Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	2240503	446	431	0.0409	NA	NA	NA	9.636998519722e-29	2240503	2243512
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2243512	2259532	8	8	0.8687	9.636998519722e-29	2240503	2243512	1.11607359805294e-39	2256101	2259532
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2263680	5944655	1166	1145	-0.0246	1.11607359805294e-39	2256101	2259532	4.71360096146551e-10	5936055	5952473
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	5946119	5994267	23	23	0.2448	4.71360096146551e-10	5936055	5952473	3.12408944972288e-06	5984109	6030900
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	5997026	15157302	3430	3361	0.0228	3.12408944972288e-06	5984109	6030900	3.13786721624299e-07	15155742	15157302
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15158665	15162189	3	3	-0.651	3.13786721624299e-07	15155742	15157302	1.55158782293993e-08	15162189	15163929
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15163929	16704522	705	697	0.0256	1.55158782293993e-08	15162189	15163929	1.05239848798085e-32	16668773	16799711
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17148592	27	27	-0.4397	1.05239848798085e-32	16668773	16799711	2.92467432240677e-31	17124554	17155989
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17154037	51352048	13645	13407	0.0214	2.92467432240677e-31	17124554	17155989	1.79953300784276e-13	51350600	51352048
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51356475	51358801	3	3	0.7058	1.79953300784276e-13	51350600	51352048	1.75074857621988e-19	51358801	51359919
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51359919	72537426	8438	8277	-0.0116	1.75074857621988e-19	51358801	51359919	1.04934620529461e-142	72537426	72537426
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.3117	1.04934620529461e-142	72537426	72537426	8.96039218827737e-142	72579311	72579311
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	111177741	12188	11966	-0.0092	8.96039218827737e-142	72579311	72579311	2.80243319183153e-10	111173447	111177741
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111180807	111188857	3	3	-0.8031	2.80243319183153e-10	111173447	111177741	3.24488213122544e-10	111188857	111190763
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111190763	147381641	4084	4013	-0.0067	3.24488213122544e-10	111188857	111190763	4.05427190277779e-10	147352661	147386366
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147386366	147441409	11	10	0.4278	4.05427190277779e-10	147352661	147386366	3.94429854553142e-10	147434894	147460661
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147446204	150823073	1271	1250	0.0508	3.94429854553142e-10	147434894	147460661	1.02052292498630e-187	150823073	150836481
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.057	1.0205229249863e-187	150823073	150836481	1.06020633949046e-132	150848509	150851439
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	-0.0429	1.06020633949046e-132	150848509	150851439	4.49545621038124e-27	151026228	151026228
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.885	4.49545621038124e-27	151026228	151026228	6.42969500566626e-16	151036435	151036435
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2629	0.0284	6.42969500566626e-16	151036435	151036435	1.06172774483658e-89	157133150	157133150
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.8058	1.06172774483658e-89	157133150	157133150	3.30022616818076e-91	157136342	157136342
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	173060997	6293	6173	-0.0031	3.30022616818076e-91	157136342	157136342	0	173060997	173060997
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-5.0387	0	173060997	173060997	0	173067337	173067337
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	200598243	9167	8995	-0.0015	0	173067337	173067337	2.95991157102258e-11	200584100	200633348
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200787319	38	37	-0.2414	2.95991157102258e-11	200584100	200633348	9.11544077648112e-12	200670407	200808717
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	215738855	5743	5644	-0.0025	9.11544077648112e-12	200670407	200808717	2.21313170712884e-11	215716124	215745459
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215740498	215789712	27	27	0.2717	2.21313170712884e-11	215716124	215745459	7.88974552041447e-11	215784016	215807330
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215792169	229980078	4994	4904	-0.003	7.88974552041447e-11	215784016	215807330	3.61414928080911e-45	229978624	229986987
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229983952	229983952	1	0	NA	3.61414928080911e-45	229978624	229986987	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229985455	230016373	18	18	0.6711	NA	NA	NA	6.66379696423885e-49	230015230	230020468
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	230020468	244907523	5779	5672	-0.0041	6.66379696423885e-49	230015230	230020468	4.2394203200256e-34	244907498	244912161
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244909016	244935586	12	12	0.6882	4.2394203200256e-34	244907498	244912161	1.40991854871243e-23	244930004	244937126
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244937126	247186514	835	821	0.0329	1.40991854871243e-23	244930004	244937126	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	186548	54	53	0.07	NA	NA	NA	3.59795200364598e-18	183756	194007
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190527	190527	1	0	NA	3.59795200364598e-18	183756	194007	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	194007	211980	10	10	0.6284	NA	NA	NA	3.31806224046918e-05	205023	211980
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213556	223539	7	7	0.2182	3.31806224046918e-05	205023	211980	2.02449915344674e-31	219081	271136
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	225265	27064046	8190	8049	-0.0151	2.02449915344674e-31	219081	271136	3.73391341812451e-28	27028450	27084496
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27066016	27109048	23	23	-0.225	3.73391341812451e-28	27028450	27084496	8.19857790345868e-09	27094463	27122656
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27110796	27766402	310	306	0.0457	8.19857790345868e-09	27094463	27122656	1.88356577841541e-06	27750997	27778689
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27770109	27801026	14	13	-0.2528	1.88356577841541e-06	27750997	27778689	1.06105420625991e-10	27789900	27828599
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27803715	33076512	2267	2220	-0.0022	1.06105420625991e-10	27789900	27828599	2.15485268983015e-13	33076512	33076512
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.1077	2.15485268983015e-13	33076512	33076512	3.44509943848594e-16	33080437	33080437
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	635	0.0025	3.44509943848594e-16	33080437	33080437	9.91890026844442e-40	34542224	34552935
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.5841	9.91890026844442e-40	34542224	34552935	1.34191308702821e-33	34582272	34591681
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37810001	1369	1348	-0.0074	1.34191308702821e-33	34582272	34591681	1.16570344055603e-78	37810001	37813211
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.8154	1.16570344055603e-78	37810001	37813211	9.55536173709026e-84	37852371	37855837
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5696	0.0054	9.55536173709026e-84	37852371	37855837	8.24535714091464e-13	52588009	52600588
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	8.24535714091464e-13	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7701	NA	NA	NA	3.10262528675498e-13	52635695	52639605
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	87721951	11171	10968	0.0036	3.10262528675498e-13	52635695	52639605	1.02316538273623e-06	87592184	87721951
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	88015932	5	5	0.5045	1.02316538273623e-06	87592184	87721951	7.2312983750925e-09	88015932	88078497
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88038874	88242349	74	72	-0.0186	7.2312983750925e-09	88015932	88078497	2.52968981195980e-07	88212291	88252978
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88244115	88280895	20	20	0.2523	2.5296898119598e-07	88212291	88252978	1.62257733773199e-07	88272449	88296822
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88283227	106244482	3903	3842	-0.0156	1.62257733773199e-07	88272449	88296822	3.76980918197357e-16	106244482	106244482
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106253229	3	3	-1.0091	3.76980918197357e-16	106244482	106244482	1.06479525556460e-16	106253229	106253229
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106256521	179767214	22369	21986	-0.0089	1.0647952555646e-16	106253229	106253229	3.62875071378635e-16	179767214	179767214
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.976	3.62875071378635e-16	179767214	179767214	1.53694287495925e-16	179778919	179778919
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	232389803	17686	17394	-0.0055	1.53694287495925e-16	179778919	179778919	2.73968115769094e-10	232382016	232393856
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232392044	232450841	15	15	0.3461	2.73968115769094e-10	232382016	232393856	4.29834328965582e-11	232447289	232455184
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232451533	232451533	1	0	NA	4.29834328965582e-11	232447289	232455184	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232452428	242689978	3840	3772	-0.0123	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	7373793	2514	2474	-0.0258	NA	NA	NA	1.45901540250682e-07	7368059	7373793
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7375107	7376517	2	2	-0.8159	1.45901540250682e-07	7368059	7373793	8.54056558804773e-07	7376517	7378691
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7378691	23923254	5789	5664	-0.0105	8.54056558804773e-07	7376517	7378691	7.63943893949003e-10	23922795	23923254
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	23926093	23927395	2	2	-0.9674	7.63943893949003e-10	23922795	23923254	4.28419549329404e-11	23927395	23927395
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	23929877	32074432	2489	2451	-0.0191	4.28419549329404e-11	23927395	23927395	9.51308956890012e-31	32074432	32074432
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.5372	9.51308956890012e-31	32074432	32074432	1.62643876909660e-24	32080848	32080848
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1844	0.0156	1.6264387690966e-24	32080848	32080848	2.41356527918740e-13	37951628	37954819
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.6388	2.4135652791874e-13	37951628	37954819	1.05923229220817e-26	37960019	37963014
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	53001678	5975	5868	0.0184	1.05923229220817e-26	37960019	37963014	1.88154110320843e-24	52999601	53003136
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.613	1.88154110320843e-24	52999601	53003136	1.28539237023188e-13	53010535	53014254
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	125113939	21698	21329	-0.0142	1.28539237023188e-13	53010535	53014254	2.17875003983216e-13	125111084	125113939
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	125115070	125115100	2	2	0.8244	2.17875003983216e-13	125111084	125113939	5.73813528085267e-13	125115100	125116854
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	125116854	137779212	4978	4891	-0.0085	5.73813528085267e-13	125115100	125116854	2.23235398157335e-10	137771416	137787809
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	137782829	137792090	5	5	-0.4002	2.23235398157335e-10	137771416	137787809	1.31859508033689e-06	137785549	137804469
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	137793401	137793401	1	0	NA	1.31859508033689e-06	137785549	137804469	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	137795952	164005577	8140	7995	-0.0056	NA	NA	NA	7.3386875362578e-147	164005577	164005577
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.2529	7.3386875362578e-147	164005577	164005577	1.01612194090092e-69	164027724	164027724
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-0.4402	1.01612194090092e-69	164027724	164027724	4.91960049843725e-22	164100804	164115417
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196835413	11133	10933	-0.0013	4.91960049843725e-22	164100804	164115417	7.29642515446682e-29	196810503	196905767
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196961238	30	30	-0.4098	7.29642515446682e-29	196810503	196905767	7.98018855840234e-39	196957322	196966631
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	198012513	417	406	0.0647	7.98018855840234e-39	196957322	196966631	6.94173944394766e-25	198003896	198019000
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198014255	198038358	13	13	0.6466	6.94173944394766e-25	198003896	198019000	2.26999969828291e-24	198035494	198041362
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	199329592	523	514	0.0267	2.26999969828291e-24	198035494	198041362	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9395	-0.0157	NA	NA	NA	2.16443653798425e-15	34439897	34445002
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.692	2.16443653798425e-15	34439897	34445002	3.44303159144120e-17	34491115	34506297
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	39005609	1358	1333	-0.0068	3.4430315914412e-17	34491115	34506297	7.03651363782832e-49	39004360	39007017
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39007017	39042115	16	16	0.7065	7.03651363782832e-49	39004360	39007017	4.27992535404983e-45	39039062	39043644
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39043644	81987988	11698	11507	-0.0012	4.27992535404983e-45	39039062	39043644	1.20220894002902e-21	81987988	81987988
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	81991770	81995323	2	2	0.9355	1.20220894002902e-21	81987988	81987988	8.0806937099217e-10	81995323	81995323
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	82001799	173660684	27191	26690	-0.004	8.0806937099217e-10	81995323	81995323	1.03271931421194e-66	173660684	173660684
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.3571	1.03271931421194e-66	173660684	173660684	4.47503701765027e-69	173666072	173666072
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3990	-0.0179	4.47503701765027e-69	173666072	173666072	1.99478835936203e-56	187330240	187330240
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.1933	1.99478835936203e-56	187330240	187330240	1.5019485970701e-42	187333619	187333619
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	189291741	708	699	-0.0197	1.5019485970701e-42	187333619	187333619	3.57577336710011e-07	189277553	189297555
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	189294327	189324048	17	17	0.2561	3.57577336710011e-07	189277553	189297555	2.05440062669661e-06	189316420	189354057
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	189326830	191153613	516	505	-0.0049	2.05440062669661e-06	189316420	189354057	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3913	-0.039	NA	NA	NA	3.00969065252957e-229	12857302	12857302
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.3636	3.00969065252957e-229	12857302	12857302	6.22265450417276e-230	12873052	12873052
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	78495585	17868	17533	-0.0093	6.22265450417276e-230	12873052	12873052	1.82497168985321e-17	78489361	78497296
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78497296	78535112	17	16	0.4246	1.82497168985321e-17	78489361	78497296	2.3041336324451e-17	78532750	78540951
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78538241	130634552	14333	14100	-0.0061	2.3041336324451e-17	78532750	78540951	9.42460950930819e-14	130632946	130638815
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130638815	130649467	7	7	0.5765	9.42460950930819e-14	130632946	130638815	2.52250474923841e-15	130647954	130652439
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130650977	140533456	4022	3940	0.0077	2.52250474923841e-15	130647954	130652439	2.48384904860292e-15	140533456	140533456
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.0792	2.48384904860292e-15	140533456	140533456	3.62706747849001e-12	140538666	140538666
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	150181399	3628	3574	-0.0151	3.62706747849001e-12	140538666	140538666	1.38508626302987e-25	150171154	150181399
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8308	1.38508626302987e-25	150171154	150181399	2.40999699138809e-27	150202601	150202601
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	174084859	7630	7501	-0.0132	2.40999699138809e-27	150202601	150202601	1.32909549565607e-17	174078177	174086025
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174086025	174121702	13	13	0.4718	1.32909549565607e-17	174078177	174086025	6.23752628552421e-13	174117406	174134683
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174125438	180644810	2262	2219	0.0238	6.23752628552421e-13	174117406	174134683	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	38	-0.0439	NA	NA	NA	2.51537393759985e-10	179804	198124
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	240119	17	17	0.3029	2.51537393759985e-10	179804	198124	1.45871007177503e-08	240119	249566
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	31382291	11124	10916	-6e-04	1.45871007177503e-08	240119	249566	1.31845624882309e-24	31382291	31383925
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31390982	5	5	-0.9244	1.31845624882309e-24	31382291	31383925	6.8182258909617e-26	31389372	31390982
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32558677	492	481	0.0488	6.8182258909617e-26	31389372	31390982	1.673533626505e-208	32558677	32567462
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	16	-2.0468	1.673533626505e-208	32558677	32567462	2.35803289236736e-20	32628420	32633691
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.0493	2.35803289236736e-20	32628420	32633691	1.73353743237069e-09	32713363	32721872
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-1.0037	1.73353743237069e-09	32713363	32721872	0.00176383139476378	32720656	32736223
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32762061	13	12	-0.2459	0.00176383139476378	32720656	32736223	3.10171809688771e-07	32732764	32778933
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	51940597	7355	7220	0.0037	3.10171809688771e-07	32732764	32778933	5.9694473517374e-12	51934145	51945586
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	51944280	51967227	13	13	0.4203	5.9694473517374e-12	51934145	51945586	3.40997037062650e-14	51964168	51970683
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	51969378	54035000	878	864	-0.0274	3.4099703706265e-14	51964168	51970683	1.13732944979471e-35	54035000	54035000
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.427	1.13732944979471e-35	54035000	54035000	1.05360382454191e-36	54042734	54042734
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	62625228	1570	1537	-0.0063	1.05360382454191e-36	54042734	54042734	2.67851498570207e-08	62622846	62625228
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	62627862	62640198	2	2	0.8467	2.67851498570207e-08	62622846	62625228	4.02308404686611e-08	62640198	62640198
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	62642380	65767409	826	811	-0.0028	4.02308404686611e-08	62640198	62640198	1.53123096968578e-11	65765501	65767409
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.0095	1.53123096968578e-11	65765501	65767409	2.45726452606315e-12	65771532	65771532
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	72919733	2135	2097	-0.0036	2.45726452606315e-12	65771532	65771532	3.03909824018442e-11	72917267	72919733
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-0.7908	3.03909824018442e-11	72917267	72919733	2.07686276290275e-10	72924440	72931542
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	79018959	1894	1849	0.0054	2.07686276290275e-10	72924440	72931542	1.85448462099576e-14	79008946	79024557
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.4427	1.85448462099576e-14	79008946	79024557	6.00223629161395e-14	79085247	79101978
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	105005606	6949	6820	-0.0059	6.00223629161395e-14	79085247	79101978	1.31805440455039e-09	104979160	105005606
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	105014384	105050092	6	6	0.5326	1.31805440455039e-09	104979160	105005606	1.40694891296314e-09	105050092	105065976
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	105056478	132706938	9530	9384	-0.003	1.40694891296314e-09	105050092	105065976	1.3635845707654e-11	132705286	132706938
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132708939	132711689	3	3	-0.8311	1.3635845707654e-11	132705286	132706938	8.46929975508363e-12	132711689	132711689
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132719547	134629897	758	748	0.006	8.46929975508363e-12	132711689	132711689	7.25429030525578e-09	134627341	134629897
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	7.25429030525578e-09	134627341	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.7234	NA	NA	NA	3.13454273160253e-10	134635779	134639397
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	139643729	1896	1864	-1e-04	3.13454273160253e-10	134635779	134639397	4.42963501408386e-11	139641158	139643729
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	0.7515	4.42963501408386e-11	139641158	139643729	2.31731559771065e-17	139648318	139648318
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	170753106	10531	10335	-0.0201	2.31731559771065e-17	139648318	139648318	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	256	0.0049	NA	NA	NA	1.13885822771091e-14	1038517	1038517
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	-1.0561	1.13885822771091e-14	1038517	1038517	6.51214365205121e-13	1047707	1047707
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	5851216	1852	1812	0.0382	6.51214365205121e-13	1047707	1047707	2.44245170441874e-08	5848555	5851216
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5856032	5861574	3	3	-0.687	2.44245170441874e-08	5848555	5851216	5.54702850141607e-12	5857936	5878458
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5878458	64443954	17413	17136	-0.0104	5.54702850141607e-12	5857936	5878458	1.17804806132959e-24	64437472	64445812
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64445812	64465154	11	11	0.6224	1.17804806132959e-24	64437472	64445812	2.23768659477210e-18	64461540	64473566
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64473566	66070280	375	372	0.0729	2.2376865947721e-18	64461540	64473566	1.07135081723722e-05	66065445	66071883
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	66071883	66078556	4	4	0.5812	1.07135081723722e-05	66065445	66071883	9.29874602468051e-12	66077006	66084996
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	66084996	73237655	2225	2195	0.0316	9.29874602468051e-12	66077006	66084996	2.00412674628855e-16	73221403	73244558
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	73238170	73301068	43	43	0.2436	2.00412674628855e-16	73221403	73244558	2.57962445493003e-45	73286739	73318779
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	73304770	93162991	6260	6167	0	2.57962445493003e-45	73286739	73318779	1.07425848150470e-35	93162991	93162991
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	-1.5843	1.0742584815047e-35	93162991	93162991	3.22220549030984e-30	93168978	93168978
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100164752	2612	2564	0.0209	3.22220549030984e-30	93168978	93168978	1.53474362939528e-21	100162851	100164752
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.7003	1.53474362939528e-21	100162851	100164752	2.07772307898760e-39	100174991	100178968
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	118611324	8199	8013	0.0034	2.0777230789876e-39	100174991	100178968	8.48011511783162e-42	118609124	118620875
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118633999	8	7	0.7188	8.48011511783162e-42	118609124	118620875	1.10710816616703e-19	118622742	118645208
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118645208	131338391	5786	5664	0.0014	1.10710816616703e-19	118622742	118645208	8.282568120965e-20	131326433	131356296
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131341451	131374950	13	12	0.2964	8.282568120965e-20	131326433	131356296	6.8536560890919e-07	131363185	131383455
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131376396	133433384	1023	998	-0.0271	6.8536560890919e-07	131363185	131383455	1.39456052181307e-31	133433384	133433384
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7975	1.39456052181307e-31	133433384	133433384	2.86690307985897e-28	133448277	133453811
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141419692	3704	3636	0.0097	2.86690307985897e-28	133448277	133453811	2.72403514805342e-09	141413352	141425306
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141422860	141442231	11	11	-0.3834	2.72403514805342e-09	141413352	141425306	1.09570092670783e-08	141438504	141449014
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141443577	141690753	115	113	0.0233	1.09570092670783e-08	141438504	141449014	8.3982951109582e-18	141689547	141698634
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.6391	8.3982951109582e-18	141689547	141698634	3.03619138111459e-21	141712786	141720324
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	3.03619138111459e-21	141712786	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	143582864	659	642	0.0141	NA	NA	NA	1.61636524460734e-07	143503317	143582864
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143583309	143584350	2	2	0.851	1.61636524460734e-07	143503317	143582864	1.26719846094717e-07	143584350	143705425
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	146350117	1173	1157	0.0037	1.26719846094717e-07	143584350	143705425	4.02388112647806e-06	146347695	146350117
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	146351946	146353730	2	2	-0.7594	4.02388112647806e-06	146347695	146350117	6.49957934082591e-07	146353730	146356235
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	146356235	147702365	675	662	-0.0192	6.49957934082591e-07	146353730	146356235	5.28024319628142e-25	147702365	147702365
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147708382	3	3	-1.1553	5.28024319628142e-25	147702365	147702365	3.39891122294660e-20	147708382	147708382
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	158191657	4023	3948	-0.019	3.3989112229466e-20	147708382	147708382	7.64464863648305e-58	158191657	158191657
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158193795	158195947	2	2	-2.3976	7.64464863648305e-58	158191657	158191657	1.28980846007448e-31	158195947	158195947
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158197662	158821263	212	209	0.0018	1.28980846007448e-31	158195947	158195947	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	-0.0274	NA	NA	NA	6.56214494785657e-87	581533	581533
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.0495	6.56214494785657e-87	581533	581533	2.09014741251262e-103	588865	588865
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	1745018	400	393	-0.0326	2.09014741251262e-103	588865	588865	7.6470522070478e-06	1734365	1752498
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1746071	1762209	15	14	0.2492	7.6470522070478e-06	1734365	1752498	2.37836982210663e-06	1754814	1771417
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1762817	9533226	2348	2311	-0.0266	2.37836982210663e-06	1754814	1771417	3.18311101072383e-16	9533226	9533226
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-0.9919	3.18311101072383e-16	9533226	9533226	4.67755867054768e-16	9538031	9538031
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	10330645	380	375	-0.0179	4.67755867054768e-16	9538031	9538031	1.00893021294334e-08	10330645	10330645
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10332803	10332839	2	2	-0.9036	1.00893021294334e-08	10330645	10330645	3.35773134593373e-08	10332839	10332839
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10339001	10339001	1	0	NA	3.35773134593373e-08	10332839	10332839	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10339780	16304869	2025	1992	-0.0151	NA	NA	NA	5.38402441006585e-08	16298530	16304869
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16309306	16315130	2	2	-0.8935	5.38402441006585e-08	16298530	16304869	7.75129034447744e-09	16315130	16315130
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16373516	32797545	5896	5784	2e-04	7.75129034447744e-09	16315130	16315130	1.77111933880621e-23	32797545	32797545
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-1.1642	1.77111933880621e-23	32797545	32797545	1.22086010079410e-24	32808049	32808049
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1843	0.0125	1.2208601007941e-24	32808049	32808049	3.74844450546074e-218	39350798	39354149
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39352361	1	0	NA	3.74844450546074e-218	39350798	39354149	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39354149	39505256	58	57	0.8246	NA	NA	NA	2.66474234071053e-204	39504332	39505256
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	435	0.0098	2.66474234071053e-204	39504332	39505256	5.60512066442741e-219	40892587	40892587
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.0879	5.60512066442741e-219	40892587	40892587	2.17389356087943e-215	40897469	40897469
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	47815970	933	917	0.0224	2.17389356087943e-215	40897469	40897469	3.94024500734356e-08	47752554	47869895
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	47822793	47952761	13	13	-0.3023	3.94024500734356e-08	47752554	47869895	1.30270713049923e-05	47902396	47987961
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	47958337	51191560	790	775	0.0048	1.30270713049923e-05	47902396	47987961	2.14575227178315e-07	51189068	51191560
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.6206	2.14575227178315e-07	51189068	51191560	3.72577315878342e-08	51200291	51204788
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	3.72577315878342e-08	51200291	51204788	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	98192360	13841	13576	-0.0087	NA	NA	NA	3.75794125073871e-09	98182515	98194776
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	98194776	98219904	13	13	0.3492	3.75794125073871e-09	98182515	98194776	1.62640888751522e-08	98217678	98231637
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	98224056	115701209	5700	5605	0	1.62640888751522e-08	98217678	98231637	7.27039460324662e-09	115701209	115701209
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.9064	7.27039460324662e-09	115701209	115701209	1.48353605747787e-17	115711730	115718942
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9518	-0.0177	1.48353605747787e-17	115711730	115718942	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7708	-0.0082	NA	NA	NA	2.07700246686017e-10	22473542	22477358
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	0.9519	2.07700246686017e-10	22473542	22477358	4.55550528145283e-08	22492603	22499541
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	159	0.0107	4.55550528145283e-08	22492603	22499541	9.56193226395466e-09	23338535	23343915
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.8254	9.56193226395466e-09	23338535	23343915	2.37816933110601e-11	23365926	23377660
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4978	-0.0018	2.37816933110601e-11	23365926	23377660	2.69932269594298e-48	70926188	70926188
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.0439	2.69932269594298e-48	70926188	70926188	8.82265548950143e-51	70930528	70930528
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	76386350	2030	1991	-0.0093	8.82265548950143e-51	70930528	70930528	6.01024392819112e-06	76379256	76391614
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	76388098	76398571	6	6	-0.4268	6.01024392819112e-06	76379256	76391614	5.08125999491878e-06	76391614	76403023
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	76401134	86960197	3324	3267	-0.0076	5.08125999491878e-06	76391614	76403023	3.35121802893337e-16	86960197	86960197
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	1.1511	3.35121802893337e-16	86960197	86960197	3.8107545710034e-15	86965458	86965458
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	116122595	10105	9937	-0.0064	3.8107545710034e-15	86965458	86965458	8.17530663021161e-14	116118907	116122595
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116124007	116132839	4	4	-0.7902	8.17530663021161e-14	116118907	116122595	1.2881672357991e-12	116132839	116137111
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	128656749	4688	4611	-0.0152	1.2881672357991e-12	116132839	116137111	9.92848835741997e-36	128654320	128657974
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128657974	128699327	20	19	0.575	9.92848835741997e-36	128654320	128657974	2.84510096206337e-30	128697140	128699467
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128699467	137352394	3586	3507	0.0233	2.84510096206337e-30	128697140	128699467	1.02180154917662e-38	137352394	137352394
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.9371	1.02180154917662e-38	137352394	137352394	2.60149762803464e-36	137356880	137356880
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	139338869	781	762	0.0019	2.60149762803464e-36	137356880	137356880	1.91526610492162e-08	139321184	139358817
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139341864	139404030	21	21	0.2978	1.91526610492162e-08	139321184	139358817	1.05047744866998e-07	139390002	139422404
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139407449	140145683	301	298	0.0213	1.05047744866998e-07	139390002	139422404	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	488108	163	160	-0.071	NA	NA	NA	7.60074334628889e-08	474202	496404
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	489591	535766	19	19	0.2186	7.60074334628889e-08	474202	496404	4.67586558155578e-13	521445	563403
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	537438	77917893	24410	23992	-0.0023	4.67586558155578e-13	521445	563403	2.16774744224205e-144	77917893	77917893
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.5653	2.16774744224205e-144	77917893	77917893	6.63151571162049e-141	77928669	77928669
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	95908082	5751	5649	-0.0102	6.63151571162049e-141	77928669	77928669	2.73524424098454e-09	95908082	95908082
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95909257	95909288	2	2	0.9318	2.73524424098454e-09	95908082	95908082	5.95858901397441e-09	95909288	95909288
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95915326	98993621	1283	1266	0.0089	5.95858901397441e-09	95909288	95909288	2.22204135767525e-14	98986029	98995967
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	98995967	99013267	9	9	0.5583	2.22204135767525e-14	98986029	98995967	5.57519586342317e-42	99010856	99015755
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	99015755	135285645	13169	12947	-0.0132	5.57519586342317e-42	99010856	99015755	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1745	0.0042	NA	NA	NA	1.54598733690877e-15	4920907	4923300
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-0.8395	1.54598733690877e-15	4920907	4923300	8.36056146510954e-15	4932214	4934594
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	18896166	5595	5488	-0.0066	8.36056146510954e-15	4932214	4934594	5.14394669670323e-10	18892456	18896166
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.5617	5.14394669670323e-10	18892456	18896166	1.98998823215245e-09	18917191	18932031
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	44619918	7642	7504	-0.0195	1.98998823215245e-09	18917191	18932031	3.23700229349698e-09	44612026	44619918
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	44627671	44645627	9	9	0.4186	3.23700229349698e-09	44612026	44619918	7.6236590631934e-09	44645627	44663129
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	44656403	55118214	1876	1830	0.0201	7.6236590631934e-09	44645627	44663129	1.10234302647313e-32	55097806	55124730
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.4087	1.10234302647313e-32	55097806	55124730	5.91014468425881e-34	55205278	55221692
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	63281206	3192	3132	0.0155	5.91014468425881e-34	55205278	55221692	2.17224341201000e-14	63264257	63286346
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	63285124	63341591	17	17	0.3155	2.17224341201e-14	63264257	63286346	4.05611681338242e-08	63330323	63353729
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	63344479	63746801	180	178	0.0517	4.05611681338242e-08	63330323	63353729	1.92276080296572e-15	63742953	63754041
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	63747995	63778254	13	13	0.4761	1.92276080296572e-15	63742953	63754041	4.0256170590595e-14	63771921	63783862
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	63779767	65005694	596	586	0.0486	4.0256170590595e-14	63771921	63783862	7.75644548709378e-16	64998691	65017132
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65007383	65062840	23	23	0.391	7.75644548709378e-16	64998691	65017132	2.27160531878457e-27	65055650	65067194
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65065965	99035340	11478	11273	-0.0029	2.27160531878457e-27	65055650	65067194	1.04299709204251e-20	99025912	99040575
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99037126	99074552	17	17	0.2935	1.04299709204251e-20	99025912	99040575	1.11970215915832e-08	99068718	99082451
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	106733851	2522	2480	-0.0144	1.11970215915832e-08	99068718	99082451	7.08694005526317e-09	106732431	106733851
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	0.6261	7.08694005526317e-09	106732431	106733851	7.64486024812213e-18	106747920	106754784
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	10134	-0.0103	7.64486024812213e-18	106747920	106754784	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	292	0.0377	NA	NA	NA	1.40591979251952e-22	736988	736988
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.8405	1.40591979251952e-22	736988	736988	4.25461059208831e-16	743223	745410
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3385	0.0087	4.25461059208831e-16	743223	745410	9.65633198386663e-54	9523923	9531133
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	0.9005	9.65633198386663e-54	9523923	9531133	1.56461382632772e-50	9589725	9599999
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	10466791	332	323	0.004	1.56461382632772e-50	9589725	9599999	3.63802333041838e-09	10464018	10477903
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10470425	10485848	7	7	-0.4944	3.63802333041838e-09	10464018	10477903	2.50486362126601e-08	10477903	10493984
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11395862	312	307	-0.0087	2.50486362126601e-08	10477903	10493984	7.89071505321964e-05	11376829	11419189
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11440927	7	7	-0.374	7.89071505321964e-05	11376829	11419189	1.12950405576524e-06	11435643	11471117
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11452868	19359838	2756	2713	0.0034	1.12950405576524e-06	11435643	11471117	1.90285704515137e-121	19358397	19359838
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19361660	19469446	55	55	0.6246	1.90285704515137e-121	19358397	19359838	1.98575092008372e-128	19469446	19471947
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19471947	46981780	8256	8106	-0.0022	1.98575092008372e-128	19469446	19471947	3.90945105038764e-09	46974773	46988969
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46986283	46996769	5	5	-0.5753	3.90945105038764e-09	46974773	46988969	1.80621744936648e-37	46992235	46999450
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	80662066	11856	11631	0.013	1.80621744936648e-37	46992235	46999450	4.91477998434041e-39	80662066	80662066
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-0.9686	4.91477998434041e-39	80662066	80662066	7.80070213384477e-45	80666751	80666751
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	122479068	14426	14198	0.0099	7.80070213384477e-45	80666751	80666751	8.49535656535422e-49	122474053	122481150
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	122481150	122516523	14	14	0.4408	8.49535656535422e-49	122474053	122481150	2.90404998371519e-17	122513364	122521294
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	122518047	128864471	2012	1960	-0.0342	2.90404998371519e-17	122513364	122521294	1.13972563796558e-24	128862871	128864471
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128867067	128888941	12	12	0.5763	1.13972563796558e-24	128862871	128864471	5.30934883716349e-25	128888941	128890948
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128890948	132013411	1249	1221	-0.0305	5.30934883716349e-25	128888941	128890948	1.70898766632153e-11	131998768	132034721
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132014758	132091704	28	28	0.2464	1.70898766632153e-11	131998768	132034721	3.2260510366286e-06	132052963	132104100
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132094863	132289090	77	77	-0.0022	3.2260510366286e-06	132052963	132104100	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7204	-0.0082	NA	NA	NA	1.88143801565066e-69	37953582	37953582
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.4493	1.88143801565066e-69	37953582	37953582	2.28509930439953e-73	37957844	37957844
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	44890846	2884	2827	-0.005	2.28509930439953e-73	37957844	37957844	2.08653230111173e-15	44884803	44894857
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	44892219	44921591	19	19	0.299	2.08653230111173e-15	44884803	44894857	5.45979307407631e-11	44912824	44935135
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	44924107	49964838	1976	1936	5e-04	5.45979307407631e-11	44912824	44935135	1.91255475412553e-17	49964838	49964838
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.1984	1.91255475412553e-17	49964838	49964838	5.66385756764726e-15	49971732	49971732
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1786	-0.0172	5.66385756764726e-15	49971732	49971732	1.74211291519739e-06	56579575	56663137
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56711774	23	23	0.2147	1.74211291519739e-06	56579575	56663137	9.60797168605746e-07	56688605	56768199
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56717816	71375082	3615	3531	-0.0146	9.60797168605746e-07	56688605	56768199	6.22543762066465e-37	71375082	71375082
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-1.7947	6.22543762066465e-37	71375082	71375082	5.83570441527569e-36	71377671	71377671
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13751	-0.0227	5.83570441527569e-36	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19295733	12	11	-0.0301	NA	NA	NA	0.000245931284063385	18544772	19381851
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19297767	19494416	48	47	0.2886	0.000245931284063385	18544772	19381851	6.15329254966784e-14	19483933	19548246
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	20030143	262	259	0.0176	6.15329254966784e-14	19483933	19548246	6.81792845313349e-10	20025635	20030143
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20034343	20052836	11	11	0.4522	6.81792845313349e-10	20025635	20030143	1.81610264162947e-25	20052836	20058465
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20055469	34674458	5417	5302	0.0138	1.81610264162947e-25	20052836	20058465	1.92519194157900e-22	34674458	34674458
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.2136	1.925191941579e-22	34674458	34674458	2.44344873736928e-24	34683810	34683810
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1868	0.0047	2.44344873736928e-24	34683810	34683810	3.76154617402223e-08	40663660	40691119
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.4426	3.76154617402223e-08	40663660	40691119	1.91506051945419e-08	40704122	40746865
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	73071404	11764	11529	1e-04	1.91506051945419e-08	40704122	40746865	1.72258470209485e-12	73060301	73071404
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	0.5673	1.72258470209485e-12	73060301	73071404	3.68895029690835e-22	73092112	73101327
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	101386830	10503	10305	-0.0108	3.68895029690835e-22	73092112	73101327	1.30708614905120e-20	101378188	101390140
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101387949	101393735	4	4	-0.4586	1.3070861490512e-20	101378188	101390140	0.000114413583709003	101390140	101397277
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101394805	105597555	1708	1677	0.0209	0.000114413583709003	101390140	101397277	0	105597555	105597555
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-2.6471	0	105597555	105597555	1.60004220747704e-178	105632168	105632168
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106214372	177	173	-0.0339	1.60004220747704e-178	105632168	105632168	2.35734923751226e-07	106193881	106218059
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.3908	2.35734923751226e-07	106193881	106218059	2.43434518390832e-08	106252126	106260962
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106309780	22	21	-0.007	2.43434518390832e-08	106252126	106260962	0.000172990326729084	106301621	106329780
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106311855	106347909	10	10	0.3416	0.000172990326729084	106301621	106329780	0.00859535816005831	106334465	106347909
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106349756	106358491	4	4	0.0377	0.00859535816005831	106334465	106347909	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.0645	NA	NA	NA	2.41688732613453e-06	18692865	18818949
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20308014	151	150	-0.5428	2.41688732613453e-06	18692865	18818949	1.41785336092362e-227	20079935	20310916
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	32456500	3670	3599	-0.0129	1.41785336092362e-227	20079935	20310916	2.57036298313605e-79	32454294	32514939
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.7638	2.57036298313605e-79	32454294	32514939	1.06208274178383e-33	32583146	32594200
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	1.06208274178383e-33	32583146	32594200	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	32714483	18	18	0.0621	NA	NA	NA	2.99460510442232e-35	32714483	32714483
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32721469	32762005	8	8	-1.025	2.99460510442232e-35	32714483	32714483	8.93656170991439e-47	32762005	32762005
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32772265	53881556	8648	8511	0	8.9365617099144e-47	32762005	32762005	1.37710387922199e-09	53879197	53881556
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53884978	53888947	2	2	0.7488	1.37710387922199e-09	53879197	53881556	1.89062154257072e-07	53888947	53888947
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53894752	54045770	72	70	-0.0189	1.89062154257072e-07	53888947	53888947	5.86234265978673e-09	54045770	54045770
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	54047917	54047985	2	2	0.8247	5.86234265978673e-09	54045770	54045770	1.83794749394249e-08	54047985	54056424
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	54056424	75084803	9266	9086	0.0096	1.83794749394249e-08	54047985	54056424	2.46387731832678e-09	75075615	75097809
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75086633	75115806	16	16	0.3149	2.46387731832678e-09	75075615	75097809	1.38954668002607e-34	75115806	75115806
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	2.9016	1.38954668002607e-34	75115806	75115806	4.37292629670684e-36	75119713	75119713
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	75131479	7	6	0.5506	4.37292629670684e-36	75119713	75119713	1.70142486008519e-10	75130268	75132915
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75132915	100298352	9428	9267	-0.0115	1.70142486008519e-10	75130268	75132915	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	142249	45	44	0.0426	NA	NA	NA	7.26443951457509e-10	138511	142249
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	144466	152285	4	4	-0.5779	7.26443951457509e-10	138511	142249	5.97318601115753e-28	152285	155724
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	155724	31854794	10522	10344	0.0221	5.97318601115753e-28	152285	155724	5.65932932390047e-34	31813741	32518665
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	33538171	46	45	0.2347	5.65932932390047e-34	31813741	32518665	1.9049178001854e-16	33525500	33846647
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	45365744	338	327	-0.0275	1.9049178001854e-16	33525500	33846647	5.25806534638014e-09	45353565	45371666
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45368675	45394416	11	11	0.3238	5.25806534638014e-09	45353565	45371666	3.99705004359407e-08	45391840	45401648
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45396411	57203733	3943	3877	-0.0092	3.99705004359407e-08	45391840	45401648	6.62482310774863e-17	57203733	57203733
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.2643	6.62482310774863e-17	57203733	57203733	3.96758982800966e-29	57206772	57206772
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3329	0.0175	3.96758982800966e-29	57206772	57206772	2.48553307082302e-26	68687301	68693086
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68710277	1	0	NA	2.48553307082302e-26	68687301	68693086	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68753209	9	9	-0.4758	NA	NA	NA	7.95215445566546e-12	68753209	68842364
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	73922165	1837	1804	0.0203	7.95215445566546e-12	68753209	68842364	1.39565512398193e-08	73921010	73922165
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73924957	73926621	2	2	-0.882	1.39565512398193e-08	73921010	73922165	9.87522500841566e-09	73926621	73926621
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73928484	75093957	375	368	0.0181	9.87522500841566e-09	73926621	73926621	5.15629724598364e-20	75093957	75093957
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1242	5.15629724598364e-20	75093957	75093957	3.44504138193535e-21	75100865	75100865
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5028	-0.0169	3.44504138193535e-21	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11810	0.0254	NA	NA	NA	1.22186352776293e-28	31443186	31470227
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.3358	1.22186352776293e-28	31443186	31470227	2.20569116669108e-15	31490899	31893451
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1779	0.0504	2.20569116669108e-15	31490899	31893451	1.99181212214276e-22	36672710	36673853
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.869	1.99181212214276e-22	36672710	36673853	3.17028465501323e-26	36684619	36684619
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36785286	47	47	-0.0299	3.17028465501323e-26	36684619	36684619	3.38058454175317e-05	36778929	36785286
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36787465	36792511	4	4	0.4426	3.38058454175317e-05	36778929	36785286	2.4120844570197e-20	36792511	36802771
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36793796	73930042	13794	13531	0.0329	2.4120844570197e-20	36792511	36802771	2.52391086557149e-19	73920937	73933740
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73931462	73956219	14	14	0.3636	2.52391086557149e-19	73920937	73933740	5.57838661653088e-09	73951734	73963637
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73958885	78653545	1898	1868	0.0129	5.57838661653088e-09	73951734	73963637	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10809	-0.0114	NA	NA	NA	5.33063190962641e-09	36509250	36509250
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-0.9127	5.33063190962641e-09	36509250	36509250	1.96632618186909e-08	36519728	36519728
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	65357415	8782	8600	-0.0204	1.96632618186909e-08	36519728	36519728	1.60279108538227e-11	65356061	65357415
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65359770	65367911	4	4	-0.7504	1.60279108538227e-11	65356061	65357415	2.62812116856249e-11	65367911	65369843
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65369843	76116026	3194	3153	-0.0366	2.62812116856249e-11	65367911	65369843	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	211	0.0645	NA	NA	NA	2.9000796104416e-10	790526	790526
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	-0.8707	2.9000796104416e-10	790526	790526	1.93584548675935e-09	794978	798817
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	19694025	8806	8636	0.0838	1.93584548675935e-09	794978	798817	3.72141929552086e-203	19694025	19694025
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-3.407	3.72141929552086e-203	19694025	19694025	1.52799514278976e-199	19700620	19700620
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	46032427	6122	6013	0.0396	1.52799514278976e-199	19700620	19700620	6.16869310593795e-19	46027876	46046859
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46046859	46063357	6	6	0.5246	6.16869310593795e-19	46027876	46046859	1.63658348731658e-08	46060523	46087549
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46086240	46318235	75	74	0.0311	1.63658348731658e-08	46060523	46087549	8.14041119107027e-07	46291901	46329350
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46322704	46391814	25	25	0.2661	8.14041119107027e-07	46291901	46329350	6.36259839726167e-06	46377200	46419097
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46393733	53428009	3021	2979	0.065	6.36259839726167e-06	46377200	46419097	1.33064287907833e-06	53406385	53433916
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53429379	53452412	13	13	-0.1793	1.33064287907833e-06	53406385	53433916	2.0576371779821e-05	53450569	53468198
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53454533	55769042	1063	1049	0.1008	2.0576371779821e-05	53450569	53468198	2.16809834870238e-32	55769042	55769042
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-1.6616	2.16809834870238e-32	55769042	55769042	3.99064829540176e-29	55772729	55772729
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	59414898	1698	1670	0.0466	3.99064829540176e-29	55772729	55772729	6.7685280892615e-27	59414645	59421197
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59440262	11	11	-0.6389	6.7685280892615e-27	59414645	59421197	9.02686885005585e-13	59434202	59441741
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	59586140	75	73	-0.0496	9.02686885005585e-13	59434202	59441741	2.45852993968218e-14	59583017	59591414
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59587098	59629931	18	18	0.4691	2.45852993968218e-14	59583017	59591414	4.45415591304452e-16	59620924	59635540
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59632147	60903915	525	516	0.0652	4.45415591304452e-16	59620924	59635540	7.48809154541516e-07	60880146	60912183
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60905890	60940332	22	21	0.3107	7.48809154541516e-07	60880146	60912183	9.78279759185122e-09	60937614	60954937
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60941502	63788698	1353	1332	0.0249	9.78279759185122e-09	60937614	60954937	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	578	-0.011	NA	NA	NA	5.33520419619037e-174	1511632	1511632
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1525300	6	6	-2.5341	5.33520419619037e-174	1511632	1511632	0.0476384664714125	1516966	1525300
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	1531162	2	2	-1.0852	0.0476384664714125	1516966	1525300	9.36610935431406e-13	1531162	1531162
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	3934118	1029	1017	0.0305	9.36610935431406e-13	1531162	1531162	1.06284917643901e-06	3921655	3943031
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3935616	3972412	17	17	0.3116	1.06284917643901e-06	3921655	3943031	1.30493731993535e-21	3957425	3989358
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3975880	42519402	12598	12397	-0.0114	1.30493731993535e-21	3957425	3989358	3.88558641111587e-22	42519402	42519402
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	42522999	42524213	2	2	-1.0083	3.88558641111587e-22	42519402	42519402	1.02629557634144e-11	42524213	42524213
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	42525828	62419534	7338	7221	-0.0092	1.02629557634144e-11	42524213	42524213	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	38499544	9406	9251	-0.013	NA	NA	NA	7.10351217093569e-07	38498057	38501105
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	38501105	38506779	5	5	0.4967	7.10351217093569e-07	38498057	38501105	7.47479829605591e-07	38505661	38511169
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	38508284	44627824	2967	2919	-0.0146	7.47479829605591e-07	38505661	38511169	1.99852360133457e-17	44622136	44634707
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44634707	44671482	15	14	0.4627	1.99852360133457e-17	44622136	44634707	1.08292371145201e-17	44669596	44673205
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44672408	46922972	1048	1031	-0.005	1.08292371145201e-17	44669596	44673205	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16997040	718	705	0.0371	NA	NA	NA	4.76244425562722e-07	16995963	16997040
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16998110	17001076	3	3	0.7219	4.76244425562722e-07	16995963	16997040	1.08738196307156e-22	17001076	17001076
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17006871	17008019	2	2	-0.8127	1.08738196307156e-22	17001076	17001076	1.9367523664092e-06	17008019	17011485
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17011485	22667608	2260	2224	0.0111	1.9367523664092e-06	17008019	17011485	1.00846483267690e-18	22643742	22679305
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	19	0.4581	1.0084648326769e-18	22643742	22679305	5.29824890487062e-21	22714979	22735036
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	35472378	6548	6398	0.0099	5.29824890487062e-21	22714979	22735036	3.15830621920174e-25	35472378	35472378
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.5051	3.15830621920174e-25	35472378	35472378	1.1835738513736e-26	35476942	35476942
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	40646323	2801	2743	0.0482	1.1835738513736e-26	35476942	35476942	2.73678670144934e-08	40634633	40654106
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40646903	40692562	30	29	0.279	2.73678670144934e-08	40634633	40654106	5.76155783478982e-15	40683651	40710148
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40696154	40696154	1	0	NA	5.76155783478982e-15	40683651	40710148	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40697399	49571068	4171	4087	-0.001	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	937699	634	622	0.0701	NA	NA	NA	3.11873461241058e-18	935713	939944
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	939030	1125802	13	13	0.5895	3.11873461241058e-18	935713	939944	3.05285839339503e-16	953270	1129075
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1125840	2228949	682	673	0.102	3.05285839339503e-16	953270	1129075	1.43646788284146e-06	2211208	2234289
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2229019	2260134	27	27	0.3008	1.43646788284146e-06	2211208	2234289	1.27909598008772e-14	2258920	2264426
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2260580	2638587	370	366	0.0232	1.27909598008772e-14	2258920	2264426	1.06039661115415e-07	2637964	2638587
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2640451	2640484	2	2	0.7526	1.06039661115415e-07	2637964	2638587	4.01602044648882e-05	2640484	2642054
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2642054	2708291	65	64	-0.0503	4.01602044648882e-05	2640484	2642054	6.01207704409984e-187	2708291	2711273
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1765	0.8932	6.01207704409984e-187	2708291	2711273	1.21109903782802e-15	8446489	8458058
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	7	0.3257	1.21109903782802e-15	8446489	8458058	9.08623019945126e-14	8463131	8477126
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	9.08623019945126e-14	8463131	8477126	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	72774795	20305	19923	0.9382	NA	NA	NA	1.13129782012877e-12	72723345	72815704
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	72815704	72844130	8	7	1.5212	1.13129782012877e-12	72723345	72815704	8.81228100298997e-08	72829240	72850893
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	72848308	76998610	827	811	0.9589	8.81228100298997e-08	72829240	72850893	1.28322635774612e-22	76998610	76998610
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.7227	1.28322635774612e-22	76998610	76998610	6.02597952296313e-26	77010018	77010018
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	115595986	9974	9798	0.9467	6.02597952296313e-26	77010018	77010018	1.37431903521365e-18	115572240	115634154
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	115617407	115698539	17	17	1.4654	1.37431903521365e-18	115572240	115634154	3.19087337314776e-07	115694572	115711419
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	115702436	115810676	20	20	0.9881	3.19087337314776e-07	115694572	115711419	8.03492346437656e-08	115798694	115810676
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	115813824	115813824	1	0	NA	8.03492346437656e-08	115798694	115810676	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	115828575	115840144	3	3	0.0446	NA	NA	NA	7.42527407458169e-21	115840144	115844154
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	115844154	154582414	12178	11963	0.9327	7.42527407458169e-21	115840144	115844154	0	154578922	154582414
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	199	-0.0017	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-3.5444	NA	NA	NA	1.67620490981948e-24	3223585	3773948
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.907	1.67620490981948e-24	3223585	3773948	6.78579086328327e-12	5531459	6692482
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-3.3556	6.78579086328327e-12	5531459	6692482	6.44018420301709e-09	7029972	7124918
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7248437	47	47	-2.0404	6.44018420301709e-09	7029972	7124918	3.09853880832395e-05	7242656	7249762
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7249762	7256919	5	5	-4.6531	3.09853880832395e-05	7242656	7249762	0.000486241112193102	7254722	7264547
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7258171	7461576	69	68	-2.3035	0.000486241112193102	7254722	7264547	3.2075385017795e-07	7384405	7590569
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7722458	81	78	-3.4641	3.2075385017795e-07	7384405	7590569	2.19932118844595e-05	7702787	7723783
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	17	-1.9501	2.19932118844595e-05	7702787	7723783	0.000329440028724667	7776265	7829133
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8010446	62	61	-3.1412	0.000329440028724667	7776265	7829133	3.24377087241967e-05	7926989	8048263
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8174858	34	34	-4.1501	3.24377087241967e-05	7926989	8048263	0.000659144701165566	8144929	8292347
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8176058	8176058	1	0	NA	0.000659144701165566	8144929	8292347	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8178487	8538835	86	83	-3.3488	NA	NA	NA	0.000614375528723446	8427047	8560621
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8685946	52	51	-2.6108	0.000614375528723446	8427047	8560621	1.06045711858049e-06	8641679	8714581
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8687580	10513747	194	192	-3.4917	1.06045711858049e-06	8641679	8714581	2.32968100446987e-27	10511255	10515697
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	18	-0.7315	2.32968100446987e-27	10511255	10515697	3.58950636779676e-21	11673476	11698871
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	11	-3.8349	3.58950636779676e-21	11673476	11698871	1.74892830438962e-13	12541506	12542979
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12593244	26	25	-1.4506	1.74892830438962e-13	12541506	12542979	0.000221400389461907	12585240	12601014
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12594824	12611624	9	9	-2.9043	0.000221400389461907	12585240	12601014	0.000516935133188456	12605673	12625208
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	18	-1.4782	0.000516935133188456	12605673	12625208	1.05164583515683e-14	12668435	12687167
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12796639	18	18	-3.6224	1.05164583515683e-14	12668435	12687167	5.49567487945061e-07	12786515	12845704
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12804329	13128515	117	115	-2.0762	5.49567487945061e-07	12786515	12845704	1.62001405883833e-06	13104920	13136828
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13158272	16	16	-3.6821	1.62001405883833e-06	13104920	13136828	0.0241214030800730	13148290	13230706
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13159901	13256555	27	26	-2.575	0.024121403080073	13148290	13230706	1.44756277529439e-07	13236901	13261173
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13329968	25	25	-4.2219	1.44756277529439e-07	13236901	13261173	0.00239543160315323	13313420	13392751
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13330707	13330707	1	0	NA	0.00239543160315323	13313420	13392751	NA	NA	NA
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13331749	13918652	207	202	-3.4984	NA	NA	NA	0.00251622111098591	13729067	13988962
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13918766	14104210	94	93	-3.927	0.00251622111098591	13729067	13988962	5.75370726778296e-11	14093152	14225706
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14112032	14508021	135	133	-2.9693	5.75370726778296e-11	14093152	14225706	3.93399224056503e-08	14498784	14536962
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	26	-1.4902	3.93399224056503e-08	14498784	14536962	9.55919574595364e-05	14561228	14579298
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-3.8469	9.55919574595364e-05	14561228	14579298	2.32803721261482e-10	14598838	14598838
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.8891	2.32803721261482e-10	14598838	14598838	1.83204475338874e-07	14644293	14684159
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15139441	103	99	-3.3934	1.83204475338874e-07	14644293	14684159	0.000212499259062691	15107365	15149506
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15165820	17	17	-2.3731	0.000212499259062691	15107365	15149506	0.000207203113023450	15155598	15176870
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15208612	23	23	-3.6645	0.00020720311302345	15155598	15176870	4.48169465773589e-10	15206674	15209166
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15244060	12	12	-1.6492	4.48169465773589e-10	15206674	15209166	5.49066090186502e-05	15241527	15258525
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15244992	16218742	380	373	-3.2108	5.49066090186502e-05	15241527	15258525	1.42242263805215e-05	16040789	16677667
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16219596	22139807	972	946	-3.5454	1.42242263805215e-05	16040789	16677667	6.46821249142715e-05	22043133	22139807
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.838	6.46821249142715e-05	22043133	22139807	0.000153079774029208	22176501	22177335
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.0734	0.000153079774029208	22176501	22177335	0.000235852226052296	22192409	22204143
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	24	-4.5288	0.000235852226052296	22192409	22204143	9.69780607326756e-06	22249988	22407622
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	25737663	66	61	-3.4592	9.69780607326756e-06	22249988	22407622	5.30614940527794e-32	23283689	26873861
MSK_252152915097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	79	-1.1388	5.30614940527794e-32	23283689	26873861	NA	NA	NA
