Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72533804	27890	27288	0.0037	NA	NA	NA	1.71354121358209e-195	72533804	72533804
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72533856	72536231	3	3	-3.0955	1.71354121358209e-195	72533804	72533804	4.81247768476633e-75	72536231	72536231
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72537426	1	0	NA	4.81247768476633e-75	72536231	72536231	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.4032	NA	NA	NA	4.62167295210985e-187	72579311	72579311
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11428	-0.015	4.62167295210985e-187	72579311	72579311	1.1368702532958e-12	109987341	109987341
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	0.9526	1.1368702532958e-12	109987341	109987341	6.59066843445545e-05	109989998	109989998
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110023268	13	13	0.0347	6.59066843445545e-05	109989998	109989998	6.48047792600654e-08	110023268	110023268
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-0.6833	6.48047792600654e-08	110023268	110023268	1.07028321316436e-11	110041712	110058441
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	145210914	4266	4170	-0.0158	1.07028321316436e-11	110041712	110058441	1.12337620211415e-07	145209321	145210914
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145212735	145214357	2	2	-0.7885	1.12337620211415e-07	145209321	145210914	2.11878321186269e-08	145214357	145214357
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145215629	147306304	288	283	-0.0084	2.11878321186269e-08	145214357	145214357	1.55602791562569e-70	147203277	147313991
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	34	0.644	1.55602791562569e-70	147203277	147313991	4.37211683833162e-92	147490608	147644831
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150823073	1259	1225	-0.0052	4.37211683833162e-92	147490608	147644831	4.31134033327036e-278	150823073	150836481
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.1803	4.31134033327036e-278	150823073	150836481	1.86979225321028e-271	150848509	150851439
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2720	-0.0038	1.86979225321028e-271	150848509	150851439	1.30788380554789e-33	157133150	157133150
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.6063	1.30788380554789e-33	157133150	157133150	8.20450477727122e-37	157136342	157136342
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4030	-0.0148	8.20450477727122e-37	157136342	157136342	5.5104742656493e-13	167479184	167495719
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167523140	10	10	-0.4525	5.5104742656493e-13	167479184	167495719	4.96012309844698e-13	167507882	167529221
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167525669	200598243	11345	11120	-0.0109	4.96012309844698e-13	167507882	167529221	1.94747389598589e-21	200589108	200620756
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200801004	40	38	-0.2991	1.94747389598589e-21	200589108	200620756	7.64308428304437e-22	200678532	200808717
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200802204	227875096	9923	9725	-0.0078	7.64308428304437e-22	200678532	200808717	1.89908670199362e-09	227872808	227875096
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-0.7014	1.89908670199362e-09	227872808	227875096	1.95490348515735e-11	227882805	227889619
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246769018	7355	7214	-0.0011	1.95490348515735e-11	227882805	227889619	2.54224951778e-29	246751473	246811355
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246882156	32	32	0.3314	2.54224951778e-29	246751473	246811355	1.57021505860961e-16	246863179	246906110
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246902260	247186514	93	91	-0.0029	1.57021505860961e-16	246863179	246906110	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34551222	11523	11280	0.002	NA	NA	NA	1.06931066811422e-29	34543992	34554208
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34591681	18	18	-0.4927	1.06931066811422e-29	34543992	34554208	1.30660388307043e-31	34583814	34595734
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	37789939	1363	1333	-3e-04	1.30660388307043e-31	34583814	34595734	5.6633741514556e-27	37781427	37810001
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.3757	5.6633741514556e-27	37781427	37810001	9.4186100988603e-25	37847519	37859985
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	154601442	34350	33675	-0.0064	9.4186100988603e-25	37847519	37859985	1.40257079277438e-10	154601442	154601442
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	0.9044	1.40257079277438e-10	154601442	154601442	2.70199977950194e-11	154606943	154606943
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	154608095	1	0	NA	2.70199977950194e-11	154606943	154606943	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154611228	212890878	19851	19439	-0.0121	NA	NA	NA	6.75389458626618e-24	212890878	212890878
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-0.9364	6.75389458626618e-24	212890878	212890878	9.83426035303748e-23	212898875	212898875
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242495169	10619	10398	0.0014	9.83426035303748e-23	212898875	212898875	4.5091560187952e-18	242484747	242514593
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242496751	242624507	47	44	0.255	4.5091560187952e-18	242484747	242514593	0.000292322484451112	242582853	242634956
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242625709	242689978	22	21	0.0439	0.000292322484451112	242582853	242634956	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	28932297	9773	9568	-0.0108	NA	NA	NA	1.22871208538297e-40	28932297	28932297
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	28942430	28972234	8	7	-0.9352	1.22871208538297e-40	28932297	28932297	2.48098472548094e-40	28972234	28972234
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	28988652	65160634	13729	13421	-0.0033	2.48098472548094e-40	28972234	28972234	5.25401094031315e-11	65160634	65160634
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-0.9372	5.25401094031315e-11	65160634	65160634	5.29787643931027e-12	65184180	65184180
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	89747986	7230	7089	-0.009	5.29787643931027e-12	65184180	65184180	4.39771002283695e-11	89747986	89747986
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89754033	89757490	2	2	-0.9029	4.39771002283695e-11	89747986	89747986	2.21512551364179e-10	89757490	89757490
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89768924	129879782	11661	11434	-0.0117	2.21512551364179e-10	89757490	89757490	9.93037298492824e-15	129879782	129879782
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129881281	129887890	4	4	0.7316	9.93037298492824e-15	129879782	129879782	1.32663050966139e-14	129887890	129887890
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129899070	133189686	1300	1280	-0.013	1.32663050966139e-14	129887890	129887890	2.08472472670972e-29	133189686	133189686
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.4636	2.08472472670972e-29	133189686	133189686	3.14535048036767e-29	133194685	133194685
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164027724	9785	9608	-0.0105	3.14535048036767e-29	133194685	133194685	1.33899671796286e-42	164019640	164027724
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5505	1.33899671796286e-42	164019640	164027724	3.62939207464864e-44	164107951	164112873
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9925	-0.0076	3.62939207464864e-44	164107951	164112873	0	194354505	194354505
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.1778	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	983	-0.0059	0	194366950	194366950	2.34189128043017e-109	196822133	196822133
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.9264	2.34189128043017e-109	196822133	196822133	1.92991192452000e-06	196929805	196946355
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196961238	10	10	-0.3336	1.92991192452e-06	196929805	196946355	6.19012465742786e-07	196942158	196966631
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	935	0.0133	6.19012465742786e-07	196942158	196966631	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3323	0.0185	NA	NA	NA	8.16079677998481e-282	9815760	9815760
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.3158	8.16079677998481e-282	9815760	9815760	2.92414976749976e-313	9842644	9842644
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	25161316	4337	4251	-0.0187	2.92414976749976e-313	9842644	9842644	2.41588807311309e-15	25155479	25161316
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25165832	25189046	6	6	0.5888	2.41588807311309e-15	25155479	25161316	7.01752914280518e-14	25189046	25192333
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25192333	66614891	10124	9919	-0.0061	7.01752914280518e-14	25189046	25192333	3.34422790622541e-10	66612156	66614891
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	66616989	66617052	2	2	-0.8975	3.34422790622541e-10	66612156	66614891	4.14679413962353e-11	66617052	66623878
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	66623878	69069651	568	550	-0.002	4.14679413962353e-11	66617052	66623878	8.09126795708267e-39	68905670	69075140
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69075140	69165814	13	12	-0.6879	8.09126795708267e-39	68905670	69075140	3.72948678480631e-38	69163312	69643272
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173660684	31388	30745	-0.0094	3.72948678480631e-38	69163312	69643272	2.32465344732493e-15	173660684	173660684
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.0646	2.32465344732493e-15	173660684	173660684	1.82520188523563e-16	173666072	173666072
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	174141776	216	215	-0.0134	1.82520188523563e-16	173666072	173666072	5.4576433730461e-10	174141776	174141776
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	174143103	174151215	2	2	-0.8574	5.4576433730461e-10	174141776	174141776	8.05611145756152e-10	174151215	174151215
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	174151726	187330240	3863	3778	-0.0061	8.05611145756152e-10	174151215	174151215	2.66068319521589e-71	187330240	187330240
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.2861	2.66068319521589e-71	187330240	187330240	1.70870480143207e-66	187333619	187333619
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190710812	1131	1104	0.0053	1.70870480143207e-66	187333619	187333619	5.54523443165608e-66	190706272	190730982
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190921041	65	64	-0.3867	5.54523443165608e-66	190706272	190730982	2.05657167859121e-21	190915643	190936155
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	43	0.0029	2.05657167859121e-21	190915643	190936155	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	194	0.0163	NA	NA	NA	2.30927535220510e-13	681141	681141
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	1.1713	2.3092753522051e-13	681141	681141	3.3671732835091e-19	686701	686701
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	52381842	13533	13280	-4e-04	3.3671732835091e-19	686701	686701	3.46211631872917e-13	52381842	52381842
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52382994	52384105	2	2	-0.9803	3.46211631872917e-13	52381842	52381842	2.10482064793978e-12	52384105	52384105
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52387445	140201609	26345	25807	-0.0108	2.10482064793978e-12	52384105	52384105	9.49271928954768e-41	140201609	140201609
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	-0.8673	9.49271928954768e-41	140201609	140201609	9.03957687514586e-40	140216524	140216524
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	180346557	13561	13290	-0.0022	9.03957687514586e-40	140216524	140216524	1.83819925935284e-16	180344964	180346557
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180348365	1	0	NA	1.83819925935284e-16	180344964	180346557	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180351118	180358977	5	5	0.7112	NA	NA	NA	3.59201739545066e-12	180358977	180362342
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	107	0.0448	3.59201739545066e-12	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26811016	9366	9173	-0.0111	NA	NA	NA	1.51320278310932e-15	26801068	26811016
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.7661	1.51320278310932e-15	26801068	26811016	1.17994545192180e-15	26861184	26861184
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32558677	2307	2254	-0.0062	1.1799454519218e-15	26861184	26861184	5.45951317470059e-267	32558677	32593151
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	7	-2.6375	5.45951317470059e-267	32558677	32593151	0.0157038052017298	32564884	32609525
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32633691	8	8	-0.5637	0.0157038052017298	32564884	32609525	0.0268047570331569	32609525	32634977
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.034	0.0268047570331569	32609525	32634977	3.08041123530781e-10	32711957	32713363
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.6501	3.08041123530781e-10	32711957	32713363	9.99825733186096e-23	32723366	32731072
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8096	-0.0075	9.99825733186096e-23	32723366	32731072	6.46558658530709e-262	54035000	54035000
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.6041	6.46558658530709e-262	54035000	54035000	1.96463973620939e-266	54042734	54042734
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6299	-0.0013	1.96463973620939e-266	54042734	54042734	1.35310066514405e-11	79008946	79018959
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79085247	12	12	-0.3864	1.35310066514405e-11	79008946	79018959	1.66758715085327e-11	79079988	79101978
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79091850	124373945	13354	13071	-0.0093	1.66758715085327e-11	79079988	79101978	8.24381743033353e-12	124373945	124373945
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	124376936	124379270	2	2	-0.9442	8.24381743033353e-12	124373945	124373945	1.08594870067408e-11	124379270	124379270
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	124383097	139643729	5791	5681	-0.0165	1.08594870067408e-11	124379270	124379270	1.18762778156565e-11	139641158	139643729
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	0.7398	1.18762778156565e-11	139641158	139643729	8.52242415247148e-11	139648318	139648318
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8543	-0.0102	8.52242415247148e-11	139648318	139648318	6.38531581463951e-22	165643653	165643653
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.901	6.38531581463951e-22	165643653	165643653	3.72975576480743e-19	165650610	165650610
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1764	0.0024	3.72975576480743e-19	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	100164752	31062	30452	-0.0015	NA	NA	NA	1.34705013463386e-17	100162851	100164752
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100178968	5	5	-0.6301	1.34705013463386e-17	100162851	100164752	1.06274870561197e-12	100178968	100181104
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100181104	109217320	3894	3812	-0.0048	1.06274870561197e-12	100178968	100181104	1.14782350415691e-07	109212149	109217320
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	0.4692	1.14782350415691e-07	109212149	109217320	6.28954598100518e-35	109233214	109233214
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	0.6926	6.28954598100518e-35	109233214	109233214	5.63199299037253e-07	109240210	109244233
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109967918	301	291	-0.0027	5.63199299037253e-07	109240210	109244233	0	109967918	109967918
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-5.3923	0	109967918	109967918	0	109974402	109974402
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	125831554	7169	7034	-0.006	0	109974402	109974402	3.21052486971396e-35	125831554	125831554
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.3086	3.21052486971396e-35	125831554	125831554	4.35916414274892e-35	125837524	125837524
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	131424513	2655	2605	-0.0042	4.35916414274892e-35	125837524	125837524	6.05944986174483e-19	131424513	131424513
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131426580	131429932	3	3	-0.975	6.05944986174483e-19	131424513	131424513	3.47307204811383e-20	131429932	131429932
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131431668	133433384	996	978	-0.0073	3.47307204811383e-20	131429932	131429932	2.65833377283464e-34	133433384	133433384
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7673	2.65833377283464e-34	133433384	133433384	5.76885412110293e-32	133448277	133453811
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3623	0.0044	5.76885412110293e-32	133448277	133453811	1.80622414120270e-27	141409512	141410894
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	0.5596	1.8062241412027e-27	141409512	141410894	2.28253286382182e-23	141440184	141442231
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	142156165	294	290	0.0342	2.28253286382182e-23	141440184	141442231	3.82419105678815e-19	142152205	142156165
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142167901	4	4	-0.8258	3.82419105678815e-19	142152205	142156165	3.52982845388058e-17	142167901	142167901
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167908	142167908	1	0	NA	3.52982845388058e-17	142167901	142167901	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143503317	486	477	-0.0081	NA	NA	NA	1.19161957285051e-10	143500499	143503317
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-0.7488	1.19161957285051e-10	143500499	143503317	3.61736928154381e-10	143584350	143705425
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	158821263	6090	5967	0.0075	3.61736928154381e-10	143584350	143705425	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	119	0.0019	NA	NA	NA	7.66504064134066e-11	581533	581533
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-0.9197	7.66504064134066e-11	581533	581533	5.13233787787027e-11	588865	588865
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	9533226	2763	2711	0.0093	5.13233787787027e-11	588865	588865	9.77908414748342e-22	9533226	9533226
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-1.0401	9.77908414748342e-22	9533226	9533226	4.91461027288995e-21	9538031	9538031
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	39350798	10187	9979	-0.0025	4.91461027288995e-21	9538031	9538031	3.81789271768568e-271	39350798	39350798
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.841	3.81789271768568e-271	39350798	39350798	2.10845361339448e-284	39505256	39505256
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30760	-0.008	2.10845361339448e-284	39505256	39505256	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5355	-0.007	NA	NA	NA	3.49230467117687e-24	15802255	15802255
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15813356	3	3	1.0752	3.49230467117687e-24	15802255	15802255	5.03746359230895e-24	15813356	15813356
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	23343915	2539	2484	-0.0163	5.03746359230895e-24	15813356	15813356	2.02728431800042e-15	23343915	23343915
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.8629	2.02728431800042e-15	23343915	23343915	5.96152550766951e-15	23365926	23365926
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4955	-0.001	5.96152550766951e-15	23365926	23365926	2.43103322942317e-25	70926188	70926188
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.3745	2.43103322942317e-25	70926188	70926188	3.39968443195060e-25	70930528	70930528
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9734	-0.0058	3.3996844319506e-25	70930528	70930528	3.96755334361035e-37	100348045	100348045
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.6632	3.96755334361035e-37	100348045	100348045	1.35473917626690e-37	100350814	100350814
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5426	-0.0031	1.3547391762669e-37	100350814	100350814	2.28362408634502e-11	116124007	116124007
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-0.9252	2.28362408634502e-11	116124007	116124007	1.42579937367350e-10	116130333	116130333
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	8124	0.0052	1.4257993736735e-10	116130333	116130333	3.57791362122598e-21	137352394	137352394
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.3014	3.57791362122598e-21	137352394	137352394	1.0460218924885e-17	137356880	137356880
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1075	0.0211	1.0460218924885e-17	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	766548	289	286	0.0083	NA	NA	NA	4.06434899876420e-09	766548	766548
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	771247	774846	2	2	0.8878	4.0643489987642e-09	766548	766548	7.5145962360537e-10	774846	774846
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	777917	45489823	14166	13875	-3e-04	7.5145962360537e-10	774846	774846	5.25313279352061e-122	45478162	46389734
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47946216	123	120	0.3908	5.25313279352061e-122	45478162	46389734	1.18726650748815e-120	47172534	47952404
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47948906	53683740	1722	1677	-0.0114	1.18726650748815e-120	47172534	47952404	3.39826280940316e-73	53683740	53683740
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-2.5546	3.39826280940316e-73	53683740	53683740	3.18566595448777e-89	53687880	53687880
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	77917893	8288	8113	-0.004	3.18566595448777e-89	53687880	53687880	2.84342860080632e-201	77917893	77917893
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.7505	2.84342860080632e-201	77917893	77917893	4.99360706950582e-193	77928669	77928669
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19824	-7e-04	4.99360706950582e-193	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1731	0.0031	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.7109	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	351	-0.0158	0	4932214	4932214	9.4214544735021e-43	5738494	5741031
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	14	-0.6851	9.4214544735021e-43	5738494	5741031	2.28615181810736e-42	5763749	5765438
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	18896166	5220	5116	-0.0072	2.28615181810736e-42	5763749	5765438	1.94552136150910e-10	18892456	18896166
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.532	1.9455213615091e-10	18892456	18896166	1.30754375373746e-10	18917191	18932031
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	48561884	9178	8996	-0.0052	1.30754375373746e-10	18917191	18932031	1.90460048392807e-14	48561884	48561884
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48564809	48583374	3	3	0.8572	1.90460048392807e-14	48561884	48561884	2.74888970755218e-12	48583374	48583374
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48602465	55118214	346	344	0.0153	2.74888970755218e-12	48583374	48583374	4.77370836177456e-37	55112618	55127355
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.4339	4.77370836177456e-37	55112618	55127355	1.17214084799415e-45	55205278	55217189
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	57389427	913	894	0.0025	1.17214084799415e-45	55205278	55217189	6.60439756301602e-11	57389427	57389427
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	57401266	57405437	2	2	-0.9213	6.60439756301602e-11	57389427	57389427	1.29043581602093e-10	57405437	57412027
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	57412027	66463477	3723	3656	4e-04	1.29043581602093e-10	57405437	57412027	1.80662954707448e-12	66463477	66463477
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9959	1.80662954707448e-12	66463477	66463477	3.69361310752304e-13	66469412	66469412
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	23251	-0.0038	3.69361310752304e-13	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3651	-0.0035	NA	NA	NA	7.32545253028125e-56	9523923	9531133
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	0.8275	7.32545253028125e-56	9523923	9531133	1.57970672477501e-63	9589725	9599999
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	69138621	19918	19528	-0.0094	1.57970672477501e-63	9589725	9599999	3.30746872417655e-26	69138621	69138621
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69161489	69164231	2	2	-1.3924	3.30746872417655e-26	69138621	69138621	1.45716533429661e-25	69164231	69164231
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69188981	132289090	21486	21082	-0.003	1.45716533429661e-25	69164231	69164231	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	12003	-0.0111	NA	NA	NA	8.0881721614427e-98	49964838	49964838
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.6675	8.0881721614427e-98	49964838	49964838	2.61569683776875e-92	49971732	49971732
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1772	-0.0095	2.61569683776875e-92	49971732	49971732	1.52450917191004e-50	56646284	56657371
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	-0.7572	1.52450917191004e-50	56646284	56657371	1.10687544165253e-57	56680346	56685341
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	66410194	2258	2207	-0.0031	1.10687544165253e-57	56680346	56685341	1.48937820932801e-12	66410194	66410194
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	66412366	66415125	2	2	-0.9461	1.48937820932801e-12	66410194	66410194	7.40118561805015e-15	66415125	66415125
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	66416280	68136198	433	423	0.0089	7.40118561805015e-15	66415125	66415125	7.78657903976089e-15	68132217	68138912
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68138912	68163523	12	10	0.4382	7.78657903976089e-15	68132217	68138912	1.30231222586279e-13	68161714	68168882
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	100690991	10336	10150	-0.0063	1.30231222586279e-13	68161714	68168882	2.98473188835163e-252	100690991	100690991
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.1761	2.98473188835163e-252	100690991	100690991	7.5024455626863e-234	100693892	100693892
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4322	-0.005	7.5024455626863e-234	100693892	100693892	1.14823739744408e-24	113788788	113788788
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	1.1145	1.14823739744408e-24	113788788	113788788	1.36182129998677e-18	113794669	113794669
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	145	0.0288	1.36182129998677e-18	113794669	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.2837	NA	NA	NA	4.72398585591552e-07	18537177	18864561
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	0.7646	4.72398585591552e-07	18537177	18864561	4.40742452670857e-192	19492531	19494416
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21635428	1039	1010	0.0055	4.40742452670857e-192	19492531	19494416	2.73467480097466e-74	21618746	21645241
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21638008	22047168	211	206	0.265	2.73467480097466e-74	21618746	21645241	7.19775520387838e-97	22038206	22054604
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22048569	34674458	4440	4339	-0.0043	7.19775520387838e-97	22038206	22054604	9.58525666824841e-23	34674458	34674458
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.0599	9.58525666824841e-23	34674458	34674458	4.84769941879785e-23	34683810	34683810
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40680589	1896	1859	0.0066	4.84769941879785e-23	34683810	34683810	1.77420479501585e-09	40663660	40687108
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40746865	9	9	-0.3899	1.77420479501585e-09	40663660	40687108	1.80173837238737e-08	40726930	40765979
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40754507	73071404	11762	11521	-0.0075	1.80173837238737e-08	40726930	40765979	1.73354955503087e-10	73060301	73071404
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	1.73354955503087e-10	73060301	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	0.5093	NA	NA	NA	1.98670532435956e-09	73092112	73104540
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11977	2e-04	1.98670532435956e-09	73092112	73104540	0	105597555	105602602
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.7758	0	105597555	105602602	1.39141493990577e-71	105630089	105632168
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	46	-0.0137	1.39141493990577e-71	105630089	105632168	2.8503554615821e-15	105848335	105856972
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-0.8087	2.8503554615821e-15	105848335	105856972	1.86885203046163e-09	105872360	105881677
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105946993	18	16	-0.0322	1.86885203046163e-09	105872360	105881677	2.16748782107546e-19	105923686	105946993
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	105985458	13	11	-0.6725	2.16748782107546e-19	105923686	105946993	0.000182082698909508	105968122	105985458
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105989160	106002179	5	5	-0.3319	0.000182082698909508	105968122	105985458	0.00260418201109991	106002179	106028936
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	139	0.0443	0.00260418201109991	106002179	106028936	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.0468	NA	NA	NA	3.4171852238953e-09	18452491	18452491
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	10	-0.9418	3.4171852238953e-09	18452491	18452491	4.17605440375678e-10	18837737	18837737
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-2.7214	4.17605440375678e-10	18837737	18837737	2.59915901139203e-38	18848213	18848213
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19430207	78	77	-0.8375	2.59915901139203e-38	18848213	18848213	2.05710482905111e-15	19424067	19537035
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19465359	19845942	13	13	-0.225	2.05710482905111e-15	19424067	19537035	1.45636342946995e-83	19845942	19845942
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-4.3017	1.45636342946995e-83	19845942	19845942	2.67121823214901e-269	19882711	19882711
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	41	-0.3084	2.67121823214901e-269	19882711	19882711	8.20595453838469e-26	20053008	20316992
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32456500	3671	3577	0.0046	8.20595453838469e-26	20053008	20316992	9.3682219311998e-61	32454294	32514939
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.606	9.3682219311998e-61	32454294	32514939	5.49231516741126e-62	32583146	32664506
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	5.49231516741126e-62	32583146	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	67289684	14732	14428	-0.0099	NA	NA	NA	9.77859882008414e-14	67284273	67292191
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67290829	67310476	8	8	0.4969	9.77859882008414e-14	67284273	67292191	4.23696645877163e-13	67304326	67311499
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67311499	75115806	3292	3233	-0.0026	4.23696645877163e-13	67304326	67311499	1.73179053411046e-67	75115806	75115806
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	2.2226	1.73179053411046e-67	75115806	75115806	6.14874811581993e-67	75119713	75119713
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98232932	8521	8359	-0.0069	6.14874811581993e-67	75119713	75119713	6.89310282777884e-14	98228743	98232932
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	-0.8524	6.89310282777884e-14	98228743	98232932	3.81496859445525e-14	98239454	98243586
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	625	-0.006	3.81496859445525e-14	98239454	98243586	4.50199997886087e-45	99632987	99632987
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.8318	4.50199997886087e-45	99632987	99632987	8.6813029361071e-45	99635701	99635701
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	265	0.0184	8.6813029361071e-45	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14615	0.009	NA	NA	NA	3.23503120254591e-90	57203733	57203733
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.5958	3.23503120254591e-90	57203733	57203733	3.49231057469245e-95	57206772	57206772
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5488	0.0035	3.49231057469245e-95	57206772	57206772	2.88643692390833e-15	75093957	75093957
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.058	2.88643692390833e-15	75093957	75093957	5.0286808213763e-14	75100865	75100865
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	597	-0.0056	5.0286808213763e-14	75100865	75100865	1.92942093023093e-42	76925748	76925748
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8964	1.92942093023093e-42	76925748	76925748	2.06652058089599e-39	76940218	76940218
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4434	0.0043	2.06652058089599e-39	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	408	0.0339	NA	NA	NA	5.76315257503537e-17	1028979	1028979
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.217	5.76315257503537e-17	1028979	1028979	5.38598099019635e-19	1030766	1030766
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	11512932	4588	4508	0.0118	5.38598099019635e-19	1030766	1030766	5.08512136458825e-09	11512932	11512932
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	11514657	11515847	2	2	0.8563	5.08512136458825e-09	11512932	11512932	9.6676719529906e-10	11515847	11515847
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	11517826	12561345	393	387	0.0117	9.6676719529906e-10	11515847	11515847	6.69196929633976e-11	12561345	12561345
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	12563254	12564722	2	2	-0.877	6.69196929633976e-11	12561345	12561345	4.47653457812290e-10	12564722	12566755
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	12566755	15727076	898	882	0.007	4.4765345781229e-10	12564722	12566755	0	15727076	15727076
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-4.8934	0	15727076	15727076	0	15733964	15733964
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	17437613	640	626	0.0302	0	15733964	15733964	6.6344542243111e-12	17437613	17437613
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	17438817	17439370	2	2	-0.889	6.6344542243111e-12	17437613	17437613	4.51277152741843e-10	17439370	17444094
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	17444094	31457889	5091	4956	0.0034	4.51277152741843e-10	17439370	17444094	6.66926354161567e-22	31447686	31462463
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.4296	6.66926354161567e-22	31447686	31462463	7.76065742215951e-21	31492553	31893451
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	362	0.0103	7.76065742215951e-21	31492553	31893451	1.25596568640150e-14	32828797	32828797
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.0873	1.2559656864015e-14	32828797	32828797	2.89343410072103e-15	32832642	32832642
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1421	0.0057	2.89343410072103e-15	32832642	32832642	3.60633257867334e-216	36673853	36673853
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	4	-2.8611	3.60633257867334e-216	36673853	36673853	3.19495071850497e-209	36683509	36683509
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41566540	2033	1988	0.013	3.19495071850497e-209	36683509	36683509	1.22685890063788e-58	41562786	41572001
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42142363	47	47	-0.4364	1.22685890063788e-58	41562786	41572001	9.10139279733459e-58	41706870	42147225
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42143048	78653545	13678	13394	0.0029	9.1013927973346e-58	41706870	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	54078204	16579	16274	-0.0056	NA	NA	NA	1.24513869573168e-25	54078204	54078204
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54082209	54087468	4	4	-0.9633	1.24513869573168e-25	54078204	54078204	6.4977459821556e-24	54087468	54087468
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54089357	63309020	2671	2614	-0.0081	6.4977459821556e-24	54087468	54087468	3.57846116654267e-27	63309020	63309020
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	63313055	63320012	4	4	-1.0257	3.57846116654267e-27	63309020	63309020	2.08955801185133e-27	63320012	63320012
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	63322258	76116026	3706	3649	-0.0063	2.08955801185133e-27	63320012	63320012	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	217	0.0352	NA	NA	NA	9.66559536174267e-08	790492	790526
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	0.9551	9.66559536174267e-08	790492	790526	5.68032263027302e-10	794978	798817
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	11448975	4951	4841	0.0194	5.68032263027302e-10	794978	798817	1.5040403921548e-16	11448975	11448975
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.2113	1.5040403921548e-16	11448975	11448975	3.11783821643733e-17	11452390	11452390
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	21533555	4361	4279	0.0186	3.11783821643733e-17	11452390	11452390	3.52157199551775e-08	21530823	21533555
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21537835	21553424	6	6	-0.4643	3.52157199551775e-08	21530823	21533555	1.35777309312619e-08	21553424	21558407
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21555247	40352568	3068	3015	0.0272	1.35777309312619e-08	21553424	21558407	6.77019939002991e-37	40352568	40352568
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-1.7377	6.77019939002991e-37	40352568	40352568	3.50860866558269e-28	40356341	40356341
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	41532062	537	532	0.0197	3.50860866558269e-28	40356341	40356341	3.29994119182419e-12	41532062	41532062
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-1.018	3.29994119182419e-12	41532062	41532062	6.47597284362021e-14	41538649	41538649
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	47131915	2447	2382	0.0121	6.47597284362021e-14	41538649	41538649	1.35557027949745e-10	47131915	47131915
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	47133943	47136639	2	2	0.9166	1.35557027949745e-10	47131915	47131915	8.66274167608835e-10	47136639	47136639
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	47137758	59414898	5456	5354	0.0119	8.66274167608835e-10	47136639	47136639	3.40587080062484e-14	59414645	59414898
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59431691	7	7	-0.565	3.40587080062484e-14	59414645	59414898	5.91601630265547e-16	59431691	59431691
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59433190	59434202	3	3	-0.8519	5.91601630265547e-16	59431691	59431691	8.86615366468818e-14	59434202	59440262
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1956	0.0024	8.86615366468818e-14	59434202	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	575	0.004	NA	NA	NA	3.00968608225003e-146	1506379	1506379
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-1.7358	3.00968608225003e-146	1506379	1506379	5.4177925741149e-161	1531162	1531162
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20585	9e-04	5.4177925741149e-161	1531162	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13183	-0.0027	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16995963	717	702	0.017	NA	NA	NA	3.78426168140297e-05	16992573	16997040
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16997040	17001076	4	4	0.505	3.78426168140297e-05	16992573	16997040	4.55282845020606e-09	17001076	17001076
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17006871	17008019	2	2	-0.7733	4.55282845020606e-09	17001076	17001076	2.0228876982766e-07	17008019	17008019
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17011485	22677959	2261	2214	0.0173	2.0228876982766e-07	17008019	17008019	7.19665624032423e-20	22643742	22679305
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22679305	22725305	21	20	0.4195	7.19665624032423e-20	22643742	22679305	5.942553659754e-22	22721042	22736990
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	37685496	7760	7591	0.0059	5.942553659754e-22	22721042	22736990	8.3225845828744e-64	37683516	37690142
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37721849	18	18	-0.7312	8.3225845828744e-64	37683516	37690142	1.86071096990094e-62	37718669	37723010
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37723010	45211069	3797	3710	0.0068	1.86071096990094e-62	37718669	37723010	7.30724984928282e-11	45209605	45211069
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45213022	45214606	2	2	-0.9319	7.30724984928282e-11	45209605	45211069	5.66276838938591e-10	45214606	45214606
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45217224	49571068	1975	1933	0.0309	5.66276838938591e-10	45214606	45214606	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.0457	NA	NA	NA	3.9742937107717e-08	94062	95819
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	106242	8	8	-0.99	3.9742937107717e-08	94062	95819	9.66856413816386e-18	104732	106242
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	127779	17	17	0.0488	9.66856413816386e-18	104732	106242	4.94211603120341e-23	127779	127779
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	3	1.5321	4.94211603120341e-23	127779	127779	3.01285558304654e-30	130528	130528
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	266212	93	90	-0.053	3.01285558304654e-30	130528	130528	5.51821055218886e-11	264886	266212
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.1237	5.51821055218886e-11	264886	266212	1.52125835228641e-13	267079	267079
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	2302065	1271	1237	-0.0023	1.52125835228641e-13	267079	267079	1.43837860665965e-24	2302065	2302065
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0612	1.43837860665965e-24	2302065	2302065	2.64950656039127e-27	2304398	2304398
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	358	-0.009	2.64950656039127e-27	2304398	2304398	3.24118635557183e-06	2666344	2695630
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2227	3.24118635557183e-06	2666344	2695630	7.66207541588514e-170	2708291	2708291
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22483	0.9673	7.66207541588514e-170	2708291	2708291	1.72255334286591e-26	76998610	76998610
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.7168	1.72255334286591e-26	76998610	76998610	4.20638278051007e-28	77010018	77010018
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	152655026	21520	21102	0.9712	4.20638278051007e-28	77010018	77010018	1.56920822035354e-15	152655026	152655026
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.3426	1.56920822035354e-15	152655026	152655026	3.39066723915721e-09	152657445	152669192
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154582414	671	658	0.9105	3.39066723915721e-09	152657445	152669192	0	154578922	154582414
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	-0.0197	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4272867	130	126	-3.5957	NA	NA	NA	2.03429038564065e-08	3773948	4421500
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4413507	5593746	10	9	-1.2855	2.03429038564065e-08	3773948	4421500	1.32676221307029e-19	5593746	5593746
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6749115	16	16	-4.2702	1.32676221307029e-19	5593746	5593746	0.0246233218418435	6741838	6871143
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6756250	6934277	88	86	-3.2093	0.0246233218418435	6741838	6871143	0.00479176474253667	6901582	6938553
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6935203	6935203	1	0	NA	0.00479176474253667	6901582	6938553	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6936196	6955902	15	14	-4.5257	NA	NA	NA	4.04884702570233e-05	6951372	6970768
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	7259689	109	103	-2.7767	4.04884702570233e-05	6951372	6970768	1.31495497599272e-05	7241740	7264547
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	22	-1.2785	1.31495497599272e-05	7241740	7264547	5.13287047971582e-05	7295562	7339162
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7653082	82	79	-2.6142	5.13287047971582e-05	7295562	7339162	7.46676148013416e-12	7643041	7656915
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.2657	7.46676148013416e-12	7643041	7656915	8.21517908032025e-11	7705876	7719658
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8043008	92	87	-2.7454	8.21517908032025e-11	7705876	7719658	1.40883691540942e-08	7970340	8048263
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8047462	8178487	33	30	-4.1592	1.40883691540942e-08	7970340	8048263	1.88217235978820e-05	8158234	8179883
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8211300	11	10	-2.9536	1.8821723597882e-05	8158234	8179883	0.000223914534085462	8208164	8229100
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8212681	8212681	1	0	NA	0.000223914534085462	8208164	8229100	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8214803	8289709	15	14	-4.0896	NA	NA	NA	2.27967516525594e-12	8277707	8292347
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	12	-2.4155	2.27967516525594e-12	8277707	8292347	0.0302379182160037	8313045	8454258
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8540974	48	46	-3.3208	0.0302379182160037	8313045	8454258	0.000394557044733502	8474062	8552999
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8541952	8697715	58	56	-2.589	0.000394557044733502	8474062	8552999	1.86307870409064e-09	8692156	8740566
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10513747	186	177	-3.6222	1.86307870409064e-09	8692156	8740566	6.43121039544091e-21	10511255	10537808
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	20	-1.0477	6.43121039544091e-21	10511255	10537808	2.11557105990755e-12	11673476	12452734
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12537944	10	10	-4.3237	2.11557105990755e-12	11673476	12452734	2.22373447704872e-11	12537944	12542979
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	53	-1.7322	2.22373447704872e-11	12537944	12542979	1.18162544505057e-09	12651786	12700767
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.4544	1.18162544505057e-09	12651786	12700767	0.000301046703999664	12786515	12859309
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12905395	25	25	-2.3234	0.000301046703999664	12786515	12859309	0.00882882101003259	12869489	12905395
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12909643	12924438	6	6	-3.6472	0.0088288210100326	12869489	12905395	0.000560975729182462	12924438	12958620
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12925401	13048283	49	49	-1.7486	0.000560975729182462	12924438	12958620	3.55760185729617e-06	13034069	13048283
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13066849	10	8	-3.8653	3.55760185729617e-06	13034069	13048283	4.74415268557554e-06	13066849	13066849
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13078432	3	3	-1.3681	4.74415268557554e-06	13066849	13066849	0.00334260205690367	13077621	13081856
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13080405	13104920	10	10	-2.5558	0.00334260205690367	13077621	13081856	2.25028374435721e-05	13101234	13111594
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-1.3434	2.25028374435721e-05	13101234	13111594	7.11419179488136e-05	13128515	13147329
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13254711	41	39	-3.0575	7.11419179488136e-05	13128515	13147329	0.00476978658261074	13153920	13358173
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14122129	336	323	-3.6998	0.00476978658261074	13153920	13358173	5.38278812546211e-09	14081173	14335755
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14508021	127	122	-3.0093	5.38278812546211e-09	14081173	14335755	3.19160932030441e-11	14500052	14526446
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.19160932030441e-11	14500052	14526446	NA	NA	NA
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.2955	NA	NA	NA	2.21314200020383e-06	14566592	14579298
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-3.345	2.21314200020383e-06	14566592	14579298	1.30572945488194e-06	14598838	14601309
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14684159	6	5	-1.0362	1.30572945488194e-06	14598838	14601309	9.42921832010794e-07	14644293	14689490
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14685149	15115689	93	90	-3.5037	9.42921832010794e-07	14644293	14689490	0.000961657356461886	14958284	15189646
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15118268	15284717	89	85	-2.8672	0.000961657356461886	14958284	15189646	5.67176842487012e-09	15274383	15303557
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15408015	79	74	-3.9171	5.67176842487012e-09	15274383	15303557	0.159206311452346	15344771	15479343
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15523178	55	53	-3.3868	0.159206311452346	15344771	15479343	0.000821874291643145	15514330	15524675
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15531144	5	5	-1.0877	0.000821874291643145	15514330	15524675	1.84602706532182e-05	15528826	15538983
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15532597	15566377	23	22	-3.3557	1.84602706532182e-05	15528826	15538983	0.00194262621861451	15554463	15566377
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573579	15583573	5	5	-1.7226	0.00194262621861451	15554463	15566377	1.37834347511949e-07	15583573	15587741
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15734650	28	27	-3.4283	1.37834347511949e-07	15583573	15587741	0.000288239741047515	15707307	15801779
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15743117	15915466	28	28	-4.297	0.000288239741047515	15707307	15801779	7.67945333892265e-14	15902561	15937162
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16071977	60	57	-2.4145	7.67945333892265e-14	15902561	15937162	0.000256053063590402	16042014	16082040
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16072965	16103913	19	19	-3.6918	0.000256053063590402	16042014	16082040	0.00596487306871252	16094964	16103913
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16107406	16110790	2	2	-1.1917	0.00596487306871252	16094964	16103913	0.0172426056010637	16110790	16154076
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16115542	16377188	79	76	-3.1403	0.0172426056010637	16110790	16154076	0.000457030710583176	16357759	16377188
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16380639	16387273	2	2	-0.6449	0.000457030710583176	16357759	16377188	2.32298624797336e-06	16387273	16399608
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16656177	38	38	-4.1854	2.32298624797336e-06	16387273	16399608	0.000712490380467214	16557904	16729877
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16659030	17351702	113	110	-3.4139	0.000712490380467214	16557904	16729877	0.00202486673511323	17208462	17409064
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17360817	17487972	23	23	-4.2893	0.00202486673511323	17208462	17409064	7.39278099860571e-14	17482749	17487972
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17566412	13	13	-1.8659	7.39278099860571e-14	17482749	17487972	6.66681112145643e-06	17544651	17615190
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17583495	22208351	771	740	-3.5506	6.66681112145643e-06	17544651	17615190	1.10622394151784e-05	22179794	22208351
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22209119	22263267	17	17	-4.9918	1.10622394151784e-05	22179794	22208351	1.11007921867302e-08	22261337	22373608
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22268552	22930737	65	62	-3.6133	1.11007921867302e-08	22261337	22373608	1.43592569553696e-42	22926726	26870361
MSK_252152915047_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	79	-1.0587	1.43592569553696e-42	22926726	26870361	NA	NA	NA
