Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	27933074	10312	10048	0.0923	NA	NA	NA	1.57429563190487e-51	27897615	27952640
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27934999	28411751	225	220	0.3041	1.57429563190487e-51	27897615	27952640	7.63632343794393e-59	28392400	28433154
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	28414381	72525842	17351	16968	0.0871	7.63632343794393e-59	28392400	28433154	1.83227204516957e-17	72525842	72528790
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72533856	3	3	-0.9342	1.83227204516957e-17	72525842	72528790	7.71518140100116e-22	72533856	72533856
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72534975	72536231	2	2	-4.0635	7.71518140100116e-22	72533856	72533856	5.68283208721493e-52	72536231	72536231
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72579311	15	13	1.3825	5.68283208721493e-52	72536231	72536231	1.20165962297578e-132	72571158	72579311
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	108533257	11128	10862	0.0852	1.20165962297578e-132	72571158	72579311	1.93282105848509e-09	108531247	108533257
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-0.6586	1.93282105848509e-09	108531247	108533257	4.86660389092692e-10	108538662	108541074
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	110023268	572	559	0.1046	4.86660389092692e-10	108538662	108541074	1.55751323115285e-08	110015739	110023268
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-0.5074	1.55751323115285e-08	110015739	110023268	2.25263963894293e-09	110041712	110058441
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	110293395	91	88	0.1258	2.25263963894293e-09	110041712	110058441	2.4958642589041e-64	110276719	110306823
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110296337	147203277	4464	4358	-0.1643	2.4958642589041e-64	110276719	110306823	3.73696607446688e-114	147203277	147308557
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147510532	36	36	0.6057	3.73696607446688e-114	147203277	147308557	3.01370592664018e-72	147490608	147644831
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1226	-0.0019	3.01370592664018e-72	147490608	147644831	6.92918286844367e-15	150819879	150823073
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	0.8088	6.92918286844367e-15	150819879	150823073	6.31904423764755e-13	150839754	150839754
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	3	2.443	6.31904423764755e-13	150839754	150839754	2.69110565461734e-28	150846148	150846148
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	2.69110565461734e-28	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	150851439	2	2	1.4229	NA	NA	NA	1.28887415972759e-22	150851439	150851439
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2683	-0.0092	1.28887415972759e-22	150851439	150851439	6.15927360062934e-17	157133150	157133150
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.2364	6.15927360062934e-17	157133150	157133150	5.88222971799235e-19	157136342	157136342
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	179692688	8935	8742	-0.0334	5.88222971799235e-19	157136342	157136342	1.7771697571838e-07	179691272	179692688
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179694500	179698210	3	3	-0.702	1.7771697571838e-07	179691272	179692688	7.1821375938702e-08	179698210	179702422
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179702422	200613454	6530	6382	-0.0065	7.1821375938702e-08	179698210	179702422	1.12180262510352e-10	200598243	200623556
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200667381	19	19	-0.3257	1.12180262510352e-10	200598243	200623556	1.19467803160641e-16	200654700	200673525
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	246769018	17298	16906	-0.0042	1.19467803160641e-16	200654700	200673525	1.65773733200493e-34	246751473	246816703
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246875016	30	30	0.3592	1.65773733200493e-34	246751473	246816703	4.39172751226745e-10	246855902	246906110
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	90	0.0372	4.39172751226745e-10	246855902	246906110	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34539740	11520	11223	-0.0424	NA	NA	NA	5.57059281947955e-11	34520482	34552935
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34542224	34591681	21	21	-0.3498	5.57059281947955e-11	34520482	34552935	8.5529282318006e-12	34580533	34605203
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	37797909	1365	1333	-0.0238	8.5529282318006e-12	34580533	34605203	3.56141439391676e-12	37779760	37813211
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37800512	37855837	25	25	-0.3286	3.56141439391676e-12	37779760	37813211	0	37847519	37868682
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	112773459	22419	21886	-0.003	0	37847519	37868682	0	112762729	112782191
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112774942	119217181	1711	1668	0.3263	0	112762729	112782191	0	119195397	119233250
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	119222651	242689978	40766	39772	-0.0308	0	119195397	119233250	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	9334711	3205	3124	-0.0402	NA	NA	NA	8.67968111611075e-10	9332235	9334711
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9336324	9339032	2	2	-0.9728	8.67968111611075e-10	9332235	9334711	8.6565457673201e-10	9339032	9339032
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9349465	28932297	6565	6407	-0.0311	8.6565457673201e-10	9339032	9339032	2.99323658404216e-22	28927824	28932297
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	28942430	28972234	8	8	-0.7289	2.99323658404216e-22	28927824	28932297	4.11993700283811e-46	28972234	28988652
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	28988652	52276232	8529	8317	-0.0484	4.11993700283811e-46	28972234	28988652	1.02726204665548e-114	52271705	52281672
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	52277176	52648394	197	190	0.2833	1.02726204665548e-114	52271705	52281672	6.50890592126759e-109	52640071	52658004
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	52651013	52652140	2	0	NA	6.50890592126759e-109	52640071	52658004	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	52653740	65160634	5001	4880	-0.0413	NA	NA	NA	7.0575370662284e-25	65160634	65160634
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-1.536	7.0575370662284e-25	65160634	65160634	2.69929433218153e-26	65184180	65184180
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	89435719	7107	6936	-0.0462	2.69929433218153e-26	65184180	65184180	6.07676003172091e-225	89433647	89438631
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89436884	89747986	123	120	0.5156	6.07676003172091e-225	89433647	89438631	1.56591761119984e-12	89747986	89747986
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89754033	89757490	2	2	-0.6563	1.56591761119984e-12	89747986	89747986	7.15191022863005e-19	89757490	89768924
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89768924	89996683	26	26	0.4352	7.15191022863005e-19	89757490	89768924	1.04758166040442e-07	89955372	90070311
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	90011179	109154922	4028	3916	0.2112	1.04758166040442e-07	89955372	90070311	1.30302106838802e-147	109144302	109178965
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	109159017	109816705	272	265	0.5165	1.30302106838802e-147	109144302	109178965	1.40302299110834e-252	109805973	109829139
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	109817880	129861428	7331	7160	0.2224	1.40302299110834e-252	109805973	109829139	9.83482720394818e-186	129857112	129879782
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129867158	129887890	8	8	0.6741	9.83482720394818e-186	129857112	129879782	2.09574349527441e-11	129879782	129902698
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129899070	133189686	1300	1268	0.1826	2.09574349527441e-11	129879782	129902698	1.71617898643919e-27	133189686	133189686
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6766	1.71617898643919e-27	133189686	133189686	2.11872680927410e-26	133194685	133194685
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	138202371	1800	1749	0.172	2.1187268092741e-26	133194685	133194685	2.52904938149323e-14	138186078	138213342
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	138203031	138382764	35	34	0.4455	2.52904938149323e-14	138186078	138213342	2.68606624377519e-13	138349361	138427154
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	138387658	164027724	7950	7762	0.1795	2.68606624377519e-13	138349361	138427154	1.15177433354942e-21	164019640	164042397
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	18	0.6415	1.15177433354942e-21	164019640	164042397	6.15532311230428e-21	164086905	164115417
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	170682210	1707	1670	0.1801	6.15532311230428e-21	164086905	164115417	7.78648391412242e-108	170677859	170691684
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	170683531	170995967	143	141	0.5682	7.78648391412242e-108	170677859	170691684	5.90879684915153e-122	170986937	171000817
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	170997755	194354505	8280	8093	0.1858	5.90879684915153e-122	170986937	171000817	0	194354505	194354505
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.9434	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	965	0.173	0	194366950	194366950	3.21760488533336e-109	196822133	196835413
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.7618	3.21760488533336e-109	196822133	196835413	1.32562128521418e-85	196929826	196940125
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	198038358	440	434	0.1998	1.32562128521418e-85	196929826	196940125	1.27918680033884e-06	198036999	198038358
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-0.669	1.27918680033884e-06	198036999	198038358	1.23813757200676e-08	198042681	198044259
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	199329592	521	513	0.1957	1.23813757200676e-08	198042681	198044259	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	646459	200	199	-0.1584	NA	NA	NA	1.03112870132778e-15	646459	646459
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	647898	649222	2	2	0.9066	1.03112870132778e-15	646459	646459	6.47713186841281e-12	649222	649222
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	652014	9815760	3191	3114	-0.1677	6.47713186841281e-12	649222	649222	1.8508061166721e-212	9815760	9815760
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.3031	1.8508061166721e-212	9815760	9815760	4.43850481766185e-293	9842644	9842644
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14672	-0.1373	4.43850481766185e-293	9842644	9842644	7.39168500767129e-280	68899247	69075140
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.6557	7.39168500767129e-280	68899247	69075140	5.48456052490313e-31	69163312	69643272
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	103078970	11434	11165	-0.0333	5.48456052490313e-31	69163312	69643272	2.65612039899038e-10	103078970	103078970
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	103080110	103081706	2	2	-1.0047	2.65612039899038e-10	103078970	103078970	3.84370358344843e-11	103081706	103081706
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	103085144	107275274	1269	1232	-0.0386	3.84370358344843e-11	103081706	103081706	6.13700297055593e-08	107274138	107275274
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107283257	5	5	0.4798	6.13700297055593e-08	107274138	107275274	2.17990606481804e-07	107283257	107286012
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107284892	112423423	1677	1633	-0.0394	2.17990606481804e-07	107283257	107286012	5.9755405331745e-08	112395560	112461977
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	112437138	112492041	13	13	0.2964	5.9755405331745e-08	112395560	112461977	1.70540839623797e-07	112463430	112507049
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	112495617	115387382	1036	1013	-0.0145	1.70540839623797e-07	112463430	112507049	1.32958260811759e-11	115387382	115387382
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	115392033	115408266	3	3	-0.8041	1.32958260811759e-11	115387382	115387382	4.09849591144805e-10	115408266	115417214
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	115417214	122500822	1805	1753	-0.0372	4.09849591144805e-10	115408266	115417214	4.66288913557354e-12	122499680	122500822
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122502339	122507557	3	3	-0.8718	4.66288913557354e-12	122499680	122500822	9.51162994255496e-12	122507557	122511771
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122511771	151235574	7318	7128	-0.0383	9.51162994255496e-12	122507557	122511771	2.87558093851403e-11	151190927	151275568
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151238144	151378362	69	67	-0.2124	2.87558093851403e-11	151190927	151275568	1.06986564255558e-12	151349494	151411403
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151379477	173224400	6559	6406	-0.0296	1.06986564255558e-12	151349494	151411403	3.53905275258223e-111	173224400	173224400
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.0659	3.53905275258223e-111	173224400	173224400	1.00167858137512e-129	173228860	173228860
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	188	-0.0209	1.00167858137512e-129	173228860	173228860	5.91953104796378e-14	173660684	173660684
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	0.9918	5.91953104796378e-14	173660684	173660684	8.63355571481268e-13	173666072	173666072
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3959	-0.0481	8.63355571481268e-13	173666072	173666072	3.20213736743032e-51	187330240	187330240
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.1227	3.20213736743032e-51	187330240	187330240	1.19858883428593e-45	187333619	187333619
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190431567	1051	1019	-0.0493	1.19858883428593e-45	187333619	187333619	8.43717779466285e-09	190425991	190431567
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190434323	190437365	2	2	-0.9297	8.43717779466285e-09	190425991	190431567	9.95844980519444e-11	190437365	190437365
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190439544	190710812	78	78	-0.0646	9.95844980519444e-11	190437365	190437365	2.42110547618134e-47	190708316	190725579
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190921041	65	63	-0.5581	2.42110547618134e-47	190708316	190725579	1.68684984283414e-30	190915643	190927969
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	45	-0.0682	1.68684984283414e-30	190915643	190927969	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	303476	66	61	-0.0383	NA	NA	NA	0	303476	303476
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	303976	303976	1	0	NA	0	303476	303476	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	320267	1091759	237	229	2.3532	NA	NA	NA	4.20971048817609e-36	1073248	1103550
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1093705	1401824	116	114	1.8952	4.20971048817609e-36	1073248	1103550	1.47747351573161e-73	1400566	1411006
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1403784	1591366	81	77	2.7458	1.47747351573161e-73	1400566	1411006	3.31898434658335e-178	1591366	1591366
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1595216	1654613	15	14	-0.0221	3.31898434658335e-178	1591366	1591366	2.57216820571838e-12	1654613	1654613
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1656692	1659579	2	2	1.013	2.57216820571838e-12	1654613	1654613	2.39374010995482e-13	1659579	1659579
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1692540	1714088	8	8	-0.0507	2.39374010995482e-13	1659579	1659579	8.77932856006079e-92	1714088	1714088
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1717747	1836537	33	33	2.44	8.77932856006079e-92	1714088	1714088	0	1836537	1836537
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1839950	37338511	10001	9748	-0.0475	0	1836537	1836537	0	37338511	37340900
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	37340900	40647909	944	922	0.9553	0	37338511	37340900	0	40640386	40657757
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	40653049	41523233	379	366	1.5255	0	40640386	40657757	0	41523233	41523233
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	41538820	94082646	14492	14143	0.043	0	41523233	41523233	5.435267789051e-186	94064096	94098250
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94084383	94470171	174	170	-0.2041	5.435267789051e-186	94064096	94098250	8.00716050207432e-82	94462167	94486502
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94471394	140200229	13529	13223	0.0791	8.00716050207432e-82	94462167	94486502	1.90191271080812e-27	140198797	140200229
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.6363	1.90191271080812e-27	140198797	140200229	8.28505605638087e-27	140216524	140219465
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	167576841	8851	8657	0.0675	8.28505605638087e-27	140216524	140219465	6.94887960431643e-16	167555664	167600729
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167579452	167709796	66	65	0.2716	6.94887960431643e-16	167555664	167600729	2.41827872413498e-13	167685175	167730303
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167710996	172115031	1869	1837	0.0712	2.41827872413498e-13	167685175	167730303	6.805029373007e-10	172111829	172116995
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172116995	172123072	3	3	0.868	6.805029373007e-10	172111829	172116995	5.02096333126124e-10	172119774	172124544
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172124544	178040439	1860	1802	0.0749	5.02096333126124e-10	172119774	172124544	4.00477564510481e-12	178040439	178040439
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	1.1349	4.00477564510481e-12	178040439	178040439	1.49471203537181e-12	178045608	178045608
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	179429409	604	584	0.0838	1.49471203537181e-12	178045608	178045608	3.30442545916291e-25	179429409	179429409
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	1.5614	3.30442545916291e-25	179429409	179429409	2.79984791924485e-25	179431937	179431937
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	179709044	125	124	0.0497	2.79984791924485e-25	179431937	179431937	2.93876643296316e-12	179709044	179709044
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179710347	179711848	2	2	1.11	2.93876643296316e-12	179709044	179709044	2.16801767420521e-11	179711848	179713960
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179713960	180107298	142	138	0.0955	2.16801767420521e-11	179711848	179713960	1.02351627104504e-08	180105808	180107298
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180110133	180115895	3	3	0.8152	1.02351627104504e-08	180105808	180107298	7.87187011082687e-14	180115895	180135156
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180135156	180346557	32	31	0.0724	7.87187011082687e-14	180115895	180135156	3.79458632865323e-20	180344964	180346557
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	0.7095	3.79458632865323e-20	180344964	180346557	4.64973534363768e-10	180358977	180364670
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	107	0.1013	4.64973534363768e-10	180358977	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26811016	9366	9139	-0.0433	NA	NA	NA	5.33111731554303e-16	26801068	26811016
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.8588	5.33111731554303e-16	26801068	26811016	3.92586266030039e-14	26861184	26863540
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32558677	2307	2262	-0.027	3.92586266030039e-14	26861184	26863540	5.15565891639729e-167	32558677	32564884
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	-2.2281	5.15565891639729e-167	32558677	32564884	0.000588346389249145	32564884	32605300
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32633691	10	10	-0.6214	0.000588346389249145	32564884	32605300	0.00536633786131633	32600962	32634977
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.0419	0.00536633786131633	32600962	32634977	2.84771210673599e-16	32711957	32713363
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	0.7737	2.84771210673599e-16	32711957	32713363	2.42143348602203e-25	32728487	32731072
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8040	-0.0342	2.42143348602203e-25	32728487	32731072	8.45982115765691e-215	54035000	54035000
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.5829	8.45982115765691e-215	54035000	54035000	7.82520475498673e-220	54042734	54042734
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6259	-0.0371	7.82520475498673e-220	54042734	54042734	7.8129107460449e-09	79005118	79024557
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.3905	7.8129107460449e-09	79005118	79024557	1.60300226259503e-41	79079988	79119694
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	139643729	19146	18693	-0.0563	1.60300226259503e-41	79079988	79119694	2.24432500162209e-42	139641158	139643729
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	0.7879	2.24432500162209e-42	139641158	139643729	1.93847986373651e-11	139648318	139648318
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8510	-0.0439	1.93847986373651e-11	139648318	139648318	2.52698330823686e-12	165642393	165643653
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.7026	2.52698330823686e-12	165642393	165643653	4.7907768684893e-12	165650610	165653315
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1742	-0.066	4.7907768684893e-12	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	6349975	2264	2203	-0.0225	NA	NA	NA	8.71834691912321e-11	6332060	6370160
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	6352424	6427939	35	34	0.2069	8.71834691912321e-11	6332060	6370160	1.07713976455573e-10	6411465	6447034
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	6431169	62123295	16846	16422	-0.0349	1.07713976455573e-10	6411465	6447034	0	62115276	62133633
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	62125504	91646012	8653	8454	0.3151	0	62115276	62133633	6.27726757808976e-276	91618147	91665601
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	91647479	95293677	1442	1411	0.5152	6.27726757808976e-276	91618147	91665601	1.63394436357663e-136	95266682	95336664
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	95296007	99783563	1643	1598	0.3343	1.63394436357663e-136	95266682	95336664	0	99646446	99801809
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	99786369	109217320	4078	3980	0.0918	0	99646446	99801809	2.20968915250325e-10	109216032	109217320
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109240210	5	5	0.7086	2.20968915250325e-10	109216032	109217320	4.03602197843402e-12	109240210	109244233
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109967918	301	294	0.1156	4.03602197843402e-12	109240210	109244233	4.1058978712243e-54	109967918	109967918
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-2.295	4.1058978712243e-54	109967918	109967918	7.41213549708545e-65	109974402	109974402
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	125831554	7169	6997	0.0912	7.41213549708545e-65	109974402	109974402	1.49217622946207e-32	125831554	125831554
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.4668	1.49217622946207e-32	125831554	125831554	7.99477299752537e-47	125837524	125837524
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	131424513	2655	2588	0.1322	7.99477299752537e-47	125837524	125837524	4.72081161144468e-45	131422605	131424513
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131426580	131429932	3	3	-0.6814	4.72081161144468e-45	131422605	131424513	5.1262209410713e-10	131429932	131431668
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131431668	133433384	996	966	0.0858	5.1262209410713e-10	131429932	131431668	2.33376557066249e-24	133432281	133436265
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.8142	2.33376557066249e-24	133432281	133436265	1.81542306499030e-25	133447868	133453811
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	137536736	1919	1860	0.0986	1.8154230649903e-25	133447868	133453811	2.20407312502194e-103	137525288	137565202
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	137540150	138494789	418	408	0.3202	2.20407312502194e-103	137525288	137565202	1.9008993006696e-87	138475148	138513286
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138496494	141409512	1362	1320	0.1023	1.9008993006696e-87	138475148	138513286	4.87352794130285e-23	141406414	141414719
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141410894	1	0	NA	4.87352794130285e-23	141406414	141414719	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	0.6386	NA	NA	NA	3.55279789551566e-21	141435643	141443577
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	142149857	292	289	0.0964	3.55279789551566e-21	141435643	141443577	1.17131777949072e-13	142141101	142149857
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142152205	142152205	1	0	NA	1.17131777949072e-13	142141101	142149857	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-0.7027	NA	NA	NA	1.74547362725605e-48	142166710	142166710
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-2.993	1.74547362725605e-48	142166710	142166710	2.84166195154232e-104	142167908	142167908
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143503317	486	474	0.0823	2.84166195154232e-104	142167908	142167908	1.22638809179802e-11	143500499	143503317
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-0.769	1.22638809179802e-11	143500499	143503317	5.10551453373799e-13	143584350	143584350
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	144774697	465	457	0.0966	5.10551453373799e-13	143584350	143584350	3.5042982762284e-06	144773589	144774697
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144776430	144778800	2	2	-0.6431	3.5042982762284e-06	144773589	144774697	1.65549955157385e-06	144778800	144783808
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144781969	144781969	1	0	NA	1.65549955157385e-06	144778800	144783808	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144783808	145624787	361	351	0.1029	NA	NA	NA	1.86779177853181e-12	145624787	145624787
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145628790	145631369	2	2	-0.9252	1.86779177853181e-12	145624787	145624787	7.22294755233097e-11	145631369	145631369
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145637032	156483966	4202	4115	0.0878	7.22294755233097e-11	145631369	145631369	8.7555200572744e-09	156480019	156490484
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156495904	6	6	0.6176	8.7555200572744e-09	156480019	156490484	1.06280961907767e-07	156490484	156498994
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156497496	158821263	1051	1027	0.0845	1.06280961907767e-07	156490484	156498994	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	39333887	13068	12745	-0.1716	NA	NA	NA	0.0193260811534808	39261556	39333887
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39333915	39350798	6	6	0.0946	0.0193260811534808	39261556	39333887	1.06641873501411e-16	39350798	39352361
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	0.7795	1.06641873501411e-16	39350798	39352361	1.77371401853295e-201	39505256	39505256
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40442961	257	249	-0.1377	1.77371401853295e-201	39505256	39505256	1.89606644806859e-84	40358691	40489564
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40447865	61958470	5092	4952	0.1027	1.89606644806859e-84	40358691	40489564	1.33446704865527e-11	61941179	61970707
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	61960944	62102363	27	27	0.372	1.33446704865527e-11	61941179	61970707	0	62072962	62175079
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	62110835	145321421	25751	25091	0.1284	0	62072962	62175079	0	145315934	145334573
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145322549	145801466	147	145	0.4721	0	145315934	145334573	3.3115204172098e-08	145722363	145836115
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145804563	146264846	159	155	0.2953	3.3115204172098e-08	145722363	145836115	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5307	0.014	NA	NA	NA	7.72564875521364e-21	15802255	15802255
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.2957	7.72564875521364e-21	15802255	15802255	1.15139701101630e-19	15807123	15807123
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2304	0.0063	1.1513970110163e-19	15807123	15807123	4.05328944089289e-34	22477358	22477358
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-1.7133	4.05328944089289e-34	22477358	22477358	1.88140519648232e-24	22492603	22492603
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23338535	160	157	0.0685	1.88140519648232e-24	22492603	22492603	0.00707087291991904	23316739	23338535
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23353267	2	2	0.569	0.00707087291991904	23316739	23338535	0	23353267	23353267
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23357805	23365926	2	2	0.9714	0	23353267	23353267	1.52503100314609e-13	23365926	23365926
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	23453132	8	8	-0.1045	1.52503100314609e-13	23365926	23365926	5.33182676831901e-06	23439471	23487650
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23463857	26628616	600	583	0.2516	5.33182676831901e-06	23439471	23487650	2.32128097361037e-105	26536181	26736903
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	26634052	43776365	4126	4028	0.0613	2.32128097361037e-105	26536181	26736903	0	39062211	67907649
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	44199401	100348045	10256	9983	-0.1491	0	39062211	67907649	6.88294847904687e-29	100348045	100348045
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.7409	6.88294847904687e-29	100348045	100348045	5.72518670847485e-35	100350814	100350814
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5418	-0.1442	5.72518670847485e-35	100350814	100350814	8.16297420001282e-32	116122595	116124007
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0539	8.16297420001282e-32	116122595	116124007	3.84110292283823e-14	116130333	116130333
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	8093	-0.1504	3.84110292283823e-14	116130333	116130333	1.14454110219914e-31	137352394	137352394
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.558	1.14454110219914e-31	137352394	137352394	9.81281887824267e-29	137356880	137356880
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1075	-0.1613	9.81281887824267e-29	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	42176875	13516	13166	0.0867	NA	NA	NA	0	38643804	42220298
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	42179817	46384985	942	915	-0.1782	0	38643804	42220298	1.85925033223493e-43	45474003	46394835
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46388078	47172534	119	117	0.0963	1.85925033223493e-43	45474003	46394835	1.63261931510419e-33	47157002	47960542
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47938346	53683740	1725	1672	-0.1506	1.63261931510419e-33	47157002	47960542	1.73220524665091e-27	53683740	53683740
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-1.853	1.73220524665091e-27	53683740	53683740	4.00571818568457e-15	53687880	53687880
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	53830907	55	55	-0.061	4.00571818568457e-15	53687880	53687880	2.45818351946582e-06	53828758	53830907
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53832408	53837487	2	2	-0.7651	2.45818351946582e-06	53828758	53830907	2.75037049468414e-53	53837487	53839618
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53839618	61057382	1838	1794	0.0862	2.75037049468414e-53	53837487	53839618	1.17658860654772e-299	61011078	61080658
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	61061678	67557893	1974	1941	-0.1591	1.17658860654772e-299	61011078	61080658	1.58321735039254e-25	67557893	67557893
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67557946	67567786	2	2	0.809	1.58321735039254e-25	67557893	67557893	2.31240153293190e-66	67567786	67568716
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67568716	77917893	4417	4314	-0.111	2.3124015329319e-66	67567786	67568716	1.31493700919860e-68	77917893	77917893
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.4949	1.3149370091986e-68	77917893	77917893	6.39604287514818e-28	77928738	77928738
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	83325646	1558	1517	-0.1716	6.39604287514818e-28	77928738	77928738	4.82631982065402e-78	83276195	83394877
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	83332821	84012805	216	208	0.094	4.82631982065402e-78	83276195	83394877	1.97186180687829e-34	83994021	84033492
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	84016557	85130024	410	401	0.294	1.97186180687829e-34	83994021	84033492	0	85120903	85148615
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	85146074	135284109	18028	17583	-0.1762	0	85120903	85148615	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135285645	135285645	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1733	-0.149	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.1091	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	4934594	1	0	NA	0	4932214	4932214	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4937118	5742476	361	349	-0.1627	NA	NA	NA	9.08123856993923e-14	5738494	5744034
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5744034	5765438	14	14	-0.6045	9.08123856993923e-14	5738494	5744034	2.66224130358643e-14	5763749	5769776
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	26128624	7363	7199	-0.1628	2.66224130358643e-14	5763749	5769776	6.33562627099822e-76	26060545	26169667
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	26136452	26912334	256	248	0.0781	6.33562627099822e-76	26060545	26169667	1.65589597606418e-84	26882239	26949774
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	26916804	46432073	5913	5760	-0.1711	1.65589597606418e-84	26882239	26949774	9.99743493236148e-77	46406347	46462434
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46433817	47248743	383	376	0.0171	9.99743493236148e-77	46406347	46462434	1.10401237667966e-09	47226539	47264476
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47252032	47335508	40	40	-0.2043	1.10401237667966e-09	47226539	47264476	8.04090582296067e-10	47318158	47357351
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47338206	48307315	398	385	0.0089	8.04090582296067e-10	47318158	47357351	2.66907192181563e-07	48299218	48311071
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48309718	48335032	10	10	-0.3434	2.66907192181563e-07	48299218	48311071	0.000448657739892336	48323976	48352089
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48340988	48561884	40	39	-0.0574	0.000448657739892336	48323976	48352089	9.26806624229013e-10	48557860	48561884
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48564809	48583374	3	3	0.6974	9.26806624229013e-10	48557860	48561884	6.63127083623619e-07	48583374	48602465
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48602465	55118214	346	340	-0.0189	6.63127083623619e-07	48583374	48602465	4.2037591146342e-30	55097806	55124730
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.4066	4.2037591146342e-30	55097806	55124730	1.96425645642325e-47	55205278	55219985
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	57389427	913	886	-0.0481	1.96425645642325e-47	55205278	55219985	1.72931581896031e-10	57389427	57389427
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	57401266	57405437	2	2	-0.9868	1.72931581896031e-10	57389427	57389427	3.63266720106403e-40	57405437	57405437
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	57412027	66463477	3723	3628	0.0212	3.63266720106403e-40	57405437	57405437	3.12492104146834e-40	66460753	66463477
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.8516	3.12492104146834e-40	66460753	66463477	3.9265972741314e-62	66469412	66473397
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	99027331	10855	10574	-0.0889	3.9265972741314e-62	66469412	66473397	2.27859288421272e-65	99013072	99032916
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99030209	99074552	21	20	0.2351	2.27859288421272e-65	99013072	99032916	7.97825681331584e-159	99068718	99081056
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	134450318	12844	12549	-0.1467	7.97825681331584e-159	99068718	99081056	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	9523923	3741	3665	-0.0394	NA	NA	NA	1.91290470411550e-51	9523923	9543817
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9607363	15	14	0.7668	1.9129047041155e-51	9523923	9543817	3.49108889738481e-44	9589725	9610054
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	11395862	649	632	-0.0185	3.49108889738481e-44	9589725	9610054	2.84770683349073e-09	11389830	11395862
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-0.5507	2.84770683349073e-09	11389830	11395862	1.10545159606138e-08	11435643	11452868
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	53749948	14061	13717	-0.0296	1.10545159606138e-08	11435643	11452868	1.91368868793714e-254	53728904	53776204
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53754539	55637770	768	752	0.2182	1.91368868793714e-254	53728904	53776204	1.47676469912715e-239	55618235	55674826
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	55660674	69138621	4432	4316	-0.0322	1.47676469912715e-239	55618235	55674826	1.02783933659082e-16	69138621	69138621
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69161489	69164231	2	2	-1.2411	1.02783933659082e-16	69138621	69138621	2.25546367271990e-16	69164231	69164231
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69188981	130943064	20934	20434	-0.0366	2.2554636727199e-16	69164231	69164231	3.43028054302011e-48	130943064	130943064
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.993	3.43028054302011e-48	130943064	130943064	9.40498585336824e-43	130946248	130946248
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	535	-0.0319	9.40498585336824e-43	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	24043107	1983	1934	-0.18	NA	NA	NA	2.88415786687327e-11	24042374	24043107
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	24063136	24068006	3	3	0.6478	2.88415786687327e-11	24042374	24043107	2.53249818257852e-11	24068006	24068006
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	24069683	49964838	10233	9988	-0.1863	2.53249818257852e-11	24068006	24068006	8.05045510435833e-68	49964838	49964838
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.6212	8.05045510435833e-68	49964838	49964838	5.64742028326531e-67	49971732	49971732
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1765	-0.1841	5.64742028326531e-67	49971732	49971732	1.42336573695226e-21	56646284	56658479
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56681665	13	13	-0.7333	1.42336573695226e-21	56646284	56658479	2.01214086789257e-23	56680346	56686863
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	68136198	2693	2627	-0.1808	2.01214086789257e-23	56680346	56686863	1.86245944926221e-09	68130387	68138912
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68138912	68163523	12	11	0.2065	1.86245944926221e-09	68130387	68138912	8.2772565315889e-10	68161714	68169957
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	96977483	8677	8500	-0.1905	8.2772565315889e-10	68161714	68169957	1.49216935465682e-54	96949243	97015824
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	96985978	97505834	147	146	0.0615	1.49216935465682e-54	96949243	97015824	1.95574207873326e-44	97485233	97560374
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97510025	100690991	1512	1477	-0.1812	1.95574207873326e-44	97485233	97560374	1.08531605718734e-293	100690991	100690991
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.2321	1.08531605718734e-293	100690991	100690991	4.54741789135553e-290	100693892	100693892
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4457	-0.1886	4.54741789135553e-290	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.4438	NA	NA	NA	3.50667982818405e-06	18537177	19271102
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	0.9756	3.50667982818405e-06	18537177	19271102	1.39766233750366e-121	19492531	19497023
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5535	0.3234	1.39766233750366e-121	19492531	19497023	1.22857765629921e-18	34674458	34674458
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.4077	1.22857765629921e-18	34674458	34674458	2.86811874779494e-37	34683810	34683810
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	79174722	16588	16180	0.1993	2.86811874779494e-37	34683810	34683810	5.31677848693118e-32	79172702	79174722
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-0.4642	5.31677848693118e-32	79172702	79174722	1.83173225695897e-08	79183154	79185548
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	9057	0.1877	1.83173225695897e-08	79183154	79185548	0	105597555	105597555
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-2.2833	0	105597555	105597555	1.21512075985111e-77	105632168	105632168
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105848335	47	44	0.1132	1.21512075985111e-77	105632168	105632168	3.29500901208099e-14	105846004	105848335
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105850033	105881893	8	7	-0.5241	3.29500901208099e-14	105846004	105848335	1.97234548988825e-11	105881893	105897061
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105946993	16	16	0.1255	1.97234548988825e-11	105881893	105897061	8.89461745511821e-16	105945006	105951399
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	106002179	18	18	-0.6263	8.8946174551182e-16	105945006	105951399	3.69493393076688e-40	105998412	106013552
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	140	0.2279	3.69493393076688e-40	105998412	106013552	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.1395	NA	NA	NA	1.65009733602386e-11	18452491	18452491
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	10	-0.9229	1.65009733602386e-11	18452491	18452491	1.67823265055831e-21	18837737	18837737
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-2.7054	1.67823265055831e-21	18837737	18837737	4.36833451144607e-41	18848213	18848213
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19427350	77	77	-0.8595	4.36833451144607e-41	18848213	18848213	5.63694480234439e-13	19415360	19800789
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19430207	19430207	1	0	NA	5.63694480234439e-13	19415360	19800789	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19465359	19845942	13	13	-0.2566	NA	NA	NA	3.02517731837005e-86	19845942	19845942
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-3.9909	3.02517731837005e-86	19845942	19845942	3.17942712909315e-263	19882711	19882711
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20060061	40	38	-0.3728	3.17942712909315e-263	19882711	19882711	5.32019665452553e-21	20029653	20316992
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20065525	32456500	3674	3587	-0.0526	5.32019665452553e-21	20029653	20316992	2.33352947333432e-13	32452971	32514939
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32549215	11	10	-0.5525	2.33352947333432e-13	32452971	32514939	1.63628606686652e-06	32544263	32557616
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32552457	32572315	8	8	-0.1693	1.63628606686652e-06	32544263	32557616	1.51669829579589e-05	32568086	32572315
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32576881	32594200	6	5	-0.5389	1.51669829579589e-05	32568086	32572315	1.33153491300908e-06	32594200	32669751
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	1.33153491300908e-06	32594200	32669751	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	67289684	14732	14371	-0.0335	NA	NA	NA	1.23649143193582e-10	67281137	67290829
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67290829	67307573	7	7	0.497	1.23649143193582e-10	67281137	67290829	3.62973387582864e-11	67304326	67311499
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67310476	75115806	3293	3224	-0.0393	3.62973387582864e-11	67304326	67311499	1.87821875355094e-55	75115806	75115806
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	2.1483	1.87821875355094e-55	75115806	75115806	5.90467994734168e-55	75119713	75119713
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98232932	8521	8302	-0.0438	5.90467994734168e-55	75119713	75119713	4.42062996168966e-15	98232932	98232932
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	-0.9973	4.42062996168966e-15	98232932	98232932	1.16824748994591e-17	98239454	98239454
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	98243586	1	0	NA	1.16824748994591e-17	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98245361	99632987	636	623	-0.0445	NA	NA	NA	1.46740257306814e-44	99632987	99632987
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.7906	1.46740257306814e-44	99632987	99632987	7.19700354776415e-37	99635701	99635701
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	266	-0.0422	7.19700354776415e-37	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	28029977	9478	9273	-0.0323	NA	NA	NA	1.70874848050114e-29	28016868	28047937
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28032476	28394123	83	80	0.2261	1.70874848050114e-29	28016868	28047937	1.13597641713227e-22	28225606	28412906
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28396084	32379126	1012	984	-0.0165	1.13597641713227e-22	28225606	28412906	1.16037914692453e-35	31813741	32547617
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	35004950	240	230	-0.2078	1.16037914692453e-35	31813741	32547617	1.00820609098721e-40	34930597	45105412
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45058242	57203733	4096	3996	-0.0223	1.00820609098721e-40	34930597	45105412	3.98591613778449e-46	57203733	57203733
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.075	3.98591613778449e-46	57203733	57203733	4.70835623681448e-51	57206772	57206772
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5487	-0.0368	4.70835623681448e-51	57206772	57206772	1.88222219708033e-53	75093957	75093957
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-1.7393	1.88222219708033e-53	75093957	75093957	3.81907188606891e-38	75100865	75100865
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75935902	215	212	-0.0855	3.81907188606891e-38	75100865	75100865	2.83613894403601e-10	75933989	75935902
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75937792	75940128	2	2	-1.1514	2.83613894403601e-10	75933989	75935902	7.72236876516807e-12	75940128	75940128
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75941787	76925748	393	383	-0.0621	7.72236876516807e-12	75940128	75940128	1.17820996640434e-36	76925748	76929598
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.9005	1.17820996640434e-36	76925748	76929598	9.7895094662594e-40	76938723	76940218
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88363658	4369	4269	-0.0432	9.7895094662594e-40	76938723	76940218	2.01460450935556e-07	88341667	88381719
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88366758	88418803	25	25	0.1951	2.01460450935556e-07	88341667	88381719	4.24572730558568e-05	88402382	88443382
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88421536	88690571	119	118	-0.0535	4.24572730558568e-05	88402382	88443382	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	411	-0.0325	NA	NA	NA	3.4941531135104e-26	1028979	1028979
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.495	3.4941531135104e-26	1028979	1028979	5.13607177482033e-25	1030766	1030766
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	12561345	4983	4847	-0.0326	5.13607177482033e-25	1030766	1030766	3.63935627067303e-09	12559582	12561345
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	12563254	12564722	2	2	-0.976	3.63935627067303e-09	12559582	12561345	4.63501724192535e-10	12564722	12566755
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	12566755	15727076	898	870	-0.0536	4.63501724192535e-10	12564722	12566755	1.43537992383856e-312	15727076	15727076
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-5.0975	1.43537992383856e-312	15727076	15727076	2.56067867242068e-273	15733964	15733964
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	27112936	3910	3803	-0.0667	2.56067867242068e-273	15733964	15733964	9.65398951792248e-65	27104733	27112936
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	27123516	27131249	2	2	0.8637	9.65398951792248e-65	27104733	27112936	3.51016608974985e-12	27131249	27131249
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	27139795	31461588	1822	1782	-0.1855	3.51016608974985e-12	27131249	27131249	7.02098737139705e-15	31447686	31467971
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31499568	17	17	-0.5831	7.02098737139705e-15	31447686	31467971	7.49035091300676e-18	31492553	31889566
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32828797	366	354	-0.1555	7.49035091300676e-18	31492553	31889566	1.90585404818224e-15	32828797	32828797
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.9847	1.90585404818224e-15	32828797	32828797	3.33579279641523e-14	32832642	32832642
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1411	-0.159	3.33579279641523e-14	32832642	32832642	8.18573719074787e-217	36673853	36673853
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.9397	8.18573719074787e-217	36673853	36673853	6.23020825610633e-204	36683509	36683509
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	38808155	925	905	-0.1589	6.23020825610633e-204	36683509	36683509	1.36976238187488e-65	38591776	38825534
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38810782	39563899	325	317	0.0675	1.36976238187488e-65	38591776	38825534	1.12328157131127e-36	39551763	39580189
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	39565607	40054160	208	201	0.2964	1.12328157131127e-36	39551763	39580189	3.60597116308598e-34	39997354	40092409
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40059322	41566540	575	561	0.095	3.60597116308598e-34	39997354	40092409	3.04153396817756e-35	41561017	41576147
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42142363	47	46	-0.2966	3.04153396817756e-35	41561017	41576147	3.35965627425598e-38	41700762	42147225
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42143048	52440878	3479	3394	0.0767	3.35965627425598e-38	41700762	42147225	9.05182438749588e-14	52440878	52440878
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-0.7993	9.05182438749588e-14	52440878	52440878	5.97812532646328e-12	52447064	52447064
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	9924	0.0822	5.97812532646328e-12	52447064	52447064	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	173	0.2392	NA	NA	NA	1.31024703789768e-20	500897	500897
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	1.5241	1.31024703789768e-20	500897	500897	5.23837390708254e-20	505456	505456
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	1822927	446	439	0.2143	5.23837390708254e-20	505456	505456	1.68750588556801e-208	1822927	1822927
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1828882	1903543	20	19	1.5975	1.68750588556801e-208	1822927	1822927	3.60153215613829e-23	1899725	1907182
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1907182	2707731	247	238	1.0777	3.60153215613829e-23	1899725	1907182	0	2703315	2707731
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	2708341	14767960	4072	3973	0.1722	0	2703315	2707731	0	14725242	14833951
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	14769239	54078204	11617	11316	-0.0279	0	14725242	14833951	1.26042710291512e-22	54078204	54078204
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54082209	54087468	4	4	-1.0021	1.26042710291512e-22	54078204	54078204	2.08611229712609e-21	54087468	54087468
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54089357	63309020	2671	2600	-0.0375	2.08611229712609e-21	54087468	54087468	4.93522434069588e-22	63309020	63309020
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	63313055	63320012	4	4	-1.0149	4.93522434069588e-22	63309020	63309020	8.88825475006326e-22	63320012	63320012
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	63322258	76116026	3706	3634	-0.0314	8.88825475006326e-22	63320012	63320012	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	216	-0.0335	NA	NA	NA	0.000863332099868772	782819	794973
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	798817	3	3	0.5031	0.000863332099868772	782819	794973	8.06205618938871e-06	798817	806292
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	801351	1398325	270	258	-0.1607	8.06205618938871e-06	798817	806292	4.20209554164712e-14	1398325	1398325
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.1202	4.20209554164712e-14	1398325	1398325	2.98830166718574e-15	1400840	1400840
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1021	-0.1417	2.98830166718574e-15	1400840	1400840	5.37502298837313e-08	3588389	3591120
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.0602	5.37502298837313e-08	3588389	3591120	7.73235799404811e-08	3593646	3596968
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	5229808	790	765	-0.1627	7.73235799404811e-08	3593646	3596968	4.18953441347661e-208	5218078	5238289
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	5231038	9138936	1735	1694	0.1083	4.18953441347661e-208	5218078	5238289	1.69793998785261e-12	9138936	9138936
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9141894	9144715	3	3	-0.7816	1.69793998785261e-12	9138936	9138936	5.31916441986575e-15	9144715	9144715
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9145735	14663282	2491	2436	0.2085	5.31916441986575e-15	9144715	9144715	3.36008749401065e-89	14656648	14669720
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14665135	14981620	160	150	0.5552	3.36008749401065e-89	14656648	14669720	4.12877541816331e-180	14973811	14989237
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14984535	32545047	3448	3356	0.1424	4.12877541816331e-180	14973811	14989237	0	24146680	32964337
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32929768	37475611	1232	1203	0.5769	0	24146680	32964337	2.86659458990315e-236	37441946	37515219
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	37488181	40352568	1212	1179	0.8837	2.86659458990315e-236	37441946	37515219	6.56271244789172e-31	40352568	40352568
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-1.1527	6.56271244789172e-31	40352568	40352568	5.32109619049736e-19	40356341	40356341
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	41325666	475	471	0.8225	5.32109619049736e-19	40356341	40356341	1.92867493719764e-131	41301967	41333192
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41327446	43925607	1132	1098	0.505	1.92867493719764e-131	41301967	41333192	5.39774357528146e-143	43916217	43952026
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43927527	44911522	426	414	0.1885	5.39774357528146e-143	43916217	43952026	2.20662225437220e-237	44894438	44917400
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44913280	52217188	3061	2987	-0.1489	2.2066222543722e-237	44894438	44917400	6.57706562439577e-14	52217188	52217188
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52220223	52223270	3	2	-1.2562	6.57706562439577e-14	52217188	52217188	5.40276626962124e-13	52223270	52223270
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52226221	59414898	3347	3279	-0.1468	5.40276626962124e-13	52223270	52223270	1.11781933558467e-23	59414645	59414898
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59440262	11	11	-0.7794	1.11781933558467e-23	59414645	59414898	5.15556793699899e-24	59440262	59440274
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	63788698	1993	1940	-0.1651	5.15556793699899e-24	59440262	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	569	-0.0398	NA	NA	NA	1.05275021368048e-59	1506379	1515948
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	-1.174	1.05275021368048e-59	1506379	1515948	0	1528899	1532433
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20459	-0.0101	0	1528899	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10167413	22	22	-0.1129	NA	NA	NA	5.0428291744759e-05	10144881	13612839
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	5.0428291744759e-05	10144881	13612839	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	13817761	23	22	0.1956	NA	NA	NA	0.0221593150456645	13699520	13874295
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13825629	13882260	11	11	0.4512	0.0221593150456645	13699520	13874295	1.38994321065906e-08	13874295	13894824
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13889359	23369245	3161	3093	0.0818	1.38994321065906e-08	13874295	13894824	4.60006041685086e-08	23369245	23369245
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	23372689	23377376	2	2	-0.7574	4.60006041685086e-08	23369245	23369245	4.99303706941168e-07	23377376	23378746
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	23378746	46922972	10221	9961	0.0691	4.99303706941168e-07	23377376	23378746	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16685770	508	497	-0.0082	NA	NA	NA	1.64475171229597e-67	16673951	16694267
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16687013	17001076	213	209	0.3088	1.64475171229597e-67	16673951	16694267	2.78679217737763e-12	17001076	17001076
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17006871	17008019	2	2	-0.9389	2.78679217737763e-12	17001076	17001076	2.45759685464802e-08	17008019	17008019
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17011485	22667608	2260	2207	-0.0249	2.45759685464802e-08	17008019	17008019	5.94151338965175e-18	22642519	22682428
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.3753	5.94151338965175e-18	22642519	22682428	2.69738039992277e-21	22718614	22736990
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	27387298	2566	2510	-0.0421	2.69738039992277e-21	22718614	22736990	1.08244902637337e-08	27386252	27387298
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27388887	27388887	1	0	NA	1.08244902637337e-08	27386252	27387298	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27395328	27396032	2	2	0.8534	NA	NA	NA	2.73151838432012e-08	27396032	27396032
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27400339	35472378	3978	3873	-0.032	2.73151838432012e-08	27396032	27396032	6.20181273333228e-12	35472378	35472378
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.02	6.20181273333228e-12	35472378	35472378	3.81267952641566e-13	35476942	35476942
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1164	-0.0286	3.81267952641566e-13	35476942	35476942	1.23593955443294e-07	37618187	37621766
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-0.8373	1.23593955443294e-07	37618187	37621766	4.64240120769788e-08	37626069	37633961
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37685496	21	21	-0.0208	4.64240120769788e-08	37626069	37633961	1.86713931166486e-42	37685496	37689058
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.9786	1.86713931166486e-42	37685496	37689058	1.07611046414297e-82	37715370	37715385
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	38482682	361	350	-0.0222	1.07611046414297e-82	37715370	37715385	0	38482682	38488711
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	38488711	38844767	193	191	0.8966	0	38482682	38488711	1.20637504953062e-110	38841936	38849236
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	38845690	39313282	271	265	1.3835	1.20637504953062e-110	38841936	38849236	3.59686606138435e-56	39311139	39315582
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39314565	39434945	62	62	1.9139	3.59686606138435e-56	39311139	39315582	0.0206209656428460	39401730	39434945
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39440431	39447480	3	3	1.4152	0.020620965642846	39401730	39434945	3.78588116862592e-39	39447480	39447480
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39452729	49571068	4886	4741	-0.1683	3.78588116862592e-39	39447480	39447480	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1188	NA	NA	NA	2.23142245031680e-28	94062	94062
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104486	6	6	-1.2967	2.2314224503168e-28	94062	94062	2.95321668272427e-37	104486	104486
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104732	104732	1	0	NA	2.95321668272427e-37	104486	104486	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1431240	775	755	-0.0695	NA	NA	NA	5.45617752638489e-06	1427338	1431240
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431411	1432953	3	3	-0.7806	5.45617752638489e-06	1427338	1431240	1.13246404489146e-07	1432953	1434970
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	597	-0.0648	1.13246404489146e-07	1432953	1434970	8.33533939784183e-13	2301365	2302065
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.7279	8.33533939784183e-13	2301365	2302065	3.23722901593751e-12	2304398	2306110
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	383	-0.0812	3.23722901593751e-12	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	45842345	15814	15431	0.9196	0	2708113	2711273	0	45829751	45876199
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	45865368	46783144	334	324	1.4569	0	45829751	45876199	2.63061695820498e-14	46757262	46813018
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	46785368	47107293	135	133	1.6952	2.63061695820498e-14	46757262	46813018	5.45901789026419e-194	47104635	47110836
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47110836	48610083	514	494	0.8318	5.45901789026419e-194	47104635	47110836	4.92347801450799e-149	48590165	48629447
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48627006	48898806	125	123	1.6272	4.92347801450799e-149	48590165	48629447	6.88166999000535e-06	48870939	48908915
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48903520	48914867	8	8	1.0107	6.88166999000535e-06	48870939	48908915	1.65154906483935e-09	48905754	48917892
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48916477	49657299	238	228	1.656	1.65154906483935e-09	48905754	48917892	0.00819369606063876	49628961	49665739
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	49658514	49682008	18	18	1.4183	0.00819369606063876	49628961	49665739	8.31852962704088e-05	49665739	49693781
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	49682681	52076130	642	622	1.1019	8.31852962704088e-05	49665739	49693781	5.59561209007352e-37	51973541	52595630
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52085409	53729679	397	386	0.8701	5.59561209007352e-37	51973541	52595630	1.24445264404143e-41	53705251	53793588
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53731691	62418434	1016	998	1.112	1.24445264404143e-41	53705251	53793588	1.02467123952506e-142	62078907	62491276
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	62435471	76998610	3698	3609	0.8653	1.02467123952506e-142	62078907	62491276	6.16759252619866e-08	76992219	76998610
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.0214	6.16759252619866e-08	76992219	76998610	5.65661560239015e-40	77010018	77010018
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21649	0.8325	5.65661560239015e-40	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	199	-0.127	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	124	-3.1477	NA	NA	NA	1.69836574868675e-12	3772482	4174561
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-0.9496	1.69836574868675e-12	3772482	4174561	3.26457110328005e-06	5531459	6711090
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	113	-2.86	3.26457110328005e-06	5531459	6711090	0.00196814240138715	6872263	7030763
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7653082	216	207	-2.2896	0.00196814240138715	6872263	7030763	4.621543100462e-09	7630477	7659535
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-3.6742	4.621543100462e-09	7630477	7659535	2.0876741801297e-06	7702787	7733351
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8005148	88	86	-2.4933	2.0876741801297e-06	7702787	7733351	9.2488888975664e-06	7930528	8048263
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8178487	37	33	-3.6339	9.2488888975664e-06	7930528	8048263	3.79062037984001e-05	8158234	8178487
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8201959	8	8	-2.2408	3.79062037984001e-05	8158234	8178487	0.000271993189350776	8201959	8221620
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8204414	8280065	18	16	-3.5959	0.000271993189350776	8201959	8221620	0.00291667817097357	8241630	8327467
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8820252	160	151	-2.6339	0.00291667817097357	8241630	8327467	0.0085655509960165	8695195	8935134
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8823361	8823361	1	0	NA	0.0085655509960165	8695195	8935134	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8824539	9081196	48	47	-3.2147	NA	NA	NA	0.000875162407285106	8959151	9090839
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9087629	9132086	13	13	-4.4181	0.000875162407285106	8959151	9090839	1.8135200971797e-05	9128508	9164547
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9133230	10515697	84	81	-3.1211	1.8135200971797e-05	9128508	9164547	8.40374176039086e-23	10513747	10515697
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.4413	8.40374176039086e-23	10513747	10515697	3.59711639517872e-78	10645500	10645500
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	10655750	2	2	-4.1417	3.59711639517872e-78	10645500	10645500	3.88621017603759e-54	10655750	10655750
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11249952	12452734	5	5	-0.9461	3.88621017603759e-54	10655750	10655750	3.43034744135448e-31	12452734	12452734
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.9771	3.43034744135448e-31	12452734	12452734	5.09522388578591e-36	12541506	12541506
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12593244	26	24	-1.1204	5.09522388578591e-36	12541506	12541506	1.19303395825639e-08	12591908	12599162
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12594824	12611624	9	8	-2.9181	1.19303395825639e-08	12591908	12599162	0.000232352745984680	12607539	12615455
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	16	-1.2759	0.00023235274598468	12607539	12615455	6.13866181171585e-08	12658135	12700767
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-2.8276	6.13866181171585e-08	12658135	12700767	9.17673862989626e-07	12804329	12857197
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13048283	80	78	-1.6382	9.17673862989626e-07	12804329	12857197	1.33224325044091e-06	13040293	13048283
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13061201	7	7	-3.5793	1.33224325044091e-06	13040293	13048283	6.62056704650103e-07	13061201	13076862
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13062151	13128515	25	25	-1.6702	6.62056704650103e-07	13061201	13076862	5.31293485825259e-11	13119344	13133803
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13151875	12	12	-3.8378	5.31293485825259e-11	13119344	13133803	0.000563996978054419	13147329	13164641
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153117	13272362	37	37	-2.4344	0.000563996978054419	13147329	13164641	1.69329741141083e-05	13232295	13330707
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13279098	14342834	360	352	-3.2679	1.69329741141083e-05	13232295	13330707	1.84755771510363e-11	14266331	14375855
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	96	-2.4647	1.84755771510363e-11	14266331	14375855	0.000184483743756627	14489801	14538156
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14561228	19	19	-1.2991	0.000184483743756627	14489801	14538156	0.0407733361794117	14549297	14601309
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14563486	14681738	16	14	-2.5017	0.0407733361794117	14549297	14601309	0.0928595624418387	14572190	15025974
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14684159	15095427	88	86	-3.2103	0.0928595624418387	14572190	15025974	0.000201533587347320	14928703	15154705
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15099698	15279629	91	90	-2.5087	0.00020153358734732	14928703	15154705	2.11855349062582e-06	15253683	15310611
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15280555	15280555	1	0	NA	2.11855349062582e-06	15253683	15310611	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15282186	15433122	100	98	-3.3299	NA	NA	NA	6.21245799041528e-06	15427777	15433122
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.1233	6.21245799041528e-06	15427777	15433122	1.44753314060146e-06	15447091	15452656
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	30	-3.3561	1.44753314060146e-06	15447091	15452656	0.000217677201815253	15497443	15543194
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15587741	35	34	-2.1334	0.000217677201815253	15497443	15543194	2.79715404475308e-06	15563346	15626220
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15915466	54	53	-3.3788	2.79715404475308e-06	15563346	15626220	1.01865702830687e-06	15829553	15974702
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16228031	134	131	-2.469	1.01865702830687e-06	15829553	15974702	0.00648803588455861	16096672	16350833
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16229149	16387273	28	28	-3.0668	0.00648803588455861	16096672	16350833	0.0209807127615369	16268810	16526327
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16656177	38	36	-3.9111	0.0209807127615369	16268810	16526327	9.34621564397946e-05	16571246	16707690
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16659030	17487972	136	131	-3.0475	9.34621564397946e-05	16571246	16707690	2.05455182531077e-05	17440719	17503455
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17557953	12	12	-1.5733	2.05455182531077e-05	17440719	17503455	3.77657976674795e-05	17533546	17623295
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	22192409	766	748	-3.0895	3.77657976674795e-05	17533546	17623295	8.52812053290883e-05	22056953	22204143
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22200078	1	0	NA	8.52812053290883e-05	22056953	22204143	NA	NA	NA
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22202315	22249988	18	17	-4.3197	NA	NA	NA	8.02607570405742e-07	22243796	22268552
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22252446	22930737	69	68	-3.1296	8.02607570405742e-07	22243796	22268552	4.92721066197366e-39	22924754	26871442
MSK_252152914688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.0685	4.92721066197366e-39	22924754	26871442	NA	NA	NA
