Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	6360237	1805	1710	-0.0087	NA	NA	NA	1.51456285868092e-08	6356693	6360237
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	6361493	6368094	2	2	-0.7412	1.51456285868092e-08	6356693	6360237	5.60579033704885e-10	6368094	6368094
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	6369598	12762774	2707	2595	0.0068	5.60579033704885e-10	6368094	6368094	2.27845040588479e-27	12762774	12790795
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12769521	1	0	NA	2.27845040588479e-27	12762774	12790795	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12789063	12839991	6	5	-0.7679	NA	NA	NA	7.27150997490416e-28	12793354	12839991
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13101056	34869589	8373	8073	0.0069	7.27150997490416e-28	12793354	12839991	4.83740698523683e-13	34859068	34869589
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.5929	4.83740698523683e-13	34859068	34869589	1.28417688608969e-12	34883375	34884849
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	61884298	10733	10336	-0.0024	1.28417688608969e-12	34883375	34884849	0	61884298	61884298
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-5.3285	0	61884298	61884298	0	61890388	61890388
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	72525842	4254	4108	0.0043	0	61890388	61890388	9.05754552491063e-43	72524413	72533804
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72579311	20	20	0.4799	9.05754552491063e-43	72524413	72533804	4.14851492093949e-43	72571158	72589682
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103932025	10118	9744	-3e-04	4.14851492093949e-43	72571158	72589682	1.4733567275827e-21	103932025	103932025
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	104012520	3	3	-0.8832	1.4733567275827e-21	103932025	103932025	6.93367220502834e-22	104012520	104012520
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	109373255	1285	1243	-0.0084	6.93367220502834e-22	104012520	104012520	7.35391336306761e-50	109373255	109373255
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.7163	7.35391336306761e-50	109373255	109373255	1.81558578461715e-38	109376249	109376249
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109987341	280	273	0.0047	1.81558578461715e-38	109376249	109376249	1.63998676810398e-18	109987341	109987341
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	0.9355	1.63998676810398e-18	109987341	109987341	3.89169907215316e-13	109989998	109989998
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110023268	13	13	0.0467	3.89169907215316e-13	109989998	109989998	1.75479578493203e-06	110014625	110023268
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	0.4663	1.75479578493203e-06	110014625	110023268	2.1971458535005e-08	110041712	110058441
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	146297175	4554	4378	-0.0076	2.1971458535005e-08	110041712	110058441	1.04680687333019e-15	146274661	147315217
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147203277	1	0	NA	1.04680687333019e-15	146274661	147315217	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147497268	34	33	0.2158	NA	NA	NA	5.30485596382627e-14	147458669	148081741
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150819879	1260	1217	0.005	5.30485596382627e-14	147458669	148081741	4.13462077154916e-40	150819879	150819879
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	1.0083	4.13462077154916e-40	150819879	150819879	2.01482432697948e-09	150839754	150839754
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	7	2.4776	2.01482432697948e-09	150839754	150839754	0	150851439	150851439
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	155801716	2216	2155	0.0039	0	150851439	150851439	1.53192706591545e-11	155801716	155803618
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	155803618	155807283	3	3	0.6596	1.53192706591545e-11	155801716	155803618	7.81471404056496e-11	155805372	155807283
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	155811484	157133150	542	531	-0.0012	7.81471404056496e-11	155805372	155807283	3.85259154826598e-41	157133150	157133150
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.5052	3.85259154826598e-41	157133150	157133150	1.94679376813964e-43	157136342	157136342
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3953	-0.0088	1.94679376813964e-43	157136342	157136342	0	167483267	167483267
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-3.9501	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	6942	-0.0054	0	167507898	167507898	6.56444905534141e-20	185979586	185979586
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.026	6.56444905534141e-20	185979586	185979586	2.18787627100926e-20	185988138	185988138
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1440	0.0122	2.18787627100926e-20	185988138	185988138	1.65391802881112e-14	192715640	192715640
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-0.8694	1.65391802881112e-14	192715640	192715640	6.35697891063672e-14	192719540	192719540
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	199323967	2023	1950	0.0105	6.35697891063672e-14	192719540	192719540	1.28671446336252e-08	199320691	199323967
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	199325277	199326903	2	2	-0.6831	1.28671446336252e-08	199320691	199323967	3.77780432866231e-07	199326903	199329268
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	199329268	200598243	618	596	-0.0027	3.77780432866231e-07	199326903	199329268	3.14432796125530e-17	200592050	200612164
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200668993	25	24	-0.3137	3.1443279612553e-17	200592050	200612164	6.80945144474581e-21	200652799	200673525
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200670407	246440949	17199	16598	-0.0058	6.80945144474581e-21	200652799	200673525	2.4137602395784e-24	246427528	246452100
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246442698	246593134	55	54	0.2151	2.4137602395784e-24	246427528	246452100	2.47648134656358e-05	246580098	246632140
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246595869	246702361	35	33	0.0279	2.47648134656358e-05	246580098	246632140	9.66221773536164e-10	246687126	246738832
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246713340	246862029	35	35	0.3291	9.66221773536164e-10	246687126	246738832	7.34566060326515e-45	246858820	246863179
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	98	-0.0223	7.34566060326515e-45	246858820	246863179	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3708749	1388	1331	-0.0281	NA	NA	NA	5.16519712688839e-15	3708749	3708749
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3714236	3	3	-0.7782	5.16519712688839e-15	3708749	3708749	2.91585387889762e-17	3714236	3714236
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	33076512	9485	9144	-0.0067	2.91585387889762e-17	3714236	3714236	1.87656137573188e-15	33076512	33076512
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	0.8893	1.87656137573188e-15	33076512	33076512	2.13311703607736e-17	33080437	33080437
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34218953	504	482	0.0056	2.13311703607736e-17	33080437	33080437	8.89204974464694e-06	34210091	34218953
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34222103	34231914	5	5	-0.3228	8.89204974464694e-06	34210091	34218953	1.02376938084133e-05	34231914	34238808
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34233158	34543992	135	133	5e-04	1.02376938084133e-05	34231914	34238808	1.39065879561337e-20	34539740	34552935
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	0.347	1.39065879561337e-20	34539740	34552935	4.3178114954597e-16	34582272	34595734
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35990291	543	519	0.0014	4.3178114954597e-16	34582272	34595734	9.1623908126319e-10	35990291	35990291
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35993306	35995686	2	2	-0.7846	9.1623908126319e-10	35990291	35990291	8.3204281020327e-11	35995686	35995686
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35997251	87721951	17823	17190	-0.0029	8.3204281020327e-11	35995686	35995686	3.34464709811617e-12	87661927	87721951
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	88038874	6	6	0.4746	3.34464709811617e-12	87661927	87721951	2.07864597199706e-12	88038874	88078497
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88078497	146571330	15160	14569	-0.006	2.07864597199706e-12	88038874	88078497	4.92657372259526e-14	146562545	146571330
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146597405	5	5	-0.5639	4.92657372259526e-14	146562545	146571330	8.0998754849976e-14	146597405	146601593
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146601593	154601442	2202	2122	-0.0063	8.0998754849976e-14	146597405	146601593	1.30237857456631e-14	154601442	154601442
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	0.8986	1.30237857456631e-14	154601442	154601442	4.39635367043216e-15	154606943	154606943
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	179767214	8999	8705	0	4.39635367043216e-15	154606943	154606943	6.3670227457257e-23	179767214	179767214
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.8977	6.3670227457257e-23	179767214	179767214	4.55673511054396e-23	179778919	179778919
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	179791128	1	0	NA	4.55673511054396e-23	179778919	179778919	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791155	212890878	10849	10467	6e-04	NA	NA	NA	7.63407772027706e-36	212890878	212890878
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-0.9622	7.63407772027706e-36	212890878	212890878	1.00355137783686e-36	212898875	212898875
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	218969487	2283	2192	0.001	1.00355137783686e-36	212898875	212898875	4.95313062183178e-14	218969487	218969487
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218970587	218970587	1	0	NA	4.95313062183178e-14	218969487	218969487	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218971708	218972428	2	2	0.8564	NA	NA	NA	1.2496421271265e-13	218972428	218972428
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218975318	242501239	8335	8034	-0.0076	1.2496421271265e-13	218972428	218972428	3.04775869701821e-25	242487220	242523086
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242666531	61	59	0.2071	3.04775869701821e-25	242487220	242523086	0.00729467720814227	242634956	242677069
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677011	242689978	6	6	-0.0348	0.00729467720814227	242634956	242677069	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10413	-0.0072	NA	NA	NA	3.69579572030061e-42	32074432	32074432
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.4812	3.69579572030061e-42	32074432	32074432	3.99564838036228e-41	32080848	32080848
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	41562758	3167	3052	-0.0032	3.99564838036228e-41	32080848	32080848	6.31153542175573e-12	41562758	41562758
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	41562796	41563630	2	2	-0.8161	6.31153542175573e-12	41562758	41562758	1.16884946072530e-11	41563630	41563630
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	41571366	47460892	2251	2162	-0.0045	1.1688494607253e-11	41563630	41563630	0	47460892	47460892
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.2574	0	47460892	47460892	0	47466921	47466921
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	99891210	15963	15364	-0.0018	0	47466921	47466921	1.72488008448151e-11	99891210	99891210
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	0.7997	1.72488008448151e-11	99891210	99891210	9.1869293275199e-12	99897201	99897201
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11115	-0.0058	9.1869293275199e-12	99897201	99897201	4.44675928409914e-46	133189686	133189686
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.5521	4.44675928409914e-46	133189686	133189686	6.92940480582732e-46	133194685	133194685
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9425	-0.0039	6.92940480582732e-46	133194685	133194685	0	163992903	164009321
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	6	-2.7963	0	163992903	164009321	0.093683231249121	164001657	164042397
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-4.4884	0.093683231249121	164001657	164042397	0	164107951	164107951
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9756	1e-04	0	164107951	164107951	0	194354505	194354505
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.0347	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	965	-0.0091	0	194366950	194366950	3.65857963975932e-32	196810503	196905767
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196952514	28	26	-0.3842	3.65857963975932e-32	196810503	196905767	4.31797468533203e-35	196945209	196958467
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196957322	199329592	956	926	0.0113	4.31797468533203e-35	196945209	196958467	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3274	-0.0117	NA	NA	NA	7.57020841989738e-19	9815760	9815760
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9832823	3	3	0.8482	7.57020841989738e-19	9815760	9815760	4.71114701761393e-21	9832823	9832823
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9842644	9842644	1	0	NA	4.71114701761393e-21	9832823	9832823	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5948	-0.0114	NA	NA	NA	1.86824474259490e-26	34439897	34445002
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.6907	1.8682447425949e-26	34439897	34445002	2.7255297726031e-27	34491115	34491115
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8547	-0.0012	2.7255297726031e-27	34491115	34491115	5.65950878721375e-68	68905670	68905670
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.7089	5.65950878721375e-68	68905670	68905670	7.44254072087187e-55	69165814	69165814
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	116	0.0149	7.44254072087187e-55	69165814	69165814	7.82976200850427e-14	70130975	70150576
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.6311	7.82976200850427e-14	70130975	70150576	7.3348077410758e-15	70216707	70294312
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	102904655	11239	10847	2e-04	7.3348077410758e-15	70216707	70294312	1.42001728031532e-14	102904655	102904655
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	102915257	102915408	2	2	-0.8841	1.42001728031532e-14	102904655	102904655	3.89098712290067e-14	102915408	102915408
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	102923296	107275274	1343	1295	-0.0014	3.89098712290067e-14	102915408	102915408	3.1626951494264e-12	107274138	107275274
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	0.5803	3.1626951494264e-12	107274138	107275274	2.35585902505927e-12	107281410	107281410
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	119334954	3589	3460	0.0038	2.35585902505927e-12	107281410	107281410	9.06780747274461e-151	119334954	119345371
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-2.3569	9.0678074727446e-151	119334954	119345371	5.21192458808139e-160	119346804	119348829
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	138307863	4214	4073	0.004	5.21192458808139e-160	119346804	119348829	1.83085129173152e-11	138307863	138307863
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-0.7632	1.83085129173152e-11	138307863	138307863	4.8625463006012e-11	138319409	138319409
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	161260146	7307	7043	-0.0018	4.8625463006012e-11	138319409	138319409	1.12327099041497e-29	161260146	161260146
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	161268543	161288702	3	3	-1.0028	1.12327099041497e-29	161260146	161260146	2.60913222074139e-29	161288702	161288702
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	161302611	173660684	3561	3414	0.0057	2.60913222074139e-29	161288702	161288702	1.0690951472899e-26	173660684	173660684
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.1852	1.0690951472899e-26	173660684	173660684	8.94152436691669e-27	173666072	173666072
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5133	-0.0043	8.94152436691669e-27	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	61730568	16846	16263	-0.0074	NA	NA	NA	2.03566253141214e-15	61730568	61730568
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	61731689	61734912	2	2	-0.773	2.03566253141214e-15	61730568	61730568	1.08272641329408e-10	61734912	61734912
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	61737836	150156233	27000	26035	-0.0022	1.08272641329408e-10	61734912	61734912	7.16700524336986e-19	150156233	150156233
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150161037	2	2	-1.0073	7.16700524336986e-19	150156233	150156233	1.98789066030150e-31	150161037	150161037
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150162435	150181399	4	4	0.0627	1.9878906603015e-31	150161037	150161037	9.09333256013812e-19	150181399	150181399
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.781	9.09333256013812e-19	150181399	150181399	1.82645042758027e-41	150202601	150202601
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	155405839	1622	1577	-0.003	1.82645042758027e-41	150202601	150202601	1.03646470610578e-14	155404062	155405839
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	-0.5578	1.03646470610578e-14	155404062	155405839	5.08246103849054e-14	155421443	155427589
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	179429409	7854	7577	-0.0046	5.08246103849054e-14	155421443	155427589	8.52868460538537e-11	179429409	179429409
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	0.7677	8.52868460538537e-11	179429409	179429409	2.25724839330539e-09	179431937	179433578
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	180346557	304	285	0.0244	2.25724839330539e-09	179431937	179433578	1.77590204531639e-24	180346557	180346557
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180348365	1	0	NA	1.77590204531639e-24	180346557	180346557	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180351118	180358977	5	5	0.7806	NA	NA	NA	9.29799044872301e-22	180358977	180362342
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	105	0.0279	9.29799044872301e-22	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	53	0.0216	NA	NA	NA	1.79550251508588e-53	237952	241674
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	44	-0.4632	1.79550251508588e-53	237952	241674	1.29849955760323e-86	323898	327962
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	10658158	3671	3528	-0.0071	1.29849955760323e-86	323898	327962	2.22626541816999e-274	10658158	10660974
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	10660974	10746388	40	38	-0.8849	2.22626541816999e-274	10658158	10660974	8.1535560579325e-274	10745007	10746388
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	10750243	32558677	7865	7595	-0.005	8.1535560579325e-274	10745007	10746388	0	32558677	32564884
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	15	-1.915	0	32558677	32564884	7.83166935814727e-17	32628420	32633691
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32711957	27	27	-0.0207	7.83166935814727e-17	32628420	32633691	0.0129162123874500	32677939	32716255
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	8	0.4067	0.01291621238745	32677939	32716255	0.000341035197152581	32728487	32728487
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32738443	5	5	-0.1465	0.000341035197152581	32728487	32728487	0.000225312541946786	32738443	32742767
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32739800	32762061	8	8	0.4461	0.000225312541946786	32738443	32742767	7.42045129560563e-15	32758904	32767722
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	32766023	1	0	NA	7.42045129560563e-15	32758904	32767722	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32767722	53963013	8208	7902	-0.0037	NA	NA	NA	5.1960698298138e-25	53963013	53963013
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	53968656	53973999	3	3	-0.9473	5.1960698298138e-25	53963013	53963013	1.00850013135521e-25	53973999	53973999
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	53976861	79018959	6469	6242	0.0029	1.00850013135521e-25	53973999	53973999	1.95372714650930e-30	79015901	79024557
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79085247	12	12	-0.5134	1.9537271465093e-30	79015901	79024557	2.78841323928903e-30	79074911	79091850
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79091850	132154299	16307	15736	-0.0013	2.78841323928903e-30	79074911	79091850	8.9741448772232e-11	132151285	132154299
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132156778	132159522	2	2	-0.7671	8.9741448772232e-11	132151285	132154299	1.78844157147353e-10	132159522	132161292
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132161292	165643653	11564	11175	-0.0047	1.78844157147353e-10	132159522	132161292	1.82779888029177e-32	165643653	165643653
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	3	1.066	1.82779888029177e-32	165643653	165643653	4.48607728923584e-30	165650610	165650610
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1741	-0.0158	4.48607728923584e-30	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	13244800	4377	4208	9e-04	NA	NA	NA	1.02437289441698e-29	13244800	13244800
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	13249035	13273470	4	4	-0.9109	1.02437289441698e-29	13244800	13244800	3.17011331284976e-30	13273470	13273470
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	13281048	16135701	1007	969	0.0092	3.17011331284976e-30	13273470	13273470	0	16135701	16135701
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.6912	0	16135701	16135701	0	16140018	16140018
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	93162991	23058	22295	-0.0019	0	16140018	16140018	1.40461919227564e-14	93162991	93162991
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.9004	1.40461919227564e-14	93162991	93162991	1.80335874878572e-14	93168978	93168978
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	109217320	6511	6260	0.0023	1.80335874878572e-14	93168978	93168978	9.66517360799261e-12	109216032	109217320
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109240210	5	5	0.5167	9.66517360799261e-12	109216032	109217320	4.18415948105491e-12	109240210	109244233
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	141410894	14837	14278	-2e-04	4.18415948105491e-12	109240210	109244233	1.32281132911452e-30	141409512	141413352
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	-0.5005	1.32281132911452e-30	141409512	141413352	3.12491696257849e-25	141438504	141442231
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	147702365	2638	2550	-0.0117	3.12491696257849e-25	141438504	141442231	2.11133628032835e-19	147699576	147702365
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147710037	4	4	-0.7872	2.11133628032835e-19	147699576	147702365	3.74215480864873e-20	147710037	147710037
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147711471	158821263	4236	4069	-0.0145	3.74215480864873e-20	147710037	147710037	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0452	NA	NA	NA	1.07553057530694e-13	581533	581533
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.183	1.07553057530694e-13	581533	581533	4.82633865793521e-23	588865	588865
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	3771559	1246	1204	-0.0159	4.82633865793521e-23	588865	588865	3.77000774990852e-12	3771559	3771559
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3773975	3776617	2	2	-0.8501	3.77000774990852e-12	3771559	3771559	2.04451250314649e-11	3776617	3779135
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3779135	4303659	251	239	-0.0059	2.04451250314649e-11	3776617	3779135	2.37462966265233e-20	4303659	4303659
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4308979	4316878	5	5	-0.7281	2.37462966265233e-20	4303659	4303659	5.71195216792664e-26	4316878	4316878
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4319364	5574577	385	372	-0.0301	5.71195216792664e-26	4316878	4316878	8.93184870602248e-10	5574577	5574577
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5585615	5591702	2	2	-0.7041	8.93184870602248e-10	5574577	5574577	2.89170763486287e-10	5591702	5591702
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5596343	7156900	380	366	1e-04	2.89170763486287e-10	5591702	5591702	1.13274770779835e-17	6926661	7226901
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-0.4368	1.13274770779835e-17	6926661	7226901	2.33027997018263e-15	7790934	8137794
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	40892587	11173	10773	-0.0035	2.33027997018263e-15	7790934	8137794	1.43500380203697e-143	40892587	40892587
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-2.8098	1.43500380203697e-143	40892587	40892587	1.03258302126923e-116	40897469	40897469
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51191560	1736	1676	-0.0021	1.03258302126923e-116	40897469	40897469	5.28341574549625e-25	51191560	51191560
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.8282	5.28341574549625e-25	51191560	51191560	1.28572296332151e-25	51200291	51200291
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	1.28572296332151e-25	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	115701209	19554	18843	-0.0023	NA	NA	NA	1.27373674864726e-16	115701209	115701209
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.9513	1.27373674864726e-16	115701209	115701209	2.49165883194207e-17	115711730	115711730
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	136070054	6519	6301	-0.0058	2.49165883194207e-17	115711730	115711730	7.42745416906539e-20	136070054	136070054
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	136072849	136074510	2	2	-1.0155	7.42745416906539e-20	136070054	136070054	4.58800116947041e-17	136074510	136074510
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	136076710	136076710	1	0	NA	4.58800116947041e-17	136074510	136074510	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	136079102	146264846	3171	3044	-0.0151	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	2135333	760	730	-0.0021	NA	NA	NA	6.59588246990632e-26	2135333	2135333
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2138129	2139868	2	2	-1.1822	6.59588246990632e-26	2135333	2135333	3.92801894789644e-26	2139868	2139868
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2143843	15802255	4696	4545	-0.0024	3.92801894789644e-26	2139868	2139868	1.35583095075605e-20	15802255	15802255
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.0478	1.35583095075605e-20	15802255	15802255	5.38394394363595e-20	15807123	15807123
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	39048058	7266	6982	0	5.38394394363595e-20	15807123	15807123	1.14623971633265e-13	38716226	43626920
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39062211	39062211	1	0	NA	1.14623971633265e-13	38716226	43626920	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39088753	70221479	34	33	-0.2157	NA	NA	NA	2.33980914480754e-12	67942846	70231532
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70223138	70926188	311	296	-0.0039	2.33980914480754e-12	67942846	70231532	4.31694524175555e-23	70926188	70926188
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.171	4.31694524175555e-23	70926188	70926188	2.19741893509144e-25	70930528	70930528
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	90006212	6329	6113	-0.0027	2.19741893509144e-25	70930528	70930528	2.04702103602575e-25	90006212	90006212
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	90007886	90009509	2	2	-1.1667	2.04702103602575e-25	90006212	90006212	7.99774671059085e-25	90009509	90009509
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	90015922	100348045	3588	3471	-0.0062	7.99774671059085e-25	90009509	90009509	2.83862228450192e-09	100348045	100348045
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	0.7161	2.83862228450192e-09	100348045	100348045	1.71282488611064e-09	100350814	100350814
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5354	-0.0045	1.71282488611064e-09	100350814	100350814	4.04490369346614e-20	116124007	116124007
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0365	4.04490369346614e-20	116124007	116124007	7.76296938021257e-20	116130333	116130333
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	130454192	5552	5349	-0.0049	7.76296938021257e-20	116130333	116130333	2.80401070560724e-18	130454192	130454192
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130456151	130458341	2	2	0.9872	2.80401070560724e-18	130454192	130454192	1.75555726609277e-16	130458341	130458341
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130459484	137352394	2741	2620	0.0054	1.75555726609277e-16	130458341	130458341	1.97550471416587e-74	137352394	137352394
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.0606	1.97550471416587e-74	137352394	137352394	3.88397823622537e-66	137356880	137356880
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1057	-0.0179	3.88397823622537e-66	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	126361	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128878	27038538	9728	9366	-0.0047	NA	NA	NA	1.22995014373707e-38	27038538	27038538
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.4438	1.22995014373707e-38	27038538	27038538	1.03349317804598e-38	27041812	27041812
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14328	-0.0043	1.03349317804598e-38	27041812	27041812	7.60065489336297e-122	77917893	77917893
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.0906	7.60065489336297e-122	77917893	77917893	1.14264462316398e-123	77928738	77928738
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	132797428	19277	18601	-0.0074	1.14264462316398e-123	77928738	77928738	1.53907859006875e-16	132797428	132797428
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.945	1.53907859006875e-16	132797428	132797428	6.92396742523123e-16	132801463	132801463
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	134739406	723	707	-0.0249	6.92396742523123e-16	132801463	132801463	1.09530103595396e-07	134739406	134739406
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	0.658	1.09530103595396e-07	134739406	134739406	1.90710906073883e-06	134743423	134746574
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	200	-0.0261	1.90710906073883e-06	134743423	134746574	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	660290	182	175	-0.0107	NA	NA	NA	6.93704538179499e-06	654251	660290
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	661520	667517	3	3	0.4983	6.93704538179499e-06	654251	660290	1.70807651838106e-06	667517	671033
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	671033	4923300	1587	1526	-0.0157	1.70807651838106e-06	667517	671033	0	4923300	4923300
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-3.5853	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	352	0.0074	0	4932214	4932214	2.73227007406828e-10	5730121	5744034
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	0.3032	2.73227007406828e-10	5730121	5744034	2.28913818578614e-12	5762182	5774108
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14241	-0.0033	2.28913818578614e-12	5762182	5774108	1.05015908562333e-69	55114405	55124730
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.4371	1.05015908562333e-69	55114405	55124730	5.63834127519155e-67	55205278	55217189
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4486	0.0029	5.63834127519155e-67	55205278	55217189	9.1625756900931e-17	66463477	66463477
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9697	9.1625756900931e-17	66463477	66463477	2.53635902866245e-17	66469412	66469412
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	84939605	6681	6428	-0.0036	2.53635902866245e-17	66469412	66469412	9.26559489755283e-32	84939605	84939605
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84942392	84951675	6	6	-0.7581	9.26559489755283e-32	84939605	84939605	2.34196332038733e-32	84951675	84951675
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84961098	99025912	4167	4020	-0.0014	2.34196332038733e-32	84951675	84951675	7.21956786709314e-15	99016880	99031550
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99027331	99064450	19	17	0.3072	7.21956786709314e-15	99016880	99031550	1.85969467371094e-15	99054423	99072015
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99068718	134450318	12847	12388	-0.0062	1.85969467371094e-15	99054423	99072015	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	4538227	1918	1856	0.0012	NA	NA	NA	9.61391315426566e-07	4536434	4538227
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4539938	4542324	2	2	-0.6288	9.61391315426566e-07	4536434	4538227	5.31469800097621e-07	4542324	4544254
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4544254	7884886	1326	1270	-0.0078	5.31469800097621e-07	4542324	4544254	4.96941004280806e-179	7884886	7884886
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7890143	8015452	50	46	0.6405	4.96941004280806e-179	7884886	7884886	3.09600708248404e-169	8015452	8015452
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8018443	9523923	446	427	0.0071	3.09600708248404e-169	8015452	8015452	1.49852435935946e-83	9523923	9531133
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9589725	11	11	0.9437	1.49852435935946e-83	9523923	9531133	0.000942161002427297	9554149	9599999
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9590351	9610054	5	5	0.2781	0.000942161002427297	9554149	9599999	0.000647758954543175	9599999	9628897
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10470425	330	321	-0.0149	0.000647758954543175	9599999	9628897	1.49728475930751e-18	10466791	10477903
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10485848	6	6	-0.5699	1.49728475930751e-18	10466791	10477903	7.46172697893975e-18	10482217	10491341
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	31188761	7067	6840	3e-04	7.46172697893975e-18	10482217	10491341	1.59312408812629e-13	31173065	31196787
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31192445	31237505	11	11	0.3688	1.59312408812629e-13	31173065	31196787	4.03070054223896e-14	31231952	31242528
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	33178741	749	723	0.015	4.03070054223896e-14	31231952	31242528	8.5781682905407e-14	33178741	33178741
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33184017	33184017	1	0	NA	8.5781682905407e-14	33178741	33178741	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-0.7996	NA	NA	NA	1.96228087273519e-11	33198331	33198331
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	78665408	14627	14088	5e-04	1.96228087273519e-11	33198331	33198331	3.40893796725323e-15	78663063	78675711
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78668041	78686371	7	7	-0.4886	3.40893796725323e-15	78663063	78675711	4.8645950206954e-18	78683625	78688893
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	80662066	783	759	0.0137	4.8645950206954e-18	78683625	78688893	1.54437441780292e-17	80662066	80662066
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-0.9074	1.54437441780292e-17	80662066	80662066	4.77506651054889e-15	80666751	80666751
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	130943064	17266	16626	-0.002	4.77506651054889e-15	80666751	80666751	1.9359232612427e-16	130943064	130943064
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	0.9421	1.9359232612427e-16	130943064	130943064	2.34363420792672e-15	130946248	130946248
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	534	-0.0106	2.34363420792672e-15	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6775	-0.0037	NA	NA	NA	1.55663754115327e-107	36969571	36969571
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-2.4344	1.55663754115327e-107	36969571	36969571	4.00790334063633e-52	36982877	36982877
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	287	0.0181	4.00790334063633e-52	36982877	36982877	2.40100710083053e-148	37953582	37953582
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.7438	2.40100710083053e-148	37953582	37953582	2.19873442163039e-148	37957844	37957844
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	50819012	5241	5065	-0.0052	2.19873442163039e-148	37957844	37957844	2.95391228472553e-19	50819012	50819012
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50820905	50822114	2	2	-1.0104	2.95391228472553e-19	50819012	50819012	1.52842097661309e-17	50822114	50822114
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50826116	63118944	2917	2797	-0.0022	1.52842097661309e-17	50822114	50822114	3.39582382296158e-16	63118944	63118944
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-0.9721	3.39582382296158e-16	63118944	63118944	4.69732781117703e-19	63130828	63130828
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	68130387	1227	1185	0.0049	4.69732781117703e-19	63130828	63130828	4.82045146943058e-14	68126375	68136198
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68132217	68163523	15	14	0.3259	4.82045146943058e-14	68126375	68136198	4.23436376005809e-14	68160625	68168882
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	113791151	14749	14250	-0.0031	4.23436376005809e-14	68160625	68168882	1.36949684230628e-10	113791151	113791151
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113792974	113794669	2	2	0.6908	1.36949684230628e-10	113791151	113791151	1.02178189464501e-08	113794669	113794669
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	145	-0.0057	1.02178189464501e-08	113794669	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18527871	4	3	0.6682	NA	NA	NA	0.000300015216333513	18508651	18544772
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18537177	19478367	50	49	0.2225	0.000300015216333513	18508651	18544772	0.0419633728987963	19297767	19483933
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19483933	19494416	6	6	0.436	0.0419633728987963	19297767	19483933	3.23624758725909e-09	19494416	19497023
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5482	0.0073	3.23624758725909e-09	19494416	19497023	1.15584787390947e-32	34674458	34674458
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1222	1.15584787390947e-32	34674458	34674458	1.61147107519177e-36	34683810	34683810
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40680589	1896	1831	0.0034	1.61147107519177e-36	34683810	34683810	1.11623671495136e-19	40676611	40680589
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40712006	5	5	-0.6394	1.11623671495136e-19	40676611	40680589	4.91833065724033e-19	40712006	40722360
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40722360	55223229	4329	4140	-2e-04	4.91833065724033e-19	40712006	40722360	3.53850364500698e-11	55223229	55223229
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55226614	55228180	2	2	-0.7816	3.53850364500698e-11	55223229	55223229	3.64088526406223e-11	55228180	55228180
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55230544	73071404	7435	7177	4e-04	3.64088526406223e-11	55228180	55228180	1.88121191835928e-13	73061942	73071404
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	1.88121191835928e-13	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	0.4935	NA	NA	NA	2.05667895034047e-13	73092112	73101327
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79172702	2913	2804	-0.0029	2.05667895034047e-13	73092112	73101327	2.11545771334274e-20	79172702	79172702
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79174722	79176037	2	2	-1.0623	2.11545771334274e-20	79172702	79172702	0.00857127566190666	79176037	79177462
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79177462	79183154	3	3	-3.9937	0.00857127566190666	79176037	79177462	0	79183154	79183154
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	8973	-0.007	0	79183154	79183154	8.37314557676457e-22	105595302	105602602
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-0.4564	8.37314557676457e-22	105595302	105602602	1.46770409815513e-13	105630089	105681007
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	48	-0.0082	1.46770409815513e-13	105630089	105681007	7.84570334629154e-16	105848335	105850033
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	0.5933	7.84570334629154e-16	105848335	105850033	2.58333662639379e-29	105881893	105881893
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923686	14	14	0.0311	2.58333662639379e-29	105881893	105881893	4.92686415339669e-14	105923686	105945006
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	19	-0.5968	4.92686415339669e-14	105923686	105945006	1.31908782834185e-28	105996176	106013552
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106218059	90	89	-0.0056	1.31908782834185e-28	105996176	106013552	1.82940249563190e-07	106205637	106223507
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106255190	17	16	-0.2957	1.8294024956319e-07	106205637	106223507	3.50455782412015e-08	106251081	106260962
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	35	-0.0014	3.50455782412015e-08	106251081	106260962	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19537035	99	94	0.0071	NA	NA	NA	4.72577528180183e-05	19412049	19803092
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19845942	11	11	-0.2467	4.72577528180183e-05	19412049	19803092	7.5737145000011e-11	19844217	19845942
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-1.0342	7.5737145000011e-11	19844217	19845942	1.74671963050296e-16	19882711	19882711
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20079935	42	40	-0.2717	1.74671963050296e-16	19882711	19882711	5.88539305909915e-22	20053008	20316992
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20088256	21205713	150	140	0.0074	5.88539305909915e-22	20053008	20316992	1.98827646913379e-14	21205713	21205713
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21208367	21218234	3	3	-0.7479	1.98827646913379e-14	21205713	21205713	5.11712495953176e-15	21218234	21218234
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21236096	41638388	7202	6939	-0.006	5.11712495953176e-15	21218234	21218234	3.72002614327287e-12	41637456	41638388
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41682937	4	4	-0.5868	3.72002614327287e-12	41637456	41638388	6.31828214494664e-13	41682937	41704248
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41704248	43711297	928	902	0.0093	6.31828214494664e-13	41682937	41704248	1.57675275159305e-10	43711297	43711297
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43713730	43715136	2	2	-0.7557	1.57675275159305e-10	43711297	43711297	1.81815280967511e-10	43715136	43716848
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43716848	52517110	3556	3455	-0.0073	1.81815280967511e-10	43715136	43716848	1.29928495616241e-64	52517110	52517110
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-1.8226	1.29928495616241e-64	52517110	52517110	1.41197224952238e-57	52533227	52533227
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	53293492	209	205	-0.0084	1.41197224952238e-57	52533227	52533227	9.146793466012e-17	53293492	53293492
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53294146	53294638	2	2	-0.9913	9.146793466012e-17	53293492	53293492	8.09957368946737e-18	53294638	53294638
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53296511	75115806	9672	9345	0.0037	8.09957368946737e-18	53294638	53294638	2.67004822448224e-38	75115806	75115806
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.4471	2.67004822448224e-38	75115806	75115806	6.05930714166855e-46	75119713	75119713
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	75518598	166	156	9e-04	6.05930714166855e-46	75119713	75119713	3.07548208509816e-21	75518598	75518598
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75519691	75520672	2	2	-0.9967	3.07548208509816e-21	75518598	75518598	4.0036726457024e-19	75520672	75520672
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75521740	82332155	2454	2366	0.0025	4.0036726457024e-19	75520672	75520672	7.73725362256493e-12	82332155	82332155
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-0.7896	7.73725362256493e-12	82332155	82332155	1.73691941137044e-10	82334704	82334704
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	99632987	6537	6286	-0.0115	1.73691941137044e-10	82334704	82334704	1.28429813836159e-109	99632987	99632987
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.4347	1.28429813836159e-109	99632987	99632987	1.84436308015122e-98	99635701	99635701
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	263	0.0068	1.84436308015122e-98	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33628	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	37560	68693086	18298	17635	-0.0026	NA	NA	NA	3.63785319139354e-15	68687301	68710277
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.4118	3.63785319139354e-15	68687301	68710277	4.41566449855692e-17	68751390	68842364
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1402	2e-04	4.41566449855692e-17	68751390	68842364	9.94502688647925e-18	72917554	72929786
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.5015	9.94502688647925e-18	72917554	72929786	2.32544390608167e-19	72964783	73022578
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	730	0.0188	2.32544390608167e-19	72964783	73022578	1.57992451571872e-32	75093957	75093957
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.0377	1.57992451571872e-32	75093957	75093957	8.37274491053496e-29	75100865	75100865
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4944	-0.0063	8.37274491053496e-29	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027736	416	397	0.0309	NA	NA	NA	5.8624370476329e-77	1027736	1027736
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1028979	1028979	1	0	NA	5.8624370476329e-77	1027736	1027736	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.1463	NA	NA	NA	4.27103451679194e-83	1030766	1030766
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	424	0.0152	4.27103451679194e-83	1030766	1030766	4.01675829357638e-16	1904451	1904451
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.7889	4.01675829357638e-16	1904451	1904451	2.96366549679015e-16	1906391	1906391
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	15727076	5445	5249	0.0053	2.96366549679015e-16	1906391	1906391	2.87708667981514e-97	15727076	15727076
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-2.3782	2.87708667981514e-97	15727076	15727076	6.56769985415489e-100	15733964	15733964
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	31457889	5733	5510	0.0083	6.56769985415489e-100	15733964	15733964	3.12197303560911e-28	31451114	31461588
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.3952	3.12197303560911e-28	31451114	31461588	2.32904645157515e-27	31499568	31891535
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1745	0.0156	2.32904645157515e-27	31499568	31891535	4.67315453234138e-133	36673853	36673853
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.604	4.67315453234138e-133	36673853	36673853	2.70378707077608e-144	36684619	36684619
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40874079	1807	1741	0.0196	2.70378707077608e-144	36684619	36684619	1.98168527332521e-10	40869151	40874079
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41015177	3	3	0.6366	1.98168527332521e-10	40869151	40874079	9.34111686536944e-10	41015177	41017338
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41017338	41519702	201	194	0.0066	9.34111686536944e-10	41015177	41017338	3.07470349515168e-50	41518222	41519702
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	19	0.5705	3.07470349515168e-50	41518222	41519702	2.43673769283087e-24	41566540	41570512
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41647135	37	37	0.1584	2.43673769283087e-24	41566540	41570512	1.09088713537785e-07	41625390	42148637
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	68326225	9421	9074	0.0049	1.09088713537785e-07	41625390	42148637	5.23009213158808e-18	68326225	68326225
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68327352	68331629	3	3	-0.7981	5.23009213158808e-18	68326225	68326225	5.05039576306965e-16	68331629	68331629
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68335510	78653545	4264	4101	-3e-04	5.05039576306965e-16	68331629	68331629	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22147	-0.0061	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	11	-0.0852	NA	NA	NA	8.76387217181104e-46	239700	239700
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	0.8251	8.76387217181104e-46	239700	239700	9.12432462753983e-12	243026	243026
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	790526	205	199	0.0101	9.12432462753983e-12	243026	243026	8.56784721959152e-23	790526	790526
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.1439	8.56784721959152e-23	790526	790526	1.42103476714361e-18	794978	794978
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	255	0.0145	1.42103476714361e-18	794978	794978	9.59598863943798e-52	1398325	1398325
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.9027	9.59598863943798e-52	1398325	1398325	2.36824813886424e-63	1400840	1400840
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3353960	926	882	0.0087	2.36824813886424e-63	1400840	1400840	3.95046518170699e-10	3353960	3353960
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	0.7775	3.95046518170699e-10	3353960	3353960	4.64157530398999e-10	3356334	3356334
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	4361883	475	461	0.0141	4.64157530398999e-10	3356334	3356334	4.69670581962165e-59	4360079	4363771
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4363771	4411863	30	29	0.5116	4.69670581962165e-59	4360079	4363771	2.45308106880285e-65	4411616	4420555
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4420555	7243635	1333	1276	0.0142	2.45308106880285e-65	4411616	4420555	1.41554873079097e-10	7242096	7246012
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7246012	7254650	3	3	0.6421	1.41554873079097e-10	7242096	7246012	5.67925365661383e-11	7250473	7254650
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7304352	11448975	1909	1839	0.0034	5.67925365661383e-11	7250473	7254650	1.53393834268690e-16	11448975	11448975
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	0.9596	1.5339383426869e-16	11448975	11448975	1.7755497093765e-15	11452390	11452390
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	59414898	15881	15296	0.0039	1.7755497093765e-15	11452390	11452390	6.41772138825505e-27	59414645	59414898
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59440262	11	10	-0.5536	6.41772138825505e-27	59414645	59414898	2.63708508848997e-26	59434159	59440274
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	63788698	1993	1913	-0.0133	2.63708508848997e-26	59434159	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	562	-0.0202	NA	NA	NA	3.70745140642215e-13	1506379	1506379
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1515948	2	2	-0.8556	3.70745140642215e-13	1506379	1506379	0.0900902550998098	1515948	1525300
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1516966	1531162	7	7	-2.8842	0.0900902550998098	1515948	1525300	0	1523000	1531162
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	48057167	15808	15224	-0.0068	0	1523000	1531162	2.37846531310163e-08	48054772	48059787
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48059787	48067777	3	3	0.5636	2.37846531310163e-08	48054772	48059787	2.61160156737921e-08	48062677	48070532
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48070532	62419534	5173	4984	-0.0111	2.61160156737921e-08	48062677	48070532	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	39395489	9822	9507	4e-04	NA	NA	NA	3.45324465755481e-15	39395489	39395489
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	39397601	39399750	2	2	-0.8908	3.45324465755481e-15	39395489	39395489	1.45303024330816e-12	39399750	39399750
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	39401971	46922972	3617	3484	-0.0146	1.45303024330816e-12	39399750	39399750	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	21571489	2520	2428	0.0054	NA	NA	NA	2.70941976776237e-21	21571489	21571489
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	0.9348	2.70941976776237e-21	21571489	21571489	3.92986268950574e-20	21576859	21576859
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	448	-1e-04	3.92986268950574e-20	21576859	21576859	0	22667608	22679305
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22718614	19	18	-2.6996	0	22667608	22679305	0.306761236863515	22679305	22718614
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22720195	22720195	1	0	NA	0.306761236863515	22679305	22718614	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	22725305	2	2	-1.2806	NA	NA	NA	8.86560865744613e-31	22725305	22725305
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6296	0.0052	8.86560865744613e-31	22725305	22725305	1.52729737731692e-10	35472378	35472378
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	0.7725	1.52729737731692e-10	35472378	35472378	9.24749432113767e-10	35476942	35476942
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	41237593	3053	2956	0.0109	9.24749432113767e-10	35476942	35476942	1.40214006172088e-10	41220567	41237593
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41237731	41279485	9	9	0.3841	1.40214006172088e-10	41220567	41237593	1.61480952013181e-10	41279485	41287060
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	49571068	3941	3793	-0.0028	1.61480952013181e-10	41279485	41287060	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	104732	13	13	0.3404	NA	NA	NA	5.54215082792494e-07	94062	110101
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	266212	114	110	0.0213	5.54215082792494e-07	94062	110101	9.22053150521898e-09	266212	266212
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	0.8455	9.22053150521898e-09	266212	266212	4.55324749861443e-12	267079	267079
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	767373	382	367	0.0077	4.55324749861443e-12	267079	267079	1.42847515241259e-08	755300	773688
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	767408	767408	1	0	NA	1.42847515241259e-08	755300	773688	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	769172	793712	20	20	-0.2182	NA	NA	NA	1.90645053202962e-10	786791	800956
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	796371	1373931	207	198	0.021	1.90645053202962e-10	786791	800956	7.3303107612534e-06	1373567	1373931
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1374886	1375885	3	3	-0.4154	7.3303107612534e-06	1373567	1373931	2.41509164233555e-05	1375885	1377839
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1377652	1571340	148	143	0.0161	2.41509164233555e-05	1375885	1377839	4.44271818146348e-07	1571340	1571340
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1572418	1572553	2	2	0.6241	4.44271818146348e-07	1571340	1571340	2.90215353832615e-07	1572553	1572553
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1573461	2302065	508	497	0.0096	2.90215353832615e-07	1572553	1572553	1.94234559635843e-28	2302065	2302065
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.857	1.94234559635843e-28	2302065	2302065	5.21579278564139e-34	2304398	2304398
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2414151	120	114	0.0014	5.21579278564139e-34	2304398	2304398	1.33824814867058e-06	2411621	2415736
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2415262	2418980	7	7	-0.2862	1.33824814867058e-06	2411621	2415736	1.98446662528461e-06	2418497	2422411
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2419541	2674962	239	227	0.0106	1.98446662528461e-06	2418497	2422411	3.03800487583068e-13	2672477	2693493
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2676476	2708291	23	23	-0.2533	3.03800487583068e-13	2672477	2693493	1.69944544481483e-183	2708291	2708291
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	53340279	18017	17354	0.9389	1.69944544481483e-183	2708291	2708291	2.75093317789804e-35	53340279	53340279
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53341809	53341809	1	0	NA	2.75093317789804e-35	53340279	53340279	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53342769	53346650	2	2	-0.2392	NA	NA	NA	1.06311618944092e-14	53346650	53346650
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53348024	55998729	849	827	0.9283	1.06311618944092e-14	53346650	53346650	3.0443333520538e-09	55994223	55998729
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56001249	56006273	3	3	0.1672	3.0443333520538e-09	55994223	55998729	4.76834967346039e-44	56006273	56017534
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56017534	153759378	25999	25041	0.9389	4.76834967346039e-44	56006273	56017534	0	153759294	153759378
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153771813	154216990	194	186	0.0606	0	153759294	153759378	4.70863107942945e-301	154216990	154281857
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154281857	154582414	69	63	0.9449	4.70863107942945e-301	154216990	154281857	0	154582414	154582414
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0077	0	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-3.6914	NA	NA	NA	3.49064209154054e-25	3219200	3223585
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	3.49064209154054e-25	3219200	3223585	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4431527	10	10	-0.433	NA	NA	NA	0.00278582646984065	4425391	4948824
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	5593746	6	6	-1.4743	0.00278582646984065	4425391	4948824	0.00408113387201421	5593746	6735310
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6997136	139	134	-3.4602	0.00408113387201421	5593746	6735310	1.12922622572134e-11	6959256	7020318
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6998513	7495687	164	156	-2.3673	1.12922622572134e-11	6959256	7020318	0.000419590491861464	7410906	7568006
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7606496	12	11	-4.0278	0.000419590491861464	7410906	7568006	0.00498050790544407	7605311	7631265
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7653082	19	19	-2.5639	0.00498050790544407	7605311	7631265	1.99980390373193e-05	7632577	7659535
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.0115	1.99980390373193e-05	7632577	7659535	1.37099369369641e-06	7701303	7731490
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8005148	88	84	-2.8485	1.37099369369641e-06	7701303	7731490	2.55868575807612e-07	7951683	8058483
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8241630	57	47	-3.9856	2.55868575807612e-07	7951683	8058483	5.97910940971608e-08	8179883	8293425
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8245608	8783087	157	153	-3.0738	5.97910940971608e-08	8179883	8293425	0.000377133502347164	8698878	8953090
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8786453	9081196	58	55	-3.6245	0.000377133502347164	8698878	8953090	0.000757998170958221	8959151	9094974
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9087629	9133230	14	14	-4.8876	0.000757998170958221	8959151	9094974	0.00482947609010521	9118845	9133230
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9135034	9135034	1	0	NA	0.00482947609010521	9118845	9133230	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9145335	9157232	5	4	-3.6812	NA	NA	NA	1.01796878671190e-05	9157232	9164547
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9160624	10012024	12	11	-2.4823	1.0179687867119e-05	9157232	9164547	8.77903271224248e-05	10004173	10055462
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10014777	10014777	1	0	NA	8.77903271224248e-05	10004173	10055462	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10025706	10515697	64	62	-3.8222	NA	NA	NA	1.01139110988760e-35	10513747	10535786
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	16	-0.5733	1.0113911098876e-35	10513747	10535786	3.27583455192765e-24	11660512	11673476
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12541506	13	12	-4.0037	3.27583455192765e-24	11660512	11673476	2.74756786400009e-07	12536761	12554612
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-1.9652	2.74756786400009e-07	12536761	12554612	1.69851949863655e-08	12658135	12696242
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	13	-4.0937	1.69851949863655e-08	12658135	12696242	2.17537221979073e-07	12745259	12796639
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	12926941	41	41	-2.5399	2.17537221979073e-07	12745259	12796639	0.00115400703598034	12905395	12994193
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13048283	47	46	-1.6593	0.00115400703598034	12905395	12994193	8.45002744701913e-05	13029929	13048283
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13062151	8	7	-3.6654	8.45002744701913e-05	13029929	13048283	4.10131775795409e-11	13062151	13066849
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13066543	13129843	25	24	-1.413	4.10131775795409e-11	13062151	13066849	6.61670148154394e-17	13128515	13136828
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13153117	12	12	-4.1984	6.61670148154394e-17	13128515	13136828	1.74788462762949e-05	13147329	13158272
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13262997	33	29	-2.7768	1.74788462762949e-05	13147329	13158272	2.01141327661791e-06	13241682	13311009
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13823928	201	184	-3.7246	2.01141327661791e-06	13241682	13311009	2.31378863055733e-05	13784030	13828384
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.1456	2.31378863055733e-05	13784030	13828384	6.3327485637317e-09	13863616	13869106
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	119	-4.0767	6.3327485637317e-09	13863616	13869106	6.47572945366661e-07	14122036	14122129
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.3097	6.47572945366661e-07	14122036	14122129	1.58950366048109e-05	14143748	14169526
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14352278	31	29	-3.8737	1.58950366048109e-05	14143748	14169526	0.000737249428677989	14330251	14382361
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	89	-2.9337	0.000737249428677989	14330251	14382361	3.49310496570334e-08	14496442	14528771
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.49310496570334e-08	14496442	14528771	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	23	-1.4277	NA	NA	NA	0.000111092230850654	14566592	14605090
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14697315	21	21	-3.0437	0.000111092230850654	14566592	14605090	0.0336687745144907	14587291	14698076
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14698076	14729413	18	17	-4.1327	0.0336687745144907	14587291	14698076	6.63656905357947e-07	14727064	14734647
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14731122	14744771	6	5	-2.8304	6.63656905357947e-07	14727064	14734647	2.42679523453393e-08	14742448	14744771
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14747796	14747796	1	0	NA	2.42679523453393e-08	14742448	14744771	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14754064	14883615	20	19	-4.428	NA	NA	NA	0.000179787192923624	14875973	14969835
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	16387273	513	488	-3.179	0.000179787192923624	14875973	14969835	4.03023947108086e-07	16279279	16413874
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16659030	39	36	-4.3233	4.03023947108086e-07	16279279	16413874	0.000598169771603268	16626771	16742431
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16660742	21186021	696	661	-3.5273	0.000598169771603268	16626771	16742431	0.000715227237529778	21134616	21224074
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21193362	21326975	26	26	-2.6063	0.000715227237529778	21134616	21224074	0.000101224204635478	21325972	21326975
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21328255	21329709	2	2	-1.0775	0.000101224204635478	21325972	21326975	0.0171114359559959	21329709	21348482
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21330576	22157319	176	167	-3.5551	0.0171114359559959	21329709	21348482	0.000201229273086839	22049641	22158616
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-1.9039	0.000201229273086839	22049641	22158616	2.52776433398581e-07	22175425	22177335
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.2801	2.52776433398581e-07	22175425	22177335	2.70273933811219e-05	22192409	22203194
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	23	-4.7896	2.70273933811219e-05	22192409	22203194	4.70103171583478e-08	22252446	22382215
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	55	-3.6654	4.70103171583478e-08	22252446	22382215	1.69006651682241e-80	22926726	22930737
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-0.8446	1.69006651682241e-80	22926726	22930737	4.57212916719553e-18	26945893	26952278
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.2432	4.57212916719553e-18	26945893	26952278	0.00176835427847213	26957814	26980386
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	26989053	2	2	-0.2603	0.00176835427847213	26957814	26980386	1.16558360977688e-33	26989053	26989053
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26990807	26990807	1	0	NA	1.16558360977688e-33	26989053	26989053	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26995399	27003308	4	4	-1.7235	NA	NA	NA	5.59916309138096e-17	27003308	27003308
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.5635	5.59916309138096e-17	27003308	27003308	5.0161508604406e-40	27019256	27019256
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.1675	5.0161508604406e-40	27019256	27019256	1.37618524268933e-45	27039222	27039222
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.3559	1.37618524268933e-45	27039222	27039222	5.29529040107068e-25	27137064	27137064
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27167148	2	2	-4.0495	5.29529040107068e-25	27137064	27137064	3.73487890683106e-54	27167148	27167148
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27171797	27171797	1	0	NA	3.73487890683106e-54	27167148	27167148	NA	NA	NA
MSK_252152915853_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	57440809	13	12	-0.4015	NA	NA	NA	NA	NA	NA
