TCGAID	PATIENTID	sampleFail	tbpGood	TBP.CT	EGFR.CT	EGFRvIII.CT	TBP.CTmad	EGFR.CTmad	EGFRvIII.CTmad	TBP.Q	EGFR.Q	EGFRvIII.Q	TBP.Qmad	EGFR.Qmad	EGFRvIII.Qmad	TBP.QTbpCorrected	EGFR.QTbpCorrected	EGFRvIII.QTbpCorrected
TCGA-02-0001-01C-01R-0676-04	1	FALSE	TRUE	29.455	26.13	38.255	0.0252	0.14826	0.09637	0.66354	0.07938	0.00026	0.01018	0.00715	1e-05	1	0.11963	0.00039
TCGA-02-0422-01A-01R-0676-04	422	FALSE	TRUE	29.139	20.31	20.72	0.00148	0.07413	0.07413	0.80508	2.7279	5.74892	0.00073	0.12291	0.24693	1	3.38837	7.14082
TCGA-02-0085-01A-01R-0676-04	85	FALSE	TRUE	28.709	26.84	39.405	0	0.07413	0.1705	1.04737	0.05148	0.00013	0	0.00232	1e-05	1	0.04915	0.00013
TCGA-02-0037-01A-01R-0676-04	37	FALSE	TRUE	28.973	26.03	38.64	0.01927	0.22239	0	0.89115	0.08455	0.00021	0.01055	0.0114	0	1	0.09487	0.00023
TCGA-02-0047-01A-01R-0676-04	47	FALSE	TRUE	29.443	28.12	39.22	0.01186	0.04448	0	0.66843	0.02363	0.00015	0.00486	0.00063	0	1	0.03535	0.00022
TCGA-02-0338-01A-01R-0676-04	338	FALSE	TRUE	27.715	30.3	NA	0.06227	0.0593	NA	1.92413	0.00628	NA	0.07426	0.00023	NA	1	0.00326	NA
TCGA-06-0139-01A-01R-0676-04	139	FALSE	TRUE	29.024	29.17	39.63	0.01483	0.11861	0.13343	0.86377	0.01249	0.00012	0.00786	9e-04	1e-05	1	0.01446	0.00014
TCGA-02-0010-01A-01R-0676-04	10	FALSE	TRUE	27.833	27.565	34.76	0.13343	0.12602	0.10378	1.79011	0.03316	0.00189	0.1422	0.00254	0.00011	1	0.01852	0.00106
TCGA-02-0038-01A-01R-0676-04	38	FALSE	TRUE	29.813	21.2	32.28	0.01927	0.04448	0.02965	0.53301	1.58719	0.0078	0.00631	0.04253	0.00013	1	2.97777	0.01463
TCGA-02-0271-01A-01R-0676-04	271	FALSE	TRUE	28.462	26.94	38.84	0.2298	0.08896	0.50408	1.21825	0.04842	0.00018	0.17968	0.00267	5e-05	1	0.03974	0.00015
TCGA-06-0187-01A-01R-0676-04	187	FALSE	TRUE	29.765	19.62	31.33	0.1364	0.01483	0.16309	0.5489	4.14781	0.01342	0.04712	0.0375	0.00129	1	7.55659	0.02445
TCGA-02-0028-01A-01R-0676-04	28	FALSE	TRUE	28.559	28.555	38.73	0.01186	0.05189	0	1.14805	0.01814	2e-04	0.00835	0.00057	0	1	0.0158	0.00017
TCGA-02-0075-01A-01R-0676-04	75	FALSE	TRUE	27.98	26.18	37.42	0	0.01483	0.17791	1.63613	0.07686	0.00041	0	0.00069	4e-05	1	0.04698	0.00025
TCGA-02-0333-01A-02R-0676-04	333	FALSE	TRUE	28.122	20.52	23.7	0.13788	0.01483	0.08896	1.49997	2.39987	1.04803	0.13021	0.02163	0.05417	1	1.59994	0.6987
TCGA-06-0132-01A-02R-0676-04	132	FALSE	TRUE	29.736	23.52	34.98	0.13047	0.25204	0.07413	0.55873	0.3873	0.00167	0.04583	0.06252	7e-05	1	0.69318	0.00299
TCGA-02-0116-01A-01R-0676-04	116	FALSE	TRUE	28.355	20.58	32.995	0.12009	0.14826	0.00741	1.30068	2.31813	0.00518	0.09798	0.2087	2e-05	1	1.78225	0.00399
TCGA-02-0089-01A-01R-0676-04	89	FALSE	TRUE	29.49	23.45	34.86	0.0252	0.02965	0.02965	0.64948	0.40414	0.00179	0.00996	0.00733	3e-05	1	0.62224	0.00275
TCGA-02-0033-01A-01R-0676-04	33	FALSE	TRUE	29.128	28.47	NA	0.12306	0.14826	NA	0.81052	0.0191	NA	0.0595	0.00167	NA	1	0.02356	NA
TCGA-06-0397-01A-01R-0676-04	397	FALSE	TRUE	27.87	27.44	38.42	0.04448	0.02965	0	1.75004	0.03573	0.00023	0.04719	0.00064	0	1	0.02042	0.00013
TCGA-02-0107-01A-01R-0676-04	107	FALSE	TRUE	29.292	27.115	37.96	0.10378	0.20015	0.16309	0.73313	0.04368	3e-04	0.04557	0.0053	3e-05	1	0.05958	0.00041
TCGA-06-0129-01A-01R-0676-04	129	FALSE	TRUE	27.413	23.14	35.6	0.00297	0.04448	0.53374	2.31465	0.48804	0.0012	0.0042	0.0132	0.00036	1	0.21085	0.00052
TCGA-02-0009-01A-01R-0676-04	9	FALSE	TRUE	28.202	20.44	21.12	0.01186	0.11861	0.08896	1.42832	2.51943	4.57471	0.01039	0.18617	0.23647	1	1.76391	3.20286
TCGA-08-0521-01A-01R-0676-04	521	FALSE	TRUE	28.57	29.56	NA	0.18384	0.19274	NA	1.14035	0.00985	NA	0.12353	0.0012	NA	1	0.00863	NA
TCGA-06-0133-01A-02R-0676-04	133	FALSE	TRUE	27.935	19.295	24.2	0.01779	0.20015	0.14826	1.6818	5.07101	0.78767	0.01824	0.6157	0.06864	1	3.01522	0.46835
TCGA-06-0157-01A-01R-0676-04	157	FALSE	TRUE	28.622	21.375	35.32	0.07858	0.11119	0.20756	1.10464	1.42847	0.00138	0.05226	0.0965	0.00016	1	1.29316	0.00125
TCGA-02-0007-01A-01R-0676-04	7	FALSE	TRUE	29.79	25.63	36.24	0.1275	0.10378	0.28169	0.54057	0.10738	0.00081	0.04108	0.00692	0.00012	1	0.19864	0.0015
TCGA-08-0531-01A-01R-0676-04	531	FALSE	TRUE	28.602	20.01	23.74	0.02669	0.04448	0	1.11824	3.27221	1.02436	0.01816	0.0893	0	1	2.92622	0.91605
TCGA-06-0214-01A-02R-0676-04	214	FALSE	TRUE	29.45	23.205	25.66	0.07265	0.15567	0.26687	0.66558	0.47001	0.34212	0.03003	0.04442	0.05492	1	0.70617	0.51402
TCGA-06-0174-01A-01R-0676-04	174	FALSE	TRUE	28.957	26.87	36.74	0.04448	0.14826	0.22239	0.89991	0.05052	0.00061	0.02427	0.00442	7e-05	1	0.05614	0.00068
TCGA-02-0114-01A-01R-0676-04	114	FALSE	TRUE	29.105	25.38	36.205	0.00297	0.28169	0.00741	0.822	0.125	0.00083	0.00149	0.02269	0	1	0.15207	0.00101
TCGA-06-0164-01A-01R-0676-04	164	FALSE	TRUE	28.4375	27.215	33.83	0.03039	0.02224	0.11861	1.22124	0.04059	0.00307	0.046	0.00111	0.00044	1	0.03324	0.00252
TCGA-08-0510-01A-01R-0676-04	510	FALSE	TRUE	29.095	24.065	38.585	0.01631	0.52632	0.65976	0.82705	0.28456	0.00022	0.00823	0.08967	8e-05	1	0.34407	0.00027
TCGA-06-0143-01A-01R-0676-04	143	FALSE	TRUE	28.487	21.29	30.32	0.09785	0.01483	0.04448	1.19976	1.50267	0.02389	0.0733	0.01359	0.00061	1	1.25248	0.01991
TCGA-02-0054-01A-01R-0676-04	54	FALSE	TRUE	29.613	24.66	36.8	0.06375	0.16309	0.31135	0.6024	0.19409	0.00059	0.02319	0.01922	0.00011	1	0.3222	0.00098
TCGA-06-0412-01A-01R-0676-04	412	FALSE	TRUE	28.695	23.66	24.35	0.10082	0.42995	0.02965	1.05638	0.3557	0.723	0.06654	0.08525	0.01218	1	0.33671	0.68441
TCGA-08-0529-01A-02R-0676-04	529	FALSE	TRUE	29.484	22.75	23.81	0.0089	0	0.01483	0.65187	0.61853	0.98421	0.00354	0	0.00831	1	0.94885	1.50982
TCGA-06-0124-01A-01R-0676-04	124	FALSE	TRUE	28.619	24.48	37.655	0.05486	0.10378	0.39289	1.10667	0.21605	0.00037	0.03757	0.01393	8e-05	1	0.19523	0.00033
TCGA-02-0058-01A-01R-0676-04	58	FALSE	TRUE	30.178	26.355	37.64	0.1023	0.02224	0.07413	0.42633	0.0691	0.00037	0.02726	0.00093	2e-05	1	0.16209	0.00086
TCGA-02-0430-01A-01R-0676-04	430	FALSE	TRUE	29.344	20.75	27.93	0.0593	0.0593	0.04448	0.71017	2.08665	0.09356	0.02609	0.07433	0.0024	1	2.93822	0.13174
TCGA-02-0439-01A-01R-0676-04	439	FALSE	TRUE	28.859	23.58	36.48	0.10971	0.02965	0.26687	0.95553	0.37342	0.00071	0.06271	0.00677	0.00011	1	0.39081	0.00074
TCGA-06-0219-01A-01R-0676-04	219	FALSE	TRUE	29.733	25.62	26.98	0.01779	0.08896	0.0593	0.55975	0.10803	0.16097	0.00607	0.00574	0.00552	1	0.193	0.28757
TCGA-02-0021-01A-01R-0676-04	21	FALSE	TRUE	29.371	21.35	33.01	0.20163	0.01483	0.02965	0.69854	1.44887	0.00514	0.08269	0.01306	9e-05	1	2.07415	0.00736
TCGA-08-0509-01A-01R-0676-04	509	FALSE	TRUE	28.729	26.47	36.11	0.05189	0.10378	0.26687	1.03463	0.06443	0.00087	0.0332	0.00398	0.00013	1	0.06228	0.00085
TCGA-08-0512-01A-01R-0676-04	512	FALSE	TRUE	29.275	27.07	39.545	0.03558	0.13343	0.2298	0.7408	0.04474	0.00012	0.01601	0.00373	2e-05	1	0.06039	0.00017
TCGA-06-0156-01A-01R-0676-04	156	FALSE	TRUE	28.624	25	27.15	0.043	0.0593	0.10378	1.10329	0.15749	0.14607	0.02928	0.00575	0.00883	1	0.14275	0.1324
TCGA-02-0071-01A-01R-0676-04	71	FALSE	TRUE	28.517	21.52	33.4	0.09044	0.11861	0	1.17794	1.30658	0.00411	0.06641	0.09655	0	1	1.10921	0.00349
TCGA-02-0451-01A-01R-0676-04	451	FALSE	TRUE	29.438	22.78	27.61	0.00148	0.65234	0.01483	0.67048	0.60735	0.11232	0.00061	0.27618	0.00095	1	0.90584	0.16753
TCGA-02-0027-01A-01R-0676-04	27	FALSE	TRUE	29.466	29.48	NA	0.13492	0.04448	NA	0.65909	0.01034	NA	0.05595	0.00028	NA	1	0.01568	NA
TCGA-08-0524-01A-01R-0676-04	524	FALSE	TRUE	27.736	28.12	39.84	0.00593	0	0	1.89957	0.02363	1e-04	0.00688	0	0	1	0.01244	5e-05
TCGA-06-0125-01A-01R-0676-04	125	FALSE	TRUE	28.082	20.725	25.85	0.19719	0.00741	0.13343	1.53714	2.11861	0.30694	0.17811	0.00955	0.0228	1	1.37828	0.19968
TCGA-02-0052-01A-01R-0676-04	52	FALSE	TRUE	29.369	31.15	NA	0.06523	0.57821	NA	0.69939	0.00374	NA	0.02754	0.00117	NA	1	0.00535	NA
TCGA-02-0046-01A-01R-0676-04	46	FALSE	TRUE	29.154	23.42	34.14	0.07413	0.48926	0.17791	0.79772	0.41158	0.0027	0.03563	0.11093	0.00028	1	0.51594	0.00338
TCGA-08-0511-01A-01R-0676-04	511	FALSE	TRUE	28.646	21.34	28.96	0.0934	0.08896	0.02965	1.08854	1.45768	0.05195	0.06103	0.08029	0.00088	1	1.33912	0.04773
TCGA-06-0147-01A-01R-0676-04	147	FALSE	TRUE	28.961	28.72	38.555	0.01779	0.02965	0.08154	0.89771	0.01641	0.00022	0.00974	3e-04	1e-05	1	0.01828	0.00024
TCGA-02-0057-01A-01R-0676-04	57	FALSE	TRUE	29.433	25.495	37.51	0.01038	0.1705	0.11861	0.67253	0.11685	0.00039	0.00428	0.01209	3e-05	1	0.17374	0.00059
TCGA-02-0006-01B-01R-0676-04	6	FALSE	TRUE	29.44	26.105	37.3	0.04003	0.18532	0.37065	0.66966	0.08068	0.00044	0.01627	0.00907	1e-04	1	0.12047	0.00066
TCGA-06-0410-01A-01R-0676-04	410	FALSE	TRUE	28.817	30.7	NA	0.043	0.02965	NA	0.9804	0.00492	NA	0.02602	9e-05	NA	1	0.00502	NA
TCGA-06-0138-01A-02R-0676-04	138	FALSE	TRUE	29.324	23.895	25.26	0.01334	0.12602	0.02965	0.71892	0.30875	0.42994	0.00589	0.02364	0.00732	1	0.42947	0.59803
TCGA-02-0099-01A-01R-0676-04	99	FALSE	TRUE	27.929	26.37	39.12	0.02965	0.13343	1.20091	1.68799	0.06858	0.00017	0.03081	0.00556	0.00011	1	0.04063	1e-04
TCGA-02-0115-01A-01R-0676-04	115	FALSE	TRUE	29.399	NA	38.35	0.01334	NA	0.77095	0.68667	NA	0.00024	0.00559	NA	9e-05	1	NA	0.00035
TCGA-08-0516-01A-01R-0676-04	516	FALSE	TRUE	27.764	26.03	38.02	0.0089	0.10378	0.01483	1.8673	0.08427	0.00029	0.01018	0.00531	0	1	0.04513	0.00016
TCGA-08-0525-01A-01R-0676-04	525	FALSE	TRUE	29.071	21.12	36.555	0.03113	0.01483	0.08154	0.83928	1.66633	0.00068	0.01589	0.01502	3e-05	1	1.98542	0.00081
TCGA-06-0130-01A-01R-0676-04	130	FALSE	TRUE	29.54	28.23	NA	0.05486	0.17791	NA	0.62991	0.0221	NA	0.02138	0.00248	NA	1	0.03508	NA
TCGA-02-0055-01A-01R-0676-04	55	FALSE	TRUE	29.769	29.995	NA	0.17198	0.25946	NA	0.54756	0.0076	NA	0.05562	0.00119	NA	1	0.01388	NA
TCGA-02-0456-01A-01R-0676-04	456	FALSE	TRUE	28.49	26.075	38.33	0.0934	0.08154	0.0593	1.19756	0.08197	0.00025	0.06714	0.00406	1e-05	1	0.06845	0.00021
TCGA-06-0126-01A-01R-0676-04	126	FALSE	TRUE	28.373	20.82	22.23	0.07413	0.14826	0.01483	1.28643	2.0034	2.42672	0.05925	0.18036	0.02061	1	1.55733	1.8864
TCGA-06-0128-01A-01R-0676-04	128	FALSE	TRUE	29.691	27.95	NA	0.09785	0.02965	NA	0.57432	0.0262	NA	0.0337	0.00048	NA	1	0.04562	NA
TCGA-02-0003-01A-01R-0676-04	3	FALSE	TRUE	29.72	22.195	31.77	0.01483	0.06672	0.17791	0.56422	0.8671	0.01044	0.00513	0.03516	0.0011	1	1.5368	0.0185
TCGA-02-0106-01A-01R-0676-04	106	FALSE	TRUE	29.581	22.64	23.83	0.09933	0.07413	0.13343	0.61431	0.66131	0.97303	0.03658	0.03026	0.07228	1	1.07651	1.58394
TCGA-06-0158-01A-01R-0676-04	158	FALSE	TRUE	28.77	21.22	24.22	0.11713	0.07413	0.07413	1.009	1.56801	0.77872	0.07059	0.07176	0.03251	1	1.55402	0.77178
TCGA-06-0211-01A-01R-0676-04	211	FALSE	TRUE	29.54	23.54	24.6	0.08747	0.02965	0.08896	0.62991	0.38262	0.62679	0.03311	0.00694	0.03131	1	0.60741	0.99504
TCGA-02-0083-01A-01R-0676-04	83	FALSE	TRUE	29.282	23.52	24.4	0.01483	0.02965	0.10378	0.73763	0.38733	0.70264	0.00671	0.00698	0.04249	1	0.5251	0.95256
TCGA-02-0330-01A-01R-0676-04	330	FALSE	TRUE	29.217	24.08	37.01	0.1275	0.10378	0.25204	0.76756	0.27554	0.00052	0.06148	0.01776	8e-05	1	0.35898	0.00068
TCGA-06-0184-01A-01R-0676-04	184	FALSE	TRUE	30.377	26.1	37.01	0.0771	0.65234	0.42995	0.37746	0.08069	0.00052	0.01752	0.03504	0.00014	1	0.21377	0.00139
TCGA-08-0522-01A-01R-0676-04	522	FALSE	TRUE	28.953	29.18	39.91	0.07413	0.0593	0	0.90212	0.0124	1e-04	0.0403	0.00044	0	1	0.01375	0.00011
TCGA-02-0113-01A-01R-0676-04	113	FALSE	TRUE	30.028	27.54	38.85	0.07561	0.08896	0.38548	0.46731	0.03362	0.00018	0.02129	0.00185	4e-05	1	0.07194	4e-04
TCGA-02-0440-01A-01R-0676-04	440	FALSE	TRUE	28.742	28.63	NA	0.02076	0.01483	NA	1.02644	0.01733	NA	0.01298	0.00016	NA	1	0.01688	NA
TCGA-06-0175-01A-01R-0676-04	175	FALSE	TRUE	29.192	26.37	38.33	0.0252	0.14826	0.682	0.77939	0.06847	0.00025	0.01196	0.00636	8e-05	1	0.08785	0.00032
TCGA-08-0514-01A-01R-0676-04	514	FALSE	TRUE	28.952	22.24	34.65	0.04596	0.14826	0.02965	0.90267	0.84338	0.00201	0.02515	0.07838	3e-05	1	0.93431	0.00223
TCGA-06-0141-01A-01R-0676-04	141	FALSE	TRUE	29.714	26.86	38.67	0.13936	0.23722	0	0.5663	0.05083	2e-04	0.0497	0.0074	0	1	0.08976	0.00036
TCGA-02-0043-01A-01R-0676-04	43	FALSE	TRUE	28.269	20.945	31.25	0.20312	0.03706	0.14826	1.37095	1.85358	0.01405	0.16914	0.04177	0.00122	1	1.35204	0.01025
TCGA-06-0182-01A-01R-0676-04	182	FALSE	TRUE	29.441	23.18	25.39	0.1023	0.31135	0.14826	0.66925	0.48012	0.39917	0.04279	0.09039	0.03286	1	0.7174	0.59644
TCGA-06-0402-01A-01R-0676-04	402	FALSE	TRUE	28.723	21.21	32.94	0.07858	0.23722	0.07413	1.03844	1.57757	0.00535	0.04913	0.23896	0.00023	1	1.51917	0.00515
TCGA-06-0190-01A-01R-0676-04	190	FALSE	TRUE	28.74	27.39	37.81	0.02076	0.02965	0.26687	1.02769	0.03683	0.00033	0.01311	0.00066	5e-05	1	0.03584	0.00032
TCGA-02-0060-01A-01R-0676-04	60	FALSE	TRUE	29.869	28.52	39.07	0.05041	0.0593	0.48926	0.51506	0.01853	0.00016	0.01605	0.00068	5e-05	1	0.03597	0.00032
TCGA-02-0269-01B-01R-0676-04	269	FALSE	TRUE	28.534	20.065	31.55	0.04893	0.20015	0.04448	1.16575	3.17527	0.01183	0.03525	0.38553	3e-04	1	2.72381	0.01015
TCGA-02-0281-01A-01R-0676-04	281	FALSE	TRUE	28.346	27.515	NA	0.06672	0.09637	NA	1.30786	0.03416	NA	0.05266	0.002	NA	1	0.02612	NA
TCGA-06-0210-01A-01R-0676-04	210	FALSE	TRUE	29.21	27.2	37.16	0.02817	0.02965	0.14826	0.77085	0.04134	0.00048	0.01321	0.00075	4e-05	1	0.05363	0.00062
TCGA-02-0086-01A-01R-0676-04	86	FALSE	TRUE	30.228	28.67	39.525	0.00593	0.44478	0.12602	0.41349	0.01691	0.00012	0.0015	0.00502	1e-05	1	0.0409	3e-04
TCGA-06-0394-01A-01R-0676-04	394	FALSE	TRUE	29.248	28.375	NA	0.01334	0.11119	NA	0.75314	0.02026	NA	0.00613	0.00137	NA	1	0.0269	NA
TCGA-06-0409-01A-02R-0676-04	409	FALSE	TRUE	29.185	21.65	35.535	0.02372	0.31135	0.28911	0.78274	1.21714	0.00122	0.01131	0.22915	2e-04	1	1.55498	0.00156
TCGA-08-0518-01A-01R-0676-04	518	FALSE	TRUE	28.66	22.32	22.75	0.04893	0.54856	0.32617	1.07925	0.80334	1.80314	0.03264	0.30046	0.35794	1	0.74435	1.67073
TCGA-02-0074-01A-01R-0676-04	74	FALSE	TRUE	28.78	26.83	37.96	0.02224	0.02965	0	1.00285	0.05177	3e-04	0.01358	0.00093	0	1	0.05162	3e-04
TCGA-02-0325-01A-01R-0677-04	325	FALSE	TRUE	28.538	25.44	38.17	0.09933	0.02965	0	1.1629	0.12053	0.00027	0.07215	0.00217	0	1	0.10365	0.00023
TCGA-12-0772-01A-01R-0677-04	772	FALSE	TRUE	28.8	26.61	39.41	0.05041	0.04448	0.07413	0.99065	0.05918	0.00013	0.03024	0.00161	1e-05	1	0.05974	0.00013
TCGA-02-0104-01A-01R-0677-04	104	FALSE	TRUE	28.047	28.53	39.26	0.1616	0.01483	0	1.57041	0.01842	0.00014	0.15022	0.00017	0	1	0.01173	9e-05
TCGA-02-0446-01A-01R-0677-04	446	FALSE	TRUE	28.348	27.81	39.71	0.20015	0.02965	0	1.30626	0.02853	0.00011	0.15354	0.00051	0	1	0.02184	9e-05
TCGA-06-0413-01A-01R-0677-04	413	FALSE	TRUE	27.8	29.53	NA	0.10378	0.13343	NA	1.75004	0.00949	0	0.23205	0.00163	0	1	0.00542	0
TCGA-06-0216-01B-01R-0677-04	216	FALSE	TRUE	29.259	21.15	32.11	0.04893	0.02965	0.19274	0.74809	1.63618	0.00859	0.02262	0.02968	0.00091	1	2.18716	0.01149
TCGA-08-0352-01A-01R-0677-04	352	FALSE	TRUE	28.431	20.98	33.66	0.00741	0.01483	0.22239	1.24158	1.81434	0.00355	0.00562	0.0164	0.00047	1	1.46132	0.00286
TCGA-06-0177-01A-01R-0677-04	177	FALSE	TRUE	28.301	29.36	39.92	0.02076	0.16309	0	1.34437	0.01112	1e-04	0.01715	0.00114	0	1	0.00827	7e-05
TCGA-02-0070-01A-01R-0677-04	70	FALSE	TRUE	28.291	24.76	37.25	0.03558	0.0593	0.19274	1.35262	0.18223	0.00046	0.02923	0.00665	5e-05	1	0.13473	0.00034
TCGA-06-0879-01A-01R-0677-04	879	FALSE	TRUE	28.955	25.39	37.79	0.15271	0.13343	0	0.90102	0.12425	0.00034	0.0869	0.00981	0	1	0.1379	0.00037
TCGA-06-0645-01A-01R-0677-04	645	FALSE	TRUE	28.789	22.71	26.32	0.01631	0.23722	0.04448	0.99734	0.63376	0.23467	0.00999	0.096	0.00601	1	0.63545	0.2353
TCGA-08-0246-01A-01R-0677-04	246	FALSE	TRUE	29.464	21.24	30.8	0.04448	0.20756	0.04448	0.6599	1.54906	0.01816	0.01779	0.20404	0.00047	1	2.34742	0.02752
TCGA-08-0392-01A-01R-0677-04	392	FALSE	TRUE	29.999	28.96	NA	0.00741	0.01483	NA	0.47568	0.01418	NA	0.00216	0.00013	NA	1	0.02981	NA
TCGA-14-0789-01A-01R-0677-04	789	FALSE	TRUE	28.805	23.69	26.22	0.03113	0.07413	0.14826	0.98762	0.34927	0.24847	0.01894	0.01598	0.02045	1	0.35364	0.25158
TCGA-06-0750-01A-01R-0677-04	750	FALSE	TRUE	29.241	21.85	27.81	0.03558	0.13343	0.16309	0.75637	1.06905	0.1002	0.01635	0.08914	0.00963	1	1.4134	0.13247
TCGA-08-0390-01A-01R-0677-04	390	FALSE	TRUE	28.45	26.78	38.92	0.18681	0.10378	0.41513	1.22723	0.05337	0.00018	0.135	0.0033	5e-05	1	0.04348	0.00014
TCGA-02-0023-01B-01R-0677-04	23	FALSE	TRUE	29.6195	22.07	34.85	0.11194	0.01483	0.10378	0.57292	0.92954	0.00169	0.08222	0.01686	0.00016	1	1.62247	0.00295
TCGA-08-0517-01A-01R-0677-04	517	FALSE	TRUE	28.958	27.74	38.97	0.04151	0.07413	0	0.89936	0.02977	0.00017	0.02265	0.00136	0	1	0.0331	0.00019
TCGA-12-0662-01A-01R-0677-04	662	FALSE	TRUE	28.76	23.2	32.13	0.11861	0.02965	0.11861	1.01519	0.47051	0.0085	0.07551	0.00848	0.00059	1	0.46347	0.00837
TCGA-08-0344-01A-01R-0677-04	344	FALSE	TRUE	28.318	23.61	33.8	0.07116	0.51891	0.04448	1.33046	0.36668	0.00327	0.05709	0.12891	8e-05	1	0.2756	0.00246
TCGA-06-0127-01A-01R-0677-04	127	FALSE	TRUE	28.963	21.98	26.42	0.00445	0.0593	0.02965	0.89662	0.9881	0.22164	0.00244	0.03562	0.00373	1	1.10204	0.2472
TCGA-08-0520-01A-01R-0677-04	520	FALSE	TRUE	29.159	26.06	38.035	0.10378	0.08896	0.15567	0.79529	0.08267	0.00029	0.04943	0.00455	3e-05	1	0.10396	0.00037
TCGA-06-0744-01A-01R-0677-04	744	FALSE	TRUE	28.636	20.07	28.5	0.01186	0.01483	0.16309	1.09522	3.15505	0.06756	0.00797	0.02844	0.0061	1	2.88076	0.06169
TCGA-12-0619-01A-01R-0677-04	619	FALSE	TRUE	27.736	21.18	28.88	0.04003	0.07413	0.01483	1.89957	1.60735	0.05438	0.04691	0.07242	0.00046	1	0.84617	0.02863
TCGA-06-0238-01A-02R-0677-04	238	FALSE	TRUE	30.149	29.99	NA	0.11564	0.0593	NA	0.43396	0.00758	NA	0.02998	0.00027	NA	1	0.01747	NA
TCGA-08-0360-01A-01R-0677-04	360	FALSE	TRUE	27.936	24.77	28.42	0.04744	0.02965	0.01483	1.68077	0.18113	0.07072	0.04832	0.00329	6e-04	1	0.10777	0.04208
TCGA-14-0787-01A-01R-0677-04	787	FALSE	TRUE	27.778	21.355	22.55	0.03706	0.03707	0.13343	1.85137	1.44461	2.02134	0.04231	0.03255	0.15016	1	0.78029	1.09181
TCGA-08-0373-01A-01R-0677-04	373	FALSE	TRUE	27.943	26.605	37.64	0.06523	0.14085	0.22239	1.67359	0.05946	0.00037	0.06591	0.00509	5e-05	1	0.03553	0.00022
TCGA-12-0776-01A-01R-0677-04	776	FALSE	FALSE	28.8275	33.795	39.37	0.78207	0.60045	0.01483	0.70541	0.00059	0.00014	0.94854	0.00055	6e-05	NA	NA	NA
TCGA-02-0068-01A-01R-0677-04	68	FALSE	TRUE	28.37	20.14	32.46	0.14678	0.04448	0.10378	1.28879	3.02404	0.00704	0.11231	0.08177	0.00041	1	2.34641	0.00546
TCGA-12-0827-01A-01R-0677-04	827	TRUE	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA
TCGA-12-0691-01A-01R-0677-04	691	FALSE	TRUE	28.594	22.255	36.08	0.15567	0.06672	0.31135	1.12373	0.83604	0.00089	0.10367	0.0339	0.00017	1	0.74399	0.00079
TCGA-08-0350-01A-01R-0677-04	350	FALSE	TRUE	28.615	26.64	37.31	0.06523	0.23722	0.42995	1.10938	0.05811	0.00044	0.04369	0.0088	0.00012	1	0.05238	4e-04
TCGA-02-0260-01A-03R-0677-04	260	FALSE	TRUE	28.201	21.61	30.14	0.03262	0.11861	0.02965	1.42919	1.237	0.02648	0.02872	0.09141	0.00045	1	0.86552	0.01853
TCGA-06-0649-01B-01R-0677-04	649	FALSE	TRUE	29.19	25.915	38.78	0.1364	0.02224	0.78578	0.78034	0.0903	0.00019	0.06333	0.00122	7e-05	1	0.11572	0.00024
TCGA-12-0657-01A-01R-0677-04	657	FALSE	TRUE	28.41	22.21	34.55	0.20608	0.0593	0.16309	1.25763	0.8589	0.00213	0.16552	0.03135	0.00021	1	0.68295	0.0017
TCGA-08-0345-01A-01R-0677-04	345	FALSE	TRUE	28.949	27.28	39.07	0.05782	0.0593	0.50408	0.90433	0.03938	0.00016	0.03162	0.0014	4e-05	1	0.04354	0.00018
TCGA-02-0266-01A-01R-0677-04	266	FALSE	TRUE	29.616	28.25	NA	0.00297	0.01483	NA	0.60129	0.02183	NA	0.00109	2e-04	NA	1	0.03631	NA
TCGA-12-0654-01B-01R-0677-04	654	FALSE	TRUE	29.584	28.24	39.44	0.00593	0.16309	0	0.61318	0.02197	0.00013	0.00222	0.00225	0	1	0.03582	0.00021
TCGA-12-0828-01A-01R-0677-04	828	FALSE	TRUE	29.213	24.01	25.3	0.1023	0.19274	0.0593	0.76944	0.28752	0.42022	0.04716	0.03506	0.0144	1	0.37367	0.54614
TCGA-06-0648-01A-01R-0677-04	648	FALSE	TRUE	28.198	26.99	39.77	0.20163	0.01483	0.16309	1.43182	0.04697	0.00011	0.17903	0.00042	1e-05	1	0.0328	8e-05
TCGA-08-0357-01A-01R-0677-04	357	FALSE	TRUE	28.341	21.6	22.43	0.04448	0.04448	0.10378	1.31187	1.24475	2.16475	0.03603	0.03366	0.12579	1	0.94884	1.65013
TCGA-16-0850-01A-01R-0677-04	850	FALSE	TRUE	27.686	27.09	39.65	0.05189	0.10378	0	1.95858	0.0442	0.00012	0.06286	0.00285	0	1	0.02257	6e-05
TCGA-12-0819-01A-01R-0677-04	819	FALSE	TRUE	29.607	19.89	29.23	0.00741	0	0.17791	0.60461	3.51987	0.04453	0.00274	0	0.00468	1	5.82169	0.07364
TCGA-12-0692-01A-01R-0677-04	692	FALSE	TRUE	28.134	24.35	37.515	0.13492	0.16309	0.1705	1.489	0.23382	0.00039	0.1264	0.02398	4e-05	1	0.15703	0.00026
TCGA-08-0353-01A-01R-0677-04	353	FALSE	TRUE	28.657	20.35	28.7	0.07413	0.19274	0.01483	1.08123	2.66113	0.06027	0.0483	0.32449	0.00051	1	2.4612	0.05574
TCGA-12-0822-01A-01R-0677-04	822	FALSE	TRUE	30.477	28.87	NA	0.06375	0.11861	NA	0.35505	0.01499	NA	0.01403	0.00108	NA	1	0.04223	NA
TCGA-02-0339-01A-01R-0677-04	339	FALSE	TRUE	28.663	29.25	NA	0.02224	0.01483	NA	1.07727	0.01189	NA	0.01459	0.00011	NA	1	0.01103	NA
TCGA-12-0778-01A-01R-0677-04	778	FALSE	TRUE	28.432	22.01	23.87	0.10082	0.0593	0.0593	1.24082	0.96996	0.95105	0.07816	0.0354	0.03185	1	0.78171	0.76647
TCGA-02-0051-01A-01R-0677-04	51	FALSE	TRUE	28.988	27.79	38.8	0.03262	0.04448	0.01483	0.88301	0.02888	0.00019	0.0175	0.00079	0	1	0.0327	0.00021
TCGA-02-0326-01A-01R-0677-04	326	FALSE	TRUE	29.495	28.99	NA	0.01631	0.08896	NA	0.6475	0.01392	NA	0.00644	0.00077	NA	1	0.0215	NA
TCGA-06-0179-01A-02R-0677-04	179	FALSE	TRUE	29.283	25.97	26.9	0.0341	0.08896	0.0593	0.73718	0.08732	0.1685	0.01527	0.00481	0.00564	1	0.11846	0.22857
TCGA-12-0775-01A-01R-0677-04	775	FALSE	TRUE	28.489	26.49	37.5	0.0682	0.04448	0.682	1.19829	0.06366	0.00041	0.05071	0.00174	0.00016	1	0.05312	0.00034
TCGA-12-0620-01A-01R-0677-04	620	FALSE	TRUE	29.184	25.14	33.49	0.08006	0.02965	0.14826	0.78321	0.14464	0.00391	0.03901	0.00262	0.00034	1	0.18468	0.00499
TCGA-08-0389-01A-01R-0677-04	389	FALSE	TRUE	28.341	24.87	37.97	0.06375	0.23722	0.01483	1.31187	0.17045	3e-04	0.05185	0.02582	0	1	0.12993	0.00023
TCGA-08-0347-01A-01R-0677-04	347	FALSE	TRUE	29.02	28.06	38.885	0.07561	0	0.06672	0.86588	0.02451	0.00018	0.04069	0	1e-05	1	0.0283	0.00021
TCGA-16-0846-01A-01R-0677-04	846	FALSE	TRUE	28.613	26.53	39.02	0.00297	0.02965	0.0593	1.11074	0.06213	0.00017	0.00201	0.00113	1e-05	1	0.05593	0.00015
TCGA-12-0616-01A-01R-0677-04	616	FALSE	TRUE	29.246	25.98	34.7	0.05486	0.01483	0.11861	0.75406	0.0868	0.00196	0.02503	0.00078	0.00013	1	0.11511	0.0026
TCGA-08-0380-01A-01R-0677-04	380	FALSE	TRUE	29.982	27.12	38.7	0.01483	0.20756	0.59304	0.48065	0.0434	2e-04	0.00437	0.00572	6e-05	1	0.09029	0.00041
TCGA-08-0346-01A-01R-0677-04	346	FALSE	TRUE	30.278	30.02	39.49	0.04893	0.20756	0	0.40103	0.00744	0.00013	0.01188	0.00098	0	1	0.01856	0.00032
TCGA-12-0820-01A-01R-0677-04	820	FALSE	TRUE	27.821	25.615	38.07	0.01334	0.06672	0.28169	1.8033	0.1084	0.00029	0.01468	0.0044	4e-05	1	0.06011	0.00016
TCGA-06-0686-01A-01R-0677-04	686	FALSE	TRUE	28.35	27.69	NA	0.00741	0.02965	NA	1.30466	0.03069	NA	0.00593	0.00056	NA	1	0.02352	NA
TCGA-02-0025-01A-01R-0677-04	25	FALSE	TRUE	28.695	28.41	38.89	0.13936	0	0	1.05638	0.01981	0.00018	0.08754	0	0	1	0.01875	0.00017
TCGA-06-0194-01A-01R-0677-04	194	FALSE	TRUE	29.212	26.73	NA	0.22239	0.17791	NA	0.76991	0.05516	NA	0.1001	0.00596	NA	1	0.07164	NA
TCGA-06-0749-01A-01R-0677-04	749	FALSE	TRUE	29.144	25.86	38.71	0.12602	0	0	0.80262	0.09336	2e-04	0.06353	0	0	1	0.11632	0.00025
TCGA-12-0618-01A-01R-0677-04	618	FALSE	TRUE	28.488	24.6	37.9	0.00445	0.02965	0.97852	1.19902	0.20085	0.00031	0.00327	0.0036	0.00021	1	0.16751	0.00026
TCGA-08-0349-01A-01R-0677-04	349	FALSE	TRUE	28.231	22.105	33.63	0.1275	0.02224	0.01483	1.4032	0.91556	0.00361	0.10664	0.01238	3e-05	1	0.65248	0.00257
TCGA-02-0016-01A-01R-0677-04	16	FALSE	TRUE	27.548	20.45	33.88	0.07858	0.02965	0.0593	2.13114	2.50416	0.00313	0.10082	0.04542	1e-04	1	1.17503	0.00147
TCGA-06-0878-01A-01R-0677-04	878	FALSE	TRUE	28.277	21.445	26.15	0.01483	0.08154	0	1.36426	1.3683	0.2586	0.01234	0.06781	0	1	1.00296	0.18956
TCGA-06-0644-01A-02R-0677-04	644	FALSE	TRUE	29.487	28.24	NA	0.07116	0.02965	NA	0.65068	0.02197	NA	0.02792	4e-04	NA	1	0.03376	NA
TCGA-06-0747-01A-01R-0677-04	747	FALSE	TRUE	27.963	21.27	33.34	0.06672	0.19274	0.04448	1.65324	1.52106	0.00426	0.06657	0.18547	0.00011	1	0.92005	0.00257
TCGA-08-0348-01A-01R-0677-04	348	FALSE	TRUE	27.92	27.3	38.69	0.07265	0.0593	0.35582	1.69731	0.0389	2e-04	0.07433	0.00142	4e-05	1	0.02292	0.00012
TCGA-12-0821-01A-01R-0677-04	821	FALSE	TRUE	28.248	25.3	33.48	0.08896	0.23722	0.02965	1.38868	0.13123	0.00393	0.07421	0.01988	7e-05	1	0.0945	0.00283
TCGA-12-0769-01A-01R-0677-04	769	FALSE	TRUE	29.058	21.78	35.9	0.02224	0.08896	0.01483	0.84598	1.11553	0.00099	0.01146	0.06145	1e-05	1	1.31862	0.00117
TCGA-12-0653-01A-01R-0677-04	653	FALSE	TRUE	28.776	24.89	38.39	0.05041	0.07413	2.23873	1.0053	0.16846	0.00024	0.03133	0.00759	2e-04	1	0.16757	0.00024
TCGA-08-0354-01A-01R-0677-04	354	FALSE	TRUE	29.34	23.37	24.11	0.09785	0.10378	0.04448	0.71191	0.42428	0.82922	0.0435	0.02735	0.02125	1	0.59597	1.16478
TCGA-16-0849-01A-01R-0677-04	849	FALSE	TRUE	28.067	24.38	38.23	0.01631	0.0593	0.44478	1.55131	0.2296	0.00026	0.01543	0.00838	7e-05	1	0.148	0.00017
TCGA-12-0773-01A-01R-0677-04	773	FALSE	TRUE	29.973	27.77	39.28	0.043	0.0593	0	0.4833	0.02923	0.00014	0.01283	0.00107	0	1	0.06048	3e-04
TCGA-06-0743-01A-01R-0677-04	743	FALSE	TRUE	28.263	20.63	34.22	0.05337	0.04448	0.28169	1.37599	2.24457	0.00258	0.04444	0.06125	0.00039	1	1.63124	0.00187
TCGA-08-0386-01A-01R-0677-04	386	FALSE	TRUE	27.788	23.19	36.165	0.04151	0.0593	0.02224	1.84008	0.47335	0.00085	0.04634	0.01728	1e-05	1	0.25724	0.00046
TCGA-02-0337-01A-01R-0677-04	337	FALSE	TRUE	29.218	28.88	NA	0.06227	0	NA	0.76709	0.01489	NA	0.0296	0	NA	1	0.01941	NA
TCGA-06-0745-01A-01R-0677-04	745	FALSE	TRUE	28.98	23.71	24.67	0.04151	0	0.07413	0.88734	0.34505	0.60222	0.02235	0	0.02587	1	0.38886	0.67869
TCGA-14-0871-01A-01R-0677-04	871	FALSE	TRUE	27.913	24.97	38.77	0.01186	0.04448	0.44478	1.70459	0.16039	0.00019	0.01234	0.00438	4e-05	1	0.09409	0.00011
TCGA-06-0646-01A-01R-0677-04	646	FALSE	TRUE	28.427	24.08	25.53	0.11861	0.04448	0.04448	1.24462	0.27554	0.36849	0.09257	0.00752	0.00928	1	0.22138	0.29607
TCGA-02-0048-01A-01R-0677-04	48	FALSE	TRUE	28.267	19.785	31.58	0.09785	0.03706	0.02965	1.37263	3.75234	0.01163	0.08386	0.08455	2e-04	1	2.73368	0.00847
TCGA-06-0882-01A-01R-0677-04	882	FALSE	TRUE	29.082	26.79	38.78	0.00445	0.04448	0.16309	0.83365	0.05304	0.00019	0.00227	0.00142	2e-05	1	0.06363	0.00023
TCGA-14-0867-01A-01R-0677-04	867	FALSE	TRUE	28.647	29.945	NA	0.0682	0.02224	NA	1.08787	0.00779	NA	0.04476	0.00011	NA	1	0.00716	NA
TCGA-12-0780-01A-01R-0677-04	780	FALSE	TRUE	29.131	25.4	NA	0.02965	0.02965	NA	0.80903	0.12349	NA	0.01477	0.00221	NA	1	0.15264	NA
TCGA-02-0026-01B-01R-0677-04	26	FALSE	TRUE	27.302	25.14	37.78	0.09637	0.02965	0.47443	2.47731	0.14465	0.00034	0.14321	0.00261	8e-05	1	0.05839	0.00014
TCGA-12-0826-01A-01R-0677-04	826	FALSE	TRUE	28.988	25.28	36.69	0.02965	0.01483	0.35582	0.88301	0.13284	0.00063	0.01612	0.0012	0.00014	1	0.15044	0.00071
TCGA-14-0817-01A-01R-0677-04	817	FALSE	FALSE	29.2285	23.97	36.54	0.39511	0	0.20756	0.6475	0.1473	0.00068	0.37015	0.21838	0.00022	NA	NA	NA
TCGA-15-0742-01A-01R-0677-04	742	FALSE	TRUE	28.502	20.64	34.79	0.01483	0.25204	0.16309	1.1888	2.23097	0.00186	0.01075	0.36016	0.00018	1	1.87666	0.00156
TCGA-08-0356-01A-01R-0677-04	356	FALSE	TRUE	28.823	20.63	32.4	0.06968	0.01483	0.02965	0.97681	2.24462	0.00728	0.04105	0.02023	0.00012	1	2.29791	0.00746
TCGA-06-0875-01A-01R-0678-04	875	FALSE	TRUE	28.234	29.09	38.47	0.10675	0.0593	0	1.40063	0.01311	0.00023	0.0895	0.00047	0	1	0.00936	0.00016
TCGA-14-1037-01A-01R-0678-04	1037	FALSE	TRUE	29.712	23.53	27.38	0.00593	0.10378	0.07413	0.56699	0.38495	0.12809	0.00206	0.02481	0.00535	1	0.67894	0.22591
TCGA-19-0955-01A-02R-0678-04	955	FALSE	TRUE	28.725	24.28	37.53	0.14381	0.04448	0.02965	1.03717	0.24399	0.00039	0.09403	0.00666	1e-05	1	0.23525	0.00037
TCGA-14-0813-01A-01R-0678-04	813	FALSE	TRUE	27.972	24.2	37.71	0.0341	0.01483	0.93404	1.64416	0.25616	0.00035	0.03406	0.00231	0.00016	1	0.1558	0.00021
TCGA-14-1396-01A-01R-0678-04	1396	FALSE	TRUE	28.21	26.77	39.3	0.08896	0.10378	0	1.42135	0.05369	0.00014	0.0788	0.00346	0	1	0.03777	1e-04
TCGA-27-1830-01A-01R-0678-04	1830	FALSE	TRUE	27.775	26.26	38.35	0.12454	0.0593	0.32617	1.85478	0.07321	0.00025	0.14503	0.00261	5e-05	1	0.03947	0.00013
TCGA-14-1459-01A-01R-0678-04	1459	FALSE	TRUE	28.874	22.75	33.17	0.09785	0.0593	0.01483	0.9468	0.61853	0.00469	0.05785	0.02258	4e-05	1	0.65329	0.00495
TCGA-16-1060-01A-01R-0678-04	1060	FALSE	TRUE	29.268	22.1	31.05	0.20312	0.26687	0.04448	0.74398	0.91831	0.01575	0.09645	0.15746	4e-04	1	1.23432	0.02116
TCGA-14-0786-01B-01R-0678-04	786	FALSE	TRUE	28.474	20.83	28.56	0.03113	0.07413	0.01483	1.20934	1.98758	0.06528	0.02319	0.08823	0.00055	1	1.64353	0.05398
TCGA-12-1599-01A-01R-0678-04	1599	FALSE	TRUE	29.056	25.73	38.565	0.04003	0.04448	1.29727	0.84702	0.10104	0.00024	0.02058	0.00271	0.00017	1	0.11929	0.00029
TCGA-06-1801-01A-02R-0678-04	1801	FALSE	TRUE	28.208	26.37	38.06	0.12306	0.04448	0.51891	1.42309	0.06847	0.00029	0.10992	0.00187	9e-05	1	0.04812	2e-04
TCGA-12-1099-01A-01R-0678-04	1099	FALSE	TRUE	28.805	25.63	39.16	0.10378	0.17791	0.45961	0.98762	0.10738	0.00015	0.06408	0.01205	4e-05	1	0.10872	0.00016
TCGA-14-1034-01A-01R-0678-04	1034	FALSE	TRUE	28.863	25.16	38.95	0.05041	0.11861	0.14826	0.95319	0.14289	0.00017	0.0291	0.01006	1e-05	1	0.14991	0.00018
TCGA-07-0249-20A-01R-0678-04	249	FALSE	TRUE	28.121	26.38	38.33	0.0682	0.01483	0.37065	1.50089	0.06806	0.00025	0.06352	0.00061	6e-05	1	0.04535	0.00016
TCGA-28-1751-01A-02R-0678-04	1751	FALSE	TRUE	28.367	27.93	39.005	0.07413	0.01483	0.33358	1.29116	0.02652	0.00017	0.05947	0.00024	3e-05	1	0.02054	0.00013
TCGA-15-1446-01A-01R-0678-04	1446	FALSE	TRUE	28.439	22.7	28.11	0.02817	0.17791	0.13343	1.23552	0.63762	0.08442	0.02142	0.07155	0.00627	1	0.51608	0.06833
TCGA-16-1045-01B-01R-0678-04	1045	FALSE	TRUE	29.325	22.15	33.84	0.11416	0.01483	0.10378	0.71848	0.89081	0.0032	0.05139	0.00805	0.00019	1	1.23986	0.00445
TCGA-12-0818-01A-01R-0678-04	818	FALSE	TRUE	28.096	24.66	36.66	0.0682	0.11861	0.37065	1.52403	0.19366	0.00064	0.06271	0.01431	0.00015	1	0.12707	0.00042
TCGA-19-1388-01A-01R-0678-04	1388	FALSE	TRUE	27.144	18.99	32.12	0.11416	0.10378	0.08896	2.72876	6.08368	0.00855	0.19517	0.39215	0.00043	1	2.22947	0.00313
TCGA-12-1094-01A-01R-0678-04	1094	FALSE	TRUE	28.102	21.53	22.22	0.1275	0.35582	0	1.51844	1.29866	2.44062	0.12163	0.30248	0	1	0.85526	1.60731
TCGA-16-1047-01B-01R-0678-04	1047	FALSE	TRUE	27.525	19.93	34.06	0.0593	0	0.11861	2.16134	3.4353	0.00282	0.07939	0	2e-04	1	1.58943	0.00131
TCGA-06-0155-01B-01R-0678-04	155	FALSE	TRUE	28.443	23.4	36.79	0.05337	0.02965	0.14826	1.2325	0.41661	0.00059	0.03981	0.00747	5e-05	1	0.33802	0.00048
TCGA-14-0865-01B-01R-0678-04	865	FALSE	TRUE	28.372	29.68	38.84	0.22387	0.0593	0	1.28722	0.00915	0.00018	0.18472	0.00033	0	1	0.00711	0.00014
TCGA-19-0963-01B-01R-0678-04	963	FALSE	TRUE	28.23	25.64	37.715	0.05634	0.13343	0.89697	1.40406	0.10673	0.00037	0.04897	0.00843	0.00018	1	0.07601	0.00026
TCGA-28-1749-01A-01R-0678-04	1749	FALSE	TRUE	28.476	20.24	23.85	0.18829	0.0593	0.0593	1.20786	2.84519	0.96198	0.13389	0.10384	0.03222	1	2.35557	0.79643
TCGA-26-1440-01A-01R-0678-04	1440	FALSE	TRUE	28.163	21.71	35.54	0	0.01483	0.22239	1.46281	1.16404	0.00122	0	0.01046	0.00015	1	0.79575	0.00083
TCGA-14-0812-01B-01R-0678-04	812	FALSE	TRUE	29.215	25.41	38	0.03558	0.04448	0.02965	0.7685	0.12274	3e-04	0.01685	0.00329	1e-05	1	0.15972	0.00039
TCGA-19-1389-01A-01R-0678-04	1389	FALSE	TRUE	28.303	25.96	37.915	0.02224	0.20756	0.77836	1.34273	0.08786	0.00033	0.01819	0.01157	0.00014	1	0.06543	0.00024
TCGA-28-1752-01A-01R-0678-04	1752	FALSE	TRUE	29.266	23.875	38.03	0.01779	0.05189	0.54856	0.74489	0.31218	0.00029	0.00808	0.00985	8e-05	1	0.4191	0.00039
TCGA-06-1086-01A-02R-0678-04	1086	FALSE	TRUE	28.019	24.99	38.6	0.00297	0.01483	0.14826	1.59755	0.15846	0.00021	0.0029	0.00143	2e-05	1	0.09919	0.00013
TCGA-19-0957-01C-01R-0678-04	957	FALSE	TRUE	27.982	26.085	38.34	0.10823	0.02224	0.69682	1.63413	0.08143	0.00024	0.11067	0.0011	0.00011	1	0.04983	0.00015
TCGA-28-1755-01A-01R-0678-04	1755	FALSE	TRUE	28.256	24.2	25.38	0.04744	0.08896	0	1.3819	0.25632	0.40145	0.04051	0.01386	0	1	0.18548	0.29051
TCGA-14-0783-01B-01R-0678-04	783	FALSE	TRUE	28.974	24.295	27.08	0.02817	0.05189	0.02965	0.8906	0.24183	0.15203	0.01544	0.00763	0.00256	1	0.27154	0.17071
TCGA-12-1095-01A-01R-0678-04	1095	FALSE	TRUE	28.7	28.065	39.5	0.18681	0.12602	0.50408	1.05316	0.02446	0.00013	0.11585	0.00187	3e-05	1	0.02323	0.00012
TCGA-19-1387-01A-01R-0678-04	1387	FALSE	TRUE	28.537	25.385	38.8	0.09933	0.1112	0.14826	1.16361	0.12475	0.00019	0.06929	0.00843	2e-05	1	0.10721	0.00016
TCGA-19-1788-01A-01R-0678-04	1788	FALSE	TRUE	28.059	24.665	36.84	0.09044	0.02224	0.54856	1.55892	0.19308	0.00058	0.08789	0.00261	0.00016	1	0.12385	0.00037
TCGA-19-0960-01A-02R-0678-04	960	FALSE	TRUE	27.993	29.34	NA	0.01779	0.07413	NA	1.62317	0.01125	NA	0.01773	0.00052	NA	1	0.00693	NA
TCGA-16-1062-01A-01R-0678-04	1062	FALSE	TRUE	28.101	21.73	22.76	0.11416	0.02965	0.11861	1.51937	1.14997	1.79287	0.10367	0.02086	0.11873	1	0.75687	1.18001
TCGA-12-1601-01A-01R-0678-04	1601	FALSE	TRUE	30.062	23.93	35	0.08747	0.04448	0.22239	0.45769	0.30185	0.00165	0.02406	0.00824	0.00022	1	0.6595	0.0036
TCGA-14-0866-01B-01R-0678-04	866	FALSE	TRUE	29.27	21.925	26.82	0.18977	0.12602	0.20756	0.74307	1.02277	0.17637	0.08975	0.07829	0.02177	1	1.37641	0.23736
TCGA-19-1789-01A-01R-0678-04	1789	FALSE	TRUE	29.509	20.42	34.7	0.09489	0.01483	0.07413	0.64198	2.55025	0.00196	0.03801	0.02306	8e-05	1	3.9725	0.00305
TCGA-14-1452-01A-01R-0678-04	1452	FALSE	TRUE	28.225	22.08	30.69	0.1957	0.08896	0.28169	1.40836	0.92954	0.01934	0.16201	0.0512	0.00324	1	0.66002	0.01373
TCGA-28-1745-01B-01R-0678-04	1745	FALSE	TRUE	29.474	26.55	39.04	0.09192	0.23722	0.44478	0.65587	0.06138	0.00016	0.0362	0.0093	4e-05	1	0.09358	0.00025
TCGA-16-1460-01A-01R-0678-04	1460	FALSE	TRUE	28.295	25.53	39.69	0.01779	0.04448	0.341	1.34931	0.11411	0.00011	0.01463	0.00311	2e-05	1	0.08457	8e-05
TCGA-16-1056-01B-01R-0678-04	1056	FALSE	TRUE	27.617	25.25	38.045	0.08006	0.20756	0.2298	2.04304	0.13528	0.00029	0.09844	0.01782	4e-05	1	0.06622	0.00014
TCGA-12-1090-01A-01R-0678-04	1090	FALSE	TRUE	28.324	24.75	39.47	0.02965	0	0.16309	1.32558	0.18335	0.00013	0.0242	0	1e-05	1	0.13831	1e-04
TCGA-19-1791-01A-01R-0678-04	1791	FALSE	TRUE	28.813	22.54	31.59	0.03262	0.04448	0.02965	0.9828	0.70288	0.01157	0.01975	0.01901	2e-04	1	0.71518	0.01177
TCGA-14-1453-01A-01R-0678-04	1453	FALSE	TRUE	29.782	21	32.65	0.49222	0.22239	0.01483	0.54322	1.79987	0.00631	0.14806	0.24269	5e-05	1	3.31334	0.01162
TCGA-12-1091-01A-01R-0678-04	1091	FALSE	FALSE	27.697	23.135	37.45	0.34693	0.02224	0.87473	1.94544	0.48946	0.00041	0.38476	0.00662	0.00017	NA	NA	NA
TCGA-16-1063-01B-01R-0678-04	1063	FALSE	TRUE	29.54	20.815	31.89	0.02669	0.05189	0.11861	0.62991	2.00625	0.00974	0.01034	0.06329	0.00065	1	3.18495	0.01547
TCGA-14-1823-01A-01R-0678-04	1823	FALSE	TRUE	29.948	24.16	37.7	0.04151	0.17791	0.14826	0.49075	0.26246	0.00035	0.01236	0.02945	3e-05	1	0.5348	0.00072
TCGA-14-1402-01A-01R-0678-04	1402	FALSE	TRUE	28.64	22.4	25.14	0.21794	0.11861	0.08896	1.09254	0.76611	0.46044	0.13933	0.0552	0.0238	1	0.70122	0.42144
TCGA-14-1401-01A-01R-0678-04	1401	FALSE	TRUE	28.14	21.045	34.25	0.08599	0.02224	0.14826	1.48355	1.74411	0.00253	0.07946	0.02358	0.00021	1	1.17564	0.00171
TCGA-26-1438-01A-01R-0678-04	1438	FALSE	TRUE	29.37	25.95	38.61	0.01483	0.01483	0.59304	0.6947	0.08786	0.00021	0.01268	0.00159	8e-05	1	0.12647	3e-04
TCGA-14-1455-01A-01R-0678-04	1455	FALSE	TRUE	28.686	28.6	39.785	0.06227	0.0593	0.31876	1.06222	0.01765	0.00011	0.041	0.00064	2e-05	1	0.01661	1e-04
TCGA-28-1750-01A-01R-0678-04	1750	FALSE	TRUE	28.727	24.265	37.15	0.03855	0.00741	0.22239	1.0359	0.24623	0.00048	0.02463	0.00111	6e-05	1	0.23769	0.00047
TCGA-15-1449-01A-01R-0678-04	1449	FALSE	TRUE	27.234	23.88	36.61	0.07116	0.04448	0.41513	2.58256	0.31122	0.00066	0.11082	0.00841	0.00017	1	0.12051	0.00025
TCGA-06-1084-01A-01R-0678-04	1084	FALSE	TRUE	28.2535	28.185	NA	0.03632	0.05189	NA	1.36342	0.02224	0	0.06152	0.00143	0	1	0.01631	0
TCGA-26-1799-01A-02R-0678-04	1799	TRUE	FALSE	NA	21.71	34.83	NA	0.0593	0.08896	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA
TCGA-19-1392-01A-01R-0678-04	1392	FALSE	TRUE	29.1815	27.035	39.31	0.03039	0.06672	0	0.77464	0.04447	7e-05	0.02918	0.00371	1e-04	1	0.05741	9e-05
TCGA-14-1451-01A-01R-0678-04	1451	FALSE	TRUE	28.885	26.565	39.07	0.02372	0.09637	1.02299	0.94044	0.06087	0.00017	0.01372	0.00356	1e-04	1	0.06472	0.00019
TCGA-06-1087-01A-02R-0678-04	1087	FALSE	TRUE	27.16	27.87	NA	0.05189	0	NA	2.70218	0.02751	NA	0.08488	0	NA	1	0.01018	NA
TCGA-19-1385-01A-02R-0678-04	1385	FALSE	TRUE	28.383	26.685	37.57	0.31728	0.02224	0.47443	1.27858	0.05654	0.00038	0.23874	0.00076	0.00011	1	0.04422	3e-04
TCGA-12-1092-01B-01R-0678-04	1092	FALSE	TRUE	29.033	28.06	39.08	0.08006	0.11861	0.50408	0.85902	0.02454	0.00016	0.04139	0.00177	5e-05	1	0.02856	0.00019
TCGA-27-1832-01A-01R-0678-04	1832	FALSE	TRUE	29.586	25.23	38	0.02965	0.13343	0.65234	0.61243	0.13694	3e-04	0.01104	0.01142	0.00013	1	0.2236	0.00049
TCGA-12-1097-01B-01R-0678-04	1097	FALSE	TRUE	29.036	23.62	25.35	0.09637	0.25204	0.02965	0.85745	0.36445	0.40839	0.04957	0.05884	0.00696	1	0.42504	0.47629
TCGA-12-1600-01A-01R-0678-04	1600	FALSE	TRUE	28.632	20.98	32.45	0.13047	0.01483	0.02965	1.0979	1.81434	0.00708	0.08533	0.0164	0.00012	1	1.65255	0.00645
TCGA-19-1786-01A-01R-0678-04	1786	FALSE	TRUE	28.611	21.24	23.59	0.15123	0.08896	0.0593	1.1121	1.54906	1.11599	0.09976	0.08533	0.03737	1	1.39291	1.0035
TCGA-28-1757-01A-02R-0678-04	1757	FALSE	TRUE	28.311	21.52	33.91	0.01038	0.13343	0.23722	1.33617	1.30658	0.00307	0.0085	0.10895	4e-04	1	0.97785	0.0023
TCGA-12-1088-01A-01R-0678-04	1088	FALSE	TRUE	28.33	24.58	38.37	0.01779	0.28169	1.33434	1.32073	0.20331	0.00024	0.01432	0.03691	0.00014	1	0.15394	0.00018
TCGA-14-1794-01A-01R-0678-04	1794	FALSE	TRUE	28.006	22.945	35.13	0.16457	0.05189	0.13343	1.61031	0.5495	0.00153	0.15676	0.01733	0.00011	1	0.34124	0.00095
TCGA-27-1834-01A-01R-0678-04	1834	FALSE	TRUE	28.806	25.885	38.15	0.20015	0.12602	0.32617	0.98702	0.09208	0.00027	0.11602	0.00705	5e-05	1	0.09329	0.00028
TCGA-06-1800-01A-01R-0678-04	1800	FALSE	TRUE	28.812	27.98	37.12	0.14529	0.19274	0.19274	0.9834	0.02573	0.00049	0.0901	0.00314	6e-05	1	0.02616	5e-04
TCGA-12-1098-01C-01R-0678-04	1098	FALSE	TRUE	28.885	26.12	38.03	0.10971	0.14826	0.42995	0.94044	0.07971	0.00029	0.06458	0.00741	8e-05	1	0.08476	0.00031
TCGA-14-1825-01A-01R-0678-04	1825	FALSE	TRUE	28.54	25.85	37.51	0.02224	0.11861	0.07413	1.16147	0.09405	0.00039	0.01588	0.00678	2e-05	1	0.08097	0.00034
TCGA-28-1760-01A-01R-0678-04	1760	FALSE	TRUE	28.414	23.245	35.29	0.11713	0.00741	0.20756	1.25456	0.45778	0.0014	0.09212	0.00206	0.00017	1	0.3649	0.00111
TCGA-19-0964-01A-01R-0678-04	964	FALSE	TRUE	28.648	21.1	35.27	0.06672	0.29652	0.23722	1.0872	1.68668	0.00141	0.04378	0.32333	0.00018	1	1.55139	0.0013
TCGA-19-0962-01B-01R-0678-04	962	FALSE	TRUE	28.351	26.225	39.11	0.03113	0.02224	0.10378	1.30386	0.07479	0.00016	0.02468	0.00101	1e-05	1	0.05736	0.00012
TCGA-06-1805-01A-01R-0678-04	1805	FALSE	TRUE	27.837	26.04	37.24	0.23573	0.10378	0.47443	1.78573	0.08376	0.00046	0.24544	0.00528	0.00012	1	0.04691	0.00026
TCGA-12-1598-01A-01R-0678-04	1598	FALSE	TRUE	28.074	22.82	26.67	0.00741	0.04448	0.0593	1.54468	0.59286	0.19215	0.007	0.01603	0.00643	1	0.3838	0.12439
TCGA-19-1386-01A-01R-0678-04	1386	FALSE	TRUE	28.397	19.25	24.24	0.04003	0.01483	0.08896	1.26768	5.19416	0.76988	0.03079	0.04696	0.03845	1	4.09738	0.60731
TCGA-12-1089-01A-01R-0678-04	1089	FALSE	TRUE	28.538	21.69	22.99	0.11268	0.10378	0.04448	1.1629	1.17934	1.57215	0.08207	0.07437	0.0396	1	1.01414	1.35193
TCGA-14-1829-01A-01R-0678-04	1829	FALSE	TRUE	29.945	24.585	35.73	0.09489	0.00741	0.4003	0.49166	0.20269	0.00109	0.02911	0.00091	0.00023	1	0.41227	0.00221
TCGA-14-1458-01A-01R-0678-04	1458	FALSE	TRUE	28.067	24.965	37.55	0.06079	0.06672	0.32617	1.55131	0.16094	0.00038	0.05843	0.00653	7e-05	1	0.10374	0.00025
TCGA-28-1746-01A-01R-0678-04	1746	FALSE	TRUE	27.692	23.16	35.68	0.10823	0.0593	0.11861	1.9514	0.4822	0.00112	0.12638	0.01738	7e-05	1	0.24711	0.00057
TCGA-15-1447-01A-01R-0678-04	1447	FALSE	TRUE	27.15	23.545	36.55	0.03262	0.02224	0.53374	2.71876	0.38147	0.00068	0.0539	0.00516	0.00023	1	0.14031	0.00025
TCGA-14-1795-01A-01R-0678-04	1795	FALSE	TRUE	28.03	28.07	NA	0.09637	0.14826	NA	1.58683	0.02436	NA	0.09545	0.00226	NA	1	0.01535	NA
TCGA-14-1821-01A-01R-0678-04	1821	FALSE	TRUE	27.491	27.035	39.27	0.00741	0.09637	0	2.20678	0.04574	0.00014	0.01002	0.00268	0	1	0.02073	7e-05
TCGA-14-1454-01A-01R-0678-04	1454	FALSE	TRUE	27.121	25.505	38.66	0.01483	0.00741	0.45961	2.76744	0.11586	2e-04	0.02503	0.00052	5e-05	1	0.04186	7e-05
