05	187338465	187346097
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	190717801	1130	1057	0.0552	1.02535936472454e-05	187338465	187346097	6.89842261296833e-67	190708316	190730982
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190725579	190921041	64	61	-0.7083	6.89842261296833e-67	190708316	190730982	5.06551200131412e-31	190915643	190924564
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	38	0.1013	5.06551200131412e-31	190915643	190924564	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	699382	206	190	0.5894	NA	NA	NA	6.20699776507456e-06	694624	704722
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	701152	718523	7	6	-0.1938	6.20699776507456e-06	694624	704722	2.53192717925506e-44	716493	722096
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	719944	24556394	7020	6474	0.7265	2.53192717925506e-44	716493	722096	2.95075607885603e-42	24541015	24560789
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	24558554	24567088	6	6	0.132	2.95075607885603e-42	24541015	24560789	4.86117146374374e-17	24560789	24594183
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	24571112	43350913	5207	4831	0.6792	4.86117146374374e-17	24560789	24594183	0	43338076	43393584
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	43372503	59927111	3890	3601	0.1908	0	43338076	43393584	0	59923774	59930765
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59930765	65046506	1490	1372	-0.9054	0	59923774	59930765	9.7301369760026e-156	65037099	65058363
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	65050616	65050616	1	0	NA	9.7301369760026e-156	65037099	65058363	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	65051358	65843037	319	288	-0.2916	NA	NA	NA	1.43734644582310e-41	65822400	65871183
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	65844329	67974495	617	570	0.0476	1.4373464458231e-41	65822400	65871183	1.06080439813005e-103	67874415	68053199
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	67979300	75726359	1948	1821	-0.3149	1.06080439813005e-103	67874415	68053199	2.85432008164937e-78	75699212	75741252
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	75728494	76390032	300	276	0.115	2.85432008164937e-78	75699212	75741252	4.59849261381893e-97	76369387	76403778
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76391786	131015436	15353	14175	-0.3129	4.59849261381893e-97	76369387	76403778	2.45666389045168e-14	131005829	131032495
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	131016610	131016610	1	0	NA	2.45666389045168e-14	131005829	131032495	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	131018563	131099719	31	28	-0.8359	NA	NA	NA	8.6006543023663e-14	131082502	131110828
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	131101980	154031948	8702	7996	-0.3024	8.6006543023663e-14	131082502	131110828	3.69497013336644e-75	154006451	154040025
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	154033560	155062289	280	258	0.1048	3.69497013336644e-75	154006451	154040025	2.2636648053828e-84	154995939	155114300
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155071008	180342860	8268	7635	-0.3247	2.2636648053828e-84	154995939	155114300	3.61049386026227e-09	180192214	180348365
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	7	0.5505	3.61049386026227e-09	180192214	180348365	1.08258822523846e-08	180348365	180364670
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	101	-0.3548	1.08258822523846e-08	180348365	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	48	0.0209	NA	NA	NA	2.02599666253052e-07	218316	251128
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	322557	43	40	-0.3995	2.02599666253052e-07	218316	251128	8.65965216692057e-19	313153	331014
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	323898	8998935	3260	2994	0.1137	8.65965216692057e-19	313153	331014	3.67948694635931e-09	8998935	8998935
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	9005020	9008588	2	2	1.7317	3.67948694635931e-09	8998935	8998935	1.57508093760314e-09	9008588	9008588
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	9012910	17721947	2877	2656	0.0976	1.57508093760314e-09	9008588	9008588	1.63326801586313e-172	17701469	17744099
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17723163	20581023	934	852	-0.2806	1.63326801586313e-172	17701469	17744099	4.8279050653076e-17	20557582	20591849
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	20582961	20692594	50	45	0.193	4.8279050653076e-17	20557582	20591849	1.31641059491470e-20	20681101	20709161
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	20695601	29052999	3004	2775	-0.3064	1.3164105949147e-20	20681101	20709161	3.30286573917182e-93	29028947	29073697
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29057267	29950805	361	335	0.1016	3.30286573917182e-93	29028947	29073697	2.51290158561222e-91	29950805	29962849
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	12	-2.3016	2.51290158561222e-91	29950805	29962849	3.39412676505201e-106	30004636	30005338
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	30010234	1	0	NA	3.39412676505201e-106	30004636	30005338	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31456663	597	553	0.0663	NA	NA	NA	1.23664611273997e-52	31454845	31457884
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31457884	31563829	31	29	-0.9563	1.23664611273997e-52	31454845	31457884	1.28870181651372e-56	31559059	31564655
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31564655	32558677	447	406	0.1024	1.28870181651372e-56	31559059	31564655	3.59088346347713e-10	32538115	32564884
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32613538	12	12	0.7952	3.59088346347713e-10	32538115	32564884	7.53420636308954e-07	32609525	32634977
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32626619	32626619	1	0	NA	7.53420636308954e-07	32609525	32634977	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32628420	32668835	13	12	-0.2745	NA	NA	NA	2.26667186585995e-102	32629848	32700719
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32672983	32672983	1	0	NA	2.26667186585995e-102	32629848	32700719	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32673823	54035000	8285	7617	0.1565	NA	NA	NA	2.39363662005267e-104	54031956	54035000
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.2564	2.39363662005267e-104	54031956	54035000	2.46327095738201e-08	54042734	54045472
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	55806329	617	568	0.0593	2.46327095738201e-08	54042734	54045472	1.62514889277701e-100	55805165	55808046
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55808046	56023909	73	65	-0.876	1.62514889277701e-100	55805165	55808046	7.68949379753686e-117	56018813	56028015
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	56028015	103841482	12517	11519	0.094	7.68949379753686e-117	56018813	56028015	6.41610383003121e-40	103841482	103841482
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	3	-2.5537	6.41610383003121e-40	103841482	103841482	3.30825191220623e-40	103868154	103868154
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	133081665	9889	9097	0.0926	3.30825191220623e-40	103868154	103868154	0	133070942	133097536
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	133082817	140953317	2753	2540	-0.3041	0	133070942	133097536	0	140921665	140985644
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	140961618	151630229	3677	3400	-0.899	0	140921665	140985644	0	151619175	151637541
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151631917	165642393	4786	4398	-0.321	0	151619175	151637541	8.12193292818312e-32	165642393	165642393
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165643653	165643653	1	0	NA	8.12193292818312e-32	165642393	165642393	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.7855	NA	NA	NA	1.67314291815194e-24	165650610	165650610
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	165755595	44	41	-0.2564	1.67314291815194e-24	165650610	165650610	1.92330473461028e-27	165743408	165766046
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165757914	170753106	1760	1631	-0.9319	1.92330473461028e-27	165743408	165766046	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	34	-0.2937	NA	NA	NA	1.23281272300253e-88	244720	244720
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	4	-3.7196	1.23281272300253e-88	244720	244720	1.57637044415837e-82	254342	254342
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	56845870	19003	17495	-0.3221	1.57637044415837e-82	254342	254342	0	56754295	57226710
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	57216914	118609124	20216	18585	0.2038	0	56754295	57226710	0	118604024	118609124
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118611324	118620875	4	4	1.2053	0	118604024	118609124	3.02511924804386e-09	118620875	118622742
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6261	0.0581	3.02511924804386e-09	118620875	118622742	7.77225750012392e-16	133432281	133433384
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	-1.0617	7.77225750012392e-16	133432281	133433384	3.26134534086849e-16	133448277	133453811
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3407	0.0713	3.26134534086849e-16	133448277	133453811	8.84174141415627e-08	141405145	141419692
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.6823	8.84174141415627e-08	141405145	141419692	1.45461078200747e-05	141426846	141446728
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	112	0.1161	1.45461078200747e-05	141426846	141446728	1.49376184634771e-178	141690753	141690753
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.5828	1.49376184634771e-178	141690753	141690753	2.0914550121287e-172	141714168	141714168
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142166710	171	157	0.1652	2.0914550121287e-172	141714168	141714168	1.25319475216822e-33	142166710	142166710
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-3.2448	1.25319475216822e-33	142166710	142166710	1.41113559748912e-39	142167908	142167908
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	147697712	2337	2167	0.0673	1.41113559748912e-39	142167908	142167908	2.76484725285438e-263	147680551	147714089
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147699576	153112092	1914	1783	-0.3189	2.76484725285438e-263	147680551	147714089	3.43130974521457e-157	153003200	153205766
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	153134693	156483966	1271	1179	0.0388	3.43130974521457e-157	153003200	153205766	6.35203537532879e-14	156483966	156483966
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	2	2.1092	6.35203537532879e-14	156483966	156483966	3.99587809935306e-15	156490484	156490484
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158498026	970	897	0.0142	3.99587809935306e-15	156490484	156490484	1.05201096566778e-102	158496345	158503036
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158500783	158500783	1	0	NA	1.05201096566778e-102	158496345	158503036	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158503036	158821263	83	79	-0.8793	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	9533226	2884	2673	0.2806	NA	NA	NA	1.41240769087487e-56	9533226	9533226
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	2	-1.5733	1.41240769087487e-56	9533226	9533226	1.77115565757096e-09	9538031	9538031
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	32797545	8306	7655	0.0695	1.77115565757096e-09	9538031	9538031	3.46103468151296e-11	32797545	32797545
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	3.46103468151296e-11	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-1.707	NA	NA	NA	0	32808049	32808049
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	104584854	20520	19024	0.3437	0	32808049	32808049	0	104560951	104603326
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	104588282	115701209	3155	2913	0.7393	0	104560951	104603326	1.01064082160010e-30	115701209	115701209
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.8593	1.0106408216001e-30	115701209	115701209	1.94397378919865e-35	115711730	115711730
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	8945	0.9011	1.94397378919865e-35	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5035	0.3552	NA	NA	NA	4.35513522066197e-08	15801123	15802255
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.8706	4.35513522066197e-08	15801123	15802255	7.70959603784102e-08	15807123	15813356
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2337	0.3433	7.70959603784102e-08	15807123	15813356	1.41371045685300e-99	23343915	23343915
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.9675	1.413710456853e-99	23343915	23343915	9.51430684450848e-113	23365926	23365926
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	33348540	2658	2438	0.3322	9.51430684450848e-113	23365926	23365926	0	33340483	33357451
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33350502	38329748	1962	1809	-0.2722	0	33340483	33357451	4.4098584589064e-204	38305084	38361539
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	38343993	70926188	449	417	0.3005	4.4098584589064e-204	38305084	38361539	6.15169046582208e-37	70926188	70926188
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.0429	6.15169046582208e-37	70926188	70926188	1.10751361486325e-42	70930528	70930528
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	112062107	13772	12734	0.3389	1.10751361486325e-42	70930528	70930528	6.51967559848689e-99	112062107	112062107
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-4.7812	6.51967559848689e-99	112062107	112062107	1.52725040525561e-90	112069192	112069192
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	137344988	9989	9196	0.3225	1.52725040525561e-90	112069192	112069192	1.16790115944143e-10	137339424	137352394
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137347945	137356880	4	4	1.4796	1.16790115944143e-10	137339424	137352394	1.6719089574288e-12	137352394	137361870
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	139893924	1011	938	0.3116	1.6719089574288e-12	137352394	137361870	1.91135048247514e-11	139877969	139896355
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139896355	139907548	7	6	-0.4844	1.91135048247514e-11	139877969	139896355	0.000157787313564598	139904154	139925535
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139913642	140145632	84	78	0.3316	0.000157787313564598	139904154	139925535	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140145683	140145683	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	6073210	2179	2023	0.3744	NA	NA	NA	1.92372392318746e-158	6061632	6087924
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	6077504	7679354	635	580	0.8091	1.92372392318746e-158	6061632	6087924	0	7669984	7686635
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	7680887	77917893	21778	20096	0.1978	0	7669984	7686635	0	77917893	77917893
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.4351	0	77917893	77917893	4.2620900373056e-149	77928669	77928669
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	96624976	6014	5541	0.2176	4.2620900373056e-149	77928669	77928669	0	96602704	96666874
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	96632282	114100979	6379	5925	-0.3044	0	96602704	96666874	1.83394705782609e-26	114100979	114100979
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-3.0183	1.83394705782609e-26	114100979	114100979	1.77886867536145e-26	114106460	114106460
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	123125107	3418	3168	-0.3125	1.77886867536145e-26	114106460	114106460	0	123099337	123164300
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123128174	135285645	4401	4079	0.0822	0	123099337	123164300	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	34507437	12339	11361	0.2336	NA	NA	NA	0	34489316	34525797
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34509286	34663735	56	52	0.6693	0	34489316	34525797	0	34645505	34767532
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34675955	98999593	20032	18491	0.256	0	34645505	34767532	0	98996069	99003189
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99001305	99165650	77	71	-0.5156	0	98996069	99003189	4.38164283342745e-39	99154585	99184114
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99179918	134450318	12800	11861	0.0347	4.38164283342745e-39	99154585	99184114	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3481	0.0619	NA	NA	NA	2.91401997699015e-12	9431548	9531133
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	0.7931	2.91401997699015e-12	9431548	9531133	3.96641878136084e-11	9589725	9626623
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11112600	573	529	0.0856	3.96641878136084e-11	9589725	9626623	2.12237690772466e-20	11110735	11112600
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	7	1.3695	2.12237690772466e-20	11110735	11112600	7.18964425951665e-187	11140421	11147675
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	33270966	7600	7033	0.3055	7.18964425951665e-187	11140421	11147675	2.55418724849929e-189	33270966	33270966
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-4.8652	2.55418724849929e-189	33270966	33270966	1.93795712404128e-113	33283825	33283825
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	34302633	234	221	0.3657	1.93795712404128e-113	33283825	33283825	9.31790993846157e-08	34289524	34302633
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	34308659	36734934	5	4	-0.6309	9.31790993846157e-08	34289524	34302633	5.80225032152413e-07	36734934	36739877
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	36739877	41539121	1524	1409	0.381	5.80225032152413e-07	36734934	36739877	0	41494162	41581014
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41549390	53246178	4598	4261	-0.3086	0	41494162	41581014	0	53225794	53263589
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53249068	132289090	26862	24756	0.0464	0	53225794	53263589	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36663076	6987	6465	-0.3141	NA	NA	NA	0	36651293	36676482
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36665922	56650373	7038	6498	-0.8896	0	36651293	36676482	5.6227119258978e-49	56646284	56650373
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	14	-2.3345	5.6227119258978e-49	56646284	56650373	2.36663193880948e-46	56685341	56686863
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	63439503	1505	1387	-0.916	2.36663193880948e-46	56685341	56686863	0	63422047	63446035
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63443166	105967430	13024	11978	-0.3019	0	63422047	63446035	3.86584018265952e-09	105958318	105976174
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	105970258	106007381	22	19	-0.8176	3.86584018265952e-09	105958318	105976174	1.26393107216796e-08	105993846	106019217
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	106009606	106009606	1	0	NA	1.26393107216796e-08	105993846	106019217	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	106011629	108262953	847	776	-0.3142	NA	NA	NA	8.12408698103417e-28	108257438	108277795
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	108264188	108367006	51	48	-0.8882	8.12408698103417e-28	108257438	108277795	5.74791363565498e-24	108357294	108375181
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	108370456	114123340	2154	1977	-0.3305	5.74791363565498e-24	108357294	108375181	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19549728	68	65	-0.3758	NA	NA	NA	2.51280652687274e-27	19490630	19560692
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19551043	43569142	8112	7512	0.0937	2.51280652687274e-27	19490630	19560692	6.3871575018678e-19	43569142	43569142
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	43571616	43597665	5	5	-1.3552	6.3871575018678e-19	43569142	43569142	5.89541231211627e-44	43597665	43597665
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	43607609	43607609	1	0	NA	5.89541231211627e-44	43597665	43597665	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	43610114	57163488	4448	4071	0.134	NA	NA	NA	0	57140675	57209669
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	57168302	62886925	2224	2054	-0.3008	0	57140675	57209669	2.30196688042679e-303	62852058	62913119
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	62889946	73071404	4562	4215	0.0388	2.30196688042679e-303	62852058	62913119	2.96481481920931e-18	73058103	73083141
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	2.96481481920931e-18	73058103	73083141	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-1.2602	NA	NA	NA	1.68844986464658e-15	73083141	73101327
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	75313551	1073	989	0.0482	1.68844986464658e-15	73083141	73101327	6.55299715042267e-201	75294526	75341232
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	75314833	84823320	3321	3062	-0.3381	6.55299715042267e-201	75294526	75341232	4.44852446007146e-41	84795201	84874089
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	84826950	85610302	199	183	0.0192	4.44852446007146e-41	84795201	84874089	9.77037585743919e-14	85601844	85610302
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85617469	85641250	5	5	-1.162	9.7703758574392e-14	85601844	85610302	3.25893357516703e-13	85641250	85649150
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85649150	99181063	4875	4517	0.0539	3.25893357516703e-13	85641250	85649150	0	99159383	99212706
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	99184048	105850033	2802	2572	-0.2946	0	99159383	99212706	2.14939907905017e-22	105850033	105850033
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-1.9818	2.14939907905017e-22	105850033	105850033	3.93237888083975e-21	105875924	105875924
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	170	-0.2419	3.93237888083975e-21	105875924	105875924	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	24062059	1121	1045	-0.3122	NA	NA	NA	2.59824739790076e-303	24026779	24095360
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	24067131	27687174	1103	1014	-0.9049	2.59824739790076e-303	24026779	24095360	2.99903985103435e-08	27684039	27687174
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	27688441	27690169	2	2	-2.4895	2.99903985103435e-08	27684039	27687174	9.18148178992034e-08	27690169	27690169
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	27691988	33159708	1813	1660	-0.8758	9.18148178992034e-08	27690169	27690169	5.14352393147428e-08	33156537	33159708
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33165775	33169388	2	2	-2.5124	5.14352393147428e-08	33156537	33159708	3.74031109445266e-08	33169388	33171881
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33171881	49346045	6623	6118	-0.8856	3.74031109445266e-08	33169388	33171881	0	49338817	49354882
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	49347488	57433847	3421	3176	-0.3032	0	49338817	49354882	2.66512628574478e-177	57410112	57456597
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	57435555	59737536	956	894	0.068	2.66512628574478e-177	57410112	57456597	4.8150121253808e-172	59679464	59770871
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59741790	64847835	2479	2302	-0.3136	4.8150121253808e-172	59679464	59770871	0	64825241	64861126
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	64849109	74669752	4191	3874	0.0682	0	64825241	64861126	1.92818932943719e-42	74669752	74669752
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-2.3392	1.92818932943719e-42	74669752	74669752	3.08429270091968e-42	74680439	74680439
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	82330854	2793	2589	0.0674	3.08429270091968e-42	74680439	74680439	5.75978222737866e-33	82330854	82330854
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82332155	82332155	1	0	NA	5.75978222737866e-33	82330854	82330854	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-2.9426	NA	NA	NA	2.46298877460576e-33	82334704	82334704
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	98232932	5897	5420	0.0761	2.46298877460576e-33	82334704	82334704	2.90444767625189e-21	98232932	98232932
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98234519	1	0	NA	2.90444767625189e-21	98232932	98232932	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98237721	98239454	2	2	-2.3469	NA	NA	NA	1.06230896601640e-19	98239454	98239454
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	594	0.0381	1.0623089660164e-19	98239454	98239454	4.06886796537825e-09	99630163	99632987
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.6758	4.06886796537825e-09	99630163	99632987	7.561395563164e-09	99635701	99635701
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100212401	266	248	0.0545	7.561395563164e-09	99635701	99635701	0.285634108095003	100082481	100282819
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217181	100298352	6	6	-0.3167	0.285634108095003	100082481	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1191361	443	407	-0.3213	NA	NA	NA	5.3704189936593e-12	1187492	1193295
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1193295	1228878	10	10	-1.2628	5.3704189936593e-12	1187492	1193295	9.53111472680326e-14	1228820	1248960
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1237137	1237137	1	0	NA	9.53111472680326e-14	1228820	1248960	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1247519	5448020	1682	1558	-0.3084	NA	NA	NA	0	5430091	5463320
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	5450007	14516444	3252	2999	-0.8888	0	5430091	5463320	6.2763132285001e-42	14506108	14520306
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14518956	14687636	79	74	-0.2791	6.2763132285001e-42	14506108	14520306	2.80452210324878e-20	14683004	14956177
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	14876356	1	0	NA	2.80452210324878e-20	14683004	14956177	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	13	-1.177	NA	NA	NA	1.24025158331843e-16	15028108	15037844
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	22999528	2196	2009	-0.3053	1.24025158331843e-16	15028108	15037844	0	22988459	23019713
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23000745	54352394	6018	5588	0.1585	0	22988459	23019713	2.30697057877357e-80	54352394	54365385
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-1.9099	2.30697057877357e-80	54352394	54365385	1.22985068551848e-133	54363713	54379839
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	68693086	4593	4249	-0.1448	1.22985068551848e-133	54363713	54379839	1.80102147917324e-151	68685696	68693086
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.8993	1.80102147917324e-151	68685696	68693086	1.29394618847188e-15	68753209	68849229
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	76922411	2825	2593	-0.2452	1.29394618847188e-15	68753209	68849229	1.53693167776677e-14	76916931	76922411
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76923844	76942679	11	7	0.5391	1.53693167776677e-14	76916931	76922411	2.51509952288282e-11	76942679	76944661
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	77424988	238	222	-0.383	2.51509952288282e-11	76942679	76944661	1.37332904121536e-24	77416806	77436640
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77428622	77563051	73	67	-0.9139	1.37332904121536e-24	77416806	77436640	2.16551289033498e-35	77552590	77569224
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77564752	88690571	4201	3868	-0.3417	2.16551289033498e-35	77552590	77569224	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	539039	185	172	0.1304	NA	NA	NA	1.17016744580498e-28	526940	547472
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	540891	804810	129	120	-0.3239	1.17016744580498e-28	526940	547472	2.86381138564012e-23	790457	834469
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	806085	1906319	541	509	0.0542	2.86381138564012e-23	790457	834469	1.34325477235616e-06	1903358	1906319
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906352	1906391	2	2	1.5226	1.34325477235616e-06	1903358	1906319	2.09786249196834e-07	1906391	1909371
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	4021796	937	844	0.0515	2.09786249196834e-07	1906391	1909371	1.09909268244586e-197	4003144	4042734
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4025515	31457889	10243	9490	-0.3234	1.09909268244586e-197	4003144	4042734	3.94064663919718e-10	31441419	31467971
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31889566	20	18	-0.8995	3.94064663919718e-10	31441419	31467971	1.41091589837843e-10	31492553	31905266
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	35810787	1503	1394	-0.315	1.41091589837843e-10	31492553	31905266	8.2204615970925e-193	35801267	35822581
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	35814521	36673853	311	289	0.3495	8.2204615970925e-193	35801267	35822581	7.84376092475381e-41	36673853	36673853
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	4	-2.0246	7.84376092475381e-41	36673853	36673853	7.1310139779514e-47	36683509	36683509
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41521544	2013	1845	0.2357	7.1310139779514e-47	36683509	36683509	1.19112728830217e-71	41518222	41527705
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	42155643	73	72	-0.4741	1.19112728830217e-71	41518222	41527705	2.62667564066982e-34	42147225	42162729
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42158650	43726934	692	635	0.0745	2.62667564066982e-34	42147225	42162729	2.43269399123054e-06	43718983	43731325
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43729275	43747629	10	9	0.7232	2.43269399123054e-06	43718983	43731325	1.74042765256136e-05	43736320	43819165
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43749290	54894102	3888	3591	0.3671	1.74042765256136e-05	43736320	43819165	2.63397578564404e-258	54846523	54963632
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54898067	59833635	1933	1767	0.7141	2.63397578564404e-258	54846523	54963632	0	59825014	59839661
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	59835362	68752970	3080	2836	0.0733	0	59825014	59839661	1.01181691680492e-12	68724562	68776246
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68754434	68873311	61	56	0.4315	1.01181691680492e-12	68724562	68776246	1.86320438782811e-13	68857638	68895130
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68876383	78653545	4008	3694	0.0385	1.86320438782811e-13	68857638	68895130	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4310767	1515	1399	-0.2862	NA	NA	NA	2.77261308381335e-269	4282765	4348562
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4317565	17564018	3818	3507	0.0945	2.77261308381335e-269	4282765	4348562	4.05926649173968e-16	17546826	17577743
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	17564122	17649688	43	42	-0.3672	4.05926649173968e-16	17546826	17577743	3.86099744831394e-13	17641723	17653448
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	17650428	17866876	86	78	0.1009	3.86099744831394e-13	17641723	17653448	5.09098841573887e-21	17850798	17883084
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	17868295	19014667	302	279	-0.3156	5.09098841573887e-21	17850798	17883084	7.45386777666379e-211	18993433	19024675
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	19016248	76116026	17200	15857	0.2063	7.45386777666379e-211	18993433	19024675	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1395246	491	448	-0.313	NA	NA	NA	4.14444415973711e-13	1395246	1395246
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1398325	1398325	1	0	NA	4.14444415973711e-13	1395246	1395246	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.7707	NA	NA	NA	8.5953888675816e-14	1400840	1400840
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	10893630	4407	4030	-0.3021	8.5953888675816e-14	1400840	1400840	0	10866103	10914913
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10894722	59491509	16186	14994	0.076	0	10866103	10914913	1.26468524301316e-54	59491509	59491509
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-1.8668	1.26468524301316e-54	59491509	59491509	3.14093843798829e-12	59497049	59497049
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1821	0.0443	3.14093843798829e-12	59497049	59497049	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	1506379	585	552	0.5544	NA	NA	NA	1.90535436161065e-17	1499421	1515948
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.5613	1.90535436161065e-17	1499421	1515948	2.47277404121169e-100	1525300	1548251
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	1544485	1	0	NA	2.47277404121169e-100	1525300	1548251	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1546858	19813301	6570	6080	0.7145	NA	NA	NA	1.40713995969822e-288	19777847	19836788
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	19815288	26148060	1868	1735	0.3644	1.40713995969822e-288	19777847	19836788	9.87519794032345e-08	26142400	26148764
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26161111	9	9	-0.3727	9.87519794032345e-08	26142400	26148764	5.16423658172903e-08	26156944	26173123
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	26162094	1	0	NA	5.16423658172903e-08	26156944	26173123	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26168610	39281554	3857	3557	0.3636	NA	NA	NA	1.33779238448791e-118	39246486	39303969
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	39283287	41072846	751	683	0.0246	1.33779238448791e-118	39246486	39303969	0	41068082	41087007
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	41074672	62419534	7926	7287	0.5638	0	41068082	41087007	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	15191308	452	413	-0.2489	NA	NA	NA	1.06421855723875e-27	15176773	15227306
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	15193667	15193667	1	0	NA	1.06421855723875e-27	15176773	15227306	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	15195773	15346772	72	66	-0.759	NA	NA	NA	2.91183238733279e-34	15336263	15354438
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	15348337	22573420	2538	2328	-0.2246	2.91183238733279e-34	15336263	15354438	5.44663603366735e-74	22573420	22573420
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	2	-4.6437	5.44663603366735e-74	22573420	22573420	3.01445205885713e-69	22585040	22585040
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	46920225	10374	9563	-0.2354	3.01445205885713e-69	22585040	22585040	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	46922972	46922972	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	31358866	7667	7034	0.0956	NA	NA	NA	0	31343962	31374939
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	31360482	35472378	1884	1735	-0.2776	0	31343962	31374939	4.20521919317219e-32	35472378	35472378
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.3496	4.20521919317219e-32	35472378	35472378	3.04883606532226e-31	35476942	35476942
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	3.04883606532226e-31	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	37685496	1210	1117	-0.2507	NA	NA	NA	7.4803613378006e-208	37685496	37689058
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	14	-3.3921	7.4803613378006e-208	37685496	37689058	2.56753624879259e-217	37715370	37715385
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5329	-0.3056	2.56753624879259e-217	37715370	37715385	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	109064	16	16	-0.572	NA	NA	NA	6.72714627627543e-05	3237	115195
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	1528282	838	774	-0.1157	6.72714627627543e-05	3237	115195	3.06038770063939e-11	1528179	1528282
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-1.4152	3.06038770063939e-11	1528179	1528282	2.49336064444389e-10	1530474	1533361
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2302065	542	503	-0.1116	2.49336064444389e-10	1530474	1533361	5.78609906507063e-12	2301365	2302065
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304008	3	3	-1.7353	5.78609906507063e-12	2301365	2302065	4.39239978547469e-14	2304008	2304008
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2304398	2327325	26	22	-0.1476	4.39239978547469e-14	2304008	2304008	0.000992765993951652	2317406	2328343
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2327379	2339116	14	14	0.2231	0.000992765993951652	2317406	2328343	1.26159033410400e-08	2339089	2344220
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2340193	2708291	350	327	-0.4681	1.261590334104e-08	2339089	2344220	0	2706218	2711273
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	134552886	39016	35953	0.5535	0	2706218	2711273	3.31684616731404e-78	134543632	134575130
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134553391	134732880	35	34	1.209	3.31684616731404e-78	134543632	134575130	4.95278257817128e-28	134659331	134805580
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134801361	145133181	2853	2619	0.5006	4.95278257817128e-28	134659331	134805580	0	145079401	145170543
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	145148307	149727325	1405	1302	-0.1185	0	145079401	145170543	0	149712851	149744091
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	149732578	152655026	1152	1073	0.471	0	149712851	149744091	1.83187782437702e-06	152652738	152655026
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.9636	1.83187782437702e-06	152652738	152655026	1.13523850144165e-06	152657445	152669503
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	152669192	1	0	NA	1.13523850144165e-06	152657445	152669503	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669503	154442377	638	584	0.6268	NA	NA	NA	5.0960085458389e-47	154442377	154442377
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.3203	5.0960085458389e-47	154442377	154442377	4.53597550102873e-48	154450309	154450309
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.6449	4.53597550102873e-48	154450309	154450309	1.16529723027321e-43	154578922	154599547
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	186	-0.4842	1.16529723027321e-43	154578922	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2969891	119	112	-3.2615	NA	NA	NA	7.45373965158194e-07	2938431	3773948
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2973379	6711090	27	24	-2.0325	7.45373965158194e-07	2938431	3773948	0.0140568006264961	4272867	6836623
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6715636	6720552	2	0	NA	0.0140568006264961	4272867	6836623	NA	NA	NA
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6728131	10513747	817	747	-2.8418	NA	NA	NA	2.94492169884389e-13	10504879	10513747
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	14	-0.5713	2.94492169884389e-13	10504879	10513747	2.7868307132046e-07	11673476	12518008
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	13112411	197	189	-2.3707	2.7868307132046e-07	11673476	12518008	0.0508193825825219	13034069	13119344
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13114169	13128515	5	5	-0.8372	0.0508193825825219	13034069	13119344	2.30999498714757e-06	13119344	13133803
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14524829	507	466	-3.2072	2.30999498714757e-06	13119344	13133803	1.62240742270216e-07	14500820	14530328
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	11	-1.456	1.62240742270216e-07	14500820	14530328	3.68105514891274e-05	14539230	14559651
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	15920478	431	402	-3.1192	3.68105514891274e-05	14539230	14559651	0.000317371256754356	15750379	15953710
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16006096	32	31	-2.2089	0.000317371256754356	15750379	15953710	6.73192526297662e-06	15986595	16042966
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16007396	25737663	1171	1080	-3.1852	6.73192526297662e-06	15986595	16042966	1.33839388925560e-54	22926726	26873861
MSK_252152920825_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	78	-1.3276	1.3383938892556e-54	22926726	26873861	NA	NA	NA
