Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27100	0.003	NA	NA	NA	4.33625398817062e-177	72537426	72537426
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72540240	2	2	-4.7524	4.33625398817062e-177	72537426	72537426	1.01161881509494e-12	72540240	72540240
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72541443	72579311	12	12	-2.8595	1.01161881509494e-12	72540240	72540240	0	72579311	72579311
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	157133150	20328	19779	-0.0095	0	72579311	72579311	7.26616623381448e-32	157133150	157133150
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.02	7.26616623381448e-32	157133150	157133150	1.50679838814979e-32	157136342	157136342
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	12923	-0.01	1.50679838814979e-32	157136342	157136342	3.34009082903037e-07	194972886	195011344
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195048208	7	7	-0.5328	3.34009082903037e-07	194972886	195011344	4.95153591735725e-07	195022854	195095156
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195062793	246479941	19398	18868	-0.0045	4.95153591735725e-07	195022854	195095156	2.62343164286351e-11	246463996	246501319
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246481598	246560663	30	30	0.3121	2.62343164286351e-11	246463996	246501319	0.000706324861024578	246537838	246612799
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246561864	246738832	48	47	0.0324	0.000706324861024578	246537838	246612799	1.81795848634977e-05	246676851	246794552
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246750352	246882156	38	37	0.3764	1.81795848634977e-05	246676851	246794552	5.05391189768528e-12	246860551	246907655
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246902260	247186514	93	92	0	5.05391189768528e-12	246860551	246907655	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10561	-0.0167	NA	NA	NA	1.56074306376614e-19	33076512	33076512
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.2334	1.56074306376614e-19	33076512	33076512	3.27131081749016e-14	33080437	33080437
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34551222	645	624	0.0221	3.27131081749016e-14	33080437	33080437	4.5703768630072e-17	34539740	34554208
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34595734	19	19	-0.4136	4.5703768630072e-17	34539740	34554208	1.4659476016146e-12	34589997	34602813
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34597294	35818921	481	467	0.0136	1.4659476016146e-12	34589997	34602813	4.14894839048141e-09	35812322	35818921
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35821494	35844884	3	3	0.9211	4.14894839048141e-09	35812322	35818921	5.18616991458853e-09	35844884	35851593
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37797909	880	852	-0.0106	5.18616991458853e-09	35844884	35851593	2.80715851225988e-15	37781427	37810001
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37800512	37855837	25	25	-0.432	2.80715851225988e-15	37781427	37810001	2.73274448058254e-18	37848754	37862351
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5641	0.0029	2.73274448058254e-18	37848754	37862351	8.48694859087179e-08	52588009	52600588
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52622353	4	4	0.7268	8.48694859087179e-08	52588009	52600588	4.814056719146e-08	52622353	52639605
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52635695	52635695	1	0	NA	4.814056719146e-08	52622353	52639605	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	110206301	16087	15635	-0.007	NA	NA	NA	3.02615532232755e-141	110202447	110206301
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	110210249	110340933	51	48	-0.8551	3.02615532232755e-141	110202447	110206301	9.52458561412387e-132	110340933	111108666
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	111108666	133781199	5949	5788	-0.0191	9.52458561412387e-132	110340933	111108666	1.46880662728788e-130	133779926	133784074
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	133784074	133872233	43	43	-0.9003	1.46880662728788e-130	133779926	133784074	9.8011952765893e-139	133870399	133873915
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	133873915	146571330	4207	4082	-0.0017	9.8011952765893e-139	133870399	133873915	0	146571330	146571330
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.5988	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	227561839	27013	26280	-0.0013	0	146592775	146592775	2.82011658423982e-15	227557984	227561839
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227562940	227567748	4	4	-0.9767	2.82011658423982e-15	227557984	227561839	2.14468908329574e-16	227567748	227569281
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227569281	227949124	185	184	0.0046	2.14468908329574e-16	227567748	227569281	3.14842394840285e-07	227941887	227952131
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227976902	11	10	0.428	3.14842394840285e-07	227941887	227952131	9.51169220835237e-07	227968956	228001864
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227981126	242689978	5536	5393	-0.0107	9.51169220835237e-07	227968956	228001864	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	12373	-0.0107	NA	NA	NA	1.18641579485144e-17	37951628	37954819
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.8756	1.18641579485144e-17	37951628	37954819	9.96686403557747e-17	37960019	37963014
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3449	-0.0214	9.96686403557747e-17	37960019	37963014	2.58326004582035e-12	47460892	47460892
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.2553	2.58326004582035e-12	47460892	47460892	7.41324535907397e-19	47466921	47466921
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	75474341	10655	10364	-0.01	7.41324535907397e-19	47466921	47466921	7.34107853825867e-19	75445864	75787094
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75479859	75875904	19	19	-0.4033	7.34107853825867e-19	75445864	75787094	4.15927821482538e-11	75868882	76032165
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	164005577	26597	25904	-0.0077	4.15927821482538e-11	75868882	76032165	1.70225738604135e-122	164005577	164005577
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.4587	1.70225738604135e-122	164005577	164005577	4.27023876100002e-84	164027724	164027724
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164101776	18	18	-0.4339	4.27023876100002e-84	164027724	164027724	1.56606500884670e-13	164083826	164112873
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164105613	194354505	10132	9854	0.0026	1.5660650088467e-13	164083826	164112873	0	194354505	194354505
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.666	0	194354505	194354505	5.38617310815047e-293	194366950	194366950
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	975	-0.0166	5.38617310815047e-293	194366950	194366950	1.90382932994653e-62	196820428	196822133
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.9268	1.90382932994653e-62	196820428	196822133	1.20577153491210e-68	196929826	196940125
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	936	0.0167	1.2057715349121e-68	196929826	196940125	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3296	-0.0158	NA	NA	NA	5.01981652736655e-209	9815760	9815760
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.6812	5.01981652736655e-209	9815760	9815760	8.93861589364062e-217	9842644	9842644
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	26563737	4811	4665	-0.0318	8.93861589364062e-217	9842644	9842644	2.31352135715896e-36	26563737	26563737
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26565071	26566345	2	2	-2.1819	2.31352135715896e-36	26563737	26563737	5.42777047498271e-38	26566345	26566345
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26568376	88752705	16822	16330	-0.0021	5.42777047498271e-38	26566345	26566345	9.53585231520224e-19	88752705	88752705
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.5459	9.53585231520224e-19	88752705	88752705	1.25186110770728e-18	88756721	88756721
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	173660684	24801	24152	-0.0012	1.25186110770728e-18	88756721	88756721	3.32210830670681e-16	173660684	173660684
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.4476	3.32210830670681e-16	173660684	173660684	1.53700101090757e-16	173666072	173666072
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3661	-0.0076	1.53700101090757e-16	173666072	173666072	3.80072057591509e-81	186676034	186676034
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.1279	3.80072057591509e-81	186676034	186676034	4.03561956161693e-76	186680176	186680176
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1505	-0.0331	4.03561956161693e-76	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	218	-0.0435	NA	NA	NA	2.07568680027755e-14	730853	737829
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	819038	5	5	-1.0504	2.07568680027755e-14	730853	737829	5.0455657703451e-21	819038	819038
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	829954	10757593	3063	2977	-0.0317	5.0455657703451e-21	819038	819038	2.38482335483300e-57	10750489	10765947
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	10760455	10760455	1	0	NA	2.384823354833e-57	10750489	10765947	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	10762097	11009019	63	61	0.4497	NA	NA	NA	6.58596905465557e-57	11004570	11014451
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	11011759	12857302	621	609	-0.0463	6.58596905465557e-57	11004570	11014451	2.67392417144439e-14	12857302	12857302
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.2871	2.67392417144439e-14	12857302	12857302	4.69412787756519e-13	12873052	12873052
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	107633150	25754	25090	-0.0049	4.69412787756519e-13	12873052	12873052	1.73524876414438e-08	107633150	107633150
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	107634848	107636275	2	2	-1.0663	1.73524876414438e-08	107633150	107633150	7.21350590458695e-09	107636275	107636275
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	107638762	125897035	5019	4874	-0.0035	7.21350590458695e-09	107636275	107636275	1.82810910925951e-07	125895069	125897035
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	125898636	125900019	2	2	0.9774	1.82810910925951e-07	125895069	125897035	1.38425118799493e-08	125900019	125900019
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	125902227	130613226	1431	1405	-0.0037	1.38425118799493e-08	125900019	125900019	1.83182639779438e-10	130596389	130619768
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130616373	130616373	1	0	NA	1.83182639779438e-10	130596389	130619768	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130618391	130656570	20	19	0.3479	NA	NA	NA	2.76682360945417e-09	130652439	130680467
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130657743	162777155	11632	11293	-0.0124	2.76682360945417e-09	130652439	130680467	7.6843234425623e-06	162771278	162779702
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	162779702	162791188	5	5	0.5568	7.6843234425623e-06	162771278	162779702	9.43239834761631e-06	162789527	162798656
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	162793209	178037603	4892	4762	-0.0021	9.43239834761631e-06	162789527	162798656	2.29613397926833e-14	178037603	178037603
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178040439	178045608	3	3	1.1073	2.29613397926833e-14	178037603	178037603	2.11998969536738e-11	178045608	178047480
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180644810	1028	996	0.0208	2.11998969536738e-11	178045608	178047480	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	55	-0.0405	NA	NA	NA	4.6421589761526e-25	236535	244363
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	44	-0.545	4.6421589761526e-25	236535	244363	4.15200244622945e-49	320854	329100
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	31457884	11099	10831	-0.0084	4.15200244622945e-49	320854	329100	1.63011290670871e-31	31454845	31468158
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31467551	31563829	30	30	0.5139	1.63011290670871e-31	31454845	31468158	2.52662067305214e-27	31558079	31583170
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31564655	32558677	447	432	0.0093	2.52662067305214e-27	31558079	31583170	1.35729378522639e-20	32548736	32558677
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	0.9011	1.35729378522639e-20	32548736	32558677	3.73325257609583e-05	32595402	32600962
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32626619	6	6	-0.147	3.73325257609583e-05	32595402	32600962	0.0425457564570201	32600962	32650672
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32628420	32731072	41	41	0.2369	0.0425457564570201	32600962	32650672	1.33717233288269e-08	32713363	32762061
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32732764	79028813	14695	14308	-0.002	1.33717233288269e-08	32713363	32762061	3.92816898920114e-09	79011979	79035891
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79032059	79085247	10	10	-0.4986	3.92816898920114e-09	79011979	79035891	3.56035766812037e-09	79074911	79101978
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79091850	165643653	27873	27163	-0.004	3.56035766812037e-09	79074911	79101978	2.90243027074457e-09	165642393	165643653
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	0.9028	2.90243027074457e-09	165642393	165643653	1.69091516582734e-09	165649379	165650610
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	166414597	297	287	-0.0441	1.69091516582734e-09	165649379	165650610	5.00307316132999e-08	166412402	166414597
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166418511	166422386	3	3	-0.9173	5.00307316132999e-08	166412402	166414597	2.14596286104828e-08	166422386	166425475
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166425475	170753106	1505	1463	-0.0426	2.14596286104828e-08	166422386	166425475	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	250	0.0065	NA	NA	NA	7.7225248735471e-11	1033418	1036135
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-1.2173	7.7225248735471e-11	1033418	1036135	4.99868512296169e-13	1038517	1038517
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1939961	327	320	0.0253	4.99868512296169e-13	1038517	1038517	1.31537866316934e-09	1935649	1946465
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1943492	1951564	4	4	-0.7474	1.31537866316934e-09	1935649	1946465	4.60826789885122e-09	1946465	1953528
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1953528	4117614	908	886	0.0173	4.60826789885122e-09	1946465	1953528	2.02370874153247e-06	4112129	4125718
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	4119679	4130894	7	7	-0.4732	2.02370874153247e-06	4112129	4125718	1.93814877986990e-06	4123161	4137289
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	4133382	8790893	1654	1607	0.0255	1.9381487798699e-06	4123161	4137289	4.51893465385681e-13	8786329	8790893
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8793843	8838768	6	6	-0.7274	4.51893465385681e-13	8786329	8790893	2.14542782218413e-13	8838768	8854232
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8843417	14346011	1525	1479	0.0045	2.14542782218413e-13	8838768	8854232	1.22715604953063e-09	14344640	14346011
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	14347947	14351507	3	3	-0.8786	1.22715604953063e-09	14344640	14346011	7.09491378342854e-12	14351507	14352748
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	14352748	64523575	14868	14465	-0.01	7.09491378342854e-12	14351507	14352748	1.99135698923078e-24	64523575	64523575
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.7921	1.99135698923078e-24	64523575	64523575	2.46462980156165e-26	64532949	64532949
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	100164752	11498	11187	0.0135	2.46462980156165e-26	64532949	64532949	1.03300397494247e-11	100162851	100164752
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.8528	1.03300397494247e-11	100162851	100164752	8.51268581615748e-11	100174991	100178968
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	120865378	9176	8907	0.0017	8.51268581615748e-11	100174991	100178968	1.54986649081141e-11	120865378	120868807
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120868807	120872125	3	3	-1.0173	1.54986649081141e-11	120865378	120868807	1.12199956760227e-11	120870445	120872125
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120874365	141409512	9557	9308	0.003	1.12199956760227e-11	120870445	120872125	2.46828796012411e-08	141398471	141414719
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141440184	15	14	0.4063	2.46828796012411e-08	141398471	141414719	1.11437616890250e-10	141435643	141446728
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	114	-0.0081	1.1143761689025e-10	141435643	141446728	3.35075534828468e-231	141690753	141690753
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	-3.5831	3.35075534828468e-231	141690753	141690753	0.0135819560777939	141706426	141711513
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141714168	2	2	-1.413	0.0135819560777939	141706426	141711513	4.52660650591605e-13	141714168	141714168
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142526341	323	320	-0.0155	4.52660650591605e-13	141714168	141714168	2.84490204247792e-69	142526254	142535936
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142535936	142602080	33	33	-0.8014	2.84490204247792e-69	142526254	142535936	8.27346468986632e-74	142600731	142605735
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142605735	158821263	6396	6235	-0.0155	8.27346468986632e-74	142600731	142605735	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	6926661	2391	2328	-0.0204	NA	NA	NA	2.90602967719333e-27	6909487	7260442
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7156900	1	0	NA	2.90602967719333e-27	6909487	7260442	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-0.8843	NA	NA	NA	8.6435892399908e-27	7729311	8137794
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	39350798	10673	10359	-0.0062	8.6435892399908e-27	7729311	8137794	0	39350798	39352361
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-3.3359	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	426	-0.0064	0	39504332	39505256	4.90779413536975e-12	40892587	40892587
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.204	4.90779413536975e-12	40892587	40892587	2.75873022198651e-11	40897469	40897469
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	40904488	1	0	NA	2.75873022198651e-11	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40911342	51191560	1735	1693	-7e-04	NA	NA	NA	1.56970821175259e-08	51189068	51191560
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	1.56970821175259e-08	51189068	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-0.8625	NA	NA	NA	1.37289246644449e-08	51200291	51204788
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	1.37289246644449e-08	51200291	51204788	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	58076960	2117	2039	-0.0157	NA	NA	NA	9.62786950210387e-15	58073413	58076960
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58081956	58092483	6	6	-0.7909	9.62786950210387e-15	58073413	58076960	2.01410991106141e-14	58092483	58100753
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58100753	115701209	17431	16958	-0.0065	2.01410991106141e-14	58092483	58100753	9.5743198924773e-09	115695036	115701209
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115718942	3	3	-0.8863	9.5743198924773e-09	115695036	115701209	2.55746578639388e-08	115718942	115725316
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115725316	142329141	8307	8062	-0.0311	2.55746578639388e-08	115718942	115725316	1.62797371439434e-24	142329141	142329141
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142331353	142332708	2	2	-1.7826	1.62797371439434e-24	142329141	142329141	1.64009548546335e-19	142332708	142332708
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142334063	146253929	1382	1340	-0.0274	1.64009548546335e-19	142332708	142332708	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146264846	146264846	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	2135333	759	740	4e-04	NA	NA	NA	1.10870938948465e-11	2135333	2135333
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2138129	2139868	2	2	-1.1567	1.10870938948465e-11	2135333	2135333	2.74907067846407e-10	2139868	2139868
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2143843	22477358	7075	6877	-0.0046	2.74907067846407e-10	2139868	2139868	6.47379514605759e-19	22477358	22477358
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-1.5475	6.47379514605759e-19	22477358	22477358	2.00648656469044e-18	22492603	22492603
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5083	-0.0085	2.00648656469044e-18	22492603	22492603	3.08389345350569e-24	70926188	70926188
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.7456	3.08389345350569e-24	70926188	70926188	5.78865359721971e-24	70930528	70930528
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	128667210	20163	19608	-0.0123	5.78865359721971e-24	70930528	70930528	2.78173946691257e-11	128657974	128671886
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128668707	128668707	1	0	NA	2.78173946691257e-11	128657974	128671886	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128669934	128710906	18	17	0.4098	NA	NA	NA	9.51471974732758e-12	128699467	128721390
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128712043	137352394	3583	3479	0.0227	9.51471974732758e-12	128699467	128721390	1.81459741450176e-11	137352394	137352394
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.3155	1.81459741450176e-11	137352394	137352394	6.33252491702102e-10	137356880	137356880
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1068	0.0112	6.33252491702102e-10	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	1959682	778	757	-0.0479	NA	NA	NA	7.14451474233644e-06	1957678	1959682
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	1965382	1971778	2	2	-0.9446	7.14451474233644e-06	1957678	1959682	7.7554069666961e-08	1971778	1975245
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	1975245	13553503	3902	3804	-0.0029	7.7554069666961e-08	1971778	1975245	6.72712234887418e-11	13551930	13555034
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13559717	4	4	-0.8473	6.72712234887418e-11	13551930	13555034	2.34348557644008e-11	13557998	13562421
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13562421	27038538	5043	4899	0.0081	2.34348557644008e-11	13557998	13562421	6.61767111469489e-26	27038538	27038538
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.8067	6.61767111469489e-26	27038538	27038538	4.01076131820912e-25	27041812	27041812
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	114100979	27256	26513	-0.0059	4.01076131820912e-25	27041812	27041812	2.58673293826352e-12	114100979	114100979
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-1.2998	2.58673293826352e-12	114100979	114100979	5.3174966408819e-12	114106460	114106460
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7579	-0.0101	5.3174966408819e-12	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1727	-0.021	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.5886	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	14685	-0.012	0	4932214	4932214	2.89425204657383e-25	55097753	55127355
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.4223	2.89425204657383e-25	55097753	55127355	4.83124782330727e-26	55203706	55223056
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	106733851	18038	17536	-0.004	4.83124782330727e-26	55203706	55223056	5.16870394845164e-08	106730906	106733851
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	0.6704	5.16870394845164e-08	106730906	106733851	4.32485064167247e-06	106747920	106756347
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	107284914	243	235	0.046	4.32485064167247e-06	106747920	106756347	4.30998804766299e-30	107284914	107284914
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-2.2727	4.30998804766299e-30	107284914	107284914	1.14463221885632e-39	107292148	107292148
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	132495973	9329	9093	-0.0212	1.14463221885632e-39	107292148	107292148	2.09487343689799e-09	132494505	132497427
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	132497427	132509061	6	5	-0.7304	2.09487343689799e-09	132494505	132497427	8.35238784439532e-09	132506858	132511062
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	132511062	134450318	738	718	-0.0604	8.35238784439532e-09	132506858	132511062	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	736988	295	288	-0.0215	NA	NA	NA	3.10954817205038e-05	730254	736988
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.6323	3.10954817205038e-05	730254	736988	6.8223418629592e-07	743223	747365
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	2109441	620	601	0.0224	6.8223418629592e-07	743223	747365	3.49696189918545e-17	2106791	2109441
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.7495	3.49696189918545e-17	2106791	2109441	4.06544634170743e-15	2127537	2128807
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	9523923	2815	2724	-0.0066	4.06544634170743e-15	2127537	2128807	4.84929524874261e-44	9516067	9543817
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9607363	15	15	0.8564	4.84929524874261e-44	9516067	9543817	7.77800701549935e-35	9590351	9610054
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	11109483	569	550	0.0138	7.77800701549935e-35	9590351	9610054	3.18637366884834e-31	11109483	11110735
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11140421	10	10	0.9642	3.18637366884834e-31	11109483	11110735	4.00030499713592e-37	11130871	11140421
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	123370406	37781	36811	0.0041	4.00030499713592e-37	11130871	11140421	3.37999784510684e-14	123370406	123370406
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123373377	123374891	2	2	-1.1558	3.37999784510684e-14	123370406	123370406	2.59689239351051e-09	123374891	123378252
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123378252	130943064	2490	2421	-0.031	2.59689239351051e-09	123374891	123378252	1.35012213359587e-17	130943064	130943064
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.4954	1.35012213359587e-17	130943064	130943064	1.0336135492493e-14	130946248	130946248
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	535	-0.0043	1.0336135492493e-14	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7153	-0.0052	NA	NA	NA	1.68511388745593e-88	37953582	37953582
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.3018	1.68511388745593e-88	37953582	37953582	1.58458652806283e-90	37957844	37957844
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	68142120	9394	9136	-0.0049	1.58458652806283e-90	37957844	37957844	8.82290466415555e-09	68134536	68144264
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	10	0.4724	8.82290466415555e-09	68134536	68144264	2.21402315340758e-08	68161714	68169957
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	71375082	919	901	0.0076	2.21402315340758e-08	68161714	68169957	1.09483142755796e-18	71375082	71375082
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-1.5493	1.09483142755796e-18	71375082	71375082	1.13980158545131e-19	71377671	71377671
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	94781365	6760	6576	-0.0063	1.13980158545131e-19	71377671	71377671	1.42794649624293e-17	94780063	94784345
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	94784345	94795044	7	6	-0.8481	1.42794649624293e-17	94780063	94784345	8.43031658554588e-16	94792969	94798959
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	94798959	97327189	1049	1020	-0.0359	8.43031658554588e-16	94792969	94798959	1.41518968470192e-07	97321844	97327189
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97329413	97330568	2	2	-1.0203	1.41518968470192e-07	97321844	97327189	1.1833883237332e-11	97330568	97331794
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97331794	113788788	6009	5826	-0.0185	1.1833883237332e-11	97330568	97331794	1.29174840881814e-12	113787620	113788788
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.0292	1.29174840881814e-12	113787620	113788788	9.57062149417393e-06	113792974	113794669
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	145	-0.0053	9.57062149417393e-06	113792974	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18864561	8	8	0.3108	NA	NA	NA	3.88740997241948e-28	18544772	18864561
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19271102	19494416	52	50	-0.7201	3.88740997241948e-28	18544772	18864561	3.37327996496286e-105	19492531	19497023
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	69086125	17568	17069	0.0047	3.37327996496286e-105	19492531	19497023	5.72049320302372e-08	69084841	69086125
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-0.848	5.72049320302372e-08	69084841	69086125	8.57407649884464e-08	69092211	69093444
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	105606424	14013	13645	-0.0041	8.57407649884464e-08	69092211	69093444	5.56358887290595e-13	105597555	105606424
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105607572	105673157	11	11	-0.5621	5.56358887290595e-13	105597555	105606424	1.19095226602419e-07	105673157	105724133
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105681007	106218059	178	175	-0.0656	1.19095226602419e-07	105673157	105724133	1.34247782548821e-05	106195565	106223137
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106255190	17	16	-0.423	1.34247782548821e-05	106195565	106223137	1.02632134391583e-08	106252126	106269543
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	34	-0.0424	1.02632134391583e-08	106252126	106269543	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1174	NA	NA	NA	0.000145433382484467	18427151	18741716
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19465359	93	90	-0.4711	0.000145433382484467	18427151	18741716	8.90662752364618e-08	19391934	19844217
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	55	-0.7464	8.90662752364618e-08	19391934	19844217	1.81186721954338e-109	20079935	20308014
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32517839	3673	3570	-0.0196	1.81186721954338e-109	20079935	20308014	6.1993673412e-40	32514939	32523241
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32520164	32594200	23	23	-0.6986	6.1993673412e-40	32514939	32523241	4.99369330834235e-43	32581730	32661846
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	74669752	17859	17376	-4e-04	4.99369330834235e-43	32581730	32661846	5.11510470676596e-19	74669752	74669752
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.1253	5.11510470676596e-19	74669752	74669752	2.13357573519757e-20	74680439	74680439
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	164	0.0148	2.13357573519757e-20	74680439	74680439	1.71393427929631e-23	75115806	75115806
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.6792	1.71393427929631e-23	75115806	75115806	1.44532403711658e-21	75119713	75119713
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9168	-0.0144	1.44532403711658e-21	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	17905421	6210	6037	0.0107	NA	NA	NA	9.87727892132727e-27	17872668	17919903
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	17914977	18069609	40	40	0.4311	9.87727892132727e-27	17872668	17919903	8.23371934121482e-28	18061432	18539669
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	18072714	28523145	3366	3268	0.0057	8.23371934121482e-28	18061432	18539669	4.78401788926283e-19	28523145	28523145
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28525086	28529948	3	3	-1.2813	4.78401788926283e-19	28523145	28523145	2.11950120342741e-19	28529948	28529948
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	57201427	5289	5139	0.0036	2.11950120342741e-19	28529948	28529948	3.48679083968625e-12	57201427	57201427
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57203733	57203733	1	0	NA	3.48679083968625e-12	57201427	57201427	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.2619	NA	NA	NA	2.79239884257267e-12	57206772	57206772
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5460	0.0066	2.79239884257267e-12	57206772	57206772	3.10210146099891e-68	75093957	75093957
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.364	3.10210146099891e-68	75093957	75093957	5.05027263357551e-67	75100865	75100865
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	592	-0.0288	5.05027263357551e-67	75100865	75100865	5.43579877538714e-34	76925748	76929598
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.9834	5.43579877538714e-34	76925748	76929598	5.40920728921175e-29	76938723	76942679
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4374	-0.0046	5.40920728921175e-29	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1903358	853	824	0.0214	NA	NA	NA	1.04994485424938e-11	1902148	1903358
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1906391	4	4	0.9338	1.04994485424938e-11	1902148	1903358	3.86113264853111e-13	1906391	1909371
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	31443186	11177	10859	0.0086	3.86113264853111e-13	1906391	1909371	1.06144854843333e-09	31426427	31461588
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31447686	31503774	22	20	-0.3197	1.06144854843333e-09	31426427	31461588	3.36117317672713e-09	31492553	31898606
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	357	0.0355	3.36117317672713e-09	31492553	31898606	2.53796234921505e-150	32828797	32828797
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.3328	2.53796234921505e-150	32828797	32828797	2.29593354412341e-156	32832642	32832642
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1399	0.0423	2.29593354412341e-156	32832642	32832642	5.8407987392841e-176	36673853	36673853
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-2.6946	5.8407987392841e-176	36673853	36673853	1.4958688783402e-170	36684619	36684619
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40869151	1806	1761	0.0345	1.4958688783402e-170	36684619	36684619	7.48379571752861e-07	40866844	40869151
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41011530	3	3	0.8226	7.48379571752861e-07	40866844	40869151	7.76599970535703e-10	41011530	41015177
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41015177	41519702	202	195	0.0069	7.76599970535703e-10	41011530	41015177	4.79630895031221e-95	41518222	41519702
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	0.9807	4.79630895031221e-95	41518222	41519702	2.56905481016359e-15	41562786	41572001
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41700762	41	41	0.4928	2.56905481016359e-15	41562786	41572001	0.00169020312128932	41652861	41702238
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41702238	41706870	3	3	1.0879	0.00169020312128932	41652861	41702238	2.58835936522873e-14	41704093	41706870
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41708551	70050770	10067	9781	0.017	2.58835936522873e-14	41704093	41706870	5.41343307394314e-11	70050770	70050770
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	70053165	70054702	2	2	-1.1844	5.41343307394314e-11	70050770	70050770	1.20766310253338e-10	70054702	70054702
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	70057681	72776416	1245	1216	0.0386	1.20766310253338e-10	70054702	70054702	1.00447344030439e-08	72776416	72776416
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72778317	72780121	2	2	-1.0721	1.00447344030439e-08	72776416	72776416	1.20041849968457e-07	72780121	72785841
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72785841	77535412	1868	1823	0.0318	1.20041849968457e-07	72780121	72785841	2.10584452590177e-07	77535412	77535412
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	77537639	77538800	2	2	-1.055	2.10584452590177e-07	77535412	77535412	7.93913333547846e-08	77538800	77538800
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	77540429	78653545	495	477	0.0325	7.93913333547846e-08	77538800	77538800	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22345	-0.0141	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	482	0.016	NA	NA	NA	4.90270697040783e-29	1398325	1398325
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.221	4.90270697040783e-29	1398325	1398325	2.12604686125178e-28	1400840	1400840
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1018	0.0648	2.12604686125178e-28	1400840	1400840	2.32960431035332e-19	3591120	3591120
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.7197	2.32960431035332e-19	3591120	3591120	3.64895926461553e-22	3593646	3593646
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	8348739	2195	2120	0.0445	3.64895926461553e-22	3593646	3593646	3.34692420392719e-08	8341611	8363157
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8360218	8368505	7	7	0.6301	3.34692420392719e-08	8341611	8363157	8.09842003795154e-09	8365923	8373338
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8368891	56823430	16133	15679	0.0344	8.09842003795154e-09	8365923	8373338	8.91034638246537e-16	56822197	56823430
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.6963	8.91034638246537e-16	56822197	56823430	2.16807177653369e-14	56840346	56842447
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58212113	587	570	0.0207	2.16807177653369e-14	56840346	56842447	2.72795129908197e-29	58208527	58213220
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58213220	58244012	14	14	0.7932	2.72795129908197e-29	58208527	58213220	6.36951108123723e-31	58239871	58247367
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59664725	693	669	0.0198	6.36951108123723e-31	58239871	58247367	4.09747044857608e-12	59664725	59664725
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59666884	59667973	2	2	-1.2607	4.09747044857608e-12	59664725	59664725	1.59996754722562e-12	59667973	59667973
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59669062	63788698	1882	1837	0.0171	1.59996754722562e-12	59667973	59667973	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	569	-0.0024	NA	NA	NA	9.17511718182391e-21	1499421	1515948
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.746	9.17511718182391e-21	1499421	1515948	8.82136684195347e-23	1528899	1544485
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	14994533	4718	4591	-0.007	8.82136684195347e-23	1528899	1544485	1.26102277464575e-139	14993158	14994533
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14996712	15091767	46	45	-0.8779	1.26102277464575e-139	14993158	14994533	5.93582743686476e-134	15091767	15093760
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15093760	52081719	12482	12134	-0.0067	5.93582743686476e-134	15091767	15093760	2.06210851450052e-10	52080395	52081719
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52086193	52090393	4	4	-0.8473	2.06210851450052e-10	52080395	52081719	9.4273235311085e-10	52090393	52092989
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62069950	3591	3495	-0.0168	9.4273235311085e-10	52090393	52092989	7.92547913760774e-12	62069950	62069950
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62070900	62072374	2	2	1.2718	7.92547913760774e-12	62069950	62069950	2.91242675167595e-10	62072374	62072374
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62073952	62419534	140	135	0.0363	2.91242675167595e-10	62072374	62072374	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22573420	3063	2983	0.0053	NA	NA	NA	2.78273262875647e-08	22564705	22573420
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-0.8345	2.78273262875647e-08	22564705	22573420	2.74401276195761e-07	22585040	22589739
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	46369875	10103	9842	-0.0077	2.74401276195761e-07	22585040	22589739	9.9041409897317e-08	46367102	46369875
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	46372167	46375024	2	2	-1.0478	9.9041409897317e-08	46367102	46369875	1.40663497996986e-06	46375024	46377504
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	46377504	46922972	270	262	0.0251	1.40663497996986e-06	46375024	46377504	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22354945	2849	2759	0.0065	NA	NA	NA	2.85796959129426e-20	22354945	22354945
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22356179	22357051	2	2	-1.7303	2.85796959129426e-20	22354945	22354945	5.35947059616477e-20	22357051	22357051
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22358386	22667608	132	126	0.0161	5.35947059616477e-20	22357051	22357051	3.56911318565992e-10	22603134	22677959
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.4113	3.56911318565992e-10	22603134	22677959	2.83508457595074e-13	22720195	22739574
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	23890085	556	542	0.0231	2.83508457595074e-13	22720195	22739574	8.7721085444128e-06	23872260	23906567
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23891201	23928420	22	21	-0.2407	8.7721085444128e-06	23872260	23906567	0.0042167580207245	23910525	23938206
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23930180	23991961	24	23	0.0123	0.0042167580207245	23910525	23938206	1.85199596932312e-14	23974713	24002585
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23994618	24241592	90	88	0.4563	1.85199596932312e-14	23974713	24002585	7.01092142263314e-71	24235777	24255714
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24249014	35472378	5855	5665	-0.0034	7.01092142263314e-71	24235777	24255714	1.01984525757516e-74	35472378	35472378
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.1106	1.01984525757516e-74	35472378	35472378	1.60749339428205e-82	35476942	35476942
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36658886	671	652	4e-04	1.60749339428205e-82	35476942	35476942	9.8895540195832e-11	36656080	36658886
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36662896	36672973	7	7	0.6089	9.8895540195832e-11	36656080	36658886	2.79262346509549e-12	36672973	36677306
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36675733	49571068	6325	6127	0.0087	2.79262346509549e-12	36672973	36677306	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	-0.0587	NA	NA	NA	6.38339705071421e-09	124528	127113
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-1.18	6.38339705071421e-09	124528	127113	5.10475767773235e-10	127779	130528
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	222034	48	47	-0.144	5.10475767773235e-10	127779	130528	8.04372086118523e-10	222004	222034
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	223009	224571	2	2	-1.3801	8.04372086118523e-10	222004	222034	2.25599407647439e-15	224571	224571
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	225591	1144723	575	559	0.0232	2.25599407647439e-15	224571	224571	2.08715905285134e-18	1144723	1144723
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1147562	1149136	3	3	-1.2269	2.08715905285134e-18	1144723	1144723	1.05397607612783e-13	1149136	1149136
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1150501	1427392	125	124	-0.006	1.05397607612783e-13	1149136	1149136	1.58534032564504e-08	1427338	1431240
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.8613	1.58534032564504e-08	1427338	1431240	2.07425652418527e-08	1432891	1434970
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	595	0.0055	2.07425652418527e-08	1432891	1434970	1.64508135326942e-10	2301365	2302065
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.9667	1.64508135326942e-10	2301365	2302065	2.30991599121657e-14	2304398	2306110
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	379	-0.0355	2.30991599121657e-14	2304398	2306110	0	2708291	2711273
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22277	0.9621	0	2708291	2711273	6.15781365863592e-22	76998610	76998610
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.807	6.15781365863592e-22	76998610	76998610	3.74119319224801e-20	77010018	77010018
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	140176737	17913	17415	0.9656	3.74119319224801e-20	77010018	77010018	6.60032364604943e-81	140142655	140181699
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140180757	140589242	108	103	1.4732	6.60032364604943e-81	140142655	140181699	4.56774310054809e-85	140581752	140618379
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140591773	140591773	1	0	NA	4.56774310054809e-85	140581752	140618379	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140616903	152821848	3569	3471	0.9275	NA	NA	NA	1.05996254511013e-20	152809182	152837176
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152823858	152881576	30	29	0.4974	1.05996254511013e-20	152809182	152837176	1.58219539743055e-11	152871621	152890262
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152882759	154582414	572	553	0.9224	1.58219539743055e-11	152871621	152890262	0	154578922	154582414
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	198	-0.0416	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	125	-3.1936	NA	NA	NA	3.82007503184918e-11	3773948	4413507
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	10	-0.9146	3.82007503184918e-11	3773948	4413507	4.2422428145393e-06	5422507	6696721
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	168	-2.9076	4.2422428145393e-06	5422507	6696721	0.000450488623282474	6998513	7256919
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7485594	126	123	-2.2435	0.000450488623282474	6998513	7256919	1.9780070597747e-05	7340782	7606496
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7722458	76	73	-3.1514	1.9780070597747e-05	7340782	7606496	2.04970671459282e-06	7693408	7745143
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7914104	59	57	-2.2398	2.04970671459282e-06	7693408	7745143	3.37706231412238e-06	7852359	8057124
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10473791	377	361	-3.0155	3.37706231412238e-06	7852359	8057124	0.26146422975097	9081196	10511255
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10475426	10515697	13	12	-2.3957	0.26146422975097	9081196	10511255	1.91912826156087e-09	10506718	10515697
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	11	-0.3236	1.91912826156087e-09	10506718	10515697	4.1295996055901e-76	10645500	10645500
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	10655750	2	2	-3.8607	4.1295996055901e-76	10645500	10645500	8.93496975335646e-15	10655750	10655750
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11249952	11698871	4	4	-1.1334	8.93496975335646e-15	10655750	10655750	2.90893581512241e-17	11698871	11698871
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12537944	11	10	-4.022	2.90893581512241e-17	11698871	11698871	1.21090645886283e-08	12537944	12545716
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	52	-1.7885	1.21090645886283e-08	12537944	12545716	5.49617100155708e-09	12649357	12687167
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.3791	5.49617100155708e-09	12649357	12687167	2.22038962395204e-07	12820920	12859309
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	110	-1.9335	2.22038962395204e-07	12820920	12859309	4.74676215197975e-26	13101234	13148290
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13129843	1	0	NA	4.74676215197975e-26	13101234	13148290	NA	NA	NA
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	393	-3.1416	NA	NA	NA	1.58779715215933e-12	14266331	14385580
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14697315	143	138	-2.3675	1.58779715215933e-12	14266331	14385580	2.15693064038566e-08	14601309	14702545
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14698076	14875973	44	44	-3.4731	2.15693064038566e-08	14601309	14702545	0.000769516319267581	14808210	15118268
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14883615	15284717	129	123	-2.7268	0.000769516319267581	14808210	15118268	0.000106856483036526	15206674	15312994
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15433122	97	97	-3.3509	0.000106856483036526	15206674	15312994	7.11136095958976e-06	15427777	15433122
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.6014	7.11136095958976e-06	15427777	15433122	6.20729564369587e-08	15447091	15452656
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15473709	19	19	-3.6637	6.20729564369587e-08	15447091	15452656	1.11395512905195e-06	15470132	15473709
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15475310	15501930	6	6	-1.7446	1.11395512905195e-06	15470132	15473709	2.60094963572037e-13	15501930	15501930
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15514330	15523178	6	6	-3.9193	2.60094963572037e-13	15501930	15501930	1.04758929504368e-13	15523178	15524675
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15542314	11	11	-1.2153	1.04758929504368e-13	15523178	15524675	2.25634660529642e-07	15540379	15549637
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15543194	15915466	78	75	-3.2219	2.25634660529642e-07	15540379	15549637	2.71175549259180e-05	15743117	15977755
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16206224	123	121	-2.4821	2.7117554925918e-05	15743117	15977755	1.50784677899518e-07	16172539	16399608
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16212418	22930737	1079	1053	-3.0791	1.50784677899518e-07	16172539	16399608	4.02550144437823e-57	22923722	26871442
MSK_252152914740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	82	-1.1534	4.02550144437823e-57	22923722	26871442	NA	NA	NA
