Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	19821227	6953	6757	0.0108	NA	NA	NA	3.23796567960907e-09	19821227	19821227
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	19822909	19824312	2	2	-0.9483	3.23796567960907e-09	19821227	19821227	7.51103094487926e-11	19824312	19828832
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	19826300	19826300	1	0	NA	7.51103094487926e-11	19824312	19828832	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	19828832	72537426	20938	20313	0.0022	NA	NA	NA	1.52599686497322e-16	72534975	72540240
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	13	0.4923	1.52599686497322e-16	72534975	72540240	6.47441741614335e-18	72568009	72589682
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	103904723	10106	9801	-0.0087	6.47441741614335e-18	72568009	72589682	1.95041508634475e-38	103901454	103906464
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	15	0.6672	1.95041508634475e-38	103901454	103906464	5.81366012486852e-37	103956767	104012520
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	109373255	1286	1245	-0.0113	5.81366012486852e-37	103956767	104012520	3.07440384007896e-13	109373255	109373255
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.1297	3.07440384007896e-13	109373255	109373255	2.04874520986245e-14	109376249	109376249
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109987341	280	275	0.0114	2.04874520986245e-14	109376249	109376249	1.91345238773296e-35	109987341	109987341
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.7926	1.91345238773296e-35	109987341	109987341	2.54696830308692e-34	109989998	109989998
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	146290772	4569	4420	-0.0054	2.54696830308692e-34	109989998	109989998	2.77755449763520e-26	146273223	147308557
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146294654	148125669	52	51	0.3095	2.7775544976352e-26	146273223	147308557	6.42456987080005e-27	148088434	148137913
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148128113	150819879	1245	1210	0.0056	6.42456987080005e-27	148088434	148137913	2.26510049191397e-296	150819879	150819879
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	2.3012	2.26510049191397e-296	150819879	150819879	5.07658935523284e-288	150851439	150851439
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2680	0.0017	5.07658935523284e-288	150851439	150851439	1.08615057048499e-23	157133150	157133150
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.4641	1.08615057048499e-23	157133150	157133150	4.79158271852521e-24	157136342	157136342
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167481271	4107	3982	-0.0055	4.79158271852521e-24	157136342	157136342	5.22900083791491e-12	167477428	167481271
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167483267	167483267	1	0	NA	5.22900083791491e-12	167477428	167481271	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5204	NA	NA	NA	8.6204456023922e-12	167507898	167520743
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	7001	-0.0089	8.6204456023922e-12	167507898	167520743	8.82656470383985e-12	185979586	185979586
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.0691	8.82656470383985e-12	185979586	185979586	5.73660436218925e-13	185988138	185988138
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	186825802	132	126	0.0037	5.73660436218925e-13	185988138	185988138	2.38587791162553e-130	186825802	186825802
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186835114	186916780	21	21	-0.972	2.38587791162553e-130	186825802	186825802	3.02534666004589e-112	186916780	186916780
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186918512	192715640	1338	1297	-0.0052	3.02534666004589e-112	186916780	186916780	2.00428129220949e-12	192715640	192715640
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-1.0658	2.00428129220949e-12	192715640	192715640	2.30846716751961e-12	192719540	192719540
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	200600795	2644	2575	0.0098	2.30846716751961e-12	192719540	192719540	3.16568934117369e-12	200585836	200623556
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200602881	200787319	37	36	-0.244	3.16568934117369e-12	200585836	200623556	1.20477117558200e-10	200676505	200810641
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	246429285	17182	16683	-0.0036	1.204771175582e-10	200676505	200810641	9.09182997993721e-18	246405101	246442698
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246430621	246553447	44	43	0.2763	9.09182997993721e-18	246405101	246442698	6.29885563880678e-05	246516224	246586253
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246554919	246769018	58	55	0.0787	6.29885563880678e-05	246516224	246586253	2.90271541867965e-07	246738832	246822838
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246878405	31	30	0.3588	2.90271541867965e-07	246738832	246822838	5.44786163240325e-20	246860551	246902260
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246882156	247186514	94	89	0.0068	5.44786163240325e-20	246860551	246902260	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	19436088	5681	5514	-0.0103	NA	NA	NA	9.08691596121676e-18	19434112	19436088
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	19439869	19447141	4	4	-0.9091	9.08691596121676e-18	19434112	19436088	3.37581406679618e-17	19447141	19447141
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	19456020	34554208	5840	5675	5e-04	3.37581406679618e-17	19447141	19447141	4.35429002894972e-11	34543992	34558824
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34556434	34589997	15	15	0.3817	4.35429002894972e-11	34543992	34558824	5.46131750163754e-12	34580533	34597294
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	462	0.0014	5.46131750163754e-12	34580533	34597294	2.64149932648865e-11	35821494	35821494
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.0129	2.64149932648865e-11	35821494	35821494	1.19158348113323e-10	35844884	35844884
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37789939	878	857	-0.0013	1.19158348113323e-10	35844884	35844884	1.04081714449377e-16	37781427	37810001
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	26	-0.3537	1.04081714449377e-16	37781427	37810001	8.5217333363993e-17	37847519	37863712
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5639	-9e-04	8.5217333363993e-17	37847519	37863712	1.87975434406572e-15	52600588	52600588
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.87975434406572e-15	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8608	NA	NA	NA	8.05209790082548e-16	52635695	52639605
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	242495169	59021	57217	-0.0063	8.05209790082548e-16	52635695	52639605	1.20200484021015e-13	242471854	242525959
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242496751	242689978	69	66	0.1932	1.20200484021015e-13	242471854	242525959	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10474	-0.0093	NA	NA	NA	1.50613969437902e-31	32074432	32074432
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.6849	1.50613969437902e-31	32074432	32074432	2.33649255127373e-29	32080848	32080848
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5256	-3e-04	2.33649255127373e-29	32080848	32080848	2.96893526326384e-196	47460892	47460892
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.3105	2.96893526326384e-196	47460892	47460892	2.65411327070473e-204	47466921	47466921
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	53001678	2442	2383	0.0136	2.65411327070473e-204	47466921	47466921	7.27925644890381e-23	53001678	53001678
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.9144	7.27925644890381e-23	53001678	53001678	4.1133125462508e-22	53011885	53014254
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	163992903	34821	33763	-0.0086	4.1133125462508e-22	53011885	53014254	1.00673700298577e-22	163984178	164005577
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	25	-0.4191	1.00673700298577e-22	163984178	164005577	3.97653389534154e-24	164100804	164121847
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9823	-0.004	3.97653389534154e-24	164100804	164121847	0	194354505	194354505
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.6009	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196904349	998	971	0.0058	0	194366950	194366950	4.45429566681153e-18	196820428	196905767
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196905767	196929826	19	19	-0.4369	4.45429566681153e-18	196820428	196905767	6.46451807647052e-21	196929805	196942158
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	198038358	440	425	0.0289	6.46451807647052e-21	196929805	196942158	1.29848015091952e-08	198036999	198038358
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-0.8865	1.29848015091952e-08	198036999	198038358	8.33672341182533e-09	198042681	198042681
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	199329592	521	501	0.0167	8.33672341182533e-09	198042681	198042681	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9272	-0.0076	NA	NA	NA	1.17076494220978e-10	34439897	34445002
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	5	-0.6475	1.17076494220978e-10	34439897	34445002	1.06127318263649e-10	34491115	34506297
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8615	-0.0071	1.06127318263649e-10	34491115	34506297	5.55252021447119e-37	68901210	69075140
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.7039	5.55252021447119e-37	68901210	69075140	2.08654908543921e-37	69153675	69643272
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	119334954	16298	15802	-0.0082	2.08654908543921e-37	69153675	69643272	1.20286599405074e-132	119334954	119334954
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-2.822	1.20286599405074e-132	119334954	119334954	1.75940361645429e-137	119348829	119348829
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	138307863	4214	4102	-0.0078	1.75940361645429e-137	119348829	119348829	1.97082048919796e-12	138307863	138307863
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-1.0551	1.97082048919796e-12	138307863	138307863	1.62608148821355e-11	138319409	138319409
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	173224400	10676	10354	-0.0107	1.62608148821355e-11	138319409	138319409	1.2820439006403e-34	173224400	173224400
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.7632	1.2820439006403e-34	173224400	173224400	1.52445273803694e-37	173228860	173228860
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	186	-0.0105	1.52445273803694e-37	173228860	173228860	3.49822464875957e-117	173660684	173660684
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.1838	3.49822464875957e-117	173660684	173660684	8.68263484759034e-114	173666072	173666072
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175860235	743	729	-0.0158	8.68263484759034e-114	173666072	173666072	1.06857951349266e-56	175860235	175860235
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	-2.4711	1.06857951349266e-56	175860235	175860235	1.76698948233282e-67	175863396	175863396
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3239	-0.0054	1.76698948233282e-67	175863396	175863396	2.49073119497787e-253	187330240	187330240
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.6588	2.49073119497787e-253	187330240	187330240	1.63868745748878e-222	187333619	187333619
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1202	-0.0104	1.63868745748878e-222	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	189	0.021	NA	NA	NA	9.41590223246908e-09	681141	681141
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	-0.9969	9.41590223246908e-09	681141	681141	2.44578581711625e-10	686701	686701
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	21480789	6153	5968	-0.0061	2.44578581711625e-10	686701	686701	5.00103309054886e-19	21480789	21480789
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.336	5.00103309054886e-19	21480789	21480789	2.93384384031446e-19	21487474	21487474
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	106249939	22897	22180	-0.0094	2.93384384031446e-19	21487474	21487474	1.50491354143341e-12	106249939	106249939
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	106257356	106260946	2	2	-1.0926	1.50491354143341e-12	106249939	106249939	3.53631543535501e-13	106260946	106260946
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	106272412	127434789	6065	5894	-0.0131	3.53631543535501e-13	106260946	106260946	1.25375197374412e-190	127434789	127434789
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-4.0241	1.25375197374412e-190	127434789	127434789	3.9115613455171e-184	127438118	127438118
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	137206340	3484	3380	0.0048	3.9115613455171e-184	127438118	127438118	2.59879834382905e-20	137206340	137206340
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137209407	137215697	3	3	-1.103	2.59879834382905e-20	137206340	137206340	1.51205557376374e-19	137215697	137215697
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137217348	155405839	6676	6496	-0.0019	1.51205557376374e-19	137215697	137215697	4.9897407130396e-16	155404062	155405839
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155420791	4	4	-0.8688	4.9897407130396e-16	155404062	155405839	4.452673683138e-16	155420791	155420791
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155421443	178040439	7249	7057	-0.0014	4.452673683138e-16	155420791	155420791	3.35850258173734e-13	178040439	178040439
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	1.1149	3.35850258173734e-13	178040439	178040439	3.2719295509309e-12	178045608	178045608
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180342860	908	883	0.024	3.2719295509309e-12	178045608	178045608	1.99692283498126e-15	180189516	180344964
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6353	1.99692283498126e-15	180189516	180344964	1.66054643432875e-12	180357210	180362342
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180491520	45	41	0.0164	1.66054643432875e-12	180357210	180362342	5.33190959444277e-06	180484951	180491520
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180493549	180502556	5	5	-0.4815	5.33190959444277e-06	180484951	180491520	5.71087749495904e-06	180502556	180512116
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180508005	180644810	62	59	0.0488	5.71087749495904e-06	180502556	180512116	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10288	-0.0047	NA	NA	NA	2.40691774879731e-28	29941766	29962849
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	14	-0.6122	2.40691774879731e-28	29941766	29962849	4.78559935805126e-29	30004636	30010234
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	32558677	1076	1042	0.0043	4.78559935805126e-29	30004636	30010234	5.66270222909879e-180	32558677	32564884
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	6	-2.4766	5.66270222909879e-180	32558677	32564884	1.37211264745043e-06	32588005	32595402
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32628420	7	7	-0.0584	1.37211264745043e-06	32588005	32595402	3.13439158625315e-09	32626619	32628420
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32633691	3	3	-2.1179	3.13439158625315e-09	32626619	32628420	3.05273934417007e-34	32633691	32633691
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.0165	3.05273934417007e-34	32633691	32633691	2.76193490494384e-06	32709263	32720656
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32731072	9	9	0.5942	2.76193490494384e-06	32709263	32720656	6.55033498171654e-17	32728285	32732764
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32732764	54035000	8258	8008	-0.0013	6.55033498171654e-17	32728285	32732764	1.26347096587186e-32	54035000	54035000
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.4151	1.26347096587186e-32	54035000	54035000	1.40888114143573e-33	54042734	54042734
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6249	-0.0086	1.40888114143573e-33	54042734	54042734	2.08991525993398e-19	79015901	79024557
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	0.5368	2.08991525993398e-19	79015901	79024557	1.50887038765967e-20	79085247	79095415
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6554	-0.0084	1.50887038765967e-20	79085247	79095415	1.17119907205371e-30	103841482	103841482
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.1382	1.17119907205371e-30	103841482	103841482	1.28712139266710e-28	103868154	103868154
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	145529772	14106	13710	-0.0103	1.2871213926671e-28	103868154	103868154	1.8333696288118e-215	145529772	145552126
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	145552126	145738936	42	42	-0.9725	1.8333696288118e-215	145529772	145552126	1.46656043905372e-217	145738936	145738936
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	145746793	145746793	1	0	NA	1.46656043905372e-217	145738936	145738936	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	145759289	165643653	6957	6739	-0.0083	NA	NA	NA	4.72225539673087e-20	165643653	165643653
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.9528	4.72225539673087e-20	165643653	165643653	5.34808319534719e-18	165650610	165650610
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1757	-0.0128	5.34808319534719e-18	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	251	-0.0063	NA	NA	NA	1.29402352237154e-11	1033418	1036135
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-1.0735	1.29402352237154e-11	1033418	1036135	0	1038517	1038517
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.1223	0	1038517	1038517	9.05179532952582e-13	1047707	1047707
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	71894353	21525	20880	-3e-04	9.05179532952582e-13	1047707	1047707	5.82647554637207e-92	71894353	71894353
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-2.9268	5.82647554637207e-92	71894353	71894353	2.57478791784189e-98	71912065	71912065
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	93162991	6659	6463	-0.005	2.57478791784189e-98	71912065	71912065	2.36808768617207e-09	93162991	93162991
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.9247	2.36808768617207e-09	93162991	93162991	4.78840742578936e-09	93168978	93168978
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	109217320	6511	6320	-0.0014	4.78840742578936e-09	93168978	93168978	5.82656598452493e-09	109212149	109217320
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109240210	5	5	0.5818	5.82656598452493e-09	109212149	109217320	6.74333461232319e-09	109240210	109245944
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109967918	301	294	-0.0094	6.74333461232319e-09	109240210	109245944	1.19648024589244e-59	109967918	109967918
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-3.2654	1.19648024589244e-59	109967918	109967918	1.60127324441289e-113	109974402	109974402
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	125831554	7169	6940	-0.0127	1.60127324441289e-113	109974402	109974402	4.24197339505118e-34	125831554	125831554
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.4274	4.24197339505118e-34	125831554	125831554	2.13212377847937e-32	125837524	125837524
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3531	-4e-04	2.13212377847937e-32	125837524	125837524	5.71296640882781e-29	133432281	133433384
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.826	5.71296640882781e-29	133432281	133433384	2.11706366769862e-30	133448277	133448277
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3587	0.0032	2.11706366769862e-30	133448277	133448277	1.00525264934751e-11	141405145	141414719
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	0.3956	1.00525264934751e-11	141405145	141414719	7.23277066621874e-10	141435643	141449014
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	142152205	293	283	0.0427	7.23277066621874e-10	141435643	141449014	8.90458408456415e-17	142152205	142156165
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142161005	3	3	-0.9761	8.90458408456415e-17	142152205	142156165	0.00170461725343654	142161005	142166710
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142166710	142167908	3	3	-3.0048	0.00170461725343654	142161005	142166710	3.1594222145551e-138	142167908	142167908
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	156483966	5522	5339	-0.0062	3.1594222145551e-138	142167908	142167908	2.07813298496013e-51	156483966	156483966
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	2	2.2309	2.07813298496013e-51	156483966	156483966	1.11943289044205e-46	156490484	156490484
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158804557	1051	1023	-0.0023	1.11943289044205e-46	156490484	156490484	2.37482038482133e-12	158792914	158811268
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158811268	158821263	3	3	-0.9606	2.37482038482133e-12	158792914	158811268	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	51191560	15312	14892	-0.0027	NA	NA	NA	6.86204327351157e-13	51189068	51191560
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.7998	6.86204327351157e-13	51189068	51191560	3.24958959337172e-13	51200291	51204788
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	3.24958959337172e-13	51200291	51204788	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	146264846	29249	28388	-0.01	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	262805	32	32	0.6102	NA	NA	NA	3.41631607264185e-69	261257	264530
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	264530	23338535	7967	7730	-0.0064	3.41631607264185e-69	261257	264530	3.48092844174397e-10	23331804	23338535
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.6807	3.48092844174397e-10	23331804	23338535	8.3759376442001e-10	23365926	23377660
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4900	-0.0019	8.3759376442001e-10	23365926	23377660	9.57986475333277e-25	70926188	70926188
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.514	9.57986475333277e-25	70926188	70926188	8.68384512294767e-24	70930528	70930528
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9648	-0.0042	8.68384512294767e-24	70930528	70930528	1.11988142806422e-52	100348045	100348045
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.2483	1.11988142806422e-52	100348045	100348045	1.49958008396137e-54	100350814	100350814
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5398	-0.0043	1.49958008396137e-54	100350814	100350814	2.97744260964852e-10	116122595	116124007
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-0.9844	2.97744260964852e-10	116122595	116124007	8.39073282483321e-10	116130333	116130333
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	8037	-1e-04	8.3907328248332e-10	116130333	116130333	5.44779956938747e-15	137352394	137352394
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.2077	5.44779956938747e-15	137352394	137352394	2.40698799614033e-13	137356880	137356880
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1077	-0.0079	2.40698799614033e-13	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9407	-0.0046	NA	NA	NA	2.84367312426975e-20	27038538	27038538
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.3786	2.84367312426975e-20	27038538	27038538	2.47964799038935e-20	27041812	27041812
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	27043861	1	0	NA	2.47964799038935e-20	27041812	27041812	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27045226	77917893	14860	14376	-0.0027	NA	NA	NA	1.28363811513893e-163	77917893	77917893
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.8552	1.28363811513893e-163	77917893	77917893	3.88801220764056e-164	77928669	77928669
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	131650218	18924	18348	-0.0046	3.88801220764056e-164	77928669	77928669	1.67365238817435e-12	131650218	131650218
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	131651597	131652807	2	2	1.0913	1.67365238817435e-12	131650218	131650218	3.61747943712803e-09	131652807	131652807
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	131654669	135285645	1288	1257	-0.0148	3.61747943712803e-09	131652807	131652807	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2073	-0.0099	NA	NA	NA	3.7828978532617e-19	5738494	5745329
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	12	-0.5929	3.7828978532617e-19	5738494	5745329	3.80797968122152e-21	5755299	5765438
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	34913989	10320	10008	-0.0113	3.80797968122152e-21	5755299	5765438	1.25927039982432e-15	34913989	34913989
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34915258	34917516	3	3	-1.0159	1.25927039982432e-15	34913989	34913989	3.93820459546424e-16	34917516	34917516
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34918468	49671267	4244	4108	-0.005	3.93820459546424e-16	34917516	34917516	3.25541834642440e-21	49666382	49683052
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49701463	7	7	-0.7616	3.2554183464244e-21	49666382	49683052	1.15492621386597e-23	49699428	49710027
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49710027	55118214	179	173	-0.0114	1.15492621386597e-23	49699428	49710027	1.13424458603346e-29	55112618	55124730
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	0.3811	1.13424458603346e-29	55112618	55124730	1.17782438103163e-30	55203706	55221692
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	58217976	1206	1166	-0.0159	1.17782438103163e-30	55203706	55221692	3.13463467628082e-09	58217976	58217976
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58220238	58224720	2	2	0.9345	3.13463467628082e-09	58217976	58217976	8.41786923013916e-09	58224720	58224720
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58226682	65359919	2942	2869	0.0114	8.41786923013916e-09	58224720	58224720	2.26001096084730e-10	65359919	65359919
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65360208	65360242	2	2	1.0096	2.2600109608473e-10	65359919	65359919	2.30360309304229e-09	65360242	65360242
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65371979	66463477	486	473	0.0123	2.30360309304229e-09	65360242	65360242	7.98826287175106e-08	66460753	66463477
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9231	7.98826287175106e-08	66460753	66463477	1.41777086897073e-08	66469412	66469412
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	81177333	5234	5067	0.0025	1.41777086897073e-08	66469412	66469412	3.7204999205789e-13	81177333	81177333
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81187470	81192409	2	2	-1.1248	3.7204999205789e-13	81177333	81177333	4.37840151215135e-13	81192409	81192409
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81202118	134450318	18484	17918	-0.0064	4.37840151215135e-13	81192409	81192409	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	288	-0.0072	NA	NA	NA	5.66238759801812e-11	734832	736988
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.7448	5.66238759801812e-11	734832	736988	1.99330462103411e-11	743223	745410
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3346	0.0021	1.99330462103411e-11	743223	745410	3.86747816477981e-56	9523923	9531133
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9582696	10	10	1.0377	3.86747816477981e-56	9523923	9531133	1.24658858079629e-59	9563866	9582696
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9589725	46996769	11733	11398	-0.004	1.24658858079629e-59	9563866	9582696	9.9007856260031e-16	46996769	46996769
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	46999450	2	2	1.2099	9.9007856260031e-16	46996769	46996769	1.93425887172505e-15	46999450	46999450
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47006226	130943064	29122	28244	-6e-04	1.93425887172505e-15	46999450	46999450	9.73653605310157e-17	130943064	130943064
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.2568	9.73653605310157e-17	130943064	130943064	1.80194986454877e-14	130946248	130946248
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	526	0.0019	1.80194986454877e-14	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6826	-0.0093	NA	NA	NA	1.39055582764194e-81	36969571	36969571
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-2.8285	1.39055582764194e-81	36969571	36969571	1.32961351022179e-50	36982877	36982877
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	289	0.0115	1.32961351022179e-50	36982877	36982877	1.99944124425691e-104	37953582	37953582
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.9553	1.99944124425691e-104	37953582	37953582	2.69194509234012e-100	37957844	37957844
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56657371	6686	6493	-0.0078	2.69194509234012e-100	37957844	37957844	6.3808332438863e-53	56650373	56657371
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56686863	15	15	-0.7972	6.3808332438863e-53	56650373	56657371	1.29458766934666e-53	56686863	56688605
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	68136198	2691	2614	-0.0099	1.29458766934666e-53	56686863	56688605	1.37640543178364e-09	68130387	68138912
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68138912	68163523	12	10	0.4064	1.37640543178364e-09	68130387	68138912	2.20546234780784e-09	68161714	68169957
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	71375082	919	901	0.0024	2.20546234780784e-09	68161714	68169957	1.05175053162015e-45	71375082	71375082
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-2.0912	1.05175053162015e-45	71375082	71375082	1.59143097407545e-47	71377671	71377671
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	113788788	13827	13385	-0.0125	1.59143097407545e-47	71377671	71377671	1.08819978214367e-16	113788788	113788788
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.2569	1.08819978214367e-16	113788788	113788788	4.0447203186497e-11	113792974	113792974
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114022835	99	97	0.0031	4.0447203186497e-11	113792974	113792974	6.20978206718273e-12	114018089	114022835
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114024521	114036368	7	7	0.7073	6.20978206718273e-12	114018089	114022835	9.22300551985272e-05	114034668	114036368
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114040642	114048730	6	6	0.367	9.22300551985272e-05	114034668	114036368	0.00125566351974137	114048730	114055783
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114050185	114067067	10	10	0.6651	0.00125566351974137	114048730	114055783	2.69728344009816e-20	114067067	114069852
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114069852	114123340	28	27	0.0252	2.69728344009816e-20	114067067	114069852	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5573	0.0083	NA	NA	NA	2.87033909559507e-14	34674458	34674458
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	0.9679	2.87033909559507e-14	34674458	34674458	2.5770998481349e-15	34683810	34683810
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1841	-0.0041	2.5770998481349e-15	34683810	34683810	6.60454533979998e-20	40670538	40676611
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.6729	6.60454533979998e-20	40670538	40676611	5.66517099601276e-20	40726930	40741934
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	73071404	11764	11377	-0.005	5.66517099601276e-20	40726930	40741934	8.4871246997421e-46	73071404	73071404
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	8.4871246997421e-46	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73083141	3	3	-1.6637	NA	NA	NA	1.1974485858555e-44	73083141	73083141
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73091980	81557350	3794	3678	-8e-04	1.1974485858555e-44	73083141	73083141	4.59968058352255e-10	81552935	81557350
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	81562448	81582262	3	3	0.8068	4.59968058352255e-10	81552935	81557350	7.97548328984595e-10	81582262	81589272
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	81589272	105597555	8421	8160	-0.0024	7.97548328984595e-10	81582262	81589272	0	105597555	105597555
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.5188	0	105597555	105597555	1.37735144104675e-241	105632168	105632168
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105946993	71	67	0.0366	1.37735144104675e-241	105632168	105632168	1.96257168140786e-15	105923686	105951399
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	106002179	18	17	-0.57	1.96257168140786e-15	105923686	105951399	3.56914751533772e-18	105996176	106015449
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	136	0.0454	3.56914751533772e-18	105996176	106015449	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.0832	NA	NA	NA	1.86746840646495e-19	18692865	18741716
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20088256	150	145	-1.1392	1.86746840646495e-19	18692865	18741716	0	20088256	20088256
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	65963189	17873	17367	-0.0037	0	20088256	20088256	1.79147156052095e-19	65959706	65963189
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	65967412	66017174	12	11	0.5799	1.79147156052095e-19	65959706	65963189	3.78098927752500e-20	66017174	66022807
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	66022807	74669752	3670	3564	-3e-04	3.780989277525e-20	66017174	66022807	1.47871486794281e-34	74669752	74669752
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.2521	1.47871486794281e-34	74669752	74669752	1.59876503506469e-29	74680439	74680439
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	165	0.0106	1.59876503506469e-29	74680439	74680439	4.48598475670790e-35	75115806	75115806
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.9106	4.4859847567079e-35	75115806	75115806	3.55020254216472e-40	75119713	75119713
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98232932	8521	8279	-0.005	3.55020254216472e-40	75119713	75119713	1.23529956991356e-13	98232932	98232932
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	-0.9312	1.23529956991356e-13	98232932	98232932	1.12237357619696e-15	98239454	98239454
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	618	-0.0094	1.12237357619696e-15	98239454	98239454	1.11171521566385e-38	99632987	99632987
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.7498	1.11171521566385e-38	99632987	99632987	2.25381627422571e-32	99635701	99635701
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217181	267	257	-6e-04	2.25381627422571e-32	99635701	99635701	1.4360755487293e-06	100212174	100282819
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.5174	1.4360755487293e-06	100212174	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	72941901	19764	19155	0.0049	NA	NA	NA	2.21543444098084e-10	72929786	72941901
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72963578	4	4	-0.7156	2.21543444098084e-10	72929786	72941901	1.50135362124843e-11	72963578	72964783
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72964783	75093957	755	736	1e-04	1.50135362124843e-11	72963578	72964783	3.34713217112629e-41	75093957	75093957
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.0071	3.34713217112629e-41	75093957	75093957	9.09167403549804e-30	75100865	75100865
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75935902	215	208	-0.0144	9.09167403549804e-30	75100865	75100865	1.1751230252099e-15	75935902	75935902
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75937792	75940128	2	2	-1.2353	1.1751230252099e-15	75935902	75935902	5.10804162086469e-15	75940128	75940128
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75941787	88690571	4914	4780	-0.0035	5.10804162086469e-15	75940128	75940128	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	408	0.0155	NA	NA	NA	4.82521250106857e-37	1028979	1028979
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.9032	4.82521250106857e-37	1028979	1028979	1.25339942355326e-41	1030766	1030766
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	428	0.0258	1.25339942355326e-41	1030766	1030766	5.43611858260240e-22	1904451	1904451
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.1504	5.4361185826024e-22	1904451	1904451	3.28092551987981e-21	1906391	1906391
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	31457889	11180	10813	0.0084	3.28092551987981e-21	1906391	1906391	1.86099259778217e-22	31447686	31467971
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	18	-0.4716	1.86099259778217e-22	31447686	31467971	6.04935853486611e-20	31490899	31889566
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32828797	366	357	-0.0068	6.04935853486611e-20	31490899	31889566	3.95336987906045e-13	32828797	32828797
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.073	3.95336987906045e-13	32828797	32828797	2.35456750099955e-12	32832642	32832642
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1416	0.0143	2.35456750099955e-12	32832642	32832642	1.23903692304457e-16	36672710	36673853
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.7216	1.23903692304457e-16	36672710	36673853	1.16522935921658e-15	36684619	36686013
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1979	0.0159	1.16522935921658e-15	36684619	36686013	1.55477572572802e-40	41561017	41570512
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41648545	37	36	-0.4457	1.55477572572802e-40	41561017	41570512	1.97332446108760e-40	41647135	41697532
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	74875257	12216	11821	0.0075	1.9733244610876e-40	41647135	41697532	2.86559339572306e-29	74872990	74877854
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74877854	74904114	15	15	0.6065	2.86559339572306e-29	74872990	74877854	5.44163991629521e-26	74902356	74905971
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74905971	78653545	1456	1417	0.0094	5.44163991629521e-26	74902356	74905971	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22305	-0.007	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	213	0.0241	NA	NA	NA	9.72272119030624e-11	790526	790526
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	798817	3	3	0.898	9.72272119030624e-11	790526	790526	1.34241922189864e-10	798817	801351
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	801351	1398325	270	258	-0.0032	1.34241922189864e-10	798817	801351	4.65557098470266e-17	1398325	1398325
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.4513	4.65557098470266e-17	1398325	1398325	8.64250890621967e-20	1400840	1400840
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1012	0.0107	8.64250890621967e-20	1400840	1400840	7.16895728583668e-09	3588389	3591120
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-0.9527	7.16895728583668e-09	3588389	3591120	3.67620271425721e-10	3593646	3593646
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	7243635	1722	1659	0.0141	3.67620271425721e-10	3593646	3593646	1.59566212813954e-11	7243635	7246012
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7246012	7254650	3	3	0.8593	1.59566212813954e-11	7243635	7246012	4.31782865575706e-11	7250473	7254650
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7304352	11448975	1909	1847	0.0215	4.31782865575706e-11	7250473	7254650	1.40563151827673e-43	11448975	11448975
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	2.0094	1.40563151827673e-43	11448975	11448975	3.16571280602744e-41	11452390	11452390
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	41532062	7974	7740	0.0198	3.16571280602744e-41	11452390	11452390	1.14803937451886e-10	41532062	41532062
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-1.0156	1.14803937451886e-10	41532062	41532062	3.63476117883737e-11	41538649	41538649
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	63788698	9909	9599	0.009	3.63476117883737e-11	41538649	41538649	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	567	0.0043	NA	NA	NA	1.52367057130731e-128	1506379	1506379
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.633	1.52367057130731e-128	1506379	1506379	2.05481850875849e-147	1532433	1532433
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20374	-5e-04	2.05481850875849e-147	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13063	-0.0041	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	18125356	1132	1099	0.0199	NA	NA	NA	9.32332413267748e-11	18125356	18125356
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	1.1198	9.32332413267748e-11	18125356	18125356	5.13139307938283e-12	18129194	18129194
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	22677959	1850	1792	0.0063	5.13139307938283e-12	18129194	18129194	2.82678738786224e-18	22643742	22682428
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22679305	22725305	21	19	0.4494	2.82678738786224e-18	22643742	22682428	1.5861940922175e-19	22718614	22736990
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6357	0.0075	1.5861940922175e-19	22718614	22736990	1.78540187356843e-178	35472378	35472378
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-4.0388	1.78540187356843e-178	35472378	35472378	8.69990340883156e-177	35476942	35476942
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6796	0.0089	8.69990340883156e-177	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	0.0243	NA	NA	NA	1.63550453427854e-13	124528	127113
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.0534	1.63550453427854e-13	124528	127113	3.87604115424701e-16	129544	132689
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	222034	48	48	-0.0539	3.87604115424701e-16	129544	132689	1.75326398767753e-15	222004	222034
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	223009	224571	2	2	-1.3763	1.75326398767753e-15	222004	222034	1.24980005929304e-12	224571	224571
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	225591	266212	43	43	-0.0155	1.24980005929304e-12	224571	224571	9.28813409656327e-40	266212	266212
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	2.4055	9.28813409656327e-40	266212	266212	1.44291954816935e-63	267079	267079
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1427392	658	638	0.0323	1.44291954816935e-63	267079	267079	1.81702504704996e-20	1427392	1431240
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9403	1.81702504704996e-20	1427392	1431240	6.73223230395777e-18	1432891	1432953
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	596	0.0118	6.73223230395777e-18	1432891	1432953	2.22794063309351e-19	2302065	2302065
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.9917	2.22794063309351e-19	2302065	2302065	5.52857566244719e-28	2304398	2304398
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2426938	136	134	-0.0169	5.52857566244719e-28	2304398	2304398	9.44074075627173e-13	2426938	2426938
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	0.9567	9.44074075627173e-13	2426938	2426938	1.34428322401221e-13	2428307	2428307
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2510846	70	69	0.028	1.34428322401221e-13	2428307	2428307	7.35375288745582e-39	2510846	2510846
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	1.54	7.35375288745582e-39	2510846	2510846	2.53454509730797e-20	2512881	2512881
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2708291	179	174	-0.015	2.53454509730797e-20	2512881	2512881	0	2708291	2708291
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	152655026	44461	43084	0.9661	0	2708291	2708291	1.29388727850326e-14	152655026	152655026
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.3972	1.29388727850326e-14	152655026	152655026	1.40510362812790e-09	152657445	152669192
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154582414	671	648	0.9025	1.4051036281279e-09	152657445	152669192	0	154578922	154582414
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	0.0046	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	123	-4.247	NA	NA	NA	1.63964719854497e-20	3777766	4413507
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.4044	1.63964719854497e-20	3777766	4413507	2.53578439212033e-09	4948824	6696721
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	167	-3.7597	2.53578439212033e-09	4948824	6696721	1.90242638980148e-06	7011055	7233066
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7653082	159	156	-2.9632	1.90242638980148e-06	7011055	7233066	7.4952489516787e-07	7612732	7658121
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7722458	43	41	-4.2709	7.4952489516787e-07	7612732	7658121	1.15420711145628e-11	7717556	7729757
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7745143	10	8	-2.2438	1.15420711145628e-11	7717556	7729757	0.00750152855035404	7734410	7782532
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7749796	7865557	40	40	-3.4747	0.00750152855035404	7734410	7782532	0.00978023616291149	7831268	7893056
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7866716	7914104	9	9	-2.3516	0.00978023616291149	7831268	7893056	2.26019565254690e-05	7914104	7936024
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8280065	84	79	-4.06	2.2601956525469e-05	7914104	7936024	0.00311738189791955	8149413	8450784
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8681965	109	104	-3.4549	0.00311738189791955	8149413	8450784	0.00109077710896763	8543430	8710546
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8683710	8949553	82	80	-4.0337	0.00109077710896763	8543430	8710546	7.44098180352863e-08	8943871	8949553
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.4579	7.44098180352863e-08	8943871	8949553	5.95128790957383e-10	8956787	8956787
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9080779	14	14	-4.2781	5.95128790957383e-10	8956787	8956787	0.00611536446885591	8965553	9094974
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9081196	9145335	17	16	-5.0391	0.00611536446885591	8965553	9094974	8.76410276594585e-17	9145335	9153682
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9147381	10012024	16	16	-2.8781	8.76410276594585e-17	9145335	9153682	8.20904533526676e-05	9990889	10055462
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10014777	10014777	1	0	NA	8.20904533526676e-05	9990889	10055462	NA	NA	NA
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10025706	10513747	63	61	-4.0656	NA	NA	NA	1.95777384794671e-32	10512616	10515697
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	15	-0.8102	1.95777384794671e-32	10512616	10515697	6.33901192833413e-15	11249952	11698871
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12536761	11	11	-3.9616	6.33901192833413e-15	11249952	11698871	3.62858720320075e-06	12530596	12542979
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12601014	31	29	-2.2955	3.62858720320075e-06	12530596	12542979	0.000587467287219028	12591908	12604268
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12602617	12611624	6	6	-3.9559	0.000587467287219028	12591908	12604268	6.08395704900556e-07	12608293	12614562
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	18	-1.5585	6.08395704900556e-07	12608293	12614562	2.17703965341731e-20	12668435	12687167
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.0938	2.17703965341731e-20	12668435	12687167	1.18657343215116e-07	12820920	12843307
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12859309	8	8	-2.1408	1.18657343215116e-07	12820920	12843307	0.00187329727887897	12852769	12871057
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12861657	12926941	25	25	-3.5587	0.00187329727887897	12852769	12871057	2.60985806867942e-11	12922667	12942170
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13048283	47	44	-1.814	2.60985806867942e-11	12922667	12942170	0.00152858683804562	13021620	13076862
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13104920	23	23	-2.8966	0.00152858683804562	13021620	13076862	0.00163351549362198	13080405	13106723
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.362	0.00163351549362198	13080405	13106723	1.05023680311745e-22	13128515	13128515
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	12	-4.5603	1.05023680311745e-22	13128515	13128515	2.64908574723297e-05	13148290	13161955
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13264329	34	32	-3.1855	2.64908574723297e-05	13148290	13161955	2.78164348146334e-05	13241682	13329968
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13271228	13823928	200	192	-4.1218	2.78164348146334e-05	13241682	13329968	8.23646931736884e-05	13780026	13836933
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.4159	8.23646931736884e-05	13780026	13836933	9.53210245793098e-08	13854528	13869106
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14359748	162	157	-4.2196	9.53210245793098e-08	13854528	13869106	2.03493943816528e-09	14358464	14359748
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14368151	3	3	-1.0394	2.03493943816528e-09	14358464	14359748	0.000306105582339266	14368151	14374313
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14370346	14524829	87	83	-3.4454	0.000306105582339266	14368151	14374313	0.000139584568001212	14498784	14563486
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14644293	34	32	-2.3054	0.000139584568001212	14498784	14563486	3.39813338081147e-10	14569287	14689490
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15208612	143	140	-3.8445	3.39813338081147e-10	14569287	14689490	5.40000500398726e-05	15203221	15223545
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	10	-2.208	5.40000500398726e-05	15203221	15223545	1.95450519528154e-06	15225775	15249591
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15433122	128	119	-4.0099	1.95450519528154e-06	15225775	15249591	7.41259046331863e-06	15427777	15434486
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.941	7.41259046331863e-06	15427777	15434486	6.97729949056989e-12	15447091	15448670
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15469100	15	15	-4.6203	6.97729949056989e-12	15447091	15448670	0.000452440296683357	15464185	15471179
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15470132	15499052	9	9	-3.3069	0.000452440296683357	15464185	15471179	6.13410037322563e-06	15479343	15514330
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15501930	15523178	7	7	-4.7911	6.13410037322563e-06	15479343	15514330	0.00374363311968454	15523178	15542314
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15590299	36	35	-3.1621	0.00374363311968454	15523178	15542314	2.24575376174552e-07	15564959	15626220
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15595870	15920478	54	52	-4.4579	2.24575376174552e-07	15564959	15626220	1.56514923402753e-11	15892492	15949457
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16065378	55	52	-2.9522	1.56514923402753e-11	15892492	15949457	2.60282726321837e-10	16033774	16085263
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16066990	25737663	1148	1115	-3.97	2.60282726321837e-10	16033774	16085263	1.42120774984430e-55	22930737	26870361
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	31	-1.0138	1.4212077498443e-55	22930737	26870361	8.95711050737561e-19	26945084	26945893
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.7276	8.95711050737561e-19	26945084	26945893	0.0080682996721651	26965406	26998633
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27003308	7	7	-1.9898	0.0080682996721651	26965406	26998633	0.0531810059494256	26989053	27003308
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.6355	0.0531810059494256	26989053	27003308	6.63314257734439e-18	27019256	27019256
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.5766	6.63314257734439e-18	27019256	27019256	1.57008021681892e-21	27039222	27039222
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	15	-0.5899	1.57008021681892e-21	27039222	27039222	1.38012047988020e-07	27131764	27163598
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-3.009	1.3801204798802e-07	27131764	27163598	1.56522627577035e-09	27172283	27176933
MSK_252152915133_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.3884	1.56522627577035e-09	27172283	27176933	NA	NA	NA
