Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	13110044	4524	4415	0.0087	NA	NA	NA	4.16485271755604e-10	13110044	13110044
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13647633	13649201	2	2	-1.0089	4.16485271755604e-10	13110044	13110044	4.79265385076832e-10	13649201	13649201
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13654754	54860193	16497	16121	-0.0028	4.79265385076832e-10	13649201	13649201	1.47815670673674e-08	54857788	54860193
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54862228	54866506	3	3	-0.7662	1.47815670673674e-08	54857788	54860193	7.39253406749583e-09	54866506	54876067
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	72525842	6862	6710	-0.0039	7.39253406749583e-09	54866506	54876067	7.7006688841073e-27	72523186	72533856
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72579311	20	20	0.4994	7.7006688841073e-27	72523186	72533856	9.47824118612798e-27	72568009	72589682
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	147203277	16262	15887	-0.0038	9.47824118612798e-27	72568009	72589682	1.32554556230406e-06	146297175	147306304
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147311437	3	3	-0.67	1.32554556230406e-06	146297175	147306304	0.208824112319282	147311437	147490608
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147313991	147510532	33	33	-2.1237	0.208824112319282	147311437	147490608	0	147490608	147510532
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150839754	1262	1234	0.001	0	147490608	147510532	8.39607848921782e-51	150839754	150839754
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-1.5292	8.39607848921782e-51	150839754	150839754	6.00046721017872e-30	150846148	150848509
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	6.00046721017872e-30	150846148	150848509	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	80	-0.0161	NA	NA	NA	8.06224830824351e-10	151026228	151026228
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151032967	2	2	1.1939	8.06224830824351e-10	151026228	151026228	0	151032967	151032967
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151033188	151036435	2	2	0.7371	0	151032967	151032967	3.95524607801303e-05	151036435	151038091
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2618	-0.0117	3.95524607801303e-05	151036435	151038091	2.25448076725333e-26	157133150	157133150
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.6661	2.25448076725333e-26	157133150	157133150	1.23428196048886e-28	157136342	157136342
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	12994	-0.0038	1.23428196048886e-28	157136342	157136342	7.38131026009859e-14	194976022	195009358
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.5556	7.38131026009859e-14	194976022	195009358	2.15599091810641e-13	195048208	195095156
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	227875096	12121	11833	-0.008	2.15599091810641e-13	195048208	195095156	1.85320978047489e-90	227875096	227875096
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-2.4141	1.85320978047489e-90	227875096	227875096	1.62229139401243e-92	227882805	227882805
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246432511	7255	7098	-0.0048	1.62229139401243e-92	227882805	227882805	2.85505691168184e-29	246405101	246481598
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246433956	246875016	130	127	0.2088	2.85505691168184e-29	246405101	246481598	2.63017123354019e-08	246831381	246912838
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	92	-0.0046	2.63017123354019e-08	246831381	246912838	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10595	-0.0079	NA	NA	NA	1.07496447773568e-18	33076512	33076512
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.3422	1.07496447773568e-18	33076512	33076512	5.49961060186013e-20	33080437	33080437
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	633	-0.0023	5.49961060186013e-20	33080437	33080437	0	34543992	34543992
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-3.9279	0	34543992	34543992	0	34589997	34589997
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35553983	381	373	0.0097	0	34589997	34589997	1.72356123536056e-24	35553983	35553983
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-1.5521	1.72356123536056e-24	35553983	35553983	1.20964016994365e-22	35562007	35562007
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	37800512	984	964	-0.0108	1.20964016994365e-22	35562007	35562007	7.48841212554182e-77	37797909	37803744
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37855837	24	23	-0.8571	7.48841212554182e-77	37797909	37803744	9.8948543779787e-86	37854350	37855837
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	39541647	786	766	-0.0121	9.8948543779787e-86	37854350	37855837	1.72001485571377e-12	39541647	39541647
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	39546042	39548509	2	2	1.0651	1.72001485571377e-12	39541647	39541647	5.48586964109709e-12	39548509	39548509
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	39550075	52600588	5013	4907	-0.0049	5.48586964109709e-12	39548509	39548509	1.47371122633904e-12	52588009	52612881
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.47371122633904e-12	52588009	52612881	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7693	NA	NA	NA	2.56319477048631e-12	52622353	52639605
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	77082396	8266	8078	-0.0026	2.56319477048631e-12	52622353	52639605	2.93070093014054e-09	77082396	77082396
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	77083734	77087090	2	2	-0.9568	2.93070093014054e-09	77082396	77082396	7.14641139700961e-10	77087090	77088262
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	77088262	78550858	448	434	0.0142	7.14641139700961e-10	77087090	77088262	3.76709157979935e-11	78545566	78555501
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78553451	78574729	11	10	-0.4516	3.76709157979935e-11	78545566	78555501	1.60609406496182e-10	78571308	78587702
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78577746	91057122	2893	2813	-0.0047	1.60609406496182e-10	78571308	78587702	7.65704969746246e-13	89890854	91131762
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91127894	91179406	12	12	-0.455	7.65704969746246e-13	89890854	91131762	2.93875104703105e-12	91158269	94892170
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91270311	142039625	13220	12919	-0.005	2.93875104703105e-12	91158269	94892170	9.21059233160956e-205	142039625	142039625
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142041792	142043930	2	2	-4.3749	9.21059233160956e-205	142039625	142039625	2.80491309712035e-212	142043930	142043930
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142051022	146571330	1483	1447	-0.0027	2.80491309712035e-212	142043930	142043930	7.04044102465265e-10	146562545	146571330
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.6864	7.04044102465265e-10	146562545	146571330	2.8335626601318e-09	146592775	146597405
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	232126456	28751	28162	-0.002	2.8335626601318e-09	146592775	146597405	6.39530953698442e-13	232126456	232126456
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232129418	232131993	2	2	-1.1282	6.39530953698442e-13	232126456	232126456	1.09152052026730e-11	232131993	232136170
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232136170	242532246	3941	3848	-0.002	1.0915205202673e-11	232131993	232136170	4.29684712216971e-16	242523086	242545993
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242535118	242603774	31	30	0.3387	4.29684712216971e-16	242523086	242545993	0.000392234014695504	242579492	242630188
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242607326	242689978	24	23	0.0548	0.000392234014695504	242579492	242630188	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10537	-0.007	NA	NA	NA	2.09106570874804e-40	32074432	32074432
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.9569	2.09106570874804e-40	32074432	32074432	1.19035985786030e-39	32080848	32080848
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5307	-0.0067	1.1903598578603e-39	32080848	32080848	1.55915363671840e-10	47460892	47460892
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.0203	1.5591536367184e-10	47460892	47460892	1.87567110313214e-10	47466921	47466921
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	95295727	14718	14373	-0.0032	1.87567110313214e-10	47466921	47466921	2.71671489340313e-17	95295727	95295727
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95297871	95300803	2	2	-1.3004	2.71671489340313e-17	95295727	95295727	2.83150973156309e-17	95300803	95300803
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95303268	133189686	12769	12488	-0.0043	2.83150973156309e-17	95300803	95300803	8.49043489556787e-30	133189686	133189686
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6827	8.49043489556787e-30	133189686	133189686	5.18137635662944e-30	133194685	133194685
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9564	-0.0026	5.18137635662944e-30	133194685	133194685	4.03788554963005e-78	164005577	164005577
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164023502	4	4	1.9105	4.03788554963005e-78	164005577	164005577	6.47206103435253e-24	164023502	164023502
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164027724	164027724	1	0	NA	6.47206103435253e-24	164023502	164023502	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	-0.348	NA	NA	NA	2.34003295393792e-12	164086905	164121847
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	164938650	199	196	0.0429	2.34003295393792e-12	164086905	164121847	8.80763759278169e-09	164938650	164938650
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164940763	164946757	2	2	0.986	8.80763759278169e-09	164938650	164938650	4.43795015825831e-10	164946757	164946757
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164948576	192546280	9347	9138	-0.0039	4.43795015825831e-10	164946757	164946757	2.97527614043362e-296	192546280	192546280
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-4.2584	2.97527614043362e-296	192546280	192546280	3.30047634840131e-214	192550989	192550989
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	194354505	579	568	-0.0156	3.30047634840131e-214	192550989	192550989	0	194354505	194354505
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.0379	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	976	-0.0172	0	194366950	194366950	1.55971355477295e-315	196822133	196822133
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	20	-1.7674	1.55971355477295e-315	196822133	196822133	2.02787457693967e-258	196929826	196929826
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	940	-0.0101	2.02787457693967e-258	196929826	196929826	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9349	0.0026	NA	NA	NA	1.44078916302663e-11	34439897	34445002
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.6221	1.44078916302663e-11	34439897	34445002	1.12193654409677e-11	34491115	34509895
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8667	3e-04	1.12193654409677e-11	34491115	34509895	0	68905670	68905670
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	-3.5425	0	68905670	68905670	1.7074376032184e-286	69165814	69165814
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	115	0.0268	1.7074376032184e-286	69165814	69165814	2.35752085278087e-16	70150576	70150576
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.8286	2.35752085278087e-16	70150576	70150576	1.39182762575316e-14	70216707	70294312
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	88752705	6464	6310	-7e-04	1.39182762575316e-14	70216707	70294312	2.69527286261721e-21	88752705	88752705
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.4056	2.69527286261721e-21	88752705	88752705	9.39821467780748e-21	88756721	88756721
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	119334954	9711	9475	0.001	9.39821467780748e-21	88756721	88756721	7.98870726422903e-69	119334954	119345371
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-2.0765	7.98870726422903e-69	119334954	119345371	4.58733666331411e-70	119346804	119348829
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173224400	14892	14528	-0.0029	4.58733666331411e-70	119346804	119348829	9.86831992464802e-103	173224400	173224400
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.0614	9.86831992464802e-103	173224400	173224400	1.02849826232204e-102	173228860	173228860
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	185	0.0066	1.02849826232204e-102	173228860	173228860	2.71511112203237e-50	173660684	173660684
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.1451	2.71511112203237e-50	173660684	173660684	4.99472601704819e-49	173666072	173666072
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3982	-0.0062	4.99472601704819e-49	173666072	173666072	2.70522566732176e-26	187330240	187330240
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.6032	2.70522566732176e-26	187330240	187330240	6.31982711573405e-25	187333619	187333619
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1206	-0.0071	6.31982711573405e-25	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	21480789	6352	6212	-1e-04	NA	NA	NA	1.15753508519179e-11	21480789	21480789
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.0725	1.15753508519179e-11	21480789	21480789	2.03746132328155e-11	21487474	21487474
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	150181399	37500	36626	-0.0026	2.03746132328155e-11	21487474	21487474	8.78730246682707e-27	150181399	150181399
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8563	8.78730246682707e-27	150181399	150181399	1.23217419635669e-26	150202601	150202601
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	178040439	8875	8657	-0.0052	1.23217419635669e-26	150202601	150202601	2.39811903330463e-09	178037603	178040439
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178047480	3	3	0.7827	2.39811903330463e-09	178037603	178040439	7.75004197340747e-08	178047480	178053491
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178053491	180644810	1027	1003	0.0095	7.75004197340747e-08	178047480	178053491	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	0.0022	NA	NA	NA	0.00190074535287415	161210	211079
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	16	0.2585	0.00190074535287415	161210	211079	7.78812272579663e-06	234115	256810
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	29950805	10531	10267	-0.0099	7.78812272579663e-06	234115	256810	1.30195694752014e-25	29939288	29973024
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30033946	21	21	-0.4797	1.30195694752014e-25	29939288	29973024	2.27979068663057e-22	30025480	30040917
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30040901	32558677	1069	1036	-0.0041	2.27979068663057e-22	30025480	30040917	2.74364646688655e-187	32558677	32563252
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	8	-2.2706	2.74364646688655e-187	32558677	32563252	2.41081259354904e-10	32597877	32600962
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32628420	5	5	0.0817	2.41081259354904e-10	32597877	32600962	1.49645431297135e-36	32628420	32628420
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32633691	3	3	-1.7548	1.49645431297135e-36	32628420	32628420	3.65414142293288e-46	32633691	32633691
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	25	-0.0793	3.65414142293288e-46	32633691	32633691	1.42154588602586e-24	32713363	32716255
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32720656	3	3	-2.9194	1.42154588602586e-24	32713363	32716255	0.0698874610061898	32718991	32723722
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32721872	32728487	5	5	-1.1015	0.0698874610061898	32718991	32723722	2.26666696684359e-30	32723366	32728487
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	72919733	12797	12517	-0.0065	2.26666696684359e-30	32723366	32728487	1.39592140204712e-154	72919733	72919733
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-3.1537	1.39592140204712e-154	72919733	72919733	2.34043062435486e-167	72924440	72924440
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	79018959	1894	1839	0.0076	2.34043062435486e-167	72924440	72924440	0	79018959	79018959
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-4.6232	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	81334248	728	713	-0.0085	0	79091850	79091850	4.82163078226548e-11	81332468	81334248
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-0.8435	4.82163078226548e-11	81332468	81334248	4.76717078789299e-11	81348170	81350502
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	102039635	5541	5425	0	4.76717078789299e-11	81348170	81350502	3.43796467176426e-18	102039635	102039635
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-1.0717	3.43796467176426e-18	102039635	102039635	1.38423362839141e-15	102044331	102046884
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	105287906	728	711	1e-04	1.38423362839141e-15	102044331	102046884	1.45522167860815e-07	105285429	105287906
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	105291227	105298061	2	2	0.9216	1.45522167860815e-07	105285429	105287906	1.45104555424536e-08	105298061	105298061
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	105301970	139643729	12141	11860	-0.0032	1.45104555424536e-08	105298061	105298061	2.34383842165282e-13	139643729	139643729
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	0.9258	2.34383842165282e-13	139643729	139643729	4.58390903613508e-13	139648318	139648318
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	139651247	1	0	NA	4.58390903613508e-13	139648318	139648318	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139652495	170738014	10528	10293	-0.0069	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	170748606	170753106	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	249	0.0146	NA	NA	NA	4.91401881182309e-12	1036135	1036135
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-1.0441	4.91401881182309e-12	1036135	1036135	2.02969916542117e-11	1038517	1038517
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	26400538	8659	8466	0.0034	2.02969916542117e-11	1038517	1038517	1.49329809208311e-38	26400538	26400538
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26403038	26404540	2	2	1.8881	1.49329809208311e-38	26400538	26400538	6.14599422651134e-37	26404540	26404540
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26406021	64523575	10641	10408	-0.003	6.14599422651134e-37	26404540	26404540	4.98982798365196e-15	64523575	64523575
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.2263	4.98982798365196e-15	64523575	64523575	5.15990045365939e-15	64532949	64532949
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	133433384	26531	25946	-7e-04	5.15990045365939e-15	64532949	64532949	2.36634782017694e-23	133432281	133436265
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7555	2.36634782017694e-23	133432281	133436265	3.64617763222631e-24	133447868	133453811
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3621	0.0027	3.64617763222631e-24	133447868	133453811	1.31652732957866e-22	141409512	141410894
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141435643	12	11	0.6242	1.31652732957866e-22	141409512	141410894	9.25187677040997e-21	141435643	141440184
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	150580943	3795	3701	0.0039	9.25187677040997e-21	141435643	141440184	5.73698819248091e-10	150580943	150580943
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	150581652	150582286	2	2	-1.0174	5.73698819248091e-10	150580943	150580943	4.25948759233633e-09	150582286	150582924
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	150582924	158821263	3083	3016	-0.0025	4.25948759233633e-09	150582286	150582924	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	113	0.0177	NA	NA	NA	1.79355271551896e-129	581533	581533
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.3984	1.79355271551896e-129	581533	581533	2.67861164461132e-123	588865	588865
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	10330645	3146	3067	0.0025	2.67861164461132e-123	588865	588865	9.55147863909946e-11	10330645	10330645
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10332803	10332839	2	2	-1.0264	9.55147863909946e-11	10330645	10330645	5.76955304884078e-10	10332839	10339001
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10339001	25120552	4890	4771	-0.0064	5.76955304884078e-10	10332839	10339001	6.09561944005746e-25	25120552	25120552
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	6.09561944005746e-25	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.58	NA	NA	NA	9.04860551535948e-27	25125700	25125700
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4791	-0.0047	9.04860551535948e-27	25125700	25125700	2.70682056865719e-233	39350798	39350798
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	0.8581	2.70682056865719e-233	39350798	39350798	5.85696420393348e-216	39505256	39508035
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	433	0.028	5.85696420393348e-216	39505256	39508035	2.48736950050333e-20	40892587	40892587
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.3292	2.48736950050333e-20	40892587	40892587	3.08108894018011e-18	40897469	40897469
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	142329141	29605	28941	-0.0039	3.08108894018011e-18	40897469	40897469	3.32857132656156e-13	142329141	142329141
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142331353	142332708	2	2	-1.1495	3.32857132656156e-13	142329141	142329141	4.9305615113071e-11	142332708	142332708
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142334063	145328970	1081	1057	0.0014	4.9305615113071e-11	142332708	142332708	1.25766634038096e-10	145327758	145328970
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145330767	145330767	1	0	NA	1.25766634038096e-10	145327758	145328970	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145333207	145334573	2	2	-1.1304	NA	NA	NA	3.55262677744357e-11	145334573	145334573
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145336073	146264846	299	292	0.0057	3.55262677744357e-11	145334573	145334573	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5326	0.0067	NA	NA	NA	1.24365453261198e-22	15802255	15802255
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-1.4709	1.24365453261198e-22	15802255	15802255	1.70929234235145e-22	15807123	15807123
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	86960197	12974	12688	-0.0057	1.70929234235145e-22	15807123	15807123	2.5944523585823e-14	86960197	86960197
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	1.1718	2.5944523585823e-14	86960197	86960197	1.52028592064291e-13	86965458	86965458
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	137352394	18403	17965	-0.004	1.52028592064291e-13	86965458	86965458	1.82216396589902e-83	137352394	137352394
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.8406	1.82216396589902e-83	137352394	137352394	2.79222162371045e-60	137356880	137356880
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1066	0.0088	2.79222162371045e-60	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13310365	4595	4471	-0.013	NA	NA	NA	1.35851956249707e-25	13308968	13310365
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13311610	13326307	7	7	-0.8463	1.35851956249707e-25	13308968	13310365	1.30884314663491e-26	13326307	13326307
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13330112	13553503	80	77	-0.009	1.30884314663491e-26	13326307	13326307	1.77265484975229e-13	13553503	13553503
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.0056	1.77265484975229e-13	13553503	13553503	1.39450852286814e-09	13556315	13556315
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	70949263	16991	16612	-0.004	1.39450852286814e-09	13556315	13556315	3.44517804898518e-09	70947915	70949263
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.6989	3.44517804898518e-09	70947915	70949263	4.39947009435377e-10	70960187	70966034
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	70964344	1	0	NA	4.39947009435377e-10	70960187	70966034	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70966034	77917893	2912	2847	-0.0015	NA	NA	NA	3.8449413805239e-43	77917893	77917893
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.6396	3.8449413805239e-43	77917893	77917893	7.37943030719413e-42	77928738	77928738
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	132797428	19277	18835	-0.0053	7.37943030719413e-42	77928738	77928738	3.20560731819192e-10	132797428	132797428
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	1.0142	3.20560731819192e-10	132797428	132797428	7.0406822274032e-08	132801463	132802775
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	134739406	723	712	0.0032	7.0406822274032e-08	132801463	132802775	1.97221291290678e-09	134739406	134739406
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	-1.0984	1.97221291290678e-09	134739406	134739406	3.97376685071208e-07	134743423	134746574
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	208	0.0023	3.97376685071208e-07	134743423	134746574	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1730	-0.0052	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.5071	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	353	0.0116	0	4932214	4932214	0	5741031	5741031
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	14	-4.7192	0	5741031	5741031	0	5763749	5763749
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	5765438	1	0	NA	0	5763749	5763749	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	18896166	5219	5121	-0.0123	NA	NA	NA	8.5665277187479e-11	18890351	18896166
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.6168	8.5665277187479e-11	18890351	18896166	2.21505172718029e-11	18917191	18929375
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	27682681	2666	2606	-0.0016	2.21505172718029e-11	18917191	18929375	5.60832425266903e-10	27681454	27682681
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	27685122	27688164	2	2	-1.0019	5.60832425266903e-10	27681454	27682681	5.31198721332932e-10	27688164	27688164
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	27689930	49671267	6673	6515	-0.0053	5.31198721332932e-10	27688164	27688164	2.76034339374851e-18	49666382	49671267
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49701463	7	7	-0.7159	2.76034339374851e-18	49666382	49671267	2.52276781666548e-16	49701463	49710027
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49710027	55118214	179	175	0.0047	2.52276781666548e-16	49701463	49710027	4.67053769284333e-31	55097806	55124730
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	37	0.4674	4.67053769284333e-31	55097806	55124730	7.37612684931357e-43	55205278	55219985
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	99021938	15493	15150	-0.0038	7.37612684931357e-43	55205278	55219985	1.13889616627905e-09	99006512	99032916
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99025912	99074552	23	22	0.2956	1.13889616627905e-09	99006512	99032916	4.74329622490219e-10	99054841	99082451
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	134450318	12844	12516	-0.006	4.74329622490219e-10	99054841	99082451	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3661	-0.008	NA	NA	NA	7.62505799078866e-289	9523923	9523923
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-3.3283	7.62505799078866e-289	9523923	9523923	9.49873591787817e-292	9554149	9554149
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	31132762	7408	7228	2e-04	9.49873591787817e-292	9554149	9554149	9.31651577457438e-39	31084265	31171313
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31301891	45	43	0.4177	9.31651577457438e-39	31084265	31171313	1.27019131029780e-39	31295667	31305068
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31303495	80662066	16141	15730	-4e-04	1.2701913102978e-39	31295667	31305068	4.40695263618679e-10	80662066	80662066
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-1.0062	4.40695263618679e-10	80662066	80662066	3.15777649926652e-10	80666751	80668695
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	99460566	5638	5491	0.0037	3.15777649926652e-10	80666751	80668695	2.01138033454654e-10	99458540	99460566
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	99462740	99468590	3	3	-0.8292	2.01138033454654e-10	99458540	99460566	4.46712698640030e-10	99468590	99470406
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	99470406	132289090	12177	11876	-0.0051	4.4671269864003e-10	99468590	99470406	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7167	-0.0048	NA	NA	NA	1.59354169898986e-92	37953582	37953582
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.9782	1.59354169898986e-92	37953582	37953582	5.85038150818076e-99	37957844	37957844
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4749	-0.0036	5.85038150818076e-99	37957844	37957844	2.14658474089831e-127	49964838	49964838
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.3843	2.14658474089831e-127	49964838	49964838	7.96613255797815e-122	49971732	49971732
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	68142120	4513	4411	0.0016	7.96613255797815e-122	49971732	49971732	1.99021255343241e-13	68136198	68146755
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	9	-0.5399	1.99021255343241e-13	68136198	68146755	2.78311768540028e-13	68160625	68168882
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	89659397	5549	5425	0.0014	2.78311768540028e-13	68160625	68168882	6.87096053132423e-16	89659397	89659397
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.2516	6.87096053132423e-16	89659397	89659397	2.85535638730239e-16	89662326	89662326
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	113788788	9197	8958	-0.0062	2.85535638730239e-16	89662326	89662326	3.33894010420613e-10	113788788	113788788
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.0144	3.33894010420613e-10	113788788	113788788	5.52729527477145e-08	113792974	113794669
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	145	0.0202	5.52729527477145e-08	113792974	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	4	0.3369	NA	NA	NA	0.000130832505108335	18544772	19273289
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19548246	61	60	-0.1952	0.000130832505108335	18544772	19273289	3.26957778268823e-08	19465322	19582682
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19549728	20411202	448	437	-0.0164	3.26957778268823e-08	19465322	19582682	4.86294858248535e-56	20407882	20430810
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20424171	20481852	25	24	0.6723	4.86294858248535e-56	20407882	20430810	6.4437519102497e-57	20477376	20488177
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20488177	73092112	18887	18433	3e-04	6.4437519102497e-57	20477376	20488177	2.94407838311317e-18	73092112	73092112
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73107419	4	4	-0.9459	2.94407838311317e-18	73092112	73092112	9.65955027722649e-18	73107419	73107419
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73112029	91606273	6759	6607	-0.0046	9.65955027722649e-18	73107419	73107419	2.24566285184988e-10	91600552	91606273
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	91608967	91611911	3	3	-0.8457	2.24566285184988e-10	91600552	91606273	4.97932228231663e-10	91611911	91616191
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	91613379	91613379	1	0	NA	4.97932228231663e-10	91611911	91616191	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	91616191	102375949	4218	4132	-0.0078	NA	NA	NA	1.82286396144993e-20	102374893	102375949
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	102380290	102386881	5	5	-0.922	1.82286396144993e-20	102374893	102375949	3.862750339584e-21	102386881	102388710
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	102388710	105597555	1225	1202	0.012	3.862750339584e-21	102386881	102388710	4.58004490172631e-17	105595302	105607572
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105625010	10	10	0.6126	4.58004490172631e-17	105595302	105607572	2.67894719834862e-08	105620983	105630089
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105630089	105787390	23	23	0.006	2.67894719834862e-08	105620983	105630089	2.46932213727950e-09	105783533	105787390
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105795807	5	5	0.6665	2.4693221372795e-09	105783533	105787390	7.65670038556421e-14	105795807	105798116
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105798116	105966378	51	47	0.0199	7.65670038556421e-14	105795807	105798116	3.56255611093605e-07	105962305	105977946
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105968122	105989160	8	7	0.4899	3.56255611093605e-07	105962305	105977946	4.92566537480727e-05	105973615	106002179
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106358491	146	143	0.0144	4.92566537480727e-05	105973615	106002179	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0776	NA	NA	NA	1.26601696988464e-15	18692865	18741716
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19427350	90	88	-0.8474	1.26601696988464e-15	18692865	18741716	1.22260973018681e-12	19407585	19819961
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19430207	20088256	60	58	-1.2174	1.22260973018681e-12	19407585	19819961	0	20079935	20088256
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	50258775	10941	10661	-0.0045	0	20079935	20088256	4.69223926459678e-09	50257208	50258775
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50259919	50261214	2	2	-0.9744	4.69223926459678e-09	50257208	50258775	2.75225498059646e-09	50261214	50261214
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50262943	74101571	10363	10106	-0.0074	2.75225498059646e-09	50261214	50261214	3.31119983717623e-11	74100946	74101571
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74111325	74133391	7	7	-0.572	3.31119983717623e-11	74100946	74101571	5.30088086788651e-09	74133391	74140287
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74137073	75115806	416	406	-0.0018	5.30088086788651e-09	74133391	74140287	3.36075560182571e-09	75115806	75115806
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.0766	3.36075560182571e-09	75115806	75115806	8.85397960002353e-13	75119713	75119713
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	76204875	397	387	0.0094	8.85397960002353e-13	75119713	75119713	1.18175558013304e-12	76199783	76209150
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	76206143	76226426	13	13	0.4383	1.18175558013304e-12	76199783	76209150	1.84612990413871e-13	76222240	76232195
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	76229424	100298352	9025	8812	-0.0085	1.84612990413871e-13	76222240	76232195	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1183660	440	418	0.0232	NA	NA	NA	2.59723060077303e-11	1183660	1183660
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1187492	1189933	2	2	-1.1103	2.59723060077303e-11	1183660	1183660	6.98152772704279e-12	1189933	1189933
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1191361	31854794	10129	9911	-0.0024	6.98152772704279e-12	1189933	1189933	3.71937554832414e-11	31812905	32525705
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	33538171	46	46	0.2223	3.71937554832414e-11	31812905	32525705	3.72227553592605e-09	33519338	34054713
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	34297461	86	83	-0.0092	3.72227553592605e-09	33519338	34054713	2.38237047802190e-31	34285301	34310087
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34302966	34602318	56	54	0.397	2.3823704780219e-31	34285301	34310087	0.000196476050345729	34571523	34619028
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	34635765	8	8	0.06	0.000196476050345729	34571523	34619028	0.00413553236952665	34630537	34643569
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34640193	34661255	5	5	0.4294	0.00413553236952665	34630537	34643569	0.000143785899812562	34661255	34671137
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34664645	54348362	2923	2858	-0.0034	0.000143785899812562	34661255	34671137	6.26952684374324e-14	54340649	54363713
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	11	-0.4985	6.26952684374324e-14	54340649	54363713	1.46080210731031e-05	54379834	54390060
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54400475	3	3	0.7404	1.46080210731031e-05	54379834	54390060	4.09338525527364e-08	54399890	54402057
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54402057	57203733	1200	1170	-0.0158	4.09338525527364e-08	54399890	54402057	5.2140441124863e-16	57203733	57203733
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.2704	5.2140441124863e-16	57203733	57203733	6.18637524606015e-17	57206772	57206772
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5476	-0.0077	6.18637524606015e-17	57206772	57206772	9.27618334770733e-108	75093957	75093957
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.6034	9.27618334770733e-108	75093957	75093957	4.15791160783096e-102	75100865	75100865
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5008	-0.0067	4.15791160783096e-102	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	407	-0.0089	NA	NA	NA	1.94213057953371e-20	1028979	1028979
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5137	1.94213057953371e-20	1028979	1028979	2.10998987140384e-24	1030766	1030766
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	423	0.0069	2.10998987140384e-24	1030766	1030766	2.06627156238704e-11	1904451	1904451
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.856	2.06627156238704e-11	1904451	1904451	4.53895216127445e-11	1906391	1909371
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	32828797	11564	11290	-0.0033	4.53895216127445e-11	1906391	1909371	3.73340889856686e-12	32828797	32828797
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.0963	3.73340889856686e-12	32828797	32828797	6.17854772553625e-12	32832642	32832642
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1404	0.0087	6.17854772553625e-12	32832642	32832642	5.76043445024348e-96	36673853	36673853
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.759	5.76043445024348e-96	36673853	36673853	6.22835859785658e-95	36684619	36684619
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15425	0.0025	6.22835859785658e-95	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	47158840	14399	14069	-0.0047	NA	NA	NA	9.23340262727952e-10	47158840	47158840
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	47161715	47164539	2	2	-0.9835	9.23340262727952e-10	47158840	47158840	1.35857835952176e-09	47164539	47171715
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	47171715	76116026	8563	8360	-0.0039	1.35857835952176e-09	47164539	47171715	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	471	0.0047	NA	NA	NA	1.30400505247627e-15	1398325	1398325
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3925	1.30400505247627e-15	1398325	1398325	2.10624252852796e-14	1400840	1400840
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1022	0.0208	2.10624252852796e-14	1400840	1400840	4.17464318092047e-18	3591120	3591120
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.4982	4.17464318092047e-18	3591120	3591120	1.44442002502686e-21	3593646	3593646
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	11448975	3634	3542	-0.0022	1.44442002502686e-21	3593646	3593646	2.50746247214096e-14	11448975	11448975
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.2257	2.50746247214096e-14	11448975	11448975	6.62681118525234e-14	11452390	11452390
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	19694025	3853	3763	0.005	6.62681118525234e-14	11452390	11452390	1.42737935857927e-150	19694025	19694025
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-3.2082	1.42737935857927e-150	19694025	19694025	3.90701832471033e-113	19700620	19700620
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	20386500	185	176	0.0457	3.90701832471033e-113	19700620	19700620	3.59382998565757e-09	20384757	20386500
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20433237	7	6	-0.6166	3.59382998565757e-09	20384757	20386500	0.278567969760484	20425020	20472156
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20436482	20493401	9	8	-0.926	0.278567969760484	20425020	20472156	1.23851768102696e-34	20472156	20493401
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	59414898	11824	11552	0.0015	1.23851768102696e-34	20472156	20493401	2.23197580739588e-30	59414645	59414898
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.7885	2.23197580739588e-30	59414645	59414898	1.22980468086974e-25	59434202	59440274
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59440262	1	0	NA	1.22980468086974e-25	59434202	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	59664725	109	105	-0.0555	NA	NA	NA	1.31303213291791e-09	59664725	59664725
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59666884	59667973	2	2	-1.0266	1.31303213291791e-09	59664725	59664725	5.93298248682993e-10	59667973	59667973
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59669062	63788698	1882	1826	-0.0083	5.93298248682993e-10	59667973	59667973	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	574	-0.0093	NA	NA	NA	1.30617960801976e-19	1506379	1506379
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-1.1501	1.30617960801976e-19	1506379	1506379	1.91793679909494e-05	1516966	1518825
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	4	-3.2678	1.91793679909494e-05	1516966	1518825	6.91520034424079e-227	1531162	1531162
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	44049312	14286	13926	-0.0079	6.91520034424079e-227	1531162	1531162	6.60926109710425e-12	44046975	44052047
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	44052047	44060277	5	5	-0.6957	6.60926109710425e-12	44046975	44052047	1.1291978220042e-11	44057165	44063052
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	44063052	62419534	6693	6546	-0.0076	1.1291978220042e-11	44057165	44063052	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13128	-0.0044	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	18088300	1113	1093	0.0025	NA	NA	NA	1.81308751672419e-07	18087057	18088300
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18092255	18093176	2	2	-0.9159	1.81308751672419e-07	18087057	18088300	1.07537839086453e-07	18093176	18093176
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18095689	22667608	1868	1825	0.0112	1.07537839086453e-07	18093176	18093176	0	22667608	22679305
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	19	-2.544	0	22667608	22679305	0	22718614	22725305
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6385	-0.0077	0	22718614	22725305	4.26535865641736e-96	35472378	35472378
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.0001	4.26535865641736e-96	35472378	35472378	1.86707818525629e-89	35476942	35476942
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49567768	7002	6829	0.0035	1.86707818525629e-89	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	0.0403	NA	NA	NA	1.19531716022345e-12	122273	127113
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.3139	1.19531716022345e-12	122273	127113	4.25357825851276e-19	129544	130528
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	222034	48	47	-0.0972	4.25357825851276e-19	129544	130528	5.38750183483755e-15	222034	222034
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	223009	224571	2	2	-1.4049	5.38750183483755e-15	222034	222034	3.1942613766465e-18	224571	224571
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	225591	1144723	575	557	-0.0253	3.1942613766465e-18	224571	224571	1.76727183444671e-19	1144723	1144723
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1147562	1149136	3	3	-1.1891	1.76727183444671e-19	1144723	1144723	5.29490735588331e-19	1149136	1149136
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1150501	1427392	125	120	-0.0556	5.29490735588331e-19	1149136	1149136	5.69740291612533e-26	1427392	1431240
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.4119	5.69740291612533e-26	1427392	1431240	3.15271263760313e-23	1431411	1432953
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1521019	57	57	-0.0576	3.15271263760313e-23	1431411	1432953	3.01711365422178e-10	1519743	1526617
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1522369	1530474	10	10	-0.4996	3.01711365422178e-10	1519743	1526617	2.51412582231041e-10	1529356	1533546
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	1782195	207	203	-0.0403	2.51412582231041e-10	1529356	1533546	3.09188092762552e-09	1782195	1782195
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1789217	1789391	2	2	0.9043	3.09188092762552e-09	1782195	1782195	6.5839519064002e-08	1789391	1791321
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1791321	2708291	726	713	-0.0531	6.5839519064002e-08	1789391	1791321	0	2708291	2711273
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	53340279	18017	17603	1.0013	0	2708291	2711273	1.07265458186085e-19	53337297	53340279
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53341809	53341809	1	0	NA	1.07265458186085e-19	53337297	53340279	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53342769	53346650	2	2	-0.1801	NA	NA	NA	3.33322942398229e-09	53346650	53348024
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53348024	103061281	10410	10166	1	3.33322942398229e-09	53346650	53348024	5.35486575210119e-17	103054719	103066301
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103062376	103110259	14	14	1.5962	5.35486575210119e-17	103054719	103066301	5.34701965265275e-18	103107068	103129734
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103129734	154570196	16688	16326	1.0005	5.34701965265275e-18	103107068	103129734	0	154570177	154570196
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154578922	154578922	1	0	NA	0	154570177	154570196	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154888224	202	198	-0.0106	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-3.4902	NA	NA	NA	2.38604023388140e-15	3034907	3773948
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.1184	2.3860402338814e-15	3034907	3773948	1.15469006378113e-12	5422507	6688691
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	170	-3.3632	1.15469006378113e-12	5422507	6688691	1.70142367740019e-09	7017919	7197846
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7653082	159	155	-2.4791	1.70142367740019e-09	7017919	7197846	9.4753908262234e-09	7631265	7656915
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-3.9126	9.4753908262234e-09	7631265	7656915	1.03983715398089e-07	7703962	7726921
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7914104	67	64	-2.7013	1.03983715398089e-07	7703962	7726921	5.84616333321374e-08	7853950	7936024
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8178487	58	55	-3.8135	5.84616333321374e-08	7853950	7936024	3.67874969243001e-08	8168499	8178487
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8195174	6	6	-1.5491	3.67874969243001e-08	8168499	8178487	6.35252512907066e-05	8195174	8211300
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8199414	10513747	325	317	-3.4163	6.35252512907066e-05	8195174	8211300	1.16628025328472e-22	10512616	10515697
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.6306	1.16628025328472e-22	10512616	10515697	4.12317444400521e-05	10622062	10655750
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11660512	4	4	-2.9242	4.12317444400521e-05	10622062	10655750	0.114735109573544	10655750	12518008
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11673476	11698871	2	0	NA	0.114735109573544	10655750	12518008	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.3079	NA	NA	NA	4.40911460178758e-10	12536761	12546917
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-1.9358	4.40911460178758e-10	12536761	12546917	5.6104874754698e-07	12637987	12687167
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.3911	5.6104874754698e-07	12637987	12687167	4.02896266623147e-14	12825903	12833424
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12859309	8	8	-1.4738	4.02896266623147e-14	12825903	12833424	1.97909331801700e-09	12857197	12863434
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12861657	12928074	26	26	-3.0045	1.979093318017e-09	12857197	12863434	0.00137194948597706	12924438	12992839
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13128515	78	77	-2.0435	0.00137194948597706	12924438	12992839	7.36036214434543e-18	13101234	13147329
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13705594	219	214	-3.3148	7.36036214434543e-18	13101234	13147329	0.232445044479773	13462577	13776202
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13854447	33	30	-3.7942	0.232445044479773	13462577	13776202	1.20313256878391e-06	13851627	13854447
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13854528	13863657	3	3	-1.3386	1.20313256878391e-06	13851627	13854447	2.25838497555181e-06	13863657	13866668
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	122	-3.7365	2.25838497555181e-06	13863657	13866668	1.13115004586839e-05	14093152	14361732
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14524829	129	122	-3.1215	1.13115004586839e-05	14093152	14361732	0.00110563827949597	14491287	14554415
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14572190	23	22	-2.0041	0.00110563827949597	14491287	14554415	7.21184162973797e-07	14540351	14601309
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	14579298	1	0	NA	7.21184162973797e-07	14540351	14601309	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15304956	207	203	-3.3813	NA	NA	NA	0.000241356702231498	15225775	15320389
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15306225	15402860	62	61	-4.0117	0.000241356702231498	15225775	15320389	3.88120143487255e-10	15396880	15418992
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15405339	15583573	92	89	-3.0045	3.88120143487255e-10	15396880	15418992	3.58097328895494e-07	15553682	15626220
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	55	-3.901	3.58097328895494e-07	15553682	15626220	1.16999566486159e-10	15892492	15949457
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	49	-2.6002	1.16999566486159e-10	15892492	15949457	1.90024640810785e-05	16015301	16065378
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16146953	39	37	-3.6688	1.90024640810785e-05	16015301	16065378	8.60096240750915e-11	16124286	16154076
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16154076	16175250	14	14	-2.1878	8.60096240750915e-11	16124286	16154076	2.73846969432286e-05	16173830	16186896
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16176562	21692175	903	880	-3.4951	2.73846969432286e-05	16173830	16186896	1.13543164612170e-05	21678127	21693809
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21693283	21761022	10	10	-1.8936	1.1354316461217e-05	21678127	21693809	1.03359092001609e-08	21752451	21768635
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	21911976	31	30	-3.5586	1.03359092001609e-08	21752451	21768635	0.000483657028358205	21864107	21935265
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21914674	22005059	28	27	-4.2527	0.000483657028358205	21864107	21935265	1.62634569508479e-05	22002703	22026566
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22005824	22058759	25	24	-3.2741	1.62634569508479e-05	22002703	22026566	5.78978136216106e-09	22052726	22157319
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22139807	22139807	1	0	NA	5.78978136216106e-09	22052726	22157319	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22179794	11	11	-1.4329	NA	NA	NA	2.1556797457765e-13	22178964	22182080
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22181855	22930737	91	90	-3.5883	2.1556797457765e-13	22178964	22182080	3.1190573305662e-51	22924754	23283689
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0389	3.1190573305662e-51	22924754	23283689	6.90826391277543e-23	26945084	26945893
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.6873	6.90826391277543e-23	26945084	26945893	0.000102380319846763	26965406	26995399
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	11	-1.499	0.000102380319846763	26965406	26995399	0.00165980811637736	27006628	27019256
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.4606	0.00165980811637736	27006628	27019256	5.63331362838772e-18	27039222	27053237
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	15	-0.5312	5.63331362838772e-18	27039222	27053237	2.72786093594029e-09	27129173	27137064
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27167148	2	2	-3.4978	2.72786093594029e-09	27129173	27137064	1.48626460995707e-44	27167148	27167148
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27171797	27171797	1	0	NA	1.48626460995707e-44	27167148	27167148	NA	NA	NA
MSK_252152915157_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	57440809	13	13	-0.3265	NA	NA	NA	NA	NA	NA
